Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
isciplina: BIOINFORMÁTICA AV Aluno Professor: HERMES Turma: 9001 SDE4 30/10/2022 Avaliação: 4,0 Nota SIA: 02265 - ANÁLISE FILOGENÉTICA 1. Ref.: 6069489 Pontos: 0,00 / 1,00 Na figura a seguir vemos uma matriz com 3 táxons (A ao C) e 4 caracteres (1 ao 3). A seguir são listadas 5 topografias de árvores diferentes (A ao E). Analise a alternativa que está de acordo com a matriz táxon × caractere. 2. Ref.: Pontos: 0,00 / A seguir são apresentadas diferentes árvores filogenéticas (de A ao E). Analise os gráficos e responda: Imagem: Leandro Pederneiras Qual dos gráficos acima (a, b, c, d ou e) é um filograma e um cronograma, respectivamente? Árvore d e e Árvore e e b Árvore d e a Árvore b e e Árvore a e c 02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS 3. Ref.: 6045464 Pontos: 0,00 / 1,00 Pesquisadores do Grupo Pardini em parceria com a UFMG desenvolveram um teste de genotipagem para as variantes P.1 (Manaus), P.2 (RJ) e B.1.1.7 (Reino Unido) do SARS-CoV-2. A partir da sequência genética de cada uma das variantes do vírus causador da covid-19, eles desenvolveram um par de primers que vão "grudar" naquela sequência exata do vírus. (Fonte: https://www1.folha.uol.com.br/equilibrioesaude/2021/04/laboratorio-lanca-teste-capaz-de-identificar-variantes- do-coronavirus.shtml). Qual das características abaixo contribui para que os primers usados sejam bastante específicos para a região do genoma que contém a mutação? Comprimento suficientemente grande, maior que vinte nucleotídeos. Porcentagem baixa de guanina (G) e citosina (C) ao longo da sequência (menor que 40%). Temperatura de anelamento baixa, menor que 50°C. Temperatura de melting baixa, menor que 55°C. Produtos amplificados maiores que 100pb. 4. Ref.: 6045362 Pontos: 0,00 / 1,00 O programa BLAST é uma ferramenta disponível em vários bancos de dados como uma opção de busca. O portal do NCBI também conta com essa opção para que o usuário possa fazer buscas em bancos como GenBank e RefSeq. Qual tipo de dado biológico é usado pelo BLAST em suas execuções? Número da atividade enzimática de proteínas. Anotação de função de proteínas. Estrutura tridimensional de proteínas. Artigos científicos. Sequências de nucleotídeos ou aminoácidos. 5. Ref.: 6045329 Pontos: 1,00 / 1,00 Observe o alinhamento entre quatro sequências de proteínas mostrado na figura. Existem algumas posições que estão representadas com um traço (-), isso significa que nessas posições existem gaps. Marque a alternativa que apresenta o significado biológico correto de regiões de gaps. Fonte: Wikimedia.org/CC by 3.0 Gaps são mutações por substituição, representam troca de um aminoácido por outro. Gaps são posição no alinhamento em que o resíduo é diferente entre as sequências comparadas. Gaps são regiões de deleções ou inserções, em que algumas das sequências perderam ou ganharam uma nova "parte". Gaps são regiões conservadas entre as sequências. Gaps é o total do somatório de matches subtraídos do número de mismatches ao longo do alinhamento. 03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA 6. Ref.: 6054908 Pontos: 1,00 / 1,00 Os dados biológicos produzidos por várias técnicas experimentais e análises computacionais precisam ser armazenados em arquivos para posterior utilização. É um exemplo de formato de arquivo utilizado para guardar o resultado do processo de anotação gênica: JPEG (.jpeg). TEXTO (.txt). GenBank (.gbk). PDB (.pdb). FASTA (.fasta). 7. Ref.: 6055045 Pontos: 0,00 / 1,00 A Doença dos Legionários é causada por bactérias do gênero Legionella, principalmente por Legionella pneumophila, sendo caracterizada por uma pneumonia severa que afeta geralmente pessoas suscetíveis, tais como idosos e fumantes, por meio da inalação de aerossóis que contenham a bactéria. Um surto da Doença dos Legionários ocorrido em Vila Franca de Xira, Portugal, ganhou notoriedade pelo fato de ter estado associado à primeira forte evidência de transmissão pessoa a pessoa dessa doença. As mais de 400 pessoas infectadas no período do surto revelaram ser moradoras ou trabalhadoras da Vila Franca de Xira, ou ter estado naquela região no período do surto. No entanto, uma mulher de 74 anos, moradora da zona do Porto (outra região de Portugal), que contraiu a Doença dos Legionários nesse período, revelou não sair da sua zona de residência há muitos meses. O inquérito epidemiológico permitiu saber, no entanto, que o seu filho, trabalhador em Vila Franca de Xira e um dos responsáveis pela manutenção de uma torre de refrigeração indiciada como potencial causa do surto, tinha contraído a Doença dos Legionários uns dias antes e tinha se deslocado para a casa da mãe durante o período agudo da doença.Amostras respiratórias de mãe e filho foram enviadas para o laboratório, e a bactéria isolada foi sujeitada a estudo detalhado de sequenciamento. Foi possível verificar que as amostras de L. pneumophila isoladas dos dois doentes (mãe e filho) eram idênticas e não apresentavam qualquer mutação no DNA quando comparado às amostras do surto de Vila Franca de Xira. A ausência, na casa, de equipamentos potencialmente geradores de aerossóis, os resultados negativos para Legionella após coleta das amostras nas torneiras e chuveiro, associados ao elevado tempo de contato entre mãe e filho numa casa pequena e com pouco arejamento, permitiram concluir como única explicação possível para a infecção da mãe a existência de transmissão pessoa a pessoa da Doença dos Legionários. O estudo detalhado feito para desvendar esse caso da Doença dos Legionários contou com um tipo de análise ômica. Qual foi ela? Metabolômica. Transcriptômica. Lipidômica. Genômica. Proteômica. 