Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
Camila Mariana Castro de Oliveira Medicina Nove de Julho BCM 2 – Biologia molecular ➛ Diagnóstico de doenças hereditárias e infecciosas ➛ Detecção de agentes patogênicos e mutações ➛ Determinação do sexo a partir do sangue materno ➛ Medicina forense ➛ Verificação de polimorfismos ➛ Verificação de mutações ➛ Analise de expressão gênica ➛ As amostras podem ser obtidas por meio de diferentes procedimentos, como punção de vasos sanguíneos, biópsias, esfregações, cultivos microbiológicos ou fragmentos de tecidos, de acordo com o organismo envolvido ➛ O acondicionamento adequado das amostras após a coleta é essencial para a sua preservação até o momento da extração. Além disso, todo o material utilizado no procedimento deve ser esterilizado, a fim de evitar a contaminação do DNA ou RNA ➛ Etapas: ✓ Extração de RNA ou DNA ✓ Análise da integridade do RNA ou DNA ✓ Quantificação do RNA ou DNA ✓ Conversão de RNA para cDNA (DNA originado a partir de um RNAm – enzima transcriptase reversa) – extração de rna ✓ Técnica molecular -> PCR, sequenciamento, NGS, etc Extração – RNA ou DNA 1) Lise celular ➛ A lise celular envolve o rompimento das células e deve ser realizada em soluções tamponadas, geralmente contendo um detergente ➛ A adição do agente quelante EDTA também auxilia na inibição da ação das DNAses por se ligar aos cofatores Ca+2 e Mg+2 da enzima DNAse ➛ O NaCl contribui rompendo ligações iônicas das cadeias peptídicas, auxiliando na desnaturação das proteínas e adicionalmente promove a aglomeração das moléculas de DNA 2) Separação dos constituintes celulares ➛ Após a lise das membranas, os ácidos nucleicos são liberados na solução aquosa juntamente com outros constituintes celulares dos quais devem ser isolados ➛ Para esse fim, são utilizados solventes orgânicos, como o fenol ou clorofórmio, que desnaturam proteínas. Nessa etapa. após a centrifugação, o DNA permanecerá solúvel na fase aquosa (sobrenadante) 3) Precipitação do DNA ➛ Em condições de baixa temperatura e elevada contração salina (devido ao NaCl presente no tampão da lise), a adição de etanol absoluto, isopropanol ou soluções acetatos de amônio ou sódio resulta na precipitação do DNA, o que forma em soluções um aglomerado de filamentos esbranquiçados que podem ser pescados com um bastão de vidro ou concentrados no fundo do tubo por centrifugação Camila Mariana Castro de Oliveira Medicina Nove de Julho BCM 2 – Biologia molecular ➛ PCR -> reação em cadeia da polimerase ➛ Técnica que permite a amplificação da quantidade de DNA específico utilizando a enzima Taq DNA polimerase, dNTP, sequências iniciadoras específicas (primers) e variações de temperatura controladas ➛ Primers: ✓ Responsáveis pela localização da sequência alvo ✓ Oligonucleotídeos com 20-24 bases ✓ O pareamento dos primers com a sequência alvo se faz pelo estabelecimento de pontes de hidrogênio, segundo o pareamento convencional descrito por Watson e Crick 1) Desnaturação -> as moléculas de DNA são inicialmente desnaturadas por alta temperatura (acima de 90°) – “abrir a fita” 2) Anelamento -> a seguir, a temperatura é diminuída (usualmente entre 45° e 65°) e dois oligonucleotídeos iniciadores (primers) pareiam-se com suas sequencias complementares nas fitas molde 3) Polimerização -> posteriormente, pela disponibilidade de extremidade 3’OH dos primers, a enzima DNA polimerase realiza a síntese das novas fitas ➛ PCR em tempo real: ✓ Técnica realizada em um instrumento fechado, que contém um termociclador acoplado a um sistema óptico para a excitação da fluorescência e um sistema de detecção dos sinais fluorescentes ✓ Encontra-se acoplado a um computador com um software que captura os dados e faz a análise final da reação ➛ Sequenciadores de DNA são equipamentos que leem uma amostra de DNA e geram um arquivo eletrônico com símbolos que representam a sequência de bases nitrogenadas – A, C, G, T – contidos na amostra ➛ Cada tecnologia de sequenciamento possui uma estratégia diferente, mas em geral podemos identificar etapas comuns entre todos os sequenciadores ➛ Benefícios: ✓ Obter informações genômicas em curto tempo a um custo razoável ✓ Flexibilidade para ser aplicada em uma série de estudos genômicos ✓ Sequenciamento gênico completo em determinadas situações e condições biológicas ✓ Exoma ➛ Sequenciamento completo do exoma na prática clínica: ✓ O termo exoma refere-se ao conjunto de éxons presentes no genoma de grande parte dos seres vivos, composto por cerca de 180.000 éxons nos humanos ✓ O sequenciamento completo do exoma consiste na análise dos éxons do DNA, que correspondem às regiões codificantes do mRNA Sequenciador de eletroforese -> processa no máximo 96 fragmentos por vez NGS -> podem ler até bilhões de fragmentos ao mesmo tempo Camila Mariana Castro de Oliveira Medicina Nove de Julho BCM 2 – Biologia molecular ➛ Identifica quais são as mutações entre os microrganismos circulantes ➛ Pode identificar espécies novas ➛ Auxilia no diagnóstico e tratamento ➛ Auxilia na definição de perfis epidemiológicos ➛ Metodologia -> técnica de sequenciamento automático de DNA ➛ Técnicas que visam o isolamento de genes e a introdução de genoma exógeno em outros organismos ➛ São produzidos organismos transgênicos, com diversas finalidades ➛ Ampla aplicação comercial e tecnológica ➛ São enzimas encontradas em bactérias, utilizadas para realizar cortes no DNA ➛ Cada enzima de restrição corta o material genético em um sítio específico, que são palíndromas ➛ As extremidades das partes cortadas recebem o nome de extremidades de ligação, pois se encaixam perfeitamente
Compartilhar