BIOTECNOLOGIA E BIOINFORMÁTICA 01

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BIOTECNOLOGIA E BIOINFORMÁTICA 01
	
	ENGENHARIA GENÉTICA E DNA RECOMBINANTE
	 
		
	
		1.
		(CONSULPLAN/2010 - Prefeitura de Campo Verde/MT - Professor - Ciências)
A engenharia genética, mais apropriadamente chamada de tecnologia do DNA recombinante, é um conjunto de técnicas que permite aos cientistas identificar, isolar e multiplicar genes dos mais diversos organismos. Essas técnicas envolvem, frequentemente, o isolamento, a manipulação e a introdução do DNA num chamado ''corpo de prova'', geralmente para exprimir um gene.
Conforme representado na figura a seguir, a utilização de vetores é uma das principais ferramentas dessas novas possibilidades da engenharia genética. Essa importância do uso de vetores se justifica por que:
	
	
	
	Os plasmídeos permitem a manipulação do material genético do DNA de todas as células, uma vez que permitem tornar o DNA circular, de mais fácil manuseio pelos cientistas.
	
	
	Os plasmídeos são formas de DNA bacteriano e, por não possuírem genes vitais à bactéria, podem ser manipulados, permitindo a inserção de genes, sem levar a bactéria à morte.
	
	
	Vírus, lipossomos e plasmídeos, que funcionam como vetores, têm a função de promover a intensa proliferação da célula de interesse, quando nela são inseridos, como acontece com bactérias geneticamente modificadas.
	
	
	Os lipossomos, claramente representados no esquema acima, constituem os principais vetores utilizados em engenharia genética, uma vez que são de fácil manipulação e podem entrar e sair livremente das células.
	
	
	Os plasmídeos são encontrados no núcleo das células eucariotas e, ao serem transportados para as bactérias, podem carregar genes de interesse para serem copiados.
		xplicação: 
A resposta certa é: Os plasmídeos são formas de DNA bacteriano e, por não possuírem genes vitais à bactéria, podem ser manipulados, permitindo a inserção de genes, sem levar a bactéria à morte.
	
	
	 
		
	
		2.
		 (Questão do Enade - Inep/2013 - Biomedicina)
Embora os transgênicos sejam muito discutidos na perspectiva das políticas de produção agrícola, as aplicações biotecnológicas de organismos geneticamente modificados (OGM) são inúmeras e vêm sendo utilizadas há cerca de duas décadas na produção industrial. Um exemplo do uso da tecnologia associada aos OGM é a quimosina, uma enzima importante na coagulação de lacticínios, pioneira entre os produtos gerados por OGM e que está no mercado desde os anos 1990. Essa enzima era tradicionalmente extraída do estômago de mamíferos. Nos anos 1990, foram criadas bactérias geneticamente modificadas contendo DNA de células estomacais de animais. Essas bactérias passaram a ser utilizadas, em larga escala, em um processo de fermentação para a síntese da referida enzima. A quimosina produzida desse modo tem estrutura molecular idêntica àquela que era obtida da forma tradicional.
Com base no texto, avalie as seguintes asserções e a relação proposta entre elas:
I. A produção de queijos com uso da quimosina sintetizada por bactérias geneticamente modificadas é considerada segura para o consumidor do alimento, e os queijos assim produzidos não podem ser classificados como alimentos transgênicos.
PORQUE
II. A quimosina utilizada na fabricação de queijos, embora seja um OGM, é eliminada no final do processo produtivo.
Acerca dessas asserções, assinale a opção correta:
	
	
	
	A asserção I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa.
	
	
	As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa correta da I.
	
	
	As asserções I e II são proposições falsas.
	
	
	As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa correta da I.
	
	
	A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
		Explicação: 
A resposta certa é: A asserção I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa.
	
	CÉLULAS TRONCO, TERAPIA GÊNICA E FARMACOGENÉTICA
	 
		
	
		3.
		Ao final da reação de sequenciamento de Sanger, que utiliza os ddNTPs é necessário realizara etapa de eletroforese para visualização do resultado.
 
Marque a alternativa que apresenta o objetivo da eletroforese após a reação de sequenciamento.
	
	
	
	Realizar a emissão de fluorescência dos ddNTPs adicionados na reação de sequenciamento.
	
	
	A identificação da sequência de DNA não pode ser separa por gel de poliacrilamida devido ao tamanho da molécula.
	
	
	Separar os fragmentos de DNA de acordo com a sua carga, do polo positivo, para o polo negativo.
	
	
	Separar os fragmentos maiores de DNA que irão correr no gel mais rápido que os menores.
	