03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA 8. Ref.: 6075099 Pontos: 0,00 / 1,00 Adaptada de UPENET/IAUPE - 2017 - UPE ¿ Biólogo) Ao compararmos um gene e uma proteína, ficamos restritos a tratar da sequência de DNA, que se estende entre os pontos correspondentes às extremidades da proteína. O processo pelo qual um gene dá origem a uma proteína é chamado expressão gênica. Nesse contexto, observe as sequências selvagem (esquerda) e mutante (direita) da cadeia β da hemoglobina. Para responder, utilize a tabela de códons a seguir: Após analisar as sequências de nucleotídeos normal e selvagem e a tabela de códon, analise a relação entre as assertivas a seguir: I. A diferença entre o DNA selvagem e mutante da cadeia β da hemoglobina, é devido a uma mutação silenciosa após a troca do nucleotídeo A pelo T. PORQUE II. A alteração no nucleotídeo de A pelo T não altera o aminoácido que é adicionado na cadeia peptídica, sendo nos dois casos adicionados a alanina. A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. As asserções I e II são proposições falsas. A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I. 9. Ref.: 6074929 Pontos: 1,00 / 1,00 Um gene hipotético apresente a seguinte sequência de nucleotídeos: ...CGT GCG TGT ACG GAA GCG ATG GGC ATA CTG TAA CCA ATA ATT ..... Uma mutação ocorreu na décima terceira base nitrogenada, da sequência apresentada, da esquerdapara a direita, substituindo-a por uma citosina. Assinale a alternativa que apresenta a sequência de bases CORRETA após ocorrida a transcrição deste gene: ...GTA CGC ACA TGC GTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ... ...GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ... ...GCT CGC UCU UGC CAA CGC AUC CCG AUC GAC UUA GGA AUA AUU ... ...GCA CGC ACA UCC CUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ... ...GTA CGC ACA TGC CTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ... 10. Ref.: 6075100 Pontos: 1,00 / 1,00 (adaptado de CESPE -2013-Química) O excesso de peso e uma alimentação rica em gordura podem causar alterações genéticas, segundo um estudo que analisou o genoma de 703 pessoas obesas, magras e com excesso de peso. Nesse estudo, os pesquisadores mostraram que o gene LY86, possível contribuidor da obesidade, sofreu uma metilação sobre vários substratos. Os resultados revelam uma mudança química no genoma, como se o organismo se adaptasse ao "novo" ambiente. Considerando as informações apresentadas, é correto afirmar que a alteração sofrida pelo gene LY86 está relacionada. À taxa de transcrição gênica. Ao número de cópias de DN. À replicação. À sequência de bases nitrogenadas. Ao aumento do splicing. 02265 - ANÁLISE FILOGENÉTICA 1. Ref.: 6069586 Pontos: 0,00 / 1,00 Analise a figura abaixo: Imagem: Leandro Pederneiras Considerando a figura acima, porque W é mais próximo relacionado a U do que a Y? Porque o ancestral de W e U viveram antes do ancestral de Y Porque W e U possuem um ancestral comum mais recente do que W e Y Porque W e U são mais similares entre si do que com Y. Porque W e Y possuem um ancestral comum mais recente do que W e U Porque W e U são separados somente por dois nós. 2. Ref.: 6069487 Pontos: 1,00 / 1,00 O estudo da classificação e evolução dos organismos é um dos principais assuntos da Biologia moderna. Isso tudo graças aos conceitos de Darwin e Wallace, no século XIX, e a metodologia de Hennig, no século XX. Sobre esse assunto podemos dizer que atualmente os cientistas procuram agrupar os organismos que possuem? Morfologias com funções descentralizadas Ancestral comum e todos os descendentes Linhagem ancestral polifilética Descendentes de linhagens modernas Hábitats amórficos 02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS 3. Ref.: 6045572 Pontos: 0,00 / 1,00 A frase abaixo está incorreta. "O NCBI contém o RefSeq, que representa a subdivisão do GenBank, que contém sequências de processamento alternativo de forma não curada e redundante em determinado genoma." Escolha a alternativa que explica onde está o erro. O RefSeq não é uma subdivisão do GenBank. O RefSeq não está contido no portal do NCBI. O RefSeq é um banco de dados de artigos científicos. O RefSeq não é um banco de dados. O RefSeq é um banco curado e não redundante. 4. Ref.: 6045642 Pontos: 0,00 / 1,00 O objetivo dos programas de alinhamento de sequências é encontrar o melhor pareamento possível, aquele que reflita o maior número de similaridade entre as sequências comparadas. Existem diferentes tipos e aplicações de alinhamento de sequências. Assim, o que é o alinhamento local de sequências? Alinhamento de três ou mais sequências. Alinhamento aproximado do perfeito. Alinhamento da extensão total das sequências envolvidas. Alinhamento de regiões das sequências envolvidas. Alinhamento de apenas duas sequências. 5. Ref.: 6045358 Pontos: 1,00 / 1,00 Sobre os tipos de programas de computador usados para o alinhamento de sequências biológicas, escolha a opção que melhor completa a frase abaixo: "Quando a comparação entre sequências exige muito tempo e poder computacional para ser executada, é indicada a utilização de um programa que realize alinhamento _ para acelerar o processo." Simples. Múltiplo. Ótimo. Global. Heurístico. 03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA 6. Ref.: 6055042 Pontos: 0,00 / 1,00 A anotação de um genoma consiste na identificação de suas regiões funcionais ou de relevância biológica ao longo das sequências de DNA. Dessa forma, podemos extrair dessas sequências a maior quantidade possível de dados úteis. Podemos dividir a anotação do genoma em etapa de predição gênica e etapa de anotação funcional. É importante saber que tipo de organismo foi sequenciado, procarioto ou eucarioto, na hora de escolher o software ideal, principalmente na etapa de predição de genes.Qual das afirmativas abaixo justifica essa necessidade? A complexidade da estrutura gênica dos eucariotos é muito maior, por exemplo, possuem íntrons que interrompem as regiões codificantes. Há muito poucas espécies de procariotos conhecidas, enquanto o número de espécies de organismos eucariotos é enorme. O código genético de procariotos é diferente daquele seguido pelos eucariotos. O material genético dos procariotos sofre mutações, enquanto o dos eucariotos não. Organismos procariotos possuem RNA como material genético, enquanto os eucariotos possuem DNA. 7. Ref.: 6055040 Pontos: 0,00 / 1,00 Existem diferentes bancos de dados biológicos que podem ser acessados de acordo com o interesse de pesquisa. Qual dos bancos abaixo é o principal reservatório de informações sobre sequências de proteínas, cujos dados são curados, validados por especialistas e revisados. KEGG. GenBank. PubMed. PDB. Swiss-Prot. 03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA 8. Ref.: 6075100 Pontos: 1,00 / 1,00 (adaptado de CESPE -2013-Química) O excesso de peso e uma alimentação rica em gordura podem causar alterações genéticas, segundo um estudo que analisou o genoma de 703 pessoas obesas, magras e com excesso de peso. Nesse estudo, os pesquisadores mostraram que o gene LY86, possível contribuidor da obesidade, sofreu uma metilação sobre vários substratos. Os resultados revelam uma mudança química no genoma, como se o organismo se adaptasse ao "novo" ambiente. Considerando as informações apresentadas, é correto afirmar que a alteração sofrida pelo gene LY86 está relacionada. Ao número de cópias de DN. À replicação. À sequência de bases nitrogenadas. Ao aumento do splicing. À taxa de transcrição gênica. 