A utilização de fertilizantes pode alterar os ciclos biogeoquímicos, pois os fertilizantes contêm elementos como Nitrogênio e Fósforo que, quando aplicados no solo, podem se acumular no ecossistema. Essa acumulação pode gerar um processo de eutrofização, que é o super-crescimento de algas. Esse processo pode afetar negativamente o ecossistema, pois o excesso de algas pode consumir todo o oxigênio disponível na água, causando a morte de outros organismos aquáticos. Além disso, a utilização excessiva de fertilizantes pode levar à contaminação do solo e da água, afetando a qualidade desses recursos naturais.
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