As hifas podem apresentar um tipo de segmentação que divide o filamento em septos , delimitado por estruturas chamadas partições, o que permite a separação citoplasmática. Por outro lado, existem fungos que não possuem esse tipo de morfologia e são denominados cenocíticos. Os núcleos das hifas septadas podem ser uninucleares ou multinucleares. Estes migram para outros septos por uma estrutura chamada poro, a fim de reproduzir e realizar suas respectivas trocas genéticas. Por outro lado, as hifas cenocíticas podem conter centenas de milhares de núcleos ao longo de todo o filamento citoplasmático. Muitas espécies de fungos chamados haustórios possuem hifas especializadas que penetram organismos vivos para digestão e absorção. Outros podem aderir a diferentes substratos, como rochas, cascas, etc. As raízes das árvores servem como um substrato muito particular, que estabelece uma relação simbiótica com as hifas chamadas micorrizas.
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