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ELETROFORESE DE DNA, RNA EPROTEÍNAS Profa. Dra. Letícia Anderson Biotecnologia e Biologia MolecularAplicada ELETROFORESE Migração de partícula carregada sob influencia de um campo elétrico em um fluido ou gel. - Separação - Identificação - Purificação DNA RNA PROTEÍNA ELETROFORESE Migração de partícula carregada sob influencia de um campo elétrico em um fluido ou gel. DNA longo DNA médio DNA curto ELETROFORESE EM GEL ETAPAS - Preparo do gel (agarose ou acrilamida) - Adição do tampão de corrida na cuba - Preparo e aplicação das amostras - Corrida - Fotodocumentação - Análise ELETROFORESE HORIZONTAL OUVERTICAL ELETROFORESE DEDNA Gel de Agarose - Polissacarídeo de resíduos de D e L-galactose - Menor resolução - Separa fragmentos grandes de DNA 20 kb – 50 pb - Concentração da agarose determina sua resolução Gel de Poliacrilamida - Polímero formado por Acrilamida + Bisacrilamida - Maior resolução - Separa mais fragmentos pequenos de 5 – 500 pb - Neurotóxica Migração do DNA na eletroforese •Tamanho da molécula de DNA • Dupla fita de DNA linear ou circular • Tamanho do DNA •Concentração do gel ↑Concentração ↓ taxa de migração •Presença de moléculas interagindo com DNA • Proteínas, corantes, polímeros inibidores •Voltagem •Tampão • Sais para estabilizar a molécula ELETROFORESE DE DNA- Equipamento Pente Forma Fonte de eletrecidade Cuba de eletroforese ELETROFORESE DE DNA- Gel Agarose + Tampão derretido a alta temperatura Gel de agarose solidificado sem o pente Aplicação da amostra Revelação Corrida Preparo da amostra com Tampão de Amostra https://learn.genetics.utah.edu/content/labs/gel/ ELETROFORESE https://learn.genetics.utah.edu/content/labs/gel/ ELETROFORESE DE DNA- Gel Agarose + Tampão derretido a alta temperatura Gel de agarose solidificado sem o pente ELETROFORESEDE DNA –Aplicaçãodas amostras Aplicação da amostra corada com azul de bromofenol e Glicerol - Facilita a visualização da amostra - Permite a “descida” da amostra no poço “well” ELETROFORESE DE DNA- Migração Porcentagem de agarose influencia na malha da matriz e na separação de DNAs de diferentes tamanhos DNA Genômico = 0,7% PCR = 1,2 a 2,5% dependendo o tamanho do fragmento ELETROFORESE DE DNA- Visualização Agente intercalante de DNA para visualização em UV - Brometo de etídio - Sybr safe - Gel Red Luz Ultravioleta Transiluminador ELETROFORESE Foto do Gel na Luz Ultravioleta Marcador AMOSTRAS Corante Azul de Bromofenol Banda da PCR ELETROFORESE DE DNA- Interpretação AG AR O SE PO LI AC RI LA M ID A Marcador de Peso Molecular Molecular Weight Fragmentos de DNA com tamanhos conhecidos para comparação com a amostra Observar - Altura da Banda formada - Quantidade de Bandas - Espessura da Banda ELETROFORESE DE DNA- Interpretação ELETROFORESE DE DNA- Interpretação Gel para PCR Observar - Altura da Banda formada - Quantidade de Bandas - Espessura da Banda - Diferentes marcadores - Comparar com Marcador M CN Excesso de primers no Controle negativo Marcador ELETROFORESE DE DNA- Interpretação Observar - Altura da Banda formada - Quantidade de Bandas - Espessura da Banda - Diferentes marcadores - Comparar com Marcador Marcador Gel para DNA genômico M ELETROFORESE DE RNA- Interpretação AG AR O SE Observar - Altura da Banda formada - Quantidade de Bandas - Espessura da Banda ELETROFORESE DEPROTEÍNA Mais de uma subunidade Estrutura Primária Estrutura Secundária Estrutura Terciária Estrutura Quaternária ESTRUTURA DE PROTEÍNA ELETROFORESE DEPROTEÍNA Mais de uma subunidade Estrutura Primária Estrutura Secundária Estrutura Terciária Estrutura Quaternária ESTRUTURA DE PROTEÍNA ELETROFORESE DEPROTEÍNA Migração em gel de Poliacrilamida PAGE - Tamanho (massa molecular) - Carga (ponto isoelétrico) ELETROFORESE DEPROTEÍNA Proteína Desnaturada - Dodecil sulfato de Sódio SDS - Beta-mercaptoetanol - Aquecimento a 95°C ELETROFORESE DE PROTEÍNA- Migração Agente desnaturante Quebra pontes Dissulfeto SDS carrega a proteína negativamente Proteína linear carregada com carga negativa ELETROFORESEDE PROTEÍNA –Migração emdiferentescondições Condição não redutora Condição redutora Separação de proteínas de estrutura terciária e quaternária ELETROFORESE DEPROTEÍNA –Corrida vertical Aplicação da amostra corada com azul de bromofenol - Facilita a visualização da amostra ELETROFORESE DE PROTEÍNA–Visualização Marcador de Peso Molecular Molecular Weight Proteínas com tamanhos conhecidos para comparação com a amostra Observar - Altura da Banda formada - Quantidade de Bandas - Espessura da Banda ELETROFORESE DE PROTEÍNA–Visualização Coloração do gel para visualização - Coomassie blue (interage com grupos amina) - Prata (redução dos íons na presença de proteína) Prata Coomassie blue ELETROFORESE COMPARADA paraEUCARIOTO Perfil comparativo de Célula eucarionte
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