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Disc.: BIOINFORMÁTICA Aluno(a): MARIANNE MACIEL BERNARDO 202008294096 Acertos: 10,0 de 10,0 20/09/2022 1a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 Desde a descoberta da estrutura do DNA e do desenvolvimento da biologia molecular, o homem vem buscando novas alternativas que o auxiliem na busca por maior fluidez nos trabalhos de pesquisa, acelerando a geração de processos e produtos. A bioinformática tem contribuído para avanços na pesquisa básica, mas também na ciência aplicada (....). Fonte: adaptado de ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. Sobre a bioinformática, analise as afirmativas a seguir: I. O projeto Genoma Humano tinha como objetivo a detecção dos genes que compõem o DNA humano. Concluído em 1990, esse projeto contou com o apoio decisivo da bioinformática. II. A biologia computacional é um campo de pesquisa diferente ao da bioinformática. III. Uma das aplicações da bioinformática é o alinhamento de sequencias que tem como objetivo principal da comparação de sequências biológicas é encontrar o(s) alinhamento(s) de maior escore de similaridade. É correto o que se afirma em: I. I e II. I e III. III. II. Respondido em 20/09/2022 11:39:07 2a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 (ADAPTADA DE ENADE 2013- biomedicina) Os mecanismos envolvidos na expressão e interação dos genes, assim como a compreensão das redes funcionais estabelecidas pelas proteínas, fazem com que, no cenário científico atual, a genômica e a proteômica estejam cada vez mais em evidência. Quatro são os principais bancos de dados utilizados para as diferentes análises de nucleotídeos. Um deles é o INSDC (INTERNATIONAL NUCLEOTIDE SEQUENCE DATABASE), que disponibiliza um repertório de sequências e é resultado da associação de três bancos de dados parceiros, o DDBJ (DATA BANK OF JAPAN), o EMBL (EMBL NUCLEOTIDE SEQUENCE DATABASE) e o GenBank. Devido à sua designação como provedor de dados primários, EMBL/DDBJ/GenBak é fonte inicial de muitos bancos de dados em biologia molecular. Como exemplos de bancos de dados de sequências genômicas secundárias, pode-se citar o Ensembl, o RefSeq e o Genome Review, que representa uma versão da sequência original de um cromossomo ou plasmídeo, com informações importadas de fontes que incluem o UniProt (UNIVERSAL PROTEIN RESOURCE), o Gene Ontology (GO), o projeto GOA (GO ANNOTATION), o InterPro e o HoGenom, além de serem disponibilizadas referências cruzadas com 18 bancos de dados. Fonte: ESPINDOLA, F. S. et al. Recursos de bioinformática aplicados às ciências ômicas como genômica, transcriptômica, proteômica, interatômica e metabolômica. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 26, n. 3, p. 463-477, Maio/Junho 2010 (adaptado). I. As informações disponíveis nos bancos de dados de sequências possibilitam o desenvolvimento de pesquisas in sílico (realizadas em programas de computador), dependendo dos métodos interpretativos e programas de análises envolvidos. https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_avaliacao_parcial_resultado.asp?cod_hist_prova=293787467&cod_prova=5679391757&f_cod_disc= PORQUE II. Os bancos de dados de sequências fornecem informações sobre diversos genes, que podem ser utilizadas de forma rápida, independentemente do tipo de processamento. A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: As asserções I e II são proposições falsas. As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I. A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. Respondido em 20/09/2022 11:40:10 3a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 Em 2017 a revista "Nature" publicou o artigo "Physical properties of the HIV-1 capsid from all-atom molecular dynamics simulations" de Perilla & Schulten (2017), onde um supercomputador conseguiu fazer uma simulação de todos os átomos presentes no capsídeo do vírus HIV-1 por 400 nanossegundos, foram cerca de 4 milhões de átomos. Qual técnica da bioinformática permite realizar essa análise? Dinâmica molecular QSAR Ancoramento molecular Modelagem molecular Alinhamento molecular Respondido em 20/09/2022 11:46:54 4a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 (UFSM, 2006, Biólogo) As temperaturas são essenciais para realização da amplificação do DNA por PCR. Associe a segunda coluna com a primeira. 1. de 0°C a 10°C 2. de 35°C a 65°C 3. 72°C 4. 82°C 5. de 90°C a 96°C ( ) Maior probabilidade de alinhamento dos primers com a fita molde. ( ) Formação de fitas-molde a partir de todos os seguimentos. ( ) Ideal para ação da enzima Taq-DNA-polimerase. ( ) Ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3'. ( ) Estabelecimento de ligações - pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers. 5 - 4 - 1 - 5 - 3. 