	
	Separar os fragmentos de DNA gerados na reação de sequenciamento de acordo com seu tamanho e carga.
		Explicação: 
A eletroforese é uma técnica de separação de moléculas com base no seu tamanho e carga. O DNA tem carga negativa e vai ser submetido então a uma voltagem para que corra no sentido positivo (cargas opostas se atraem). Ao final da corrida eletroforética, o resultado é revelado e analisado. Os fragmentos menores vão migrar/correr no gel mais rápido, pela facilidade de locomoção, do que fragmentos maiores. Assim, de acordo com cada seguimento gerado pela reação, em cada tubo, podemos montar qual a sequência exata de nucleotídeos do DNA de interesse.
	
	
	 
		
	
		4.
		(FGV/ Prefeitura de Salvador/2017 - adaptada) Nos últimos anos, os cientistas descobriram uma nova técnica para "recortar" e mudar partes do código genético, conseguindo eliminar trechos indesejados do genoma, que causam doenças e, se necessário, inserir novas sequências no local. Essa possibilidade de "cortar e cola" partes do código genético tornou possível a cura de algumas condições hereditárias, como, por exemplo, o diabetes, a obesidade, a fibrose cística e tipos graves de distrofia muscular.
Essa nova técnica é conhecida como 
	
	
	
	inseminação artificial.
	
	
	edição de DNA.
	
	
	reprodução por clonagem.
	
	
	terapia gênica.
	
	
	implante de células-tronco.
		Explicação: 
Diferente da terapia gênica, que leva à adição de um gene inteiro nas células alvo, a edição permite alterar diretamente uma sequência de DNA na célula. Assim, a edição gênica é mais uma possibilidade que permite realizar alterações nos genes ou regiões especificas do genoma com fins terapêuticos. Inseminação artificial é uma técnica de reprodução assistida. A clonagem é um processo artificial pautado na reprodução de cópias genéticas de determinados seres vivos através de um filamento de DNA. Implante de células-tronco é a transferência dessas células visando o tratamento de uma doença, dano ou lesão tecidual, mas sem alterar o DNA.
	
	
	NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS
	 
		
	
		5.
		O PubMed é um dos bancos de dados disponíveis no portal do NCBI. A partir dele, podemos buscar por artigos científicos da área biomédica publicados por cientistas em todo o mundo. Caso você queira direcionar a sua busca para obter artigos mais adequados ao seu interesse, o que poderia ser feito?
	
	
	
	Utilizar os filtros de busca, que incluem ano e tipo de artigo, por exemplo, ou, ainda, optar pela busca avançada.
	
	
	Pagar uma assinatura mensal ao PubMed para que ele direcione automaticamente suas buscas de acordo com os critérios que você deseja.
	
	
	Acessar o PubMed por meio de rede de Internet de instituição pública, como universidades ou bibliotecas. Só assim é possível direcionar a busca por artigos.
	
	
	Não existe a possibilidade de direcionar a busca, é necessário avaliar todos os títulos que aparecem como resultado para escolher aqueles mais adequados.
	
	
	Cadastrar seus dados profissionais e receber uma autorização para acessar a parte restrita do PubMed que permite buscas avançadas.
		Explicação: 
Qualquer usuário pode acessar ao PubMed, via NCBI, e fazer buscas direcionadas usando filtro ou o modo avançado. Pode acontecer de alguns dos artigos que aparecem como resultados não estejam disponíveis para leiturade todo o conteúdo, mas isso depende da revista em que o artigo foi publicado, e não do PubMed.
	
	
	 
		
	
		6.
		(PR4 - UFRJ - Biólogo  -UFRJ - Biologia Molecular - 2016)
Um pesquisador e sua equipe acabam de obter a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo antes desconhecido. Querendo saber se esse gene ou um gene similar está presente no genoma humano, ele deve recorrer à seguinte ferramenta de bioinformática:
 
	
	
	
	Velvet.
	
	
	Multialignm.
	
	
	BLAST.
	
	
	GenBank.
	
	
	Mega.
		Explicação: 
O BLAST é um software para alinhamento simples e local de sequências biológicas. Essas sequências podem ser de nucleotídeos ou aminoácidos. Como o pesquisador quer descobrir se a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo antes desconhecido está presente no genoma humano, essa é a ferramenta mais aplicada, pois ele vai comparar sequências simples. O Mega é um software para análises filogenéticas. Multialignm é um programa para alinhamento múltiplo de sequências. Velvet é um algoritmo para montagem de genomas. GenBank é um banco de dados.
	