9. Ref.: 6074929 Pontos: 1,00 / 1,00 Um gene hipotético apresente a seguinte sequência de nucleotídeos: ...CGT GCG TGT ACG GAA GCG ATG GGC ATA CTG TAA CCA ATA ATT ..... Uma mutação ocorreu na décima terceira base nitrogenada, da sequência apresentada, da esquerda para a direita, substituindo-a por uma citosina. Assinale a alternativa que apresenta a sequência de bases CORRETA após ocorrida a transcrição deste gene: ...GTA CGC ACA TGC GTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ... ...GTA CGC ACA TGC CTT CGC TAC CCT TAT GAC GGT TAT TAA ... ...GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ... ...GCT CGC UCU UGC CAA CGC AUC CCG AUC GAC UUA GGA AUA AUU ... ...GCA CGC ACA UCC CUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ... 10. Ref.: 6075097 Pontos: 1,00 / 1,00 Analise a seguir a seguinte sequência de nucleotídeos encontradas após a transcrição, na fita pré-RNAm: ....GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA.... Na sequência as regiões sublinhadas representam os íntrons e a região sem estar sublinhada representa os éxons. Assinale a alternativa que apresenta a sequência de bases CORRETA após a síntese do RNAm. CGT GCG TGT ACG CAA GCG ATG GGC ATA CTG TAA CCA ATA ATT GCA CGC GUU CGC CCG UAU UAU UAA GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA ACA UGC UAC GAC AUU GGU GCA CGC ACA GUU CGC UAC BIOINFORMÁTICA AV 05/10/2022 16:02:04 (F) Avaliação: 6,0 Av. Parcial.: Nota SIA: 6,0 pts 02265 - ANÁLISE FILOGENÉTICA1. Ref.: 6069792 Pontos: 1,00 / 1,00 A construção da árvore filogenética começa no tempo atual e vai estimando as relações no tempo passado. Os fósseis servem como retratos de um período da evolução e fornecem importantíssimas compreensões. Numa árvore filogenética, o fóssil é representado por um ramo em que seu ponto terminal está numa idade anterior a atual. Todas as espécies vivas, entretanto, terminam alinhadas na parte mais extrema do gráfico, representando a idade atual. Para a construção de uma árvore uma metodologia empregada é a máxima parcimônia. Assim, uma matriz de táxon/caracter produz uma única árvore parcimoniosa de comprimento 43. A que se refere o número 43? É o número de mudanças de estado do caractere necessárias para explicar todos os dados na árvore. É o número de caracteres previamente escolhidos. É o número de clados da árvore mais parcimoniosa. É a probabilidade posterior de uma árvore ser escolhida. É a maior probabilidade de uma árvore ser escolhida. 2. Ref.: 6069682 Pontos: 1,00 / 1,00 A inferência Bayesiano é um método que avaliar a probabilidade posterior de uma árvore. Qual das afirmações a seguir é verdadeira para as probabilidades posteriores? Hipóteses com probabilidades posteriores menores são favorecidas em relação àquelas com valores maiores. Usa o teorema de Bayes. Não dependem da escolha de um modelo. Pode ser calculada exclusivamente pelo teorema de Pitágoras. Não precisam de dados adicionais. 02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206069792.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206069682.'); 3. Ref.: 6045575 Pontos: 0,00 / 1,00 Sobre a figura abaixo, é correto afirmar que: Fonte: LarsonGCD/Wikimedia.org/CC BY 3.0 https://commons.wikimedia.org/wiki/File:FAM149A_Promoter_region_(FASTA_format).png Ilustra uma sequência de aminoácidos no formato FASTA. Mostra uma sequência de nucleotídeos no formato PDF. Apresenta o formato FASTA de uma sequência de nucleotídeos. Representa o formato Docx de uma sequência de aminoácidos. Exibe uma sequência de nucleotídeos em formato PDB. 4. Ref.: 6045362 Pontos: 1,00 / 1,00 como uma opção de busca. O portal do NCBI também conta com essa opção para que o usuário possa fazer buscas em bancos como GenBank e RefSeq. Qual tipo de dado biológico é usado pelo BLAST em suas execuções? Anotação de função de proteínas. Sequências de nucleotídeos ou aminoácidos. Número da atividade enzimática de proteínas. Estrutura tridimensional de proteínas. Artigos científicos. 5. Ref.: 6045336 Pontos: 0,00 / 1,00 Qual ferramenta é uma das mais comuns em bioinformática para alinhamento múltiplo de sequências biológicas de forma heurística? BLAST. GenBank. Clustal. Primer3. javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206045575.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206045362.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206045336.'); PubMed. 03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA 6. Ref.: 6054915 Pontos: 0,00 / 1,00 O sequenciamento de DNA é a técnica utilizada para estudos genômicos. Existem diferentes aparelhos capazes de determinar a ordem de nucleotídeos do genoma. Porém, determinado tipo de abordagem de sequenciamento é o mais indicada, devido à rapidez da obtenção dos resultados e aos menores custos. Qual é essa abordagem? Sanger. Microarranjo. Nova geração. Espectrometria. PCR. 7. Ref.: 6055049 Pontos: 1,00 / 1,00 O termo proteômica foi inicialmente utilizado em 1995. Ao longo dos anos, a análise proteômica é uma área que vem se desenvolvendo com grande rapidez, permitindo relacionar as informações com a obtida por essa análise com outras abordagens, a partir da Bioinformática. Sobre a análise proteômica, leia as alternativas a seguir e assinale a alternativa correta. Podemos analisar todo conjunto de proteínas produzido por uma célula utilizando, por exemplo, o sequenciamento de Sanger. Quando estudamos o proteoma estamos analisando metabólitos e proteínas. A proteômica é útil para detecção de mutações pontuais ao longo das sequências de DNA. A análise proteômica permite a detecção de modificações pós-traducionais, o que amplia a relevância biológica dos dados obtidos. A análise proteômica e a análise da expressão gênica no nível de RNA apresentam resultados redundantes, e podemos escolher entre uma ou outra. 