BIOQUÍMICA AULA 01 UFPE

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A bioquímica é o estudo da química da vida (literalmente)
Assim como outras ciências, depende de instrumentos sofisticados para dissecar a 
arquitetura e funcionamento de sistemas inacessíveis aos sentidos humanos. 

ORIGEM DA VIDA 
CONCEITOS-CHAVE 
As moléculas biológicas são construídas a partir de um número limitado de 
elementos. 

Certos grupos funcionais e ligações caracterizam diferentes tipos de 
biomoléculas. 

Durante a evolução química, compostos simples se condensaram para formar 
moléculas mais complexas e polímeros. 

Moléculas autorreplicantes teriam se submetido à seleção natural
○
CARACTERÍSTICAS COMUNS A TODOS ORGANISMOS:
O modo como a informação hereditária é codificada e expressa (como as 
moléculas biológicas são construídas e degradadas para a produção de energia)

A unidade genética e bioquímica subjacente dos organismos atuais sugere que 
eles descendam de um ancestral único

○
AS MOLÉCULAS BIOLÓGICAS SURGIRAM DE MATERIAIS INORGÂNICOS 
A matéria viva consiste em um número relativamente pequeno de elementos 
C, H, O, N, P, Ca e S são responsáveis por 97% do peso do corpo humano □
A evidência fóssil da vida mais antiga que se conhece é de em torno de 3,5 
bilhões de anos. A era pré-biótica anterior, que começou com a formação da 
Terra há aproximadamente 4,6 bilhões de anos, não deixou nenhum registro 
direto, mas os cientistas podem experimentalmente reproduzir os tipos de 
reações químicas que podem ter dado origem aos organismos vivos durante 
aquele período de bilhões de anos. 
□
A atmosfera da Terra primitiva provavelmente consistia em compostos 
pequenos e simples, como H2O, N2, CO2, e quantidades menores de CH4 e 
NH3. 
□
Na década de 1920, Alexander Oparin e J. B. S. Haldane sugeriram 
independentemente que a radiação ultravioleta do sol ou as descargas dos 
relâmpagos levaram as moléculas da atmosfera primordial a reagirem para 
formar compostos orgânicos (contendo carbono) simples. 
□
Esse processo foi replicado em 1953 por Stanley Miller e Harold Urey, que 
submeteram uma mistura de H2O, CH4, NH3 e H2 a descargas elétricas por 
cerca de uma semana. 
□
A solução resultante continha compostos orgânicos solúveis em água, 
incluindo vários aminoácidos (os componentes das proteínas) e outros 
compostos bioquimicamente significativos
□
As moléculas orgânicas primitivas se tornaram os precursores de uma 
enorme variedade de moléculas biológicas. 
□
Essas podem ser classificadas de várias maneiras, dependendo da sua 
composição e reatividade química. 
□
Uma familiaridade com a química orgânica é útil para reconhecer os grupos 
funcionais (porções reativas) das moléculas bem como as ligações (arranjos 
de ligações) entre elas, uma vez que essas características determinam em 
última análise a atividade biológica das moléculas
□

○
1.
Aula 01 - Introdução à química da vida (Livro 
fundamentos da bioquímica - Voet)
segunda-feira, 5 de junho de 2023 10:14
 
□
COMPLEXOS SISTEMAS AUTORREPLICANTES EVOLUÍRAM DE MOLÉCULAS 
SIMPLES 
Durante um período de evolução química, moléculas orgânicas simples se 
condensaram para formar moléculas orgânicas mais complexas ou se 
combinaram pelas extremidades como polímeros de unidades repetitivas. 

Em uma reação de condensação, moléculas de água são perdidas. A taxa de 
condensação de compostos simples para formar um polímero estável deve, 
portanto, ser maior do que a taxa de hidrólise (quebra pela adição de moléculas de 
água). 

No ambiente pré-biótico, minerais como as argilas podem ter catalisado reações 
de polimerização e retirado os produtos de reação da água. 

O tamanho e a composição das macromoléculas pré-bióticas teriam sido limitados 
pela disponibilidade dos materiais iniciais de pequenas moléculas, pela eficiência 
com que eles poderiam se juntar e pela sua resistência à degradação. 

