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Genética Molecular Aplicada ao Melhoramento Animal Introdução: - Melhoramento Genético: seleção e acasalamentos; - Avaliações genéticas: qualidade informações; - Características quantitativas; - QTL- região que possui 1 ou mais características quantitativas; - Genômica e genotipagem; - Marcadores moleculares; - GWAS; - Seleção genômica. Características Quantitativas: - Afetadas por muitos genes, de pequeno efeito individual, muito influenciadas pelo ambiente. • Lócus de genes que influenciam características quantitativas -> QTL (quantitative trait loci) Genômica: - Área da ciência que estuda todo o genoma de um organismo; - 2,4 bilhões de pares de genomas no cão. Genômica no Melhoramento Animal: - Avanços na biologia molecular: • Incorporação de informações coletadas diretamente do genoma dos animais nas avaliações genéticas - Marcadores Moleculares: fragmentos de DNA polimórficos que diferenciam indivíduos geneticamente relacionados, mediante diferenças na sequência do DNA; - Variações na sequência de DNA. Marcadores Moleculares: Aplicações na Medicina Veterinária/Produção Animal: - Identificação de doenças genéticas; - Resistência a doenças; - Identificação de progenitores; - Preservação de genótipos raros; - Transgenia; - Diagnósticos diferenciais; - Farmacogenômica; - Nutrigenômica; - Edição genética. Marcadores Moleculares no Melhoramento Animal: - Estudos de genes e QTLs; - Seleção genômica. Como identificar polimorfismos associados a um melhor fenótipo? - Genes Candidatos • Investiga genes envolvidos na expressão da característica para definir se a ocorrência de polimorfismos nestes genes está relacionada a variações fenotípicas na população. o Exemplos: Gene da miostatina, e Gene halotano (suínos) • Limitações: pouco conhecimento acerca dos genes relacionados a características quantitativas. - Sequenciamento do genoma (muitos indivíduos); - Associar variações na sequência de nucleotídeos com variações nos fenótipos; - ↑ Compreensão sobre mecanismos biológicos de caracteres quantitativos – Seleção mais acurada! Seleção Genômica: - Estimativas tradicionais de valores genéticos (VGs): método estatístico “BLUP”– “Seleção “tradicional” (dados de produção e informações de pedigree); - Seleção Genômica (SG): incorporar informações dos marcadores moleculares para predição do valor genético = valores genéticos genômicos (VGGs); - VGGs são estimados utilizando as informações de milhares de marcadores espalhados por todo o genoma, baseando-se na predição simultânea dos efeitos de todos estes marcadores, de modo a capturar os efeitos de todos os loci para explicar toda a variação genética de uma característica quantitativa; - Estimativas dos efeitos dos marcadores e obtenção de modelos de predição dos VGGs em uma população referência (dados fenotípicos e genotípicos) - Obtenção das acurácias dos modelos na população de validação (animais que não pertencem à população referência); - Predição dos VGGs na população de seleção (animais com dados genotípicos e SEM dados fenotípicos). Pontos importantes da Seleção Genômica: - Desequilíbrio de ligação (DL) entre alelos do marcador e alelos do QTL; - Alelos fisicamente próximos são transmitidos como blocos de alelos (haplótipos), criando um nível de correlação entre alelos de diferentes loci; - A densidade de marcadores deve ser suficientemente grande para garantir que todos os QTL estejam em DL com ao menos um marcador; - Altos níveis de DL = efeitos dos marcadores serão os mesmos em toda a população e persistirão por várias gerações. Vantagens da seleção Genômica: - Matriz de parentesco tradicional: desconsidera a amostragem mendeliana; - Amostragem mendeliana = variação na proporção de genes em comum entre animais aparentados; - Correções de inconsistências no pedigree; - ↑ acurácia das estimativas; - Possibilidade de seleção precoce dos animais; - Acelerar ganhos genéticos. Considerações: - Aplicação dos marcadores em áreas diversas; - Coleta de fenótipos.
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