Vamos analisar cada alternativa: I - pela morte do agente; Verdadeiro, a morte do agente extingue a punibilidade. II - pela anistia, graça ou indulto; Verdadeiro, a anistia, graça ou indulto são formas de extinção da punibilidade. III - pela retroatividade da lei que não mais considera o fato como criminoso; Verdadeiro, a retroatividade de lei mais benigna que não mais considera o fato como criminoso extingue a punibilidade. IV - pela prescrição, decadência ou perempção; Verdadeiro, a prescrição é uma forma de extinção da punibilidade. V - pela renúncia do direito de queixa ou pelo perdão aceito, nos crimes de ação privada; Verdadeiro, a renúncia do direito de queixa ou o perdão aceito são formas de extinção da punibilidade nos crimes de ação privada. VI - pela retratação do agente, nos casos em que a lei a admite; Verdadeiro, a retratação do agente nos casos previstos em lei é uma forma de extinção da punibilidade. IX - pelo perdão judicial, nos casos previstos em lei; Falso, não existe o item IX na descrição. Portanto, as alternativas corretas são I, II, III, IV, V e VI. A alternativa que contém todos os itens verdadeiros é: a) I, II e V estão corretas.