Nested-PCR é uma técnica de amplificação de DNA que consiste em duas rodadas de amplificação em vez de uma. Na primeira rodada, os iniciadores externos são usados para amplificar a sequência de interesse. Na segunda rodada, os iniciadores internos são usados para amplificar um fragmento menor dentro do produto da primeira rodada. Essa técnica é usada quando a sensibilidade da PCR convencional não é suficiente para detectar a sequência de interesse em amostras que possuem o DNA-alvo em pouquíssima quantidade. A Nested-PCR aumenta a sensibilidade da técnica e reduz a chance de produtos inespecíficos que podem atrapalhar a interpretação.
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