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ARA0484 Biotecnologia e Bioinformática Alice Ornelas @ornelas_alicem Biomédica (UFF) Mestre em Imunologia Básica e Aplicada (USP- FMRP) Doutora em Genética (UFRJ) Planos de Aula (16 semanas) 2% 75% 4 aulas Crédito presencial ATIVIDADE PRÁTICA SUPERVISIONADA 12 aulas Distribuição dos Planos de aula Nestas 4 aulas, o aluno explora o conteúdo digital e discute/aplica este conhecimento em sala de aula. 12 aulas com uso de metodologias ativas com protagonismo do aluno e a orientação do professor. BIOTECNOLOGIA E BIOINFORMÁTICA 4 aul as 12 aul as ATIVIDADE PRÁTICA SUPERVISIONADA Crédito presencial Tema 1 – ENGENHARIA GENÉTICA E DNA RECOMBINANTE 1.1 CONCEITOS, HISTÓRICO E BASES DA BIOTECNOLOGIA 1.2 MARCADORES MOLECULARES 1.3 TECNOLOGIA DO DNA RECOMBINANTE 1.4 EXPRESSÃO DE PROTEÍNAS RECOMBINANTES EM BACTÉRIAS E BIBLIOTECAS DE DNA E CDNA Tema 2 – BIOTECNOLOGIA NA SAÚDE 3.1 SEQUENCIAMENTO DE DNA E MICROARRANJO 3.2 CÉLULAS TRONCO 3.3 TERAPIA GÊNICA 3.4 FARMACOGENÔMICA Tema 3– APLICAÇÕES DA BIOTECNOLOGIA 4.1 BIOTECNOLOGIA VEGETAL 4.2 BIOTECNOLOGIA ANIMAL 4.3 BIOTECNOLOGIA AMBIENTAL 4.4 BIOTECNOLOGIA INDUSTRIAL Tema 4 – Controle da expressão gênica 4.1 Mecanismos de regulação gênica em procariotos 4.2 Mecanismos de regulação gênica em eucariotos 4.3 Epigenética Aulas 1 -4 Aulas 5-8 Aulas 9-12 Aulas 10-12 Tema 5 – ANOTAÇÃO GÊNICA 6.1 BANCOS DE DADOS: FUNÇÕES E UTILIZAÇÕES 6.2 ANOTAÇÃO GÊNICA 6.3 ÔMICAS: CONCEITOS E APLICAÇÕES Aulas 15-16 Tema 4 – NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS 5.1 NCBI: FUNÇÕES E APLICAÇÕES 5.2 ALINHAMENTO: TIPOS E PROGRAMAS UTILIZADOS 5.3 PRIMERS: DEFINIÇÃO, CARACTERÍSTICAS E CONSTRUÇÃO Aulas 13 -14 http://portaldoaluno.webaula.com.br/cursos_graduacao/temas/a_motivacao_e_o_trabalho/index.html Sistema de avaliação Os procedimentos de avaliação contemplarão as competências desenvolvidas durante a disciplina, divididos da seguinte forma: AV e AVS • AV: Contemplará todos os temas abordados pela disciplina e será assim composta: - Prova individual no formato PNI - Prova Nacional Integrada com valor total de 8,0 e as demais atividades acadêmicas avaliativas devem somar 2 (dois) pontos. A soma de todos os instrumentos que possam vir a compor o grau final da AV não poderá ultrapassar o grau máximo de 10 (dez) pontos. • AVS; Contemplará todos os temas abordados pela disciplina. Será composta por uma prova no formato PNI Prova Nacional Integrada, com total de 10 pontos, e substituirá a nota da AV, caso seja maior. • Para aprovação na disciplina, deverá atingir nota igual ou superior a 6 (seis) na prova de AV ou AVS e frequentar, no mínimo, 75% das aulas ministradas. • Avaliando Aprendizado 1 - Disciplinas Presenciais | TEAMS (aplicado pelo PROFESSOR EM SALA) Valor: 2,0 pontos. • Avaliando Aprendizado 2 - Disciplinas Presenciais | TEAMS • AV - Disciplinas Presenciais | TEAMS • Data Nova Chance AV a definir • AVS - Disciplinas Presenciais | TEAMS Sistema de avaliação – consulte as datas no calendário acadêmico BRUNO, A.N. Biotecnologia II: aplicações e tecnologias. Porto Alegre: Artmed, 2017. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/#/books/9788582713853/cfi/6/2!/4/2@0:0 RESENDE, R.R.; SOCCOL, C.R. Biotecnologia Aplicada à Saúde: Fundamentos e Aplicações. São Paulo: Blucher, 2015. 1. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/#/books/9788521208976/cfi/0!/4/2@100:0.00 RESENDE, R.R; SOCCOL, C.R. Biotecnologia Aplicada à Saúde: Fundamentos e Aplicações. São Paulo: Blucher, 2015. 2. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/#/books/9788521209256/cfi/0!/4/2@100:0.00 BATISTA, B.G. et al. Biologia molecular e biotecnologia.. Porto Alegre: SAGAH, 2018. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/#/books/9788595024465/cfi/1!/4/4@0.00:50.9 BRUNO, A.N. Biotecnologia I: princípios e métodos. Porto Alegre: Artmed, 2014. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/#/books/9788582711019/cfi/0!