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BIOINFORMÁTICA SDE4449 BIOINFORMÁTICA 09/03/2022 Contextualização A Bioinformática é uma ciência capaz de identificar sequências genicas utilizando ferramentas computacionais com objetivo de contribui para o diagnóstico laboratorial, identificação de variabilidade antigênica em surtos e pandemias, pesquisa de novas drogas, aprimoramento ara solução de crimes, além de melhorias nas indústrias. O estudo em bioinformática é um diferencial de qualidade para o aluno de Biomedicina pois concentra os conhecimentos adquiridos em genética e biologia molecular a fim de para propor novas soluções e inovações tecnológicas estimulando o raciocínio crítico e científico. Ementa A biologia molecular e a bioinformática. Aplicações da bioinformática. A importância do NCBI. Alinhamentos de sequências. Os primers. Banco de dados e anotação genômica. Conceitos e aplicações das ciências ômicas. Conceitos e terminologias filogenéticas. Principais mecanismos de construção de uma árvore filogenética. Objetivos Gerais Compreender o que é a bioinformática e suas áreas de atuação; Proporcionar os conhecimentos práticos da bioinformática e sua aplicação na pesquisa científica e na indústria; Despertar o raciocínio científico a partir da construção de um modelo experimental e análise de dados significativos. Objetivos Específicos 1. Compreender os conceitos de biologia molecular, o histórico e as aplicações da bioinformática; 2. Conhecer as plataformas e ferramentas mais utilizadas na bioinformática; 3. Conhecer os processos pelos quais os dados biológicos passam e onde é possível acessálos; 4. Compreender da evolução dos organismos vivos com base na análise filogenética. Conteúdos Tema 1: Introdução à bioinformática. 1.1 A biologia molecular e a bioinformática; 1.2 Aplicações da bioinformática; Tema 2: NCBI e alinhamento de sequências 2.1 A importância do NCBI; 2.2 Alinhamentos de sequências; 2.3 Os primers Tema 3: Anotação Gênica 3.1 Banco de dados e anotação genômica; 3.2 Conceitos e aplicações das ciências ômicas; Tema 4: Análise filogenética 4.1 Conceitos e terminologias filogenéticas; 4.2 Principais mecanismos de construção de uma árvore filogenética. Procedimentos de Avaliação A avaliação da disciplina segue as normas regimentais da Instituição. Nesta disciplina o aluno será avaliado por seu desempenho nas avaliações presenciais, bem como nos simulados que realizar. No que se refere às avaliações presenciais, o aluno agendará a realização da AV e, se necessário e posteriormente a AVS. As referidas avaliações, realizadas no polo de apoio EAD, envolvem questões objetivas e/ou discursivas a partir do banco de questão da disciplina e consideram diferentes níveis de complexidade e diferentes níveis cognitivos. Os simulados tomam como base o conteúdo de toda a disciplina e permitem a obtenção de até 2,0 pontos na média, desde que o aluno obtenha, pelo menos, nota 4,0 na AV e na AVS. Bibliografia Básica RESENDE, Rodrigo Ribeiro. Biotecnologia aplicada à saúde. São Paulo: Blucher, 2016. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/books/9788521209683 ELMASRI, R.; NAVATHE, S.B. Sistemas de banco de dados. 6.ed. São Paulo: Pearson, 2011. Disponível em:https://plataforma.bvirtual.com.br/Leitor/Publicacao/1992 LIPAY, Monica V. N.; BIANCO, Bianca. Biologia molecular: métodos e interpretação. Rio de Janeiro: Roca, 2015. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/books/9788527727686 Bibliografia Complementar CARVALHO, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de et al. Inteligência artificial: uma abordagem de aprendizado de máquina. Rio de Janeiro: LTC, 2011. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/books/9788521621461 MELO, A.C.V.; SILVA, F.S.C. Princípios de linguagens de programação. 3.ed. São Paulo: Blucher, 2014. Disponível em: https://plataforma.bvirtual.com.br/Leitor/Publicacao/172605 SANTOS, F. Linguagem de programação. Rio de Janeiro: SESES, 2016. Disponível em: http://api.repositorio.novatech.net.br/api/objetos/efetuaDownload/390c9dfd64cb4a1baf2a 798d72905e89 VICCI, C.(Org.) Banco de Dados. São Paulo: Pearson, 2015. Disponível em: https://plataforma.bvirtual.com.br/Leitor/Publicacao/22152 SILVA, Fabrício Machado da et al. Inteligência artificial. Porto Alegre: SAGAH, 2019. