São causas do insucesso: • Erro na escolha do antimicrobiano e/ou na sua posologia (dose, intervalo entre doses, duração do tratamento); • Tratamento iniciado com atraso, quando o microrganismo já causou as lesões no organismo animal; • Persistência, isto é, o agente infeccioso é sensível ao antimicrobiano in vitro, porém nos tecidos do animal o microrganismo pode encontrar-se em uma fase do seu ciclo na qual é refratário ao medicamento. • Resistência bacteriana, que pode ser natural ou adquirida.