Principais polímeros biológicos e seus monômeros componentes
Polímero Monômero 
PROTEÍNA (PEPTÍDEO) AMINOÁCIDO
ÁCIDO NUCLEICO (POLINUCLEOTÍDEO) NUCLEOTÍDEO
POLISSACARÍDEO (CARBONATO COMPLEXO) MONOSSACARÍDEO 
○
 
POLISSACARÍDEO (CARBONATO COMPLEXO) MONOSSACARÍDEO 
(CARBOIDRATO SIMPLES)
Obviamente, a combinação de diferentes monômeros e de seus vários grupos 
funcionais em uma única e grande molécula aumenta a versatilidade química 
daquela molécula, fazendo-a realizar atividades além do alcance das moléculas 
mais simples (esse princípio das propriedades emergentes pode ser expresso 
como “o todo é maior do que a soma das partes”). 

Macromoléculas separadas com arranjos complementares de grupos funcionais 
podem se associar umas às outras, dando origem a conjuntos moleculares mais 
complexos com um espectro ainda maior de possibilidades funcionais. 

O pareamento específico entre grupos funcionais complementares permite que o 
membro de um par determine a identidade e orientação do outro membro. Essa 
complementaridade torna possível uma macromolécula replicar-se, ou copiar a si 
mesma, ao comandar a montagem de uma nova molécula a partir de unidades 
complementares menores. 


Um fenômeno semelhante é central à função do DNA, em que a sequência de 
bases em uma fita (p. ex., A-C-G-T) especifica completamente a sequência de 
bases na fita a qual ela está pareada (T-G-C-A). 

Quando o DNA se replica as duas fitas se separam e direcionam a síntese das fitas-
filhas complementares. A complementaridade também é a base para a transcrição 
do DNA em RNA e para a tradução do RNA em proteína. 

Um momento crucial na evolução química foi a transição de sistemas de 
moléculas geradas aleatoriamente para sistemas em que as moléculas eram 
organizadas e especificamente replicadas. 
Assim que as macromoléculas ganharam a capacidade de se autoperpetuar, 
o ambiente primitivo teria se tornado rico em moléculas mais capazes de 
sobreviver e multiplicar. Sem dúvida, os primeiros sistemas replicadores 
eram pouco eficientes, com uma progênie de moléculas imperfeitamente 
complementar aos seus pais. 
□
Ao longo do tempo, a seleção natural teria favorecido moléculas que 
fizessem cópias mais acuradas de si próprias.
□

REVISÃO 
• Quais quatro elementos ocorrem em virtualmente todas as moléculas biológicas? 
• Resuma os principais estágios da evolução química. 
• Treine desenhando uma reação simples de condensação e hidrólise. 
• Explique por que a complementaridade seria necessária para o desenvolvimento de 
moléculas autorreplicantes
ARQUITETURA CELULAR 
CONCEITOS-CHAVE 
A compartimentalização das células promove a eficiência ao manter altas as 
concentrações locais de reagentes. 

As vias metabólicas evoluíram para sintetizar moléculas e gerar energia. 
As células mais simples são procariotos. 
○
2.
 
As células mais simples são procariotos. 
Os eucariotos são caracterizados por várias organelas envoltas por dupla 
membrana, incluindo um núcleo. 

A árvore filogenética da vida inclui três domínios: bactérias, archaea e eucaria. 
A evolução ocorre à medida que a seleção natural age sobre variações que 
ocorrem aleatoriamente entre os indivíduos

Os tipos de sistemas descritos até agora tiveram que competir com todos os outros 
componentes da Terra primitiva pelos recursos disponíveis. 
Uma vantagem seletiva seria obtida por um sistema que fosse sequestrado e 
protegido por limites de algum tipo. Como esses limites surgiram primeiro ou 
mesmo do que eles eram feitos são questões ainda inexplicáveis. 

○
Uma teoria é a de que vesículas (sacos preenchidos por líquido) membranosas primeiro 
se ligaram a sistemas autorreplicantes e depois os incorporaram. Essas vesículas 
teriam se tornado as primeiras células. 
○
AS CÉLULAS EXECUTAM REAÇÕES METABÓLICAS 
São muitas as vantagens da compartimentalização. 
Além de receber alguma proteção das forças ambientais adversas, um sistema 
fechado pode manter altas concentrações locais de componentes que de outro 
modo se difundiriam para longe. Substâncias mais concentradas podem reagirmais prontamente, levando a maior eficiência na polimerização e outros tipos de 
reações químicas. 

Um compartimento envolvido por membrana que protege seu conteúdo se 
tornaria sua composição gradativamente bem diferente daquela do meio à sua 
volta. 

