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O sequenciamento de DNA revolucionou nosso conhecimento sobre o material genético e revelou que a maior parte dele não codifica nenhuma proteína.
Com relação ao sequenciamento de DNA, assinale a alternativa correta.
A Os métodos de sequenciamento têm base na produção de fragmentos de DNA de comprimento crescente, que começam em um ponto comum e possuem todos os quatro tipos de nucleotídeos nas respectivas extremidades.
B Após a etapa de desnaturação do DNA, é colocado um primer na extremidade 5' de uma das cadeias e, com a ajuda de uma DNA polimerase, sintetiza-se a cadeia complementar por completo.
C Após término da reação de sequenciamento, ela é submetida à eletroforese capilar.
D Todos os fragmentos recém-sintetizados, cada um terminado em um nucleotídeo diferente e cada um marcado com um diferente fluoróforo, são separados pelas respectivas cores.
E Os nucleotídeos empregados nessa técnica são quimicamente modificados de forma que não apresentam um terminal hidroxila (3'-OH), impedindo a inserção de um novo nucleotídeo pela DNA polimerase.
F O método de Sanger revolucionou sequenciamento de DNA pela não utilização de substâncias radioativas e marcando os ddNTPs, e ficou conhecido como sequenciamento da segunda geração.
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Desafios Para o Conhecimento

há 8 horas

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há 8 horas

Vamos analisar cada alternativa cuidadosamente: A) "Os métodos de sequenciamento têm base na produção de fragmentos de DNA de comprimento crescente, que começam em um ponto comum e possuem todos os quatro tipos de nucleotídeos nas respectivas extremidades." - Parcialmente correta, mas a parte "possuem todos os quatro tipos de nucleotídeos nas respectivas extremidades" está incorreta. Os fragmentos terminam em nucleotídeos específicos (ddNTPs), não em todos os tipos simultaneamente. B) "Após a etapa de desnaturação do DNA, é colocado um primer na extremidade 5' de uma das cadeias e, com a ajuda de uma DNA polimerase, sintetiza-se a cadeia complementar por completo." - Incorreta. O primer é colocado na extremidade 3' para que a DNA polimerase sintetize na direção 5' → 3'. C) "Após término da reação de sequenciamento, ela é submetida à eletroforese capilar." - Correta. No sequenciamento de Sanger moderno, a eletroforese capilar é usada para separar os fragmentos de DNA. D) "Todos os fragmentos recém-sintetizados, cada um terminado em um nucleotídeo diferente e cada um marcado com um diferente fluoróforo, são separados pelas respectivas cores." - Parcialmente correta, mas a separação é feita por tamanho na eletroforese, e a detecção é feita por fluorescência das cores, não pela separação física por cor. E) "Os nucleotídeos empregados nessa técnica são quimicamente modificados de forma que não apresentam um terminal hidroxila (3'-OH), impedindo a inserção de um novo nucleotídeo pela DNA polimerase." - Correta. Os ddNTPs (didesoxinucleotídeos) usados no sequenciamento de Sanger não possuem o grupo 3'-OH, o que termina a síntese da cadeia. F) "O método de Sanger revolucionou sequenciamento de DNA pela não utilização de substâncias radioativas e marcando os ddNTPs, e ficou conhecido como sequenciamento da segunda geração." - Incorreta. O método de Sanger é considerado sequenciamento de primeira geração; a segunda geração envolve tecnologias como sequenciamento em massa (NGS). Analisando as alternativas, as que estão corretas são C e E, mas a questão pede a alternativa correta (única). A alternativa E explica um princípio fundamental do sequenciamento de Sanger, enquanto a C fala do procedimento posterior. Como a questão pede a alternativa correta sobre o sequenciamento de DNA, a melhor resposta é: E) Os nucleotídeos empregados nessa técnica são quimicamente modificados de forma que não apresentam um terminal hidroxila (3'-OH), impedindo a inserção de um novo nucleotídeo pela DNA polimerase.

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As técnicas de sequenciamento de Nova Geração (NGS) baseiam-se em uma amplificação clonal antes da reação de sequenciamento em si. No entanto, cada equipamento utiliza uma técnica diferente de amplificação clonal.
Sobre estas técnicas, assinale a opção correta.
A Uma das técnicas utilizadas é a PCR em ponte, na qual as fitas de DNA são dispersas em uma placa, aleatoriamente, e a PCR é realizada através de pareamento de bases com fitas de DNA presentes nesta placa; esta técnica é utilizada na metodologia do sequenciador 454 (pirosequenciamento).
B A PCR em emulsão é uma técnica utilizada na metodologia do sequenciador 454 (pirosequenciamento) e consiste em uma emulsão de água, em uma fase oleosa, formando gotículas de água que contêm os reagentes de PCR, uma fita de DNA a ser sequenciada e uma 'bead' para sua ancoragem.
C Uma das técnicas utilizadas é a PCR em ponte, na qual as fitas de DNA são dispersas em uma placa aleatoriamente e a PCR é realizada através de pareamento de bases com fitas de DNA presentes nesta placa; esta técnica é utilizada na metodologia do sequenciador Sanger.
D A PCR em emulsão é uma técnica utilizada na metodologia do sequenciador Sanger e consiste em uma emulsão de água em uma fase oleosa, formando gotículas de óleo que contêm os reagentes de PCR, uma fita de DNA a ser sequenciada e uma 'bead' para sua ancoragem.
E A PCR em emulsão é uma técnica utilizada na metodologia do sequenciador Illumina e consiste em uma emulsão de água em uma fase oleosa, formando gotículas de água que contêm os reagentes de PCR, uma fita de DNA a ser sequenciada e uma 'bead' para sua ancoragem.

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