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As defesas do organismo contra a infecção incluem barreiras naturais, como a pele, mecanismos inespecíficos, como certos tipos de glóbulos brancos e a febre, e mecanismos específicos, como os anticorpos. Assim, a função do sistema imunológico é a de reconhecer os agentes agressores e defender o organismo da sua acção. Durante o processo de recrutamento, os leucócitos migram do sangue para dentro do tecido, atravessando as paredes das vênulas pós-capilares. Algumas moléculas especializadas da superfície das células endoteliais possuem um papel crucial neste processo. A pele é a primeira defesa do corpo humano contra uma infecção. Ela possui uma barreira impenetrável de epitélio protegido por camadas de células queratinizadas. Em continuidade com a pele estão os epitélios que revestem os tratos respiratório, gastrintestinal e urogenital. Essas superfícies são conhecidas como superfícies mucosas (ou apenas mucosas), por serem continuamente banhadas pelo muco que secretam. Essa camada de fluido espesso contém glicoproteínas, proteoglicanos e enzimas que protegem as células epiteliais contra danos e ajudam a limitar a infecção. "Enzimas antimicrobianas, como a lisozima, iniciam a digestão da parede celular bacteriana; peptídeos antimicrobianos, como as defensinas, lisam diretamente a membrana da célula bacteriana; e um sistema de proteínas plasmáticas, conhecidas como sistema do complemento, direcionam-se aos patógenos para lise e para fagocitose por células do sistema imune inato, como os macrófagos." Veja agora como estão organizadas as linhas de defesa da nossa imunidade inata. A doença de Crohn é uma doença inflamatória intestinal de origem desconhecida, que consiste na perda de função por mutações em NOD2 em humanos.
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