Questões sobre Filogenia e Anotação Genômica

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Analise a figura abaixo: 
 
Imagem: Leandro Pederneiras 
De acordo com a figura, são estabelecidas várias relações entre as espécies. Analise as 
alternativas e assinale a que retrata essa relação de forma correta. 
 
 H G F é mais próximo filogeneticamente de I J do que de U V. 
 
O grupo J K é polifilético e possui maior relação de aproximação do grupo L M do 
que do grupo X Y. 
 
O grupo A B C é monofilético e está mais próximo filogeneticamente do grupo L M 
do que do grupo F G. 
 O grupo T S é parafilético e seria um grupo polifilético se incluísse as espécies Q P O 
N. 
 
O grupo Z Z é irmão do clado I J K L M, não existindo nenhuma outra linhagem 
entre eles. 
 
 
 2. Ref.: 6069684 Pontos: 0,00 / 1,00 
 
Analise a árvore filogenética a seguir. 
javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206069684.');
 
Fonte: Leandro C.Pederneiras 
Qual a distância evolutiva entre o táxon F e o táxon J? 
 
 
1,9 
 3,65 
 4,35 
 
2,25 
 
3,6 
 
 
 3. Ref.: 6069594 Pontos: 0,00 / 1,00 
 
A seguir são apresentadas diferentes árvores filogenéticas (de A ao E). Analise os gráficos e 
responda: 
javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206069594.');
 
Imagem: Leandro Pederneiras 
Qual dos gráficos acima (a, b, c, d ou e) é um filograma e um cronograma, respectivamente? 
 
 
Árvore d e e 
 
Árvore a e c 
 
Árvore d e a 
 
 
Árvore e e b 
 
 
Árvore b e e 
 
 
 
 
02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS 
 
 
 4. Ref.: 6045539 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
Uma árvore filogenética busca desvendar a história evolutiva de um grupo de organismos. 
Isso pode ser feito a partir da comparação de sequências biológicas. Uma boa estratégia é 
escolher um gene que todas as espécies comparadas possuam, e identificar a partir de 
alinhamentos as similaridades entre as sequências de cada espécie. Supondo que você irá 
comparar a sequência completa do gene para DNA polimerase de 50 espécies bacterianas 
diferentes, qual o tipo de alinhamento é o mais adequado nessa situação? 
 
 
Alinhamento simples e local. 
 
Alinhamento simples e múltiplo. 
 
Alinhamento local e global. 
 Alinhamento múltiplo e global. 
 
Alinhamento múltiplo e local. 
 
 
 5. Ref.: 6045362 Pontos: 0,00 / 1,00 
 
O programa BLAST é uma ferramenta disponível em vários bancos de dados como uma 
opção de busca. O portal do NCBI também conta com essa opção para que o usuário possa 
fazer buscas em bancos como GenBank e RefSeq. Qual tipo de dado biológico é usado pelo 
BLAST em suas execuções? 
 
 Artigos científicos. 
 
Número da atividade enzimática de proteínas. 
 
Estrutura tridimensional de proteínas. 
 Sequências de nucleotídeos ou aminoácidos. 
 
Anotação de função de proteínas. 
 
 
 6. Ref.: 6045329 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
Observe o alinhamento entre quatro sequências de proteínas mostrado na figura. Existem algumas 
posições que estão representadas com um traço (-), isso significa que nessas posições 
existem gaps. Marque a alternativa que apresenta o significado biológico correto de regiões 
de gaps. 
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javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206045362.');
javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206045329.');
 
Fonte: Wikimedia.org/CC by 3.0 
 
 
Gaps são regiões conservadas entre as sequências. 
 
Gaps são posição no alinhamento em que o resíduo é diferente entre as sequências 
comparadas. 
 
Gaps são mutações por substituição, representam troca de um aminoácido por outro. 
 Gaps são regiões de deleções ou inserções, em que algumas das sequências perderam ou 
ganharam uma nova "parte". 
 
