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Capítulo 3 • Energia, catálise e biossíntese 101 Dessa maneira, cada uma das moléculas presentes no citosol colidirá com um grande número de moléculas a cada segundo. À medida que as moléculas pre- sentes em um líquido colidirem entre si e se empurrarem mutuamente, cada uma delas se moverá primeiro em uma direção e depois em outra. Assim, o percurso será um caminho aleatório (Figura 3-22). Embora o citosol das células seja densamente preenchido com moléculas de vários tamanhos e formas (Figura 3-23), as moléculas orgânicas pequenas se difundem nesse gel aquoso praticamente com a mesma rapidez quanto se difun- dem em água. Isso foi demonstrado por meio de experimentos nos quais coran- tes fluorescentes e outras moléculas marcadas foram injetadas no citosol. Uma molécula orgânica pequena, como um substrato, leva apenas cerca de um quinto de segundo, em média, para difundir-se a uma distância de 10 μm. A difusão é, portanto, um modo eficiente que as moléculas pequenas têm para se moverem a distâncias limitadas no interior das células. A velocidade com que uma enzima encontra o seu substrato depende da concentração do substrato, pois as proteínas se difundem no citosol muito mais vagarosamente que as moléculas pequenas. Os substratos mais abundantes es- tão presentes nas células em concentrações de aproximadamente 0,5 mM. Uma vez que a concentração da água pura é de 55 M, há, nas células, apenas uma dessas moléculas de substrato para cada 105 moléculas de água. Apesar disso, o sítio da enzima que se liga ao substrato é bombardeado pelo substrato por cerca de 500.000 colisões aleatórias por segundo. Para uma concentração de substrato dez vezes menor (0,05 mM), o número de colisões diminui para 50.000 por segun- do, e assim por diante. Os encontros aleatórios entre uma enzima e o seu substrato geralmente le- vam à formação de um complexo enzima-substrato. Essa associação é estabili- zada pela formação de múltiplas ligações fracas entre a enzima e o substrato. Es- sas interações fracas, que podem incluir ligações de hidrogênio, atrações de van der Waals e atrações eletrostáticas (discutidas no Capítulo 2), persistem até que a energia cinética faça com que as moléculas se dissociem novamente. Quando as duas moléculas que colidem possuem superfícies que não se ajustam bem, são formadas poucas ligações não covalentes, e a energia total é desprezível, em comparação com a energia cinética. Nesse caso, as duas moléculas se dissociam tão rapidamente quanto se associaram (ver Figura 2-33). É isso que evita associa- ções incorretas e indesejadas entre moléculas que não se ajustam entre si, como ocorre entre uma enzima e um substrato errado. Entretanto, caso a enzima e o substrato se encaixem bem, formam muitas interações fracas que permitem que enzima e substrato permaneçam unidos um tempo suficiente para que uma li- gação covalente, na molécula do substrato, possa ser formada ou rompida. O co- nhecimento das velocidades com as quais as moléculas colidem e se afastam e também da rapidez com que as ligações podem ser formadas ou rompidas contri- bui para que a velocidade da catálise enzimática pareça menos impressionante. Distância líquida percorrida 100 nm QUESTÃO 3-5 A enzima anidrase carbônica é uma das enzimas mais rápidas conheci- das. Ela catalisa a rápida conversão de CO2 gasoso em íon bicarbo- nato (HCO3 –), muito mais solúvel. A reação: CO2 + H2O ↔ HCO3 – + H+ é muito importante para um trans- porte eficiente de CO2 dos tecidos, onde o CO2 é produzido pela respi- ração, para os pulmões, onde é exa- lado. A anidrase carbônica acelera a reação em 107 vezes, hidratando, na velocidade máxima, 105 moléculas de CO2 por segundo. O que se pode supor sobre o fator limitante da velocidade dessa enzima? Faça um esquema análogo ao mostrado na Figura 3-13 para representar a ace- leração de 107 vezes. Figura 3-22 As moléculas atravessam o citosol em uma trajetória aleató- ria. Em uma solução, as moléculas se movem de maneira aleatória em razão dos constantes golpes que recebem pelas colisões com outras moléculas. Esse movimento possibilita que as moléculas pequenas se difundam rapida- mente pelo citosol das células (Animação 3.2). Figura 3-23 O citosol é repleto de moléculas distintas. Estão mostradas, em escala, apenas as macromoléculas. RNA em azul, ribossomos em verde e proteínas em vermelho. Enzimas e outras macromoléculas se difundem relati- vamente pouco no citosol, em parte porque elas interagem com uma grande quantidade de outras macromoléculas. As moléculas pequenas, ao contrário, podem difundir-se quase tão rapidamente quanto se difundem em água. (Adaptada de D.S. Goodsell, Trends Biochem. Sci. 16:203–206, 1991. Com autorização de Elsevier.) Alberts_03.indd 101Alberts_03.indd 101 16/01/2017 09:10:2516/01/2017 09:10:25
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