As enzimas podem ser proteínas simples, ou seja, formadas apenas por cadeias polipeptídicas. Quando a enzima é ligada a um grupo não proteico, chamado cofator, a parte proteica é chamada de apoenzima. Normalmente esse cofator é um íon metálico. Quando o cofator é uma molécula orgânica, ele é chamado de coenzima. A holoenzima é a união de um cofator e uma apoenzima. Tanto a apoenzima como o cofator são inativos quando estão separados, tornando-se ativos na holoenzima.
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