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/books/9788595029392 Outras Informações BIOINFORMÁTICA SDE4449 BIOINFORMÁTICA 09/03/2022 Contextualização A Bioinformática é uma ciência capaz de identificar sequências genicas utilizando ferramentas computacionais com objetivo de contribui para o diagnóstico laboratorial, identificação de variabilidade antigênica em surtos e pandemias, pesquisa de novas drogas, aprimoramento ara solução de crimes, além de melhorias nas indústrias. O estudo em bioinformática é um diferencial de qualidade para o aluno de Biomedicina pois concentra os conhecimentos adquiridos em genética e biologia molecular a fim de para propor novas soluções e inovações tecnológicas estimulando o raciocínio crítico e científico. Ementa A biologia molecular e a bioinformática. Aplicações da bioinformática. A importância do NCBI. Alinhamentos de sequências. Os primers. Banco de dados e anotação genômica. Conceitos e aplicações das ciências ômicas. Conceitos e terminologias filogenéticas. Principais mecanismos de construção de uma árvore filogenética. Objetivos Gerais Compreender o que é a bioinformática e suas áreas de atuação; Proporcionar os conhecimentos práticos da bioinformática e sua aplicação na pesquisa científica e na indústria; Despertar o raciocínio científico a partir da construção de um modelo experimental e análise de dados significativos. Objetivos Específicos 1. Compreender os conceitos de biologia molecular, o histórico e as aplicações da bioinformática; 2. Conhecer as plataformas e ferramentas mais utilizadas na bioinformática; 3. Conhecer os processos pelos quais os dados biológicos passam e onde é possível acessálos; 4. Compreender da evolução dos organismos vivos com base na análise filogenética. Conteúdos Tema 1: Introdução à bioinformática. 1.1 A biologia molecular e a bioinformática; 1.2 Aplicações da bioinformática; Tema 2: NCBI e alinhamento de sequências 2.1 A importância do NCBI; 2.2 Alinhamentos de sequências; 2.3 Os primers Tema 3: Anotação Gênica 3.1 Banco de dados e anotação genômica; 3.2 Conceitos e aplicações das ciências ômicas; Tema 4: Análise filogenética 4.1 Conceitos e terminologias filogenéticas; 4.2 Principais mecanismos de construção de uma árvore filogenética. Procedimentos de Avaliação A avaliação da disciplina segue as normas regimentais da Instituição. Nesta disciplina o aluno será avaliado por seu desempenho nas avaliações presenciais, bem como nos simulados que realizar. No que se refere às avaliações presenciais, o aluno agendará a realização da AV e, se necessário e posteriormente a AVS. As referidas avaliações, realizadas no polo de apoio EAD, envolvem questões objetivas e/ou discursivas a partir do banco de questão da disciplina e consideram diferentes níveis de complexidade e diferentes níveis cognitivos. Os simulados tomam como base o conteúdo de toda a disciplina e permitem a obtenção de até 2,0 pontos na média, desde que o aluno obtenha, pelo menos, nota 4,0 na AV e na AVS. Bibliografia Básica RESENDE, Rodrigo Ribeiro. Biotecnologia aplicada à saúde. São Paulo: Blucher, 2016. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/books/9788521209683 ELMASRI, R.; NAVATHE, S.B. Sistemas de banco de dados. 6.ed. São Paulo: Pearson, 2011. Disponível em:https://plataforma.bvirtual.com.br/Leitor/Publicacao/1992 LIPAY, Monica V. N.; BIANCO, Bianca. Biologia molecular: métodos e interpretação. Rio de Janeiro: Roca, 2015. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/books/9788527727686 Bibliografia Complementar CARVALHO, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de et al. Inteligência artificial: uma abordagem de aprendizado de máquina. Rio de Janeiro: LTC, 2011. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/books/9788521621461MELO, A.C.V.; SILVA, F.S.C. Princípios de linguagens de programação. 3.ed. São Paulo: Blucher, 2014. Disponível em: https://plataforma.bvirtual.com.br/Leitor/Publicacao/172605 SANTOS, F. Linguagem de programação. Rio de Janeiro: SESES, 2016. Disponível em: http://api.repositorio.novatech.net.br/api/objetos/efetuaDownload/390c9dfd64cb4a1baf2a 798d72905e89 VICCI, C.(Org.) Banco de Dados. São Paulo: Pearson, 2015. Disponível em: https://plataforma.bvirtual.com.br/Leitor/Publicacao/22152 SILVA, Fabrício Machado da et al. Inteligência artificial. Porto Alegre: SAGAH, 2019. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/books/9788595029392 Outras Informações
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