Vamos analisar cada alternativa em relação ao contexto da Idade Moderna e as ciências naturais mencionadas: a. química, a física e a nutrologia - A nutrologia não é uma ciência natural reconhecida no contexto da Idade Moderna, portanto, essa alternativa está incorreta. b. medicina, a física e a biologia - Embora a medicina e a física sejam relevantes, a biologia como a conhecemos hoje não estava totalmente desenvolvida na Idade Moderna, mas ainda assim, essa alternativa é mais aceitável. c. filosofia, a e a biologia - A alternativa está incompleta e não menciona ciências naturais relevantes. d. química, a física e a biologia - Esta alternativa é a mais correta, pois a química e a física estavam em desenvolvimento significativo durante a Idade Moderna, e a biologia começou a se formar como uma ciência. e. geografia, a física e a biologia - A geografia não é uma ciência natural no mesmo sentido que as outras mencionadas, então essa alternativa também está incorreta. Após essa análise, a alternativa que contém todas as ciências naturais relevantes para o contexto da Idade Moderna é: d) química, a física e a biologia.