A diferenciação dos subtipos de vírus influenza do tipo A é feita com base na variação das proteínas de superfície hemaglutinina (HA) e neuraminidase (NA). Existem 18 subtipos de HA e 11 subtipos de NA conhecidos, e os vírus influenza A são nomeados de acordo com o subtipo de HA e NA que eles possuem. Por exemplo, o vírus H1N1 possui o subtipo de HA 1 e o subtipo de NA 1. A identificação dos subtipos é importante para a vigilância epidemiológica e para a produção de vacinas contra a gripe.
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