Para identificar a palavra que foi empregada em sentido conotativo, precisamos entender o que é o sentido conotativo. O sentido conotativo é aquele que atribui significados figurados ou simbólicos a palavras, enquanto o sentido denotativo é o significado literal. Vamos analisar as alternativas: (A) "Fez a mulher a partir da costela do homem" - Aqui, a expressão é mais literal, referindo-se à criação da mulher. (B) "O melhor que Ele fazia, em sentido figurado, era deixar transfigurado o tórax masculino" - A palavra "transfigurado" pode ter um sentido figurado, mas a frase é um pouco ambígua. (C) "São questionamentos que afetam profundamente o cerne dos homens" - "Cerne" pode ser interpretado de forma figurada, mas também pode ser entendido de maneira mais literal. (D) "Podes ser um poeta, mas, sei que não és bobo" - Aqui, "bobo" é usado de forma mais direta, sem conotação. (E) "Soubeste escolher a dedo a criatura ideal para aguentar o tranco existencial no teu misterioso projeto de perpetuação da espécie humana no planeta azul" - "Aguentar o tranco" é uma expressão que tem um sentido figurado. Analisando as opções, a que apresenta uma palavra em sentido conotativo é a (E), pois "aguentar o tranco" é uma expressão que não deve ser interpretada literalmente. Portanto, a resposta correta é a E.