As plantas recalcitrantes são difíceis de enraizar por estacas devido a algumas características específicas. Essas plantas possuem uma baixa capacidade de formação de raízes adventícias, além de apresentarem uma maior quantidade de compostos fenólicos e uma menor quantidade de auxinas, hormônios responsáveis pelo enraizamento. Além disso, essas plantas também possuem uma maior taxa de perda de água, o que pode dificultar o processo de enraizamento.
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