O blastocisto consiste em células que formam uma camada externa de trofectoderma (TE, trofoblasto), uma massa celular interna (MCI, explosão embrionária) e um blastocelo (cavidade cheia de fluido). A massa celular interna do blastocisto é a fonte de verdadeiras células-tronco embrionárias capazes de formar todos os tipos de células dentro do embrião.
As células externas do embrião também começam a expressar uma variedade de moléculas de transporte de membrana, incluindo bombas de sódio. Um resultado dessas mudanças é um acúmulo de fluido dentro do embrião, que sinaliza a formação do blastocisto.
Portanto, como o blastocisto continua a acumular fluido blastocélico, ele se expande formando um blastocisto expandido. O estágio do blastocisto também é um marco, pois é a primeira vez que dois tecidos distintos estão presentes. Um blastocisto é composto por uma esfera oca de células trofoblásticas, dentro da qual é um pequeno aglomerado de células chamado de massa celular interna.
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