As células modernas contêm altas concentrações de íons, pequenas moléculas e 
grandes agregados moleculares encontrados apenas em vestígios – se o forem –
fora da célula. 
Por exemplo, a célula de Escherichia coli (E. coli) contém milhões de 
moléculas representando cerca de 3.000 a 6.000 compostos diferentes. Uma 
típica célula animal pode conter 100.000 tipos diferentes de moléculas. 
□

As células primitivas dependiam do ambiente para fornecer matérias-primas. 
À medida que alguns dos componentes essenciais na mistura pré-biótica se 
tornaram escassos, a seleção natural favoreceu organismos que 
desenvolveram mecanismos para sintetizar os compostos necessários a 
partir de precursores mais simples, porém mais abundantes. 
□

As primeiras reações metabólicas podem ter empregado catalisadores metálicos 
ou de argila (catalisador é uma substância que promove uma reação química sem 
que ela sofra alteração). 
De fato, os íons metálicos ainda estão no cerne de muitas reações químicas 
nas células modernas. 
□
Alguns catalisadores também podem ter surgido de moléculas poliméricas 
que tinham os grupos funcionais apropriados. 
□

Em geral, as reações biossintéticas precisam de energia; portanto, as primeiras 
reações celulares também precisavam de uma fonte de energia. O consequente 
esgotamento das substâncias ricas em energia preexistentes no meio pré-biótico 
teria favorecido o desenvolvimento de vias metabólicas produtoras de energia. 
Por exemplo, a fotossíntese se desenvolveu relativamente cedo para tirar 
proveito de uma fonte de energia praticamente inesgotável: o sol. Entretanto, 
o acúmulo do O2 gerado a partir da H2O por fotossíntese (a atmosfera 
moderna tem 21% de O2) representou um desafio adicional aos organismos 
adaptados à vida em uma atmosfera pobre em oxigênio. 
□

Por fim, aperfeiçoamentos metabólicos permitiram aos organismos não apenas 
evitar o dano oxidativo, mas usar o O2 para o metabolismo oxidativo, forma muito 
mais eficiente de metabolismo energético do que o metabolismo anaeróbio. 
Vestígios da vida antiga podem ser vistos no metabolismo anaeróbio de certos 
organismos modernos. 

Os organismos primitivos que desenvolveram estratégias metabólicas para 
○
 
Os organismos primitivos que desenvolveram estratégias metabólicas para 
sintetizar moléculas biológicas, conservar e utilizar energia de maneira 
controlada e replicar- -se no interior de um compartimento protetor eram capazes 
de se propagar em uma variedade de habitats cada vez maior. 

A adaptação das células a diferentes condições externas, em última análise, levou 
à atual diversidade de espécies. A especialização de células individuais também 
tornou possível que grupos de células diferenciadas trabalhassem juntos em 
organismos multicelulares. 

HÁ DOIS TIPOS DE CÉLULAS: PROCARIÓTICAS E EUCARIÓTICAS
Todos os organismos modernos baseiam-se na mesma unidade morfológica, a 
célula. 

Há duas classificações principais das células: 
As eucarióticas (do grego eu, bom ou verdadeiro 1 karyon, núcleo ou noz), 
que têm núcleo envolvido por membrana encapsulando seu DNA
Eucariotos, tanto multicelulares quanto unicelulares, são imensamente 
mais complexos do que os procariotos. (Os vírus são entidades muito 
mais simples do que as células e não são classificados como vivos, pois 
não têm o aparato metabólico para se reproduzirem fora de suas células 
hospedeiras.)

Células eucarióticas geralmente têm 10 a 100 mm de diâmetro; por isso, 
têm de mil a um milhão de vezes o volume típico das procarióticas. 

O que melhor caracteriza as células eucarióticas não é o tamanho, mas a 
profusão de organelas envolvidas por membranas. Além de um núcleo, 
as eucarióticas têm um retículo endoplasmático, local da síntese de 
vários componentes celulares, alguns dos quais são posteriormente 
modificados no aparelho de Golgi. A maior parte do metabolismo 
aeróbio ocorre nas mitocôndrias em quase todos os eucariotos, e 
células fotossintetizantes contêm cloroplastos. Outras organelas, como 
os lisossomos e peroxissomos, realizam funções especializadas. 
Vacúolos, mais proeminentes em células vegetais do que em células 
animais, em geral funcionam como depósitos de armazenamento. O 
citosol (o citoplasma menos suas organelas envolvidas por membranas) 
é organizado pelo citoesqueleto, extenso conjunto de filamentos que 
também fornece à célula sua forma e capacidade de locomoção. 