03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA 8. Ref.: 6075023 Pontos: 1,00 / 1,00 Observe a figura a seguir: javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206054915.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206055049.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206075023.'); Conceitualmente, a estrutura das proteínas pode ser dividida em quatro diferentes níveis de organização: primário, secundário, terciário e quaternário. Baseado na figura e em seus conhecimentos, assinale a alternativa correta. A estrutura terciária é formada por α-hélices, folhas-β e regiões de loop. A estrutura secundária é formada pela união de diferentes subunidades. A estrutura quaternária é formada pelas interações entre as α-hélices, folhas-β e regiões de loop de uma única subunidade. A estrutura terciária é constituída pelas ligações peptídicas, interações entre resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica. A estrutura primária é constituída pelas ligações peptídicas, que são interações entre resíduos de aminoácidos formando uma cadeia peptídica. 9. Ref.: 6075099 Pontos: 0,00 / 1,00 Adaptada de UPENET/IAUPE - 2017 - UPE ¿ Biólogo) Ao compararmos um gene e uma proteína, ficamos restritos a tratar da sequência de DNA, que se estende entre os pontos correspondentes às extremidades da proteína. O processo pelo qual um gene dá origem a uma proteína é chamado expressão gênica. Nesse contexto, observe as sequências selvagem (esquerda) e mutante (direita) da cadeia β da hemoglobina. Para responder, utilize a tabela de códons a seguir: javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206075099.'); Após analisar as sequências de nucleotídeos normal e selvagem e a tabela de códon, analise a relação entre as assertivas a seguir: I. A diferença entre o DNA selvagem e mutante da cadeia β da hemoglobina, é devido a uma mutação silenciosa após a troca do nucleotídeo A pelo T. PORQUE II. A alteração no nucleotídeo de A pelo T não altera o aminoácido que é adicionado na cadeia peptídica, sendo nos dois casos adicionados a alanina. A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I. As asserções I e II são proposições falsas. 10. Ref.: 6075097 Pontos: 1,00 / 1,00 Analise a seguir a seguinte sequência de nucleotídeos encontradas após a transcrição, na fita pré-RNAm: ....GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA.... Na sequência as regiões sublinhadas representam os íntrons e a região sem estar sublinhada representa os éxons. Assinale a alternativa que apresenta a sequência de bases CORRETA após a síntese do RNAm. GCA CGC ACA GUU CGC UAC GCA CGC ACA UGC GUU CGC UAC CCG UAU GAC AUU GGU UAU UAA CGT GCG TGT ACG CAA GCG ATG GGC ATA CTG TAA CCA ATA ATT javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206075097.'); GCA CGC GUU CGC CCG UAU UAUUAA ACA UGC UAC GAC AUU GGU 1a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Na era pós-moderna, com o advento e a consolidação da revolução robótica no século XX, foi possível aprimorar a criação de tecnologias computacionais nas mais variadas áreas do conhecimento, o que tem provocado profundas mudanças sociais em âmbito individual e coletivo. Nesse cenário, a bioinformática ou biocomputação surge na década de 1980, a fim de superar as fronteiras das ciências pelo desenvolvimento de novas abordagens capazes de promover a análise e a apresentação de dados biológicos, bem como de garantir a investigação de novos métodos para a resolução de complexas perguntas. Fonte: ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. Sobre a bioinformática analise as afirmativas a seguir: I. A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que combina diferentes disciplinas, com destaque para a Estatística, biologia, química, informática e física. II. A bioinformática possibilitou a interpretação da linguagem dos de genes por algoritmos. III. Atualmente, os programas de computadores estão muito modernos, e é possível realizar todas grandes análises de forma rápida e precisa, como prever a ligação de diferentes átomos em uma molécula. É correto o que se afirma em: I e II. III. I. I e III. II. Respondido em 06/09/2022 22:09:03 Explicação: Existem diversas ciências envolvidas com a bioinformática, que desfrutam do seu avanço, entretanto as áreas mais intimamente ligadas de acordo com a questão 17 são: Estatística, biologia, química, informática e física. Essa nova ciência permitiu que algoritmos fossem criados auxiliando na interpretação de genes, alinhamentos dos genes, descobrir sequências e funções de genes desconhecidas. No entanto, ainda precisamos de programas de computadores mais avançados, para por exemplo, analisar as dinâmicas moleculares (interação de átomos de diferentes proteínas), mas complexas e mais longas. 2a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Desde a descoberta da estrutura do DNA e do desenvolvimento da biologia molecular, o homem vem buscando novas alternativas que o auxiliem na busca por maior fluidez nos trabalhos de pesquisa, acelerando a geração de processos e produtos. A bioinformática tem contribuído para avanços na pesquisa básica, mas também na ciência aplicada (....). Fonte: adaptado de ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. A seguir são listadas algumas aplicações da bioinformática. Analise as afirmativas a seguir: I. Identificação de alvos proteicos com potencial para serem modificados diretamente pela interação com fármacos. II. A identificação de moléculas que poderão atuar como princípio ativo na elaboração de produtos terapêuticos, inibindo ou acelerando certas reações bioquímicas, poderá apresentar efeitos sobre a cura ou a atenuação da doença. III. Proporcionar melhor entendimento dos processos evolutivos e das relações filogenéticas. IV. Amplificação do material genético para a verificação quantitativa e qualitativa de um determinado DNA em uma amostra biológica. V. Identificar a expressão gênica durante um tumor, identificar suas alterações para que genes defeituosos, ausentes ou superativados sejam reconstruídos ou desligados, para garantir o desenvolvimento de medidas terapêuticas ou preventivas contra tumores e agentes infecciosos. Assinale a opção correta. Apenas III e IV. I, II e III. I, II, III e V. Apenas II. Apenas I. Respondido em 06/09/2022 22:12:50 Explicação: A bioinformática é a ciência integra essencialmente o desenvolvimento de programas computacionais para tratar dados biológicos preexistentes e identificar sequências de genes, predizer a configuração tridimensional das proteínas, identificar inibidores enzimáticos, promover o agrupamento de proteínas, estabelecer árvores filogenéticas e analisar experimentos da expressão gênica. No entanto, ela não amplifica o DNA para a sua detecção em uma amostra biológica, essa análise é realizada pela reação de polimerase da cadeia, que pode apenas detectar a presença (qualitativa) ou então verificar a concentração (quantitativa). As demais alternativas estão corretas. 