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ELETROFORESE EM GEL DE AGAROSE (analítica e preparativa) PREPARO DO GEL DE AGAROSE (0,8%): 1. Para 100mL de gel, pesar 0,8g de agarose. 2. Adicionar 100mL de TAE 1X. 3. Fundir a solução no microondas até homogeneizar (aproximadamente 1 min e 10 seg na potência máxima – evitar fervura). 4. Enquanto a solução de gel esfria (morno), preparar o suporte de gel, selando as laterais com fita crepe ou na própria cuba. 5. Acrescentar 40μL de Brometo de Etídeo (10mg/mL) e misturar com agitação leve. Obs.: Brometo de Etídio é mutagênico e deve ser manuseado com luvas. 6. Despejar a solução de gel no suporte sem fazer bolhas. 7. Colocar o pente da espessura desejada no suporte. Obs.: Verificar o número e o volume das amostras para escolher o pente mais adequado. 8. Esperar a solução solidificar. 9. Colocar o suporte com o gel na cuba de eletroforese. Adicionar tampão TAE 1X até cobrir a superfície do gel. ANALÍTICA: 1. Extrair 3μL da amostra de DNA. 2. Homogeinizar com 1μL de tampão de corrida 5X (Loading Buffer). 3. Aplicar as amostras nos poços. 4. Reservar 2 poços para utilização de um padrão de corrida (Ladder-1Kb). 5. Ajustar a voltagem de acordo com o tempo de corrida desejado (média utilizada 80V). 6. Analisar o gel sob radiação ultravioleta (Alpha Imager). 7. Tirar foto dos resultados obtidos. PREPARATIVA: 1. Adicionar tampão de corrida ao material a ser purificado (diluição de 5X). 2. Aplicar as amostras nos poços, pulando um poço entre cada amostra para evitar contaminação. Para volumes maiores, montar o gel com o pente de dentes largos ou unir os dentes do pente com fita adesiva antes de colocar o pente no gel ainda líquido (morno). 3. Aplicar em outro poço o padrão de tamanho molecular (Ladder-1kb). 4. Ajustar a voltagem de acordo com o tempo de corrida desejado (média utilizada 80V). 5. Vizualizar as bandas no gel utilizando a luz ultravioleta manual no comprimento de onda longo. 6. Cortar a banda desejada utilizando bisturi limpo e colocá-la em um tubo de microcentrífuga previamente pesado. 7. Seguir protocolo de Purificação de DNA a partir de Gel. QUESTÕES PARA DISCUSSÃO NO RELATÓRIO: 1 - O resultado da corrida foi satisfatório? Em caso negativo, explique as possíveis causas do erro. 2 - Diferencie as seguintes técnicas: Western blot, Southern blot e Northern blot. 3 -(UFES/2013) A impressão digital do DNA é rotineiramente usada na determinação de paternidade. A técnica consiste em extrair o DNA dos glóbulos brancos do sangue coletado da mãe, da criança e do(s) suposto(s) pai(s). O DNA de cada indivíduo é tratado com a mesma enzima de restrição, e os fragmentos obtidos são separados, formando-se, assim, o padrão de banda de cada indivíduo. Legenda: M – mãe; F – filho; SP1 – suposto pai 1; SP2 – suposto pai 2 a) No esquema de um gel mostrado acima, indique o pai biológico da criança. Justifique a sua indicação. b) Cite uma aplicação da investigação do DNA na análise forense e uma na prática clínica. c) A maioria das células eucarióticas é diploide; seus dois conjuntos de cromossomos podem ser dispostos em pares de homólogos. Por outro lado, as células eucarióticas haploides contêm um único conjunto de cromossomos. Na espécie humana, é possível encontrar tanto células diploides, como células haploides. Indique os tipos celulares que exemplificam o genoma haploide e diploide, respectivamente, na espécie humana.
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