Perguntas Bioinformatica 1

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Disc.: BIOINFORMÁTICA 
 202109363476 
Acertos: 9,0 de 10,0 10/09/2022 
 
 
1a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Na era pós-moderna, com o advento e a consolidação da revolução robótica no século XX, foi possível aprimorar a criação 
de tecnologias computacionais nas mais variadas áreas do conhecimento, o que tem provocado profundas mudanças sociais 
em âmbito individual e coletivo. Nesse cenário, a bioinformática ou biocomputação surge na década de 1980, a fim de 
superar as fronteiras das ciências pelo desenvolvimento de novas abordagens capazes de promover a análise e a 
apresentação de dados biológicos, bem como de garantir a investigação de novos métodos para a resolução de complexas 
perguntas. 
Fonte: ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. Sobre a bioinformática 
analise as afirmativas a seguir: 
I. A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que combina diferentes disciplinas, com destaque para a Estatística, 
biologia, química, informática e física. 
II. A bioinformática possibilitou a interpretação da linguagem dos de genes por algoritmos. 
III. Atualmente, os programas de computadores estão muito modernos, e é possível realizar todas grandes análises de 
forma rápida e precisa, como prever a ligação de diferentes átomos em uma molécula. 
É correto o que se afirma em: 
 
 
I e III. 
 I e II. 
 
III. 
 
I. 
 
II. 
Respondido em 10/09/2022 23:23:33 
 
Explicação: 
Existem diversas ciências envolvidas com a bioinformática, que desfrutam do seu avanço, entretanto as áreas mais intimamente 
ligadas de acordo com a questão 17 são: Estatística, biologia, química, informática e física. Essa nova ciência permitiu que 
algoritmos fossem criados auxiliando na interpretação de genes, alinhamentos dos genes, descobrir sequências e funções de genes 
desconhecidas. No entanto, ainda precisamos de programas de computadores mais avançados, para por exemplo, analisar as 
dinâmicas moleculares (interação de átomos de diferentes proteínas), mas complexas e mais longas. 
 
 
2a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Desde a descoberta da estrutura do DNA e do desenvolvimento da biologia molecular, o homem vem buscando novas 
alternativas que o auxiliem na busca por maior fluidez nos trabalhos de pesquisa, acelerando a geração de processos e 
produtos. A bioinformática tem contribuído para avanços na pesquisa básica, mas também na ciência aplicada (....). 
Fonte: adaptado de ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. 
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_avaliacao_parcial_resultado.asp?cod_hist_prova=292830502&cod_prova=5635120977&f_cod_disc=
A seguir são listadas algumas aplicações da bioinformática. Analise as afirmativas a seguir: 
I. Identificação de alvos proteicos com potencial para serem modificados diretamente pela interação com fármacos. 
II. A identificação de moléculas que poderão atuar como princípio ativo na elaboração de produtos terapêuticos, inibindo ou 
acelerando certas reações bioquímicas, poderá apresentar efeitos sobre a cura ou a atenuação da doença. 
III. Proporcionar melhor entendimento dos processos evolutivos e das relações filogenéticas. 
IV. Amplificação do material genético para a verificação quantitativa e qualitativa de um determinado DNA em uma amostra 
biológica. 
V. Identificar a expressão gênica durante um tumor, identificar suas alterações para que genes defeituosos, ausentes ou 
superativados sejam reconstruídos ou desligados, para garantir o desenvolvimento de medidas terapêuticas ou preventivas 
contra tumores e agentes infecciosos. 
Assinale a opção correta. 
 
 
Apenas I. 
 
Apenas II. 
 
Apenas III e IV. 
 
I, II e III. 
 I, II, III e V. 
Respondido em 10/09/2022 23:30:28 
 
Explicação: 
A bioinformática é a ciência integra essencialmente o desenvolvimento de programas computacionais para tratar dados biológicos 
preexistentes e identificar sequências de genes, predizer a configuração tridimensional das proteínas, identificar inibidores 
enzimáticos, promover o agrupamento de proteínas, estabelecer árvores filogenéticas e analisar experimentos da expressão 
gênica. No entanto, ela não amplifica o DNA para a sua detecção em uma amostra biológica, essa análise é realizada pela reação 
de polimerase da cadeia, que pode apenas detectar a presença (qualitativa) ou então verificar a concentração (quantitativa). As 
demais alternativas estão corretas. 
 
 
3a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Sobre a técnica de modelagem molecular analise a relação entre as afirmativas a seguir: 
I. O método de modelagem a ser escolhido depende da igualdade. 
PORQUE 
II. Uma igualdade superior a 25% podemos optar pela modelagem por homologia. Se for abaixo desse valor e tivermos o 
enovelamento do molde conhecido usamos modelagem por ab initio, caso não, optamos pela modelagem threading. 
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: 
 
 
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I. 
 