3a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Sobre a técnica de modelagem molecular analise a relação entre as afirmativas a seguir: I. O método de modelagem a ser escolhido depende da igualdade. PORQUE II. Uma igualdade superior a 25% podemos optar pela modelagem por homologia. Se for abaixo desse valor e tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos modelagem por ab initio, caso não, optamos pela modelagem threading. A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I. A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. As asserções I e II são proposições falsas. As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. Respondido em 06/09/2022 22:01:34 Explicação: O método de modelagem a ser escolhido depende da identidade, caso seja acima de 25% podemos optar pela modelagem por homologia, se for abaixo desse valor e tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos modelagem por treading, caso não realizamos a modelagem por ab initio. 4a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 (UFSM, 2006, Biólogo) As temperaturas são essenciais para realização da amplificação do DNA por PCR. Associe a segunda coluna com a primeira. 1. de 0°C a 10°C 2. de 35°C a 65°C 3. 72°C 4. 82°C 5. de 90°C a 96°C ( ) Maior probabilidade de alinhamento dos primers com a fita molde. ( ) Formação de fitas-molde a partir de todos os seguimentos. ( ) Ideal para ação da enzima Taq-DNA-polimerase. ( ) Ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3'. ( ) Estabelecimento de ligações - pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers. 2 - 3 - 1 - 3 - 4. 2 - 5 - 3 - 3 - 2. 3 - 4 - 5 - 4 - 2. 5 - 4 - 1 - 5 - 3. 4 - 2 - 3 - 2 - 1. Respondido em 06/09/2022 21:12:29 Explicação: Durante a etapa de desnaturação, a temperatura está entre 90-96°C e a dupla fita do DNA se separa, por desnaturação, etapa em que ocorre a formação de fitas-molde a partir de todos os seguimentos. O anelamento ocorre entre 35°C a 65°C, quando os primers se anelam na região complementar do molde, esse é o momento de estabelecimento de ligações ¿ pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers. Após, a DNA polimerase pode adicionar os nucleotídeos, em 72°C, essa é a temperatura ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3¿. Durante o ciclo do PCR, a faixa entre 0°C a 10°C e as temperaturas de 82°C não são utilizadas. 5a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Em uma análise utilizando a PCR, Lucas encontrou como resultado a amplificação de várias regiões diferentes do DNA das amostras analisadas. O que ele esperava era encontrar apenas uma região amplificada, somente nas amostras positivas. Para solucionar o problema, seu chefe sugeriu, então, que ele desenhasse um novo par de primers e prestasse atenção no comprimento em nucleotídeos, para melhorar a especificidade. Você diria para Lucas desenhar um novo par de primers com um comprimento maior ou menor que o par de primers que ele havia usado primeiro? Menor, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo. Maior, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma. Igual, pois o comprimento nãointerfere na especificidade dos primers. Maior, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo. Menor, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma. Respondido em 06/09/2022 22:27:39 Explicação: A especificidade de um primer garante que a região copiada seja realmente a que você deseja, e não outra qualquer. No caso exposto, houve amplificação de várias sequências não desejadas e, para melhorar a especificidade, faz-se necessário aumentar o número de nucleotídeos, pois quanto maior o comprimento de um primer, mais específico ele é. Sequências pequenas de primers podem ocorrer aleatoriamente ao longo do DNA, e não somente na região de interesse. Quando você usa mais nucleotídeos, você específica melhor o alvo e permite que ele seja amplificado apenas na região desejada. 6a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 (PR4 - UFRJ - Biólogo -UFRJ - Biologia Molecular - 2016) Um pesquisador e sua equipe acabam de obter a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo antes desconhecido. Querendo saber se esse gene ou um gene similar está presente no genoma humano, ele deve recorrer à seguinte ferramenta de bioinformática: BLAST. Mega. Velvet. Multialignm. GenBank. Respondido em 06/09/2022 22:20:47 Explicação: O BLAST é um software para alinhamento simples e local de sequências biológicas. Essas sequências podem ser de nucleotídeos ou aminoácidos. Como o pesquisador quer descobrir se a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo antes desconhecido está presente no genoma humano, essa é a ferramenta mais aplicada, pois ele vai comparar sequências simples. O Mega é um software para análises filogenéticas. Multialignm é um programa para alinhamento múltiplo de sequências. Velvet é um algoritmo para montagem de genomas. GenBank é um banco de dados. 7a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Um grande avanço da bioinformática aconteceu durante a execução do Projeto Genoma Humano, que durou mais de 10 anos e teve como objetivo principal determinar a ordem dos nucleotídeos de todo genoma da nossa espécie. Essa empreitada científica estimulou o aprimoramento de computadores e de programas para lidar com a grande quantidade de dados que começou a ser gerada. Hoje vivemos o que é chamado de ¿era pós- genômica¿, como o desenvolvimento e aperfeiçoamento de técnicas e programas que permitem estudar outras ciências ômicas. De acordo com as ciências ômicas, analise as afirmativas a seguir: I. Genética é o estudo de todo o DNA de um indivíduo. II. Metabolômica estuda moléculas de baixo peso molecular produzidas por uma célula. III. Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de uma amostra de seu RNA. Quais são as afirmativas corretas? Somente a afirmativa de número 1 está correta. Somente a afirmativa 2 está correta. As afirmativas 1 e 3 estão corretas. As afirmativas 1 e 2 estão corretas. Somente a afirmativa de número 3 está correta. Respondido em 06/09/2022 22:24:31 Explicação: O estudo de todo o DNA de um indivíduo é chamado de genômica. A genética é a parte da ciência que estuda a hereditariedade, a estrutura e a função dos genes e a variação dos seres vivos. Na genética estudamos genes individuais. Às vezes, genética e genômica são usadas indistintamente, mas têm significados diferentes. Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de uma amostra de seu DNA. 8a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 (CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular) Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que permite medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta. A técnica em questão é empregada em estudos proteômicos, visto que permite a identificação direta das proteínas expressas. As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas de lipídios. A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de agarose. A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com brometo de etídio. O microarranjo de DNA consiste em um arranjo predefinido de moléculas de DNA quimicamente ligadas a uma superfície sólida. Respondido em 06/09/2022 21:43:57 Explicação: A técnica em questão é empregada em estudos transcriptômicos, visto que permite a identificação direta das RNAs expressas. Para a técnica, são utilizadas lâminas de vidro revestidas com sondas de DNA. A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com corantes fluorescentes. A detecção é realizada por meio de detecção da fluorescência. 9a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Durante uma análise cadeia Markoviana Monte Carlo (MCMC), o que determina quando uma cadeia se move da árvore atual para uma nova árvore? A cadeia Markoviana sempre aceitará uma proposta que seja consistente com a anterior. A cadeia rejeitará uma proposta que produza uma probabilidade de log maior do que o estado atual. A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado atual. A cadeia Markoviana aceitará uma proposta com uma probabilidade que é fixada no início da pesquisa. A probabilidade de aceitar uma proposta depende da razão entre as probabilidades posteriores entre o estado atual e proposto. Respondido em 06/09/2022 22:27:01 Explicação: Gabarito: A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado atual. Justificativa: Uma geração MCMC sempre aceita o novo estado se a probabilidade, ou log, for maior que o estado atual. A geração MCMC não é calculada por uma razão, nem possui uma probabilidade fixada de início. Na cadeia Markoviana, o novo estado é sempre aceito quando possui melhor probabilidade. As vezes a cadeia Markoviana Monte Carlo pode aceitar um ponto pior do que o anterior. Isso ocorre raramente. 10a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 O quadro a seguir mostra uma matriz de dados táxons x caracteres, sendo apresentados 9 espécies (de A ao I) e 9 caracteres (de 1 ao 9): Como uma análise de parcimônia seria afetada pela remoção das duas primeiras posições (1 e 2) e da última posição (9) da matriz de dados fornecida? A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará, e nem seu comprimento. A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará; a árvore ótima terá três etapas a mais. A topologia de árvore ideal certamente mudará; a árvore ótima será menor. A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará; a árvore ótima será três etapas mais curta. A topologia de árvore ideal pode ou não mudar; o comprimento ideal da árvore pode ser maior ou menor. Respondido em 06/09/2022 22:27:24 Explicação: Gabarito: A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará, e nem seu comprimento. Justificativa: Os caracteres que estão na posição 1, 2 e 9 na matriz de dados não possui variação de estados, ou seja, ao analisar a matriz de dados vemos que em todas as espécies (de A a I) na posição 1 temos a base C, na posição 2 a base G e na posição 9 a base C. Isso significa que elas não trazem informações que possam diferenciar um táxon ou um conjunto de táxons. Assim, a retirada destes caracteres, por tanto, não modifica a topologia e o comprimento de ramos, pois não houve alteração. A modificação na topografia só seria obtida caso tivesse alteração nos carateres entre os táxons, assim todas as outras alternativas estão falsas. 1a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 As proteínas são biomoléculas construídas a partir de ligações peptídicas formadas no ribossomo,com a sua sequência dada pela ordem dos códons de RNAm, que foram transcritos do DNA. A forma que as proteínas se consolidam depende dos resíduos de aminoácidos que as compõem. Dentre os aminoácidos existem quatro classes: com carga (positivo ou negativo), polares (sem carga), apolares e os casos especiais (que se comportam de forma única). Sobre esse assunto analise as afirmativas a seguir: I. Os aminoácidos são classificados em dois grandes grupos, são eles polares ou apolares. II. O conjunto total das interações entre os resíduos forma a conformação final da proteína (basicamente a forma tridimensional que ela assume) e esta é fundamental para sua função. III. A interação entre os aminoácidos ligações de hidrogênio formando α-hélices ou dobrando sua estrutura. É correto o que se afirma em: I e II, apenas. I e III, apenas. II e III, apenas. II, apenas. I, apenas. Respondido em 05/09/2022 18:50:02 Explicação: Existem quatro classes que os aminoácidos podem se incluir são eles: com carga polares (positivo ou negativo), polares sem carga, apolares e os casos especiais (que se comportam de forma única). Dependendo da carga dos aminoácidos que compõem uma sequência de peptídeos pode ocorrer uma interação do tipo ligação de hidrogênio e assim formar uma α- hélice ou dobrar a sua estrutura, ou uma repulsão. Essas interações podem irão fornecer a estrutura de cada proteína. Cada conformação tridimensional é de extrema importância para o funcionamento da proteína, pois irá possibilitar interação com enzimas, cofatores, funcionar como um canal para a passagem seletiva de alguma substância, entre outras funções. 