	
	ANOTAÇÃO GÊNICA
	 
		
	
		7.
		Diferentes tipos de dados biológicos podem ser armazenados em bancos de dados computacionais. Em relação aos tipos de bancos de dados biológicos, relacione as duas colunas.
1. Curado.
2. Acesso livre.
3. Especializado
4. Primário.
( ) Armazenam informações biológicas originais, resultados de experimentos científicos.
( ) Banco que contém informações processadas por um profissional com uma boa experiência no assunto.
( ) Reúnem todo conteúdo que atende a um interesse em particular, por exemplo, sobre o HIV.
( ) Está disponível para qualquer tipo de usuário, sem restrição de acesso.
Qual a sequência correta?
	
	
	
	4-1-3-2.
	
	
	1-2-3-4.
	
	
	1-3-2-4.
	
	
	2-4-1-3.
	
	
	4-3-2-1.
		Explicação: 
Os bancos de dados podem ser categorizados de acordo com a disponibilidade de acesso, com o conteúdo dos dados armazenados e com a qualidade deles. O acesso pode ser livre ou restrito; o conteúdo pode ser de dados brutos ou processados, referindo-se a sequências biológicas, estruturas 3D, anotação funcional de proteínas, dentre outros. No que diz respeito à qualidade, um banco curado é aquele que passou pela análise de profissionais especialistas no assunto. Um banco primário é aquele que armazena informações biológicas originais, resultados de experimentos científicos, e um banco especializado reúne todo conteúdo que atende a um interesse em particular, por exemplo, sobre o HIV.
	
	
	
ANÁLISE FILOGENÉTICA
	 
		
	
		8.
		Durante uma análise cadeia Markoviana Monte Carlo (MCMC), o que determina quando uma cadeia se move da árvore atual para uma nova árvore?
	
	
	
	A probabilidade de aceitar uma proposta depende da razão entre as probabilidades posteriores entre o estado atual e proposto.
	
	
	A cadeia Markoviana sempre aceitará uma proposta que seja consistente com a anterior.
	
	
	A cadeia Markoviana aceitará uma proposta com uma probabilidade que é fixada no início da pesquisa.
	
	
	A cadeia rejeitará uma proposta que produza uma probabilidade de log maior do que o estado atual.
	
	
	A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado atual.
		Explicação: 
Gabarito: A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado atual.
Justificativa: Uma geração MCMC sempre aceita o novo estado se a probabilidade, ou log, for maior que o estado atual. A geração MCMC não é calculada por uma razão, nem possui uma probabilidade fixada de início. Na cadeia Markoviana, o novo estado é sempre aceito quando possui melhor probabilidade. As vezes a cadeia Markoviana Monte Carlo pode aceitar um ponto pior do que o anterior. Isso ocorre raramente.
	
	
	APLICAÇÕES DA BIOTECNOLOGIA
	 
		
	
		9.
		Sobre o uso de animais transgênicos NÃO é correto afirmar: 
	
	
	
	Permitem a criação de modelos de doenças humanas pela inserção de genes ou silenciamento de genes.  
	
	
	A produção de animais transgênicos permite a criação de animais imunocompatíveis com o homem, de modo a permitir o xenotransplante 
	
	
	Permitem uso de animais como biorreatores na produção de biofármacos. 
	
	
	A inserção do gene de interesse precisa acontecer nas células germinativas ou no início da fecundação. 
	
	
	O único modo de se criar um animal transgênico é pela inserção do DNA recombinante através do sistema biológico Agrabacterium tumefaciens. 
		Explicação: 
A resposta correta é: O único modo de se criar um animal transgênico é pela inserção do DNA recombinante através do sistema biológico Agrabacterium tumefaciens. 
	
	
	 
		
	
		10.
		Pesticidas são contaminantes ambientais altamente tóxicos aos seres vivos e, geralmente, com grande persistência ambiental. A busca por novas formas de eliminação dos pesticidas tem aumentado nos últimos anos, uma vez que as técnicas atuais são economicamente dispendiosas e paliativas. A biorremediação de pesticidas utilizando microrganismos tem se mostrado uma técnica muito promissora para essa finalidade, por apresentar vantagens econômicas e ambientais. Para ser utilizado nesta técnica promissora, um microrganismo deve ser capaz de 
	
	
	
	Apresentar alta taxa de mutação ao longo das gerações. 
	
	
	Estimular o sistema imunológico do homem contra o contaminante. 
	
	
	Transferir o contaminante do solo para a água. 
	
	
	Metabolizar o contaminante, liberando subprodutos menos tóxicos ou atóxicos. 
	
	
	Absorver o contaminante sem alterá-lo quimicamente. 
		Explicação: 
A resposta correta é:Metabolizar o contaminante, liberando subprodutos menos tóxicos ou atóxicos.