Atividade de Autoaprendizagem 2-4

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Atividade de Autoaprendizagem 2
Biologia Molecular
1. Pergunta 1
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. Os oligonucleotídeos iniciadores devem ser desenvolvidos com total precisão para que a ampliação dos fragmentos desejados seja específica e permita um diagnóstico preciso. De acordo com a sequência de DNA dupla-fita abaixo, quais serão os oligonucleotídeos iniciadores da ampliação desse fragmento de DNA:
5’ CCGCTTAGCCGGTAC 3’
3’ GGCGAATCGGCCATG 5’
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0. ATG e CCG.
Resposta correta
1. GGC e ATG.
2. TTG e GTA.
3. GGC e CCG.
4. GGC e ATC.
2. Pergunta 2
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Os polimorfismos genéticos são muito utilizados para teste de paternidade e amostras forenses. Considere que chegaram ao laboratório quatro amostras para um teste de paternidade: da criança, da mãe e de dois possíveis pais; e você terá que determinar qual é o pai da criança. Entre as metodologias abaixo, qual é a mais indicada? 
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0. PCR.
1. STR
Resposta correta
2. VNTR.
3. Polimorfismos genéticos.
4. Endonucleases de restrição.
3. Pergunta 3
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O avanço das tecnologias e dos métodos para aprimoramento das técnicas de PCR permitiu o desenvolvimento de diversos tipos diferentes de PCR. Um dos tipos mais proeminente e utilizado é a PCR em tempo real. Essa técnica se caracteriza pelo fato de:
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0. a qPCR recebe essa denominação, representada por essa sigla, pelo fato da polimerase nessa reação ser especializada, permitindo a quantificação do fragmento de polimerase;
1. essa técnica se diferencia por não precisar de um DNA molde para a amplificação, basta apenas adicionar um DNA de concentração conhecida para que ele possa ser quantificado durante a reação;
2. a PCR em tempo real segue o mesmo padrão da técnica normal, possibilitando apenas a amplificação em tempo real, sem permitir a quantificação da molécula alvo;
3. a tecnologia de PCR em Tempo Real (qPCR) é uma evolução do método de PCR (Polymerase Chain Reaction ou Reação em Cadeia da Polimerase). Seu princípio se baseia na duplicação de cadeias de DNA “in vitro”, que pode ser repetida diversas vezes, gerando quantidade de DNA suficiente para realizar diversas análises. Com apenas um único fragmento de DNA é possível reproduzir milhões de cópias.
Resposta correta
4. a técnica em tempo real é pouco viável na prática, sendo, por esse motivo, pouco aplicável em alguma área de atuação, se restringindo a pesquisa cientifica em institutos apenas. Ademais, a reação de amplificação do DNA é acompanhada de outro fragmento de DNA com concentração conhecida, possibilitando a quantificação do alvo em tempo real, por isso a sigla qPCR;
4. Pergunta 4
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O conhecimento do código genético, caracterizado pelas sequências específicas de nucleotídeos, foi fundamental para o desenvolvimento das tecnologias do DNA. Assim, encontrar ferramentas que fragmentassem esse DNA nessas sequências específicas para permitir a manipulação desse código foi imprescindível na época. Sobre as ferramentas que possibilitaram isso é correto afirmar que:  
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0. a descoberta de tesouras moleculares não é uma prioridade, na atualidade, para o desenvolvimento da tecnologia do DNA, visto que o grande enfoque no momento é sequenciar e conhecer os genes humanos.
1. as enzimas de restrição se mostraram ferramentas importantíssimas para a sua utilização como tesouras moleculares, porém, sua obtenção a partir de bactérias torna essas enzimas não aplicáveis em seres humanos;
2. o homem ainda busca o desenvolvimento de ferramentas que consigam clivar o DNA em regiões específicas e que não atuem de forma aleatória, como a maioria das enzimas atuais;
3. um grande salto para as tecnologias do DNA foi a descoberta das enzimas bacterianas conhecidas como enzimas de restrição, porém, essa técnica é pouco aplicável por cortar apenas sequências curtas;
4. a descoberta de uma classe de enzimas bacterianas, denominadas enzimas de restrição, capazes de cortar o DNA em sequências altamente específicas, foi um marco no desenvolvimento das tecnologias do DNA;
Resposta correta
5. Pergunta 5
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Sabe-se hoje que apesar dos processos de variação do DNA ocorrerem comumente na célula e em várias regiões do DNA, a existência de polimorfismos é relativamente rara e mais difícil ainda é que essas variações causem efeitos biológicos ou doenças no ser humano. Em relação a isso podemos afirmar que:
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0. as variações nos genes, consideradas polimórficas, são causadas apenas por recombinações genéticas, fato que explica a razão para não ter influência sobre nenhuma função biológica do corpo.
