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* * UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ FACULDADE DE MEDICINA DEPARTAMENTO DE PATOLOGIA E MEDICINA LEGAL LABORATÓRIO DE GENÉTICA MOLECULAR (LABGEM) REAÇÃO EM CADEIA DA POLIMERASE (PCR) Fortaleza/CE 2009 ISABELLE SILVA-FERNANDES * * Técnica de biologia molecular empregada para se obter amplificação de fragmentos alvo de DNA in vitro, empregando elementos do processo natural de replicação do DNA; Produtos da PCR são chamados Amplicons DEFINIÇÃO * * BREVE HISTÓRICO Prêmio Nobel em 1993 Kary Mullis * * Propriedades importantes do DNA para sua manipulação Após desnaturação (separação das fitas por altas temperaturas ou meios alcalinos), filamentos do DNA se ligam exatamente nos mesmos pontos na renaturação. * * Propriedades importantes do DNA para sua manipulação Pares CG três pontes de H: mais difíceis de separar que AT (apenas duas pontes). Quanto mais CG no DNA, mais difícil será de desnaturar. * * PCR Componentes * * 1969 – T. Brock e H. Freeze relataram a descoberta de uma nova espécie de bactéria – Thermus aquaticus – sobrevive na água a temperatura média de 75ºC DNA POLIMERASE TERMOESTÁVEL Yellowstone National Park Várias enzimas isoladas desse microorganismo incluindo a primeira DNA polimerase termoestável – Taq DNA polimerase (1976) BREVE HISTÓRICO * * PCR A reação DESNATURAÇÃO → ANELAMENTO EXTENSÃO * * PCR A reação: 1º ciclo * * PCR Polimerização no sentido 5’ 3’ * * PCR * * PCR A reação: após sucessivos ciclos * * VARIANTES PCR - PROTOCOLOS Temperatura de anelamento; Região a ser amplificada; * * ELETROFORESE É a migração de partículas em um determinado gel (gel de agarose, poliacrilamida) de acordo com seu tamanho e sua carga elétrica; O gel é formado por conjuntos de moléculas e polímeros que formam uma rede; A eletroforese normalmente é utilizada para separar proteínas ou moléculas de DNA ou RNA * * ELETROFORESE Enquanto o gel ainda está líquido, coloca-se um pente que induzirá a formação de poços; Quando o gel está sólido, retira-se o pente. Nos poços formados, aplica-se DNA, RNA ou proteínas. * * ELETROFORESE * * ELETROFORESE * * 506 pb 491 pb ELETROFORESE EM GEL DE AGAROSE * * ELETROFORESE EM GEL DE POLIACRILAMIDA * * * * Detecção de mutações/polimorfismos em genes específicos (diagnóstico precoce em estudos de câncer e doenças genéticas); Estudos diagnósticos de doenças infecciosas, detecção de bactérias, vírus e protozoários; Elucidar relações evolutivas entre espécies; Grande potencial na Medicina Forense (Ex: Teste de Paternidade; Inclusão/Exclusão de suspeitos). APLICAÇÕES DA PCR * * POLIMORFISMO DE MICROSSATÉLITES * * TESTE DE PATERNIDADE * * IDENTIFICAÇÃO DE SUSPEITO * * IDENTIFICAÇÃO DE SUSPEITO V S1 S2 M V AMOSTRA S2 é culpado S1 não pode ser excluído S2 não pode ser excluído Não existem informações suficientes para tirar conclusões * * POLIMORFISMO * * COMO DETECTAR UMA MUTAÇÃO DE PONTO? * * ENZIMAS DE RESTRIÇÃO Endonucleases de restrição encontradas nas bactérias; A descoberta de um vasto número de enzimas de restrição levou à criação de uma nomenclatura uniforme; Ex: Eco R1 E = primeira letra do gênero (Escherichia) co = duas primeiras letras do epíteto (coli) R = linhagem 1 = primeira enzima extraída dessa bactéria * * ENZIMAS DE RESTRIÇÃO * * ENZIMAS DE RESTRIÇÃO * * ENZIMAS DE RESTRIÇÃO * * ELETROFORESE EM GEL DE POLIACRILAMIDA * * OBRIGADA! *
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