Bioinformática e Bancos de Dados

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Disc.: BIOINFORMÁTICABIOINFORMÁTICA     
Acertos: 10,010,0 de 10,0 de 10,0 05/05/202305/05/2023
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
Nos organismos __________ a expressão de um determinado gene é
dependente do quão enovelado o DNA está, as ___________ regulam
essa compactação. A reação de _________ ocorre o maior
enovelamento, já a reação de ____________ faz com que o DNA fique
mais relaxado, possibilitando sua expressão. 
procariotos / polimerase / metilação / acetilação
 procariotos / polimerase /acetilação / metilação
procariotos / histona / metilação /acetilação
  eucariotos / histona / metilação / acetilação
eucariotos / polimerases / acetilação / metilação
Respondido em 05/05/2023 18:16:56
Explicação:
Nos organismos eucariotos a expressão de um determinado gene é
dependente do quão enovelado o DNA está, as histonas regulam
essa compactação. A reação de metilação ocorre o maior
enovelamento, já a reação de acetilação faz com que o DNA fique
mais relaxado, possibilitando sua expressão. Os organismos
procariotos apresentam outro tipo de regulação, como a presença do
operon lac. As polimerases são enzimas responsáveis enzima que
catalisa a reação de polimerização de ácidos nucleicos a partir dos
seus monômeros.
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
Desde a descoberta da estrutura do DNA e do desenvolvimento da
biologia molecular, o homem vem buscando novas alternativas que
o auxiliem na busca por maior fluidez nos trabalhos de pesquisa,
acelerando a geração de processos e produtos. A bioinformática
tem contribuído para avanços na pesquisa básica, mas também na
ciência aplicada (....).
Fonte: adaptado de ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática.
Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. Sobre a
bioinformática, analise as afirmativas a seguir:
I. O projeto Genoma Humano tinha como objetivo a detecção dos
genes que compõem o DNA humano. Concluído em 1990, esse
projeto contou com o apoio decisivo da bioinformática.
II. A biologia computacional é um campo de pesquisa diferente ao
da bioinformática.
III. Uma das aplicações da bioinformática é o alinhamento de
sequencias que tem como objetivo principal da comparação de
sequências biológicas é encontrar o(s) alinhamento(s) de maior
escore de similaridade.
É correto o que se afirma em:
I. 
I e II.
I e III.
 III. 
II. 
Respondido em 05/05/2023 18:17:10
Explicação:
Bioinformática e a biologia computacional são duas utilizadas como
sinônimos e tem como objetivo a aplicação de ferramentas
computacionais para coletar, armazenar, analisar, manipular,
apresentar e compartilhar dados biológicos. Mas é importante
ressaltar que segundo o NCBI a Biologia computacional é uma área
de pesquisa que tem como foco principal problemas de pesquisa
específicos em biologia. O projeto genoma foi iniciado na década de
90, e tinha como objetivo o desvendar por completo o DNA do ser
humano. Após 13 anos para a conclusão desse projeto, a
bioinformática mais uma vez foi essencial, pois a partir de programas
de computador específicos, os pequenos trechos sequenciados eram
adicionados a um grande banco de dados e encaixados no seu devido
lugar, formando um único arquivo editável em que todos os
participantes do trabalho.
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
(ADAPTADA DE ENADE 2013- biomedicina)
Os mecanismos envolvidos na expressão e interação dos genes,
assim como a compreensão das redes funcionais estabelecidas
pelas proteínas, fazem com que, no cenário científico atual, a
genômica e a proteômica estejam cada vez mais em evidência.
Quatro são os principais bancos de dados utilizados para as
diferentes análises de nucleotídeos. Um deles é o INSDC
(INTERNATIONAL NUCLEOTIDE SEQUENCE DATABASE), que
disponibiliza um repertório de sequências e é resultado da
associação de três bancos de dados parceiros, o DDBJ (DATA
BANK OF JAPAN), o EMBL (EMBL NUCLEOTIDE SEQUENCE
DATABASE) e o GenBank. Devido à sua designação como provedor
de dados primários, EMBL/DDBJ/GenBak é fonte inicial de muitos
bancos de dados em biologia molecular. Como exemplos de bancos
de dados de sequências genômicas secundárias, pode-se citar o
Ensembl, o RefSeq e o Genome Review, que representa uma
versão da sequência original de um cromossomo ou plasmídeo,
com informações importadas de fontes que incluem o UniProt
(UNIVERSAL PROTEIN RESOURCE), o Gene Ontology (GO), o
projeto GOA (GO ANNOTATION), o InterPro e o HoGenom, além
de serem disponibilizadas referências cruzadas com 18 bancos de
dados.
Fonte: ESPINDOLA, F. S. et al. Recursos de bioinformática
aplicados às ciências ômicas como genômica, transcriptômica,
proteômica, interatômica e metabolômica. Bioscience Journal,
Uberlândia, v. 26, n. 3, p. 463-477, Maio/Junho 2010 (adaptado).
