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Normalmente esses seres são associados à doenças, mas os protozoários também podem ser úteis para os seres humanos atuando como bioindicadores da toxidade de compostos químicos como, por exemplo, dos fármacos.
Geralmente esses seres são encontrados livremente, porém existem alguns que são encontrados associados a outros animais. Um exemplo dessa relação é o caso da presença de protozoários no rúmen dos animais ruminantes auxiliando na digestão da celulose.
Portanto, os protozoários podem ser úteis ao ser humano e a outros animais atuando como bioindicadores de fármacos e como digestores de celulose, respectivamente.
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