4 - 2 - 3 - 2 - 1. 2 - 3 - 1 - 3 - 4. 3 - 4 - 5 - 4 - 2. 2 - 5 - 3 - 3 - 2. Respondido em 20/09/2022 12:01:45 5a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 Durante um noticiário na televisão que falava sobre notícias na área de ciência e tecnologia, o repórter citou o termo NCBI. Dona Rosângela, curiosa, perguntou a seu neto o significado daquele termo. Qual seria a resposta correta que o neto de Dona Rosângela deveria dar? O NCBI se trata apenas de um banco de dados de artigos científicos da área biomédica. O NCBI é um programa on-line para o desenho de primers. O NCBI é um portal que apresenta bancos de dados e ferramentas importantes para a área biotecnológica. O NCBI é uma ferramenta usada para o alinhamento de sequências biológicas. O NCBI é um banco de dados de sequências de nucleotídeos curadas e sem redundância. Respondido em 20/09/2022 12:07:14 6a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 Aline é biomédica e trabalha em um laboratório para diagnóstico de doenças genéticas. Um dos genes mais pesquisados é o brca1, que quando sofre mutações específicas está associado ao risco aumentado de câncer. Para identificar as mutações, é necessário comparar a sequência obtida do paciente com uma sequência referência não mutada. Qual banco de dados, disponível no NCBI, Aline pode consultar para conseguir uma sequência referência curada para o gene brca1? BLAST. PubMed. RefSeq. KEGG. GenBank. Respondido em 20/09/2022 11:50:29 7a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 (Adaptado de UFCE - 2015 - Engenheiro - Área Engenharia de Pesca) A transcritômica ou transcriptômica é a ciência que estuda o transcritoma produzido por determinada célula, tecido ou organismo. Sobre esse tema, é correto afirmar que: O transcriptoma é o mesmo em todos tecidos e órgãos. Apesar de sua aplicação em diversos campos da biologia, a transcriptômica não pode ser pesquisada a partir de técnicas de alto desempenho e sequenciamento de nova geração (NGS). A transcriptômica estuda o conjunto de proteínas. Independente de estágio de desenvolvimento, o transcriptoma é o mesmo. Podem haver vários transcriptomas em um único organismo. Respondido em 20/09/2022 11:52:18 8a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 A química de produtos naturais tem empregado novas metodologias com o objetivo de acelerar a descoberta e o isolamento de novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com fins terapêuticos. Entre eles, técnicas de separação associadas às espectrométricas de alto desempenho, assim analisando o extrato bruto de uma planta, ou seja, sem prévio isolamento de um composto único, uma vez que esses estudos são realizados para a obtenção das informações qualitativas e quantitativas acerca da maior quantidade possível de tiposdiferentes de constituintes de cada amostra. Esse tipo de estudo emprega qual abordagem ômica? Transcriptômica. Metabolômica. Lipdômica. Proteômica. Genômica. Respondido em 20/09/2022 11:55:11 9a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 Existem diversas metodologias para buscar a melhor árvore filogenética. Todas estas abordagens são fundamentais para o avanço da compreensão da evolução. Dentre estes métodos está a aplicação do neighbor-joining. Qual é a melhor definição desta técnica? A árvore mais curta é encontrada sob a suposição de que há uma árvore mais curta. Um protocolo para adicionar táxons a uma árvore construída por parcimônia ou máxima verossimilhança. Uma árvore é estimada com base na proximidade dos táxons em uma matriz de dados. Uma busca em árvore é conduzida para encontrar a árvore que minimiza a diferença entre as distâncias observadas e previstas. Um algoritmo rápido que encontrará uma árvore com base em distâncias entre pares. Respondido em 20/09/2022 11:57:19 10a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 Existem diversas formas de buscarmos a melhor hipótese filogenética com uma matriz de táxons × caractere. Dentre as possibilidades temos a máxima verossimilhança. Qual das alternativas a seguir define melhor este conceito? A probabilidade de que uma hipótese seja falsa através do método dos mínimos quadrados. A probabilidade de que um evento ocorra. A probabilidade de observar um conjunto de dados fornecido uma hipótese. A melhor árvore calculada a partir da quantidade de passos, ou mudanças, nos ramos. A proporção das probabilidades de duas hipóteses alternativas. Respondido em 20/09/2022 11:57:55
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