A reprodução assexuada por bipartição, ou cissiparidade, é realmente o método mais comum de multiplicação das bactérias. Nesse processo, o DNA bacteriano é duplicado e, em seguida, a célula se divide em duas células-filhas. Esse tipo de reprodução permite que as bactérias se multipliquem rapidamente, especialmente em condições favoráveis, podendo duplicar a população em cerca de 20 minutos. Os mesossomos, que são pregas da membrana plasmática, desempenham um papel importante na separação dos cromossomos irmãos durante a divisão celular, além de estarem envolvidos em processos metabólicos, como a respiração celular. Essa eficiência na reprodução e na utilização de recursos é uma das razões pelas quais as bactérias são tão bem-sucedidas em diversos ambientes.