1. todas as formas de polimorfismos acontecem em regiões inter genes, que não tem relação nenhuma com a codificação de proteínas ou codifica proteínas irrelevantes para funções biológicas;
2. as variantes polimórficas constantemente ocorrem em regiões não codificantes do DNA, além de serem causadas por mutações que provavelmente são muito raras para alcançar a frequência mínima esperada em uma população;
Resposta correta
3. os polimorfismos são tão raros que não conseguem atingir a frequência mínima para causar qualquer alteração nos indivíduos, seja na diferenciação, função biológica ou originando doenças;
4. todos os tipos de polimorfismos, como acontecem sempre em regiões codificantes do DNA, estão relacionados a maioria das doenças que podem ser transmitidas através desses genes específicos;
6. Pergunta 6
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Diversas técnicas foram desenvolvidas nos últimos anos para otimizar o diagnóstico de diferentes tipos de doenças. Uma das técnicas mais conhecida e utilizada no mundo é a reação em cadeia da polimerase (PCR), por apresentar um bom custo e efetividade em comparação a outras técnicas moleculares. Sobre a PCR, assinale a alternativa correta.
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0. A PCR convencional amplifica somente fragmentos de DNA.
Resposta correta
1. A técnica é pouco utilizada por ser inespecífica.
2. Essa técnica permite a amplificação de no máximo 10 fragmentos de DNA.
3. Para a amplificação é necessário o uso da enzima transcriptase reversa.
4. Para essa técnica não é necessário o uso de primers.
7. Pergunta 7
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A reação em cadeia da polimerase necessita de vários ciclos repetidos para poder se obter uma quantidade de fragmentos suficientes para serem analisados em eletroforese. Assinale a alternativa que contenha a ordem correta de cada um desses ciclos.
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0. Desnaturação – Anelamento – Extensão.
Resposta correta
1. Extração – Amplificação – Eletroforese.
2. Desnaturação – Extensão – Anelamento. 
3. Desnudamento – Anelamento – Extensão.
4. Desnaturação – Amplificação – Eletroforese.
8. Pergunta 8
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O sequenciamento de Sanger foi desenvolvido por Frederick Sanger em 1997. Quais são os produtos/reagentes necessários para desenvolver esta metodologia molecular?
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0. Taqpolimerase, nucleotídeos, nucleotídios modificados, DNA. 
1. Taqpolimerase, primers, nucleotídios modificados, DNA. 
2. Taqpolimerase, primers, nucleotídeos, nucleotídeos modificados, DNA. 
Resposta correta
3. Taqpolimerase, primers, nucleotídeos, nucleotídios modificados, RNA.
4. Taqpolimerase, primers, nucleotídeos, nucleotídios modificados. 
9. Pergunta 9
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A manipulação do DNA envolve um conjunto de técnicas que estão inseridas na disciplina denominada biologia molecular, que se empenham em estudar e desenvolver formas de isolar, clonar, manipular e estudar o DNA dos organismos vivos. Em relação ao histórico desses procedimentos realizados pelo homem, podemos afirmar que:
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0. a tecnologia do DNA é a composição de técnicas que permitem ao homem estudar o DNA e os genes apenas nos ambientes acadêmicos, dentro dos institutos de pesquisa;
1. através da manipulação do DNA, a ciência deu um grande salto no entendimento do código genético, contudo, o custo e a complexidade das técnicas fizeram com que elas não fossem levadas adiante. 
2. as técnicas de manipulação são extremamente recentes, só sendo capazes de serem desenvolvidas apóso conhecimento detalhado da estrutura e composição do DNA e dos genes como um todo;
3. a manipulação do DNA pelo homem não é um processo recente, sendo realizado há muitos séculos, através de cruzamentos seletivos para obtenção de características o homem “domesticou” várias espécies;
Resposta correta
4. o homem, apesar do desenvolvimento tecnológico na área de manipulação genética, só consegue atualmente isolar um gene para estudá-lo, não tendo esse procedimento uma aplicação muito prática na sociedade;
10. Pergunta 10
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Sobre os polimorfismos genéticos, analise as afirmativas abaixo. 
( ) O polimorfismo pode afetar a codificação de proteínas específicas, podendo gerar quantidades anormais de proteínas e/ou proteínas truncadas, esse tipo de polimorfismo é denominado de não funcional.
( ) DNA fingerprinting é as diferenças dentro de um genoma que acarretam em um perfil de DNA único.
( ) Os SNPs são a troca de um único nucleotídeo de uma determinada sequência de DNA.
( ) Os códons são sequências de três nucleotídeos que formam uma tríade. 
( ) Os polimorfismos funcionais são aqueles que não influenciam o gene no qual está inserido, não interferindo na função daquele gene.
Assinale a alternativa que aponta a sequência correta.
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0. F – F – V – V – F. 
1. F – V – V – V – F.
Resposta correta
2. F – F – F – V – F.
3. F – V – V – F – F. 
4. F – V – F – V – F.