AV II DE BIOLOGIA MOLECULAR

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A genômica estrutural busca determinar qual é esse local e onde estão os marcadores associados
a cada um dos genes encontrados. Sobre os termos utilizados para denominar os locais de um
cromossomo, assinale a alternativa CORRETA:
 a) O termo locus se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado
cromossomo.
 b) O termo homólogo se refere aos diferentes cromossomos, que apresentam genes
heterógenos.
 c) O alelo se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado
cromossomo.
 d) O termo locus se refere a uma das formas em que um gene pode ser encontrado em um
cromossomo.
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2. A grande vantagem da utilização do RNA-seq é que, nesta tecnologia, não é necessário que se
tenha prévio conhecimento do genoma ou dos transcritos que serão avaliados. Algumas das
aplicações relacionadas a essa técnica são: a avaliação da expressão gênica diferencial,
análise do perfil do transcriptoma e a investigação de SNPs. Com base nas etapas para do
método da transcriptoma RNA-seq, ordene os itens a seguir:
I- Fragmentar as moléculas por ação de enzimas de restrição, sonicação ou nebulização,
formando fragmentos que serão ligados a adaptadores (pequenas sequências de nucleotídeos
que indicam onde o sequenciamento deve ser iniciado em cada molécula).
II- Isolar e fragmentar o RNA a ser sequenciado e convertê-lo em cDNA.
III- Aplicar métodos de sequenciamento para sequenciar pequenas porções, compostas por 30
a 200 pb (pares de bases), de cada um dos fragmentos.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
 a) I - III - II.
 b) II - III - I.
 c) II - I - III.
 d) I - II - III.
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3. A determinação da região de um gene no cromossomo pode ser realizada pela técnica de
eletroforese em gel de campo pulsado. Sobre essa técnica, assinale a alternativa CORRETA:
 a) O campo pulsado se deve à corrente elétrica que se alterna perpendicularmente ao gel.
 b) Essa técnica identifica a presença ou não de DNA na amostra, não sendo possível indicar
sua localização.
 c) Essa técnica é utilizada para detecção de grandes cromossomos somente, pois os pequenos
cromossomos não conseguem ser isolados nas bandas do gel.
 d) O campo pulsado se deve à correte elétrica comum aplicada à eletroforese em gel.
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4. A interação entre proteínas e o DNA é de extrema importância na genômica funcional,
especialmente pelo fato de que diversas proteínas são reguladoras da expressão gênica. Com
base nas técnicas utilizadas para identificar os locais de interação, classifique V para as
sentenças verdadeiras e F para as falsas:
( ) A MNase (nuclease microcócica), uma nuclease específica, capaz de clivar o DNA em
pequenos fragmentos, é modificada com a adição de uma proteína, a proteína A (pA) no
sequenciamento CUT & RUN.
( ) A MNase modificada com a pA forma regiões de interação entre a proteína e o DNA que
podem ser imunoprecipitadas, formando uma amostra rica de precipitados de regiões de
interação da proteína de interesse com o DNA.
( ) No sequenciamento ChIP, a proteína de interesse é reticulada ao DNA, ou seja, são
formadas ligações covalentes entre a proteína e o DNA por meio da adição de anticorpos
específicos para essa proteína.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
 a) V - F - V.
 b) F - F - V.
 c) F - V - F.
 d) V - V - F.
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5. As informações obtidas no processo de digestão proteica são relativas à m/z dos diferentes
peptídeos. Contudo, é de grande interesse que as sequências de aminoácidos que compõem
as proteínas sejam também identificadas. De acordo com a detecção da sequência dos
aminoácidos de uma proteína, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
( ) No processo de fragmentação dos íons peptídicos, são utilizadas técnicas que favorecem
a formação de fragmentos que sejam opostos e complementares.
( ) A sequência de aminoácidos dos peptídeos pode ser deduzida por softwares apropriados
para o sequenciamento, que podem formar a sequência completa da proteína.
( ) Os processos de dissociação induzida por colisão (CID) ou por transferência de elétrons
(ETD) formam íons de massa molecular elevada, que são aplicados ao primeiro ciclo de
cromatografia líquida.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
 a) V - F - F.
 b) F - F - V.
 c) V - V - F.
 d) V - F - V.
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6. No processo de digestão in gel, os spots contendo as proteínas de interesse são submetidos a
um processo de hidrólise química e enzimática, formando fragmentos proteicos menores,
capazes de migrar pela malha do gel e se difundir no sobrenadante, formando a amostra que
será analisada por espectrometria de massas. De acordo com a digestão in gel, classifique V
para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
( ) As proteínas são apenas separadas de acordo com sua massa molecular, embora, nesse
caso, as bandas obtidas do gel representem populações de proteínas com massas similares.
