Durante uma análise de cadeia Markoviana Monte Carlo (MCMC), a decisão de mover a cadeia da árvore atual para uma nova árvore é determinada pela probabilidade de aceitação da nova árvore. Essa probabilidade é calculada com base na função de verossimilhança da nova árvore e na função de verossimilhança da árvore atual, bem como na distribuição a priori das árvores. Se a probabilidade de aceitação for alta, a cadeia será movida para a nova árvore. Caso contrário, a cadeia permanecerá na árvore atual.
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