A organização do DNA no núcleo celular é hierárquica: o DNA se enrola em torno das histonas formando nucleossomos, que se compactam em fibras de cromatina. A eucromatina é uma forma menos condensada, onde os genes estão mais acessíveis para a transcrição, enquanto a heterocromatina é altamente condensada e geralmente transcriptionalmente inativa. Essa alternância entre eucromatina e heterocromatina é regulada por modificações epigenéticas (como metilação do DNA e modificações nas histonas), que controlam a expressão gênica ao tornar regiões do DNA mais ou menos acessíveis para os fatores de transcrição. Portanto, a relação funcional correta é que a estrutura da cromatina, modulada por mecanismos epigenéticos, determina a acessibilidade dos genes e regula sua expressão.