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. 
 As asserções I e II são proposições falsas. 
Respondido em 20/09/2022 10:25:16 
 
Explicação: 
O método de modelagem a ser escolhido depende da identidade, caso seja acima de 25% podemos optar pela modelagem por 
homologia, se for abaixo desse valor e tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos modelagem por treading, caso não 
realizamos a modelagem por ab initio. 
 
 
4a 
 Questão 
Acerto: 0,0 / 1,0 
 
Considere o alinhamento de uma sequência nucleotídica desconhecida em relação a um banco de dados de genes 
associados ao desenvolvimento de câncer usando a ferramenta BLAST. A partir dessa situação, são descritas algumas 
características desse programa. Assinale a alternativa que retrata a utilização correta dessa ferramenta. 
 
 Quanto menor o valor de e-value, menor a probabilidade de o alinhamento ter sido obtido ao acaso com uma 
sequência do banco de dados. 
 
Se o valor de e-value for igual a 0.0, o alinhamento deve ser desconsiderado, pois ocorreu ao acaso. 
 A opção de BLASTn deve ser escolhida, uma vez que compara sequência de aminoácidos contra um banco de 
dados de proteínas. 
 
Caso encontre o e-value igual a 100%, a sequência desconhecida será idêntica à sequência no banco de dados. 
 
A variação da ferramenta indicada nesse caso é o BLASTp, que compara sequência de nucleotídeos contra um 
banco de dados de proteínas. 
Respondido em 20/09/2022 11:00:45 
 
Explicação: 
O valor de e-value diz respeito à significância estatística do alinhamento realizado com a ferramenta BLAST. Valores iguais ou 
muito próximos de zero são desejados, pois indicam que a chance daquele alinhamento ter ocorrido ao acaso é muito pequena. A 
variante BLASTn usa sequências de nucleotídeos para buscar em banco de nucleotídeos, enquanto a variante BLASTp usa 
sequências de aminoácidos para buscar em bancos de proteínas. 
 
 
5a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
(PR4 - UFRJ - Biólogo -UFRJ - Biologia Molecular - 2016) 
Um pesquisador e sua equipe acabam de obter a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo antes desconhecido. 
Querendo saber se esse gene ou um gene similar está presente no genoma humano, ele deve recorrer à seguinte ferramenta 
de bioinformática: 
 
 
 BLAST. 
 
Mega. 
 
GenBank. 
 
Velvet. 
 
Multialignm. 
Respondido em 11/09/2022 00:41:39 
 
Explicação: 
O BLAST é um software para alinhamento simples e local de sequências biológicas. Essas sequências podem ser de nucleotídeos ou 
aminoácidos. Como o pesquisador quer descobrir se a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo antes desconhecido 
está presente no genoma humano,essa é a ferramenta mais aplicada, pois ele vai comparar sequências simples. O Mega é um 
software para análises filogenéticas. Multialignm é um programa para alinhamento múltiplo de sequências. Velvet é um algoritmo 
para montagem de genomas. GenBank é um banco de dados. 
 
 
6a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Escolha a opção que justifique por que é importante que o comprimento do produto amplificado pela reação de PCR seja maior 
que 150 pares de bases (pb). 
 
 Produtos amplificados menores que 150pb podem se confundir com restos de primers que não se ligaram ao DNA e 
ficam no final da eletroforese. 
 
A temperatura de anelamento para amplificar uma região menor que 150pb é maior que 72°C. 
 
A enzima Taq DNA polimerase não consegue amplificar seguimentos de DNA menores que 150pb. 
 
Primers que se ligam ao redor de regiões menores que 150pb formam estruturas secundárias com maior facilidade. 
 
Estabelecer um comprimento mínimo do produto aumenta a especificidade da reação.Primers que se ligam ao redor 
de regiões menores que 150pb formam estruturas secundárias com maior facilidade. 
Respondido em 20/09/2022 11:12:33 
 
Explicação: 
O tamanho do produto amplificado não interfere na especificidade, na formação de estruturas secundárias ou na temperatura de 
anelamento. O tamanho ideal do produto da PCR está entre 150 e 1.000 pares de bases (pb). Fragmentos muito pequenos podem 
ser confundidos com restos de primers que não se ligaram ao alvo e aparecem no final do gel da eletroforese. Por outro lado, se a 
região amplificada for muito grande, a DNA polimerase pode não conseguir adicionar todos os nucleotídeos necessários, e nesses 
casos a PCR não vai funcionar. A Taq tem dificuldade para amplificar produtos maiores que 1000pb. 
 