I. As informações disponíveis nos bancos de dados de sequências
possibilitam o desenvolvimento de pesquisas in sílico (realizadas
em programas de computador), dependendo dos métodos
interpretativos e programas de análises envolvidos.  
PORQUE
II. Os bancos de dados de sequências fornecem informações sobre
diversos genes, que podem ser utilizadas de forma rápida,
independentemente do tipo de processamento.
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
As asserções I e II são proposições falsas.
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição
verdadeira.
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é
falsa.
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não
é uma justificativa da I.
 As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma
justificativa da I.
Respondido em 05/05/2023 18:17:32
Explicação:
Em relação a proposição I e II são verdadeiras, pois as informações
disponíveis nos bancos de dados, como sequências de genes, quanto
proteínas) possibilitam a sua utilização em pesquisa in sílico de forma
rápida.
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
Aline é biomédica e trabalha em um laboratório para diagnóstico
de doenças genéticas. Um dos genes mais pesquisados é o brca1,
que quando sofre mutações específicas está associado ao risco
aumentado de câncer. Para identificar as mutações, é necessário
comparar a sequência obtida do paciente com uma sequência
referência não mutada. Qual banco de dados, disponível no NCBI,
Aline pode consultar para conseguir uma sequência referência
curada para o gene brca1?
 RefSeq.
PubMed.
KEGG.
BLAST.
GenBank.
Respondido em 05/05/2023 18:17:41
Explicação:
O RefSeq é um banco de dados de sequências de nucleotídeos de
referência, curado por funcionários do NCBI, que é o banco que a
biomédica deveria usar para conseguir comparar a sequência obtida
do paciente com uma sequência referência não mutada de forma
curada. O GenBank também é um banco de dados de sequências de
nucleotídeos, mas ele não é curado. O PubMed é banco de dados de
textos biomédicos. O KEGG é um banco de dados de vias
metabólicas, principalmente. Já o BLAST não é um banco de dados, e
sim uma ferramenta para alinhamento de sequências.
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
Durante um noticiário na televisão que falava sobre notícias
na área de ciência e tecnologia, o repórter citou o termo NCBI.
Dona Rosângela, curiosa, perguntou a seu neto o significado
daquele termo. Qual seria a resposta correta que o neto de
Dona Rosângela deveria dar?
O NCBI é um banco de dados de sequências de nucleotídeos
curadas e sem redundância.
O NCBI se trata apenas de um banco de dados de artigos
científicos da área biomédica.
 O NCBI é um portal que apresenta bancos de dados e
ferramentas importantes para a área biotecnológica.
O NCBI é uma ferramenta usada para o alinhamento de
sequências biológicas.
O NCBI é um programa on-line para o desenho de primers.
Respondido em 05/05/2023 18:20:08
Explicação:
O NCBINCBI (Centro Nacional para Informação Biotecnológica) é uma
organização que controla o portal mais famoso da bioinformática.
Dentro desse portal, estão disponíveis diferentes bancos debancos de
dados biológicos e ferramentasdados biológicos e ferramentas para analisá-los. O NCBI se
propõe a reunir o resultado do trabalho de pesquisadores ao redor
do mundo em umsó lugar, facilitando o acesso e manipulação desses
registros. Essa iniciativa impulsiona o avanço do conhecimento na
área biotecnológica.  Dentro do NCBI, temos o GenBank e PubMed,
que são bancos de dados disponíveis no portal do NCBI, mas esse
não é o único propósito desse portal. A ferramenta BLAST, usada
para o alinhamento de sequências, também está implementada
nesse portal.
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
O PubMed é um dos bancos de dados disponíveis no portal do
NCBI. A partir dele, podemos buscar por artigos científicos da área
biomédica publicados por cientistas em todo o mundo. Caso você
queira direcionar a sua busca para obter artigos mais adequados
ao seu interesse, o que poderia ser feito?
Não existe a possibilidade de direcionar a busca, é
necessário avaliar todos os títulos que aparecem como
resultado para escolher aqueles mais adequados.
 Utilizar os filtros de busca, que incluem ano e tipo de
artigo, por exemplo, ou, ainda, optar pela busca avançada.
Pagar uma assinatura mensal ao PubMed para que ele
direcione automaticamente suas buscas de acordo com os
critérios que você deseja.
Acessar o PubMed por meio de rede de Internet de
instituição pública, como universidades ou bibliotecas. Só
assim é possível direcionar a busca por artigos.
Cadastrar seus dados profissionais e receber uma
autorização para acessar a parte restrita do PubMed que
permite buscas avançadas.
Respondido em 05/05/2023 18:18:08
Explicação:
Qualquer usuário pode acessar ao PubMed, via NCBI, e fazer buscas
direcionadas usando filtro ou o modo avançado. Pode acontecer de
alguns dos artigos que aparecem como resultados não estejam
disponíveis para leitura de todo o conteúdo, mas isso depende da
revista em que o artigo foi publicado, e não do PubMed.
