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Na cromatografia em fase reversa, a principal interação entre o analito e a fase estacionária é a interação hidrofóbica. Isso ocorre porque a fase estacionária é composta por uma matriz hidrofóbica, enquanto a fase móvel é composta por uma solução aquosa. Essa diferença de polaridade faz com que os compostos hidrofóbicos sejam retidos na fase estacionária por mais tempo, enquanto os compostos hidrofílicos são eluídos mais rapidamente.
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