 
7a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Um grande avanço da bioinformática aconteceu durante a execução do Projeto Genoma Humano, que durou mais de 10 anos 
e teve como objetivo principal determinar a ordem dos nucleotídeos de todo genoma da nossa espécie. Essa empreitada 
científica estimulou o aprimoramento de computadores e de programas para lidar com a grande quantidade de dados que 
começou a ser gerada. Hoje vivemos o que é chamado de ¿era pós-genômica¿, como o desenvolvimento e aperfeiçoamento 
de técnicas e programas que permitem estudar outras ciências ômicas. De acordo com as ciências ômicas, analise as 
afirmativas a seguir: 
 
I. Genética é o estudo de todo o DNA de um indivíduo. 
II. Metabolômica estuda moléculas de baixo peso molecular produzidas por uma célula. 
III. Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de uma amostra de seu RNA. 
 
Quais são as afirmativas corretas? 
 
 
Somente a afirmativa 2 está correta. 
 
As afirmativas 1 e 2 estão corretas. 
 Somente a afirmativa de número 3 está correta. 
 
As afirmativas 1 e 3 estão corretas. 
 
Somente a afirmativa de número 1 está correta. 
Respondido em 20/09/2022 10:29:04 
 
Explicação: 
O estudo de todo o DNA de um indivíduo é chamado de genômica. A genética é a parte da ciência que estuda a hereditariedade, a 
estrutura e a função dos genes e a variação dos seres vivos. Na genética estudamos genes individuais. Às vezes, genética e 
genômica são usadas indistintamente, mas têm significados diferentes. Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de 
uma amostra de seu DNA. 
 
 
8a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
(CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular) 
Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que permite medir os níveis de expressão de transcritos em 
larga escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta. 
 
 O microarranjo de DNA consiste em um arranjo predefinido de moléculas de DNA quimicamente ligadas a uma 
superfície sólida. 
 
A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com brometo de etídio. 
 
A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de agarose. 
 
A técnica em questão é empregada em estudos proteômicos, visto que permite a identificação direta das 
proteínas expressas. 
 
As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas de lipídios. 
Respondido em 20/09/2022 10:30:22 
 
Explicação: 
A técnica em questão é empregada em estudos transcriptômicos, visto que permite a identificação direta das RNAs expressas. Para 
a técnica, são utilizadas lâminas de vidro revestidas com sondas de DNA. A expressão dos genes é acompanhada com o emprego 
de sondas marcadas com corantes fluorescentes. A detecção é realizada por meio de detecção da fluorescência. 
 
 
9a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Durante uma análise cadeia Markoviana Monte Carlo (MCMC), o que determina quando uma cadeia se move da árvore 
atual para uma nova árvore? 
 
 
A cadeia rejeitará uma proposta que produza uma probabilidade de log maior do que o estado atual. 
 
A probabilidade de aceitar uma proposta depende da razão entre as probabilidades posteriores entre o estado 
atual e proposto. 
 A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado atual. 
 
A cadeia Markoviana sempre aceitará uma proposta que seja consistente com a anterior. 
 
A cadeia Markoviana aceitará uma proposta com uma probabilidade que é fixada no início da pesquisa. 
Respondido em 20/09/2022 10:31:09 
 
Explicação: 
Gabarito: A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado atual. 
Justificativa: Uma geração MCMC sempre aceita o novo estado se a probabilidade, ou log, for maior que o estado atual. A 
geração MCMC não é calculada por uma razão, nem possui uma probabilidade fixada de início. Na cadeia Markoviana, o novo 
estado é sempre aceito quando possui melhor probabilidade. As vezes a cadeia Markoviana Monte Carlo pode aceitar um ponto pior 
do que o anterior. Isso ocorre raramente. 
 
 
10a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
O quadro a seguir mostra uma matriz de dados táxons x caracteres, sendo apresentados 9 espécies (de A ao I) e 9 
caracteres (de 1 ao 9): 
 
Como uma análise de parcimônia seria afetada pela remoção das duas primeiras posições (1 e 2) e da última posição (9) da 
matriz de dados fornecida? 
 
 
A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará; a árvore ótima terá três etapas a mais. 
 
A topologia de árvore ideal certamente mudará; a árvore ótima será menor. 
 A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará, e nem seu comprimento. 
 
A topologia de árvore ideal pode ou não mudar; o comprimento ideal da árvore pode ser maior ou menor. 
 
A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará; a árvore ótima será três etapas mais curta. 
Respondido em 20/09/2022 10:32:55 
 
Explicação: 
Gabarito: A topologia de árvore ideal definitivamente não mudará, e nem seu comprimento. 
Justificativa: Os caracteres que estão na posição 1, 2 e 9 na matriz de dados não possui variação de estados, ou seja, ao analisar 
a matriz de dados vemos que em todas as espécies (de A a I) na posição 1 temos a base C, na posição 2 a base G e na posição 9 a 
base C. Isso significa que elas não trazem informações que possam diferenciar um táxon ou um conjunto de táxons. Assim, a 
retirada destes caracteres, por tanto, não modifica a topologia e o comprimento de ramos, pois não houve alteração. A modificação 
na topografia só seria obtida caso tivesse alteração nos carateres entre os táxons, assim todas as outras alternativas estão falsas.