No estômago, onde ocorre produção de suco gástrico, a pepsina (outra enzima), em meio ácido (presença de ácido clorídrico), inicia a "quebra" das proteínas. Do estômago, o bolo alimentar passa ao intestino delgado, onde será banhado por sucos digestivos produzidos pelo pâncreas, pelo fígado e pela parede do intestino
Pontes de tecido muscular chamado rugae revestem o estômago. Os músculos do estômago contraem periodicamente, agitando os alimentos para melhorar a digestão. O esfíncter pilórico é uma válvula muscular que se abre para permitir que os alimentos passem do estômago para o intestino delgado.
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