Gaps é o total do somatório de matches subtraídos do número de mismatches ao longo do 
alinhamento. 
 
 
 
 
03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA 
 
 
 7. Ref.: 6055042 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
A anotação de um genoma consiste na identificação de suas regiões funcionais ou de 
relevância biológica ao longo das sequências de DNA. Dessa forma, podemos extrair dessas 
sequências a maior quantidade possível de dados úteis. Podemos dividir a anotação do 
genoma em etapa de predição gênica e etapa de anotação funcional. É importante saber 
que tipo de organismo foi sequenciado, procarioto ou eucarioto, na hora de escolher o 
software ideal, principalmente na etapa de predição de genes.Qual das afirmativas abaixo 
justifica essa necessidade? 
 
 
O código genético de procariotos é diferente daquele seguido pelos eucariotos. 
 A complexidade da estrutura gênica dos eucariotos é muito maior, por exemplo, 
possuem íntrons que interrompem as regiões codificantes. 
 
Organismos procariotos possuem RNA como material genético, enquanto os 
eucariotos possuem DNA. 
 
O material genético dos procariotos sofre mutações, enquanto o dos eucariotos não. 
 
Há muito poucas espécies de procariotos conhecidas, enquanto o número de 
espécies de organismos eucariotos é enorme. 
 
 
 8. Ref.: 6055040 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
Existem diferentes bancos de dados biológicos que podem ser acessados de acordo com o 
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javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206055040.');
interesse de pesquisa. Qual dos bancos abaixo é o principal reservatório de informações 
sobre sequências de proteínas, cujos dados são curados, validados por especialistas e 
revisados. 
 
 
PDB. 
 Swiss-Prot. 
 
PubMed. 
 
GenBank. 
 
KEGG. 
 
 
 
 
03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA 
 
 
 9. Ref.: 6075100 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
(adaptado de CESPE -2013-Química) O excesso de peso e uma alimentação rica em 
gordura podem causar alterações genéticas, segundo um estudo que analisou o genoma de 
703 pessoas obesas, magras e com excesso de peso. Nesse estudo, os pesquisadores 
mostraram que o gene LY86, possível contribuidor da obesidade, sofreu uma metilação 
sobre vários substratos. Os resultados revelam uma mudança química no genoma, como se 
o organismo se adaptasse ao "novo" ambiente. Considerando as informações apresentadas, 
é correto afirmar que a alteração sofrida pelo gene LY86 está relacionada. 
 
 
Ao aumento do splicing. 
 À taxa de transcrição gênica. 
 
À replicação. 
 
Ao número de cópias de DN. 
 
À sequência de bases nitrogenadas. 
 
 
 10. Ref.: 6075099 Pontos: 1,00 / 1,00 
 
Adaptada de UPENET/IAUPE - 2017 - UPE ¿ Biólogo) Ao compararmos um gene e uma proteína, 
ficamos restritos a tratar da sequência de DNA, que se estende entre os pontos correspondentes 
às extremidades da proteína. O processo pelo qual um gene dá origem a uma proteína é chamado 
expressão gênica. Nesse contexto, observe as sequências selvagem (esquerda) e mutante 
(direita) da cadeia β da hemoglobina. 
 
Para responder, utilize a tabela de códons a seguir: 
javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206075100.');
javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206075099.');
 
Após analisar as sequências de nucleotídeos normal e selvagem e a tabela de códon, analise a 
relação entre as assertivas a seguir: 
I. A diferença entre o DNA selvagem e mutante da cadeia β da hemoglobina, é devido a uma 
mutação silenciosa após a troca do nucleotídeo A pelo T. 
PORQUE 
II. A alteração no nucleotídeo de A pelo T não altera o aminoácido que é adicionado na cadeia 
peptídica, sendo nos dois casos adicionados a alanina. 
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: 
 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I. 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. 
 
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. 
 As asserções I e II são proposições falsas. 
 
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.