Qual a diferença do código civil anotado e o comentado ??

um código anotado teria apenas notas de remissão ao próprio código, outros códigos ou à legislação correlata (por exemplo, remissão a um artigo mencionado), ou notas de remissão a decisões judiciais a respeito do dispositivo). 

o código comentado contém, além das notas de remissão legislativa e jurisprudencial (decisões), a interpretação doutrinária de cada artigo, que pode ser uma compilação de vários entendimentos de vários autores, ou a interpretação do próprio organizador. 

detalhe: a maioria dos professores e concursos públicos não admitem usar o código comentado durante as provas, mas admitem o código anotado (apenas com remissões).