Embora esteja em processo de crescimento, o comércio eletrônico ainda passa por algumas desvantagens. Uma delas é a questão da segurança. Muitos clientes ainda têm certo receio em disponibilizar seu cadastro online ou o número do cartão de crédito. Para minimizar esta desconfiança, as empresas de comércio eletrônico:
a. Solicitar que o cliente possua uma conexão de qualidade e um programa de antivírus eficiente, que o proteja em relação aos seus dados.
b. Disponibilizar as informações dos clientes em outras plataformas de acesso livre, onde as pessoas possam encontrar estes dados.
c. Devem apresentar em seu site uma autentificação, para que o consumidor possa verificar se a empresa é quem diz ser.
d. Devem se preocupar em desenvolver um site moderno, com um design gráfico atraente em que o cliente possa confiar.
e. Oferecem assistência técnica local, mas os produtos comprados de forma online não têm a garantia do código de defesa do consumidor.