As várias organelas que compartimentalizam as células eucarióticas 
representam um nível de complexidade em grande parte ausente nas 
células procarióticas. 

□
As procarióticas (do grego pro, antes), que não têm núcleo. 
Os procariotos, compreendendo os vários tipos de bactérias, têm 
estruturas relativamente simples e são quase todos unicelulares 
(embora possam formar filamentos ou colônias de células 
independentes). 

Os procariotos são os organismos mais numerosos e mais difundidos na 
Terra. Isso se dá uma vez que seus diferentes metabolismos, altamente 
adaptáveis, os permitem viver em uma enorme variedade de habitats. 

Os procariotos variam em tamanho de 1 a 10 mm e apresentam três 
formas básicas: esferoidal (cocos), em bastão (bacilos) e espiralados em 
hélice (espirilos). 

Exceto por uma membrana celular externa, que, na maioria dos casos, é 
envolvida por uma parede celular protetora, quase todos os procariotos 
não apresentam membranas celulares. 

Entretanto, o citoplasma procariótico (conteúdo celular) não é de forma 
alguma uma mistura homogênea. Diferentes funções metabólicas são 
executadas em diferentes regiões do citoplasma. 

O procarioto melhor caracterizado é a Escherichia coli, bactéria em 
bastão de 2 por 1 mm que habita o colo de mamíferos.

□

No entanto, os procariotos são mais eficientes do que os eucariotos em vários 
○
 
No entanto, os procariotos são mais eficientes do que os eucariotos em vários 
aspectos. 
Os procariotos exploraram as vantagens da simplicidade e miniaturização. □
Suas taxas de crescimento rápido lhes permitem ocupar os nichos ecológicos 
em que podem existir grandes variações de nutrientes disponíveis. 
□

Em contrapartida, a complexidade dos eucariotos, que lhes torna maiores e de 
crescimento mais lento que os procariotos, lhes dá a vantagem competitiva em 
ambientes estáveis com recursos limitados. 

É, portanto, errôneo considerar os procariotos como evolutivamente primitivos 
em relação aos eucariotos. 
Ambos os tipos de organismos estão bem adaptados aos seus respectivos 
modos de vida
□

DADOS MOLECULARES REVELAM TRÊS DOMÍNIOS EVOLUTIVOS DE ORGANISMOS 
A prática de reunir todos os procariotos em uma única categoria com base naquilo 
que não possuem – o núcleo – dificulta sua diversidade metabólica e história 
evolutiva. 

Em sentido oposto, a impressionante diversidade morfológica de organismos 
eucariotos (considere as diferenças anatômicas entre, por exemplo, amebas, 
carvalhos e seres humanos) esconde sua similaridade básica no nível celular. 
Os esquemas taxonômicos tradicionais (taxonomia é a ciência da 
classificação biológica), que se baseiam na morfologia macroscópica, se 
mostraram inadequados para descrever as relações reais entre organismos, 
conforme reveladas por sua história evolutiva (filogenia). 
□

Esquemas de classificação biológica com base em estratégias reprodutivas ou de 
desenvolvimento refletem mais precisamente a história evolutiva do que com 
base apenas na morfologia do adulto. Porém, relações filogenéticas são melhor 
deduzidas ao se comparar moléculas poliméricas – RNA, DNA ou proteína – de 
diferentes organismos. 
Por exemplo, a análise de RNA levou Carl Woese a agrupar todos os 
organismos em três domínios.As archaea (também conhecidas como arqueobactérias) são um grupo 
de procariotos tão distantemente aparentados com outros procariotos 
(as bactérias, algumas vezes chamadas de eubactérias) quanto ambos os 
grupos o são em relação aos eucariotos (eucaria). 

As archaea incluem alguns organismos incomuns: as bactérias 
metanogênicas (que produzem CH4), as halobactérias (que proliferam 
em soluções hipersalinas concentradas) e certos termófilos (que 
habitam fontes termais). 