2a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 O alinhamento molecular é a técnica importante dentro da bioinformática e para o desenvolvimento de um novo alvo terapêutico representa a primeira etapa a ser realizada. Com relação ao alinhamento molecular marque a alternativa correta: O alinhamento é capaz de armazenar informações que serão usadas para transcrever o DNA em RNAm. É a técnica responsável por combinar duas sequencias de DNA ou proteínas para que possamos identificar qual é a correta. É a técnica responsável por alinhar proteínas que serão utilizadas em uma simulação, dentro de um ambiente virtual, o mais próximo possível da realidade. É capaz de identificar se diferentes espécies possuem alguma relação evolutiva ou gene com função em comum. O alinhamento é capaz de modelar proteínas tridimensionais, que irão auxiliar em diversas outras técnicas de bioinformática. Respondido em 05/09/2022 18:04:12 Explicação: O alinhamento molecular é feito pela correlação de duas ou mais sequencias de DNA ou proteínas, a partir de um algoritmo de pontuação. Assim podemos identificar genes que compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também usar o alinhamento para encontrar proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. O alinhamento não armazenar informações que serão usadas para transcrever o DNA em RNAm, não compara sequencias para dizer qual é a correta, não realiza o modelamento de proteínas e não realiza a modelagem molecular, etapa posterior ao alinhamento e não tem a finalidade de alinhar proteínas o mais próximo da realidade, e sim encontrar os melhores alinhamentos entre as proteínas já cadastradas no banco de dados. 3a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 (adaptada de IBADE - 2018 - Prefeitura de Presidente Kennedy - ES - Biólogo ) As informações genéticas nos seres vivos são codificadas por bases nitrogenadas que constituem os ácidos nucléicos. Analise as sequências de nucleotídeos a seguir. Fita 1 - CCCTATACGCTAGCATGACTT Fita 2 - GGGATATGCGATCGTACTGAA A seguir são listadas algumas características sobre as fitas de nucleotídeo 1 e 2. Assinale a alternativa correta: Se considerarmos a fita 1 como a fila molde, o RNAm formado por esta sequência apresentará as mesmas bases nitrogenadas da fita 2. Na fita 1 existem 30 códons e 15 nucleotídeos. As fitas analisadas constituem um segmento de uma molécula de RNA. As fitas 1 e 2 são complementares, formando juntas um segmento do DNA. Na fita 1 e 2 existem 21 códons e 07 nucleotídeos Respondido em 05/09/2022 18:49:50 Explicação: Tanto a sequência de nucleotídeos 1 e 2 apresentam 21 nucleotídeos e 7 códons (um códon equivale a 3 nucleotídeos). Como ambas as fitas apresentam as bases C, G, A e T elas são representativas do DNA e não do RNA. Para ser uma fita de RNA deveria apresentar as bases C, G, A e U. Além disso, se observarmos as fitas vemos que 1 e 2 são complementares, ou seja, no lugar que temos uma base C na outra fita equivale a G, e no lugar que temos uma base A na outra fita equivale a t e vice-versa, representando as duas fitas de DNA, que são complementares entre si. 4a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 O PubMed é um dos bancos de dados disponíveis no portal do NCBI. A partir dele, podemos buscar por artigos científicos da área biomédica publicados por cientistas em todo o mundo. Caso você queira direcionar a sua busca para obter artigos mais adequados ao seu interesse, o que poderia ser feito? Não existe a possibilidade de direcionar a busca, é necessário avaliar todos os títulos que aparecem como resultado para escolher aqueles mais adequados. Utilizar os filtros de busca, que incluem ano e tipo de artigo, por exemplo, ou, ainda, optar pela busca avançada. Cadastrar seus dados profissionais e receber uma autorização para acessar a parte restrita do PubMed que permite buscas avançadas. Acessar o PubMed por meio de rede de Internet de instituição pública, como universidades ou bibliotecas. Só assim é possível direcionar a busca por artigos. Pagar uma assinatura mensal ao PubMed para que ele direcione automaticamente suas buscas de acordo com os critérios que você deseja. Respondido em 05/09/2022 18:49:45 Explicação: Qualquer usuário pode acessar ao PubMed, via NCBI, e fazer buscas direcionadas usando filtro ou o modo avançado. Pode acontecer de alguns dos artigos que aparecem como resultados não estejam disponíveis para leitura de todo o conteúdo, mas isso depende da revista em que o artigo foi publicado, e não do PubMed. 5a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Em uma análise utilizando a PCR, Lucas encontrou como resultado a amplificação de várias regiões diferentes do DNA das amostras analisadas. O que ele esperava era encontrar apenas uma região amplificada, somente nas amostras positivas. Para solucionar o problema, seu chefe sugeriu, então, que ele desenhasse um novo par de primers e prestasse atenção no comprimento em nucleotídeos, para melhorar a especificidade. Você diria para Lucas desenhar um novo par de primers com um comprimento maior ou menor que o par de primers que ele havia usado primeiro? Menor, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma. Igual, pois o comprimento não interfere na especificidade dos primers. Maior, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma. Menor, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo. Maior, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo. Respondido em 05/09/2022 18:49:08 Explicação: A especificidade de um primer garante que a região copiada seja realmente a que você deseja, e não outra qualquer. No caso exposto, houve amplificação de várias sequências não desejadas e, para melhorar a especificidade, faz-se necessário aumentar o número de nucleotídeos, pois quanto maior o comprimento de um primer, mais específico ele é. Sequências pequenas de primers podem ocorrer aleatoriamente ao longo do DNA, e nãosomente na região de interesse. Quando você usa mais nucleotídeos, você específica melhor o alvo e permite que ele seja amplificado apenas na região desejada. 6a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 (UFSM, 2006, Biólogo) As temperaturas são essenciais para realização da amplificação do DNA por PCR. Associe a segunda coluna com a primeira. 