( ) A análise no espectrômetro de massas necessita que a carga líquida se torne negativa, ou
seja, o processo de ionização não é necessário.
( ) A cromatografia líquida é utilizada como método de fracionamento, em que os peptídeos
presentes na amostra são dissolvidos em uma fase líquida, bombeadas para passar por uma
fase estacionária e direcionadas para espectrometria de massas.
( ) As amostras podem ser submetidas a outro fracionamento prévio à análise por MS, com o
objetivo de reduzir a complexidade da amostra ou apenas complementar o fracionamento já
realizado na eletroforese.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
 a) V - V - F - V.
 b) V - F - V - V.
 c) F - F - V - F.
 d) V - F - F - V.
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7. Embora a frequência de variações no genoma não seja alta, quando uma determinada variação
ocorre em pelo menos cerca de 1% da população, o que a torna uma variação comum, essa
variação passa a ser tratada como um polimorfismo genético. Com base nos polimorfismos,
analise as sentenças a seguir:
I- Os polimorfismos genéticos podem ser gerados por mudanças como deleção, duplicação ou
inversão de apenas um ou vários pares de bases nitrogenadas na sequência do DNA.
II- As alterações no DNA podem ocorrer na região codificadora (éxon) e na região não
codificadora (íntron) de um gene.
III- Os polimorfismos em regiões reguladoras não podem afetar o fenótipo do indivíduo.
Assinale a alternativa CORRETA:
 a) As sentenças I e II estão corretas.
 b) Somente a sentença II está correta.
 c) As sentenças I e III estão corretas.
 d) Somente a sentença III está correta.
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8. As regiõesresponsáveis por codificar ou regular o DNA são conservadas entre as espécies,
permitindo driblar um dos grandes desafios do Projeto Genoma Humano, ou seja, a
interpretação dos dados, já que grande parte dessa informação era não codificadora. Sobre as
sequências codificadoras e reguladoras de DNA, avalie as asserções a seguir e a relação
proposta entre elas:
I- Uma estratégia utilizada para conhecer as sequências codificadoras do genoma humano é
baseada na comparação com outras espécies que sejam evolutivamente relacionadas aos
seres humanos, como os camundongos, por exemplo.
PORQUE
II- A partir da estratégia é possível definir quais regiões são não codificadoras entre as duas
espécies, indicando que essas regiões estiveram menos sujeitas a mutações ao longo do
processo evolutivo.
Assinale a alternativa CORRETA:
 a) As asserções I e II são proposições falsas.
 b) A asserção I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa.
 c) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
 d) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
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9. A sigla CRISPR vem do inglês Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats e
pode ser traduzida como grupos de repetições palindrômicas curtas e regularmente
interespaçadas. Já o Cas 9 se refere à nuclease que se encontra associada ao sistema
CRISPR. Com base na técnica CRISPR-Cas9, analise as sentenças a seguir:
I- Uma molécula de RNA guia (gRNA) é inserida em uma sequência maior de RNA. Quando em
contato com o DNA, o gRNA se liga uma a sequência específica do DNA, indicando para a
enzima Cas9 onde o DNA deve ser cortado.
II- Os mecanismos de reparo de DNA presentes na célula é ativado e utilizado para a inserção,
exclusão de pares de bases do DNA ou para efetuar a substituição de segmentos inteiros de
DNA por segmentos de DNA personalizados.
III- Os efeitos da edição do genoma em células e animais experimentais, pois essa ferramenta
se mostra bastante promissora para o tratamento de doenças relacionadas a determinados
genes, como a fibrose cística e a hemofilia, e para auxiliar no tratamento de outras doenças,
como o câncer.
Assinale a alternativa CORRETA:
 a) As sentenças I, II e III estão corretas.
 b) Somente a sentença I está correta.
 c) Somente a sentença II está correta.
 d) Somente a sentença III está correta.
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10.As ciências ômicas buscam o entendimento do funcionamento celular dos organismos e suas
alterações biológicas. A era das diferentes ciências "ômicas" está intimamente relacionada
entre si. Sobre as "ômicas", associe os itens, utilizando o código a seguir:
I- Transcriptoma.
II- Proteoma.
III- Metaboloma.
( ) Estudo das proteínas e enzimas expressas.
( ) Estudo dos metabólitos resultantes de processos biológicos.
( ) Estudo do RNA mensageiro, ou seja, quais genes são lidos.
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
 a) II - III - I.
 b) II - I - III.
 c) I - II - III.
 d) I - III - II.
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