A morfologia de Trichomonas vaginalis é de uma célula polimórfica, tanto no hospedeiro natural quanto em meios de cultura. O organismo é tipicamente elipsoide, piriforme ou em forma de pêra, medindo em média 9,7 µm de comprimento e 7 µm de largura. T. vaginalis pode formar cistos, ao contrário da maioria dos protozoários. O flagelado possui quatro flagelos anteriores livres e desiguais, uma membrana ondulante e uma costa que se origina no complexo granular basal anterior.
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