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
(CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular)
Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que
permite medir os níveis de expressão de transcritos em larga
escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta.
A técnica em questão é empregada em estudos
proteômicos, visto que permite a identificação direta das
proteínas expressas.
As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas
de lipídios.
A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de
sondas marcadas com brometo de etídio.
 O microarranjo de DNA consiste em um arranjo
predefinido de moléculas de DNA quimicamente ligadas a
uma superfície sólida.
A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de
agarose.
Respondido em 05/05/2023 18:20:20
Explicação:
A técnica em questão é empregada em estudos transcriptômicos,
visto que permite a identificação direta das RNAs expressas. Para a
técnica, são utilizadas lâminas de vidro revestidas com sondas de
DNA. A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de
sondas marcadas com corantes fluorescentes. A detecção é realizada
por meio de detecção da fluorescência.
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
(Adaptado de VUNESP - 2020 - EBSERH - Farmacêutico) A
revolução biotecnológica tem fornecido informações
extremamente úteis para a descoberta de fármacos. O sufixo
"ômica" indica uma série de novas disciplinas e procedimentos que
visam à identificação funcional e/ou estrutural de tecidos, de
células, de padrões de expressão gênicos e de características
metabólicas (Bhogal & Balls, 2008), dentre elas:
BHOGAL, N.; BALLS, M. Translation of new technologies: from
basic research to drug discovery and development. Curr. Drug
Discov. Technol., v.5, n.3, p.250-62, 2008.
Proteômica, lipidômica e dicotômica.
Genômica, lipidômica e biônica.
Genômica, dicotômica e proteômica.
Genômica, transcriptômica e biônica.
 Genômica, transcriptômica e metabolômica.
Respondido em 05/05/2023 18:24:34
Explicação:
Genômica, transcriptômica e metabolômica são exemplos de
ciências ômicas. Segundo o Dicionário Priberam da Língua
Portuguesa, a palavra "dicotômica" significa "que se divide ou
subdivide em dois", enquanto "biônica" significa "ciência que tem por
fim o estudo de certos processos biológicos com vista a aplicar
processos análogos para fins militares, tecnológicos etc." As demais
palavras são ciências ômicas (lipidômica).
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
Observe o caldograma abaixo:
Imagem: Leandro Pederneiras
A seguir são listadas alguns grupos de espécies. Analise as
alternativas que, segundo o cladograma, se refere a um grupo
polifilético.
O conjunto de espécies A B C D
O conjunto de espécies S T
 O conjunto de espécies H I
O conjunto de espécies N O P
O conjunto de espécies W X Y
Respondido em 05/05/2023 18:30:07
Explicação:
Gabarito: Gabarito: O conjunto de espécies H I
Justificativa: Justificativa: O grupo polifilético é um conjunto de táxons que não
inclui o ancestral comum de todos os seus membros. Ao analisar as
alternativas, aquela que representa um grupo prolifilético, é o
conjunto de espécies H I porque possuem origem em linhagens
amplamente desconexas. Os conjuntos de espécies listados nas
outras alternativas (conjunto de espécies N, O, P; conjunto de
espécies W X Y; conjunto de espécies A B C D e o conjunto de
espécies S T) apresentam um ancestral comum.
Acerto: 1,01,0  / 1,01,0
Durante uma análise cadeia Markoviana Monte Carlocadeia Markoviana Monte Carlo
(MCMC), o que determina quando uma cadeia se move da árvore
atual para uma nova árvore?
A cadeia Markoviana aceitará uma proposta com uma
probabilidade que é fixada no início da pesquisa.
 A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma
probabilidade posterior maior do que o estado atual.
A cadeia Markoviana sempre aceitará uma proposta que
seja consistente com a anterior.
A cadeia rejeitará uma proposta que produza uma
probabilidade de log maior do que o estado atual.
A probabilidade de aceitar uma proposta depende da
razão entre as probabilidades posteriores entre o estado
atual e proposto.
Respondido em 05/05/2023 18:27:20
Explicação:
Gabarito: Gabarito: A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza
uma probabilidade posterior maior do que o estado atual.
Justificativa: Justificativa: Uma geração MCMC sempre aceita o novo estado se
a probabilidade, ou log, for maior que o estado atual. A geração
MCMC não é calculada por uma razão, nem possui uma
probabilidade fixada de início. Na cadeia Markoviana, o novo estado
é sempre aceito quando possui melhor probabilidade. As vezes a
cadeia Markoviana Monte Carlo pode aceitar um ponto pior do que o
anterior. Isso ocorre raramente.
 Questão11a
 Questão22a
 Questão33a
 Questão44a
 Questão55a
 Questão66a
 Questão77a
 Questão88a
 Questão99a
 Questão1010a
16/05/2023 10:12
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