1. de 0°C a 10°C 2. de 35°C a 65°C 3. 72°C 4. 82°C 5. de 90°C a 96°C ( ) Maior probabilidade de alinhamento dos primers com a fita molde. ( ) Formação de fitas-molde a partir de todos os seguimentos. ( ) Ideal para ação da enzima Taq-DNA-polimerase. ( ) Ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3'. ( ) Estabelecimento de ligações - pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers. 2 - 5 - 3 - 3 - 2. 3 - 4 - 5 - 4 - 2. 4 - 2 - 3 - 2 - 1. 2 - 3 - 1 - 3 - 4. 5 - 4 - 1 - 5 - 3. Respondido em 05/09/2022 18:40:40 Explicação: Durante a etapa de desnaturação, a temperatura está entre 90-96°C e a dupla fita do DNA se separa, por desnaturação, etapa em que ocorre a formação de fitas-molde a partir de todos os seguimentos. O anelamento ocorre entre 35°C a 65°C, quando os primers se anelam na região complementar do molde, esse é o momento de estabelecimento de ligações ¿ pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers. Após, a DNA polimerase pode adicionar os nucleotídeos, em 72°C, essa é a temperatura ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3¿. Durante o ciclo do PCR, a faixa entre 0°C a 10°C e as temperaturas de 82°C não são utilizadas. 7a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Julgue as afirmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos. I - Existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas. II - Os bancos de dados biológicos só podem ser acessados mediante o pagamento de uma mensalidade pelo usuário. III - Quanto mais detalhado o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais confiáveis eles são. As afirmativas I e II são proposições verdadeiras, enquanto a III é falsa. As afirmativas I e III são proposições verdadeiras, e a II é uma proposição falsa. A afirmativa III é uma proposição verdadeira, enquanto I e II são proposições falsas. A afirmativa I é uma proposição verdadeira, e II e III são proposições falsa. As afirmativas I, II e III são proposições verdadeiras. Respondido em 05/09/2022 17:57:53 Explicação: A maioria dos bancos de dados biológicos mais conhecidos e utilizados são aqueles cujo acesso é livre, isto é, qualquer um pode acessar e obter os dados armazenados. Eles são muito úteis para o compartilhamento de informações e verificação da veracidade de dados divulgados por cientistas. No entanto, existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas, e quanto mais detalhado for o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais confiáveis eles são. 8a Questão Acerto: 1,0 / 1,0 Diferentes tipos de dados biológicos podem ser armazenados em bancos de dados computacionais. Em relação aos tipos de bancos de dados biológicos, relacione as duas colunas. 1. Curado. 2. Acesso livre. 3. Especializado 4. Primário. ( ) Armazenam informações biológicas originais, resultados de experimentos científicos. ( ) Banco que contém informações processadas por um profissional com uma boa experiência no assunto. ( ) Reúnem todo conteúdo que atende a um interesse em particular, por exemplo, sobre o HIV. ( ) Está disponível para qualquer tipo de usuário, sem restrição de acesso. Qual a sequência correta? 4-1-3-2. 4-3-2-1. 1-2-3-4. 2-4-1-3. 1-3-2-4. Respondido em 05/09/2022 18:25:07 Explicação: Os bancos de dados podem ser categorizados de acordo com a disponibilidade de acesso, com o conteúdo dos dados armazenados e com a qualidade deles. O acesso pode ser livre ou restrito; o conteúdo pode ser de dados brutos ou processados, referindo-se a sequências biológicas, estruturas 3D, anotação funcional de proteínas, dentre outros. No que diz respeito à qualidade, um banco curado é aquele que passou pela análise de profissionais especialistas no assunto. Um banco primário é aquele que armazena informações biológicas originais, resultados de experimentos científicos, e um banco especializado reúne todo conteúdo que atende a um interesse em particular, por exemplo, sobre o HIV. 9a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Observe o caldograma abaixo: Imagem: Leandro Pederneiras A seguir são listadas alguns grupos de espécies. Analise as alternativas que, segundo o cladograma, se refere a um grupo polifilético. O conjunto de espécies A B C D O conjunto de espécies H I O conjunto de espécies N O P O conjunto de espécies W X Y O conjunto de espécies S T Respondido em 05/09/2022 18:45:31 Explicação: Gabarito: O conjunto de espécies H I Justificativa: O grupo polifilético é um conjunto de táxons que não inclui o ancestral comum de todos os seus membros. Ao analisar as alternativas, aquela que representa um grupo prolifilético, é o conjunto de espécies H I porque possuem origem em linhagens amplamente desconexas. Os conjuntos de espécies listados nas outras alternativas (conjunto de espécies N, O, P; conjunto de espécies W X Y; conjunto de espécies A B C D e o conjunto de espécies S T) apresentam um ancestral comum. 10a Questão Acerto: 0,0 / 1,0 Analise a figura a seguir: Imagens: Leandro Pederneiras Analisando as árvores da esquerda e direita é possível afirmar que: São perfeitamente similares, apenas a forma de apresentação mudou e alguns ramos giraram em seu próprio eixo. Possuem topologias idênticas, mas a árvore da direita possui nós mais profundos. São árvores diferentes porque possuem relações entre grupos diferentes. O grupo A B C D E é mais próximo relacionado ao grupo I J K L M na árvore da esquerda do que na da direita. Alguns clados foram cortados e colados em diferentes ramos na árvore da direita. Respondido em 05/09/2022 18:46:52 Explicação: Gabarito: São perfeitamente similares, apenas a forma de apresentação mudou e alguns ramos giraram em seu próprio eixo. Justificativa: As duas imagens correspondem a um cladograma, nesse tipo de árvore não é possível saber a profundidade exata dos nós porque não possui uma escala de tempo. As duas árvores são idênticas em seus relacionamentos (topologia), apenas com ramos torcidos em seus próprios eixos, pela alteração da forma (retangular e diagonal, respectivamente). Os grupos A B C D E e I J K L M estão na mesma posição nas árvores, apenas com ramos torcidos, sendo assim não mudam a relação de proximidade. Não houve corte nas árvores que justificaria a mudança de topografia entre as árvores.
Compartilhar