□
O padrão de ramificações no diagrama de Woese indica a divergência de 
diferentes tipos de organismos (cada ponto de ramificação representa um 
ancestral comum). 
□

O esquema de três domínios também mostra que animais, plantas e fungos 
constituem apenas uma pequena porção de todas as formas de vida. Tais árvores 
filogenéticas completam o registro fóssil, que fornece um registro irregular da 
vida antes de cerca de 600 milhões de anos atrás (organismos multicelulares 
surgiram há cerca de 700 a 900 milhões de anos). 
É pouco provável que os eucariotos sejam descendentes de um único 
procarioto, pois as diferenças entre bactérias e eucariotos são muito 
profundas. Em vez disso, os eucariotos provavelmente evoluíram da 
associação entre células de arqueobactérias e eubactérias. 
□
O material genético eucariótico apresenta características que sugerem 
origem arqueobacteriana. 
□
Além disso, as mitocôndrias e os cloroplastos das células eucarióticas 
modernas lembram os das bactérias em tamanho e forma, e os dois tipos de 
organelas contêm seu próprio material genético e sua própria maquinaria de 
síntese proteica. 
□
Evidentemente, como proposto por Lynn Margulis, mitocôndrias e □

○
 
Evidentemente, como proposto por Lynn Margulis, mitocôndrias e 
cloroplastos se desenvolveram a partir de bactérias de vida livre que 
formaram relações simbióticas (mutuamente benéficas) com uma célula 
eucariótica primordial. De fato, certos eucariotos sem mitocôndrias ou 
cloroplastos permanentemente abrigam bactérias simbióticas.
□
OS ORGANISMOS CONTINUAM A EVOLUIR 
A seleção natural que guiou a evolução pré-biótica continua a dirigir a evolução 
dos organismos. 
Richard Dawkins comparou a evolução a um relojoeiro cego capaz de 
produzir complexidade aleatoriamente, embora tal imagem falhe em 
transmitir a vasta quantidade de tempo e o modo gradual, com base em 
tentativa e erro, pelo qual os organismos complexos aparecem. 
□

Pequenas mutações (mudanças no material genético de um indivíduo) surgem 
aleatoriamente como resultado de dano químico ou erros inerentes no processo 
de replicação. 
Uma mutação que aumente as chances de sobrevivência do indivíduo, 
aumenta a probabilidade de que a mutação seja transmitida para a próxima 
geração. 
□
Mutações genéticas tendem a se espalhar rapidamente por uma população; 
mudanças deletérias tendem a desaparecer junto com os organismos que as 
apresentam. 
□

A teoria de evolução por seleção natural, inicialmente articulada por Charles 
Darwin na década de 1860, foi confirmada por meio de observação e 
experimentação. Portanto, é útil destacar vários princípios importantes –
frequentemente mal compreendidos – da evolução: 
A evolução não é direcionada a um objetivo em particular. 
Ela procede por variações aleatórias que podem afetar a capacidade de 
um organismo de se reproduzir sob as condições existentes. Um 
organismo que esteja bem adaptado ao seu ambiente pode ter 
desempenho melhor ou pior quando as condições se alteram 

□
A variação entre indivíduos permite que os organismos se adaptem a 
mudanças inesperadas. 
Por esse motivo, populações geneticamente homogêneas (p. ex., 
lavouras de milho) são tão suscetíveis a mudanças simples (p. ex., 
doenças fúngicas). Uma população mais heterogênea provavelmente 
inclui indivíduos que consigam resistir à adversidade e se recuperar. 

□
O passado determina o futuro. 
Novas estruturas e funções metabólicas emergem dos elementos 
preexistentes. Por exemplo, as asas de insetos não surgiram 
espontaneamente, mas parecem ter se desenvolvido gradualmente a 
partir de pequenas estruturas termorregulatórias. 

□
A evolução é contínua, embora ela não prossiga exclusivamente na direção 
da complexidade. 
Uma visão antropocêntrica coloca os seres humanos no ápice do 
esquema evolutivo, mas uma rápida pesquisa da diversidade da vida 
revela que as espécies mais simples não se extinguiram ou pararam de 

□

○

 
revela que as espécies mais simples não se extinguiram ou pararam de 
evoluir.
REVISÃO
Explique as vantagens seletivas da compartimentalização e vias metabólicas. ○
Discuta as diferenças entre procariotos e eucariotos. ○
Faça uma lista das principais organelas eucarióticas e suas funções. ○
Explique por que uma taxonomia com base em sequências moleculares é mais precisa 
do que uma com base em morfologia. 
○
Quais dos três domínios são procariotos? Que domínio é o mais semelhante aos 
eucariotos? 
○
Explique como variações individuais permitem que a evolução ocorra. ○
Por que a mudança evolutiva é limitada pelo seu passado, mas impossível de se prever?○