/4/2@100:0.00 PIMENTA, C.A.M. Genética aplicada à biotecnologia.. São Paulo: Érica, 2015. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/#/books/9788536520988/cfi/9!/4/4@0.00:18.3 RESENDE, R.R. Biotecnologia aplicada à agroindústria: fundamentos e aplicações. São Paulo: Blucher, 2016. 4. Disponível em: https://integrada.minhabiblioteca.com.br/#/books/9788521211150/cfi/8!/4/2@100:0.00 Aula 01 -Conceitos, Histórico e Bases da Biotecnologia Alice Ornelas @ornelas_alicem Biomédica (UFF) Mestre em Imunologia Básica e Aplicada (USP- FMRP) Doutora em Genética (UFRJ) https://www.menti.com/ixysicbtjm Pergunta norteadora Roteiro da aula 1. Conceitos; 2. Histórico; 3. Bases da Biotecnologia; 4. Tipos de Biotecnologia; 5. Modelos em Biotecnologia. 12 https://produto.mercadolivre.com.br/MLB-1042861339-kit-9-display-cientista-totem-chao-mesa-mdf-festa-_JM 13 Conceitos Biotecnologia A palavra tem origem grega, onde “bio” significa vida, “tecnos” remete à técnica e “logos” quer dizer “conhecimento”. 1. tecnologia que gera produtos e processos de origem biológica; 2. espectro ou conjunto de tecnologias moleculares aplicadas ao estudo de microrganismos, plantas e animais. 14 15 Histórico ▪ 8000 a.C., Mesopotâmia: os povos selecionavam sementes de plantas para aumentar a colheita. ▪ 7000-6.500 a.C., Babilônia: os povos descobriram que poderiam usar microrganismos vivos (leveduras) para fermentar pães (trigo), bebidas (uva) e outros alimentos (Biotecnologia clássica); Até hoje, queijos, iogurtes, bolos e vinhos são produzidos com a ajuda de bactérias, fungos, algas e até alguns tipos de vírus. https://www.meusresumos.com/historia/mesopotamia/ 16 Histórico ▪ 1675, Van Leeuwenhock: por meio da construção e da utilização de um microscópio com capacidade de ampliação de 270x, descreveu a existência de seres minúsculos que poderiam ser os agentes responsáveis pela fermentação; https://micro.magnet.fsu.edu/optics/timeline/people/leeuwenhoek.html https://www.behance.net/gallery/4871853/Microscopic-observations-by-Anton-Van-Leeuwenhoek 17 Histórico ▪ 1875, Louis Pasteur: mostrou que a fermentação era causada por microrganismos chamados leveduras (gênero Saccharomyces). http://olhar-sustentavel.blogspot.com/2012/05/pasteur.html https://www.beerbooks.com/cgi/ps4.cgi?action=enter&thispage=1299&order_id=!ORDERID! 18 Fermentação https://mundoeducacao.bol.uol.com.br/biologia/fermentacao.htm 19 Histórico ▪ 1928, Alexander Fleming: observou ao microscópio que a cultura de bactérias que estavava estudando (Staphylococcus aureus) continha um fungo e não estava crescendo normalmente. Por algum motivo, em vez de considerar o experimento perdido, Fleming decidiu acompanhar o crescimento daquele fungo, o Penicillium notatum. A descoberta da penicilina, um produto da biotecnologia, revolucionou a medicina do século XX. 20 A penicilina ▪ Depois de isolar esse fungo, o médico francês descobriu que ele continha uma substância capaz de matar muitas das bactérias que infectavam o homem, a penicilina. Foi assim, praticamente por acaso, que o mundo ingressou na era dos antibióticos. Assim como a descoberta da fermentação, a da penicilina também ocorreu em um período de guerra (durante a 2a Guerra Mundial), quando quantidades massivas desse antibiótico começaram a ser produzidas para combater os processos infecciosos dos feridos, sendo responsáveis por isso os cientistas Howard Florey e Ernest Boris Chain. http://www.invivo.fiocruz.br/cgi/cgilua.exe/sys/start.htm?sid=7&infoid=811 http://topatudo.blogspot.com/2013/09/15-de-setembro-descoberta-da-penicilina.html 21 Histórico ▪ 1953, James Watson e Francis Crick: descobriram a natureza química e a estrutura tridimensional do material genético, o DNA. Esse ano foi um marco para a história e para o desenvolvimento da biotecnologia. https://br.pinterest.com/pin/5136987045094138/https://lobaparda.com/dna-molecule-diagram/dna-molecule-diagram-lovely-colored-diagram-dna-car-wiring-diagrams-explained-%E2%80%A2/ 22 Histórico ▪ Início da década de 1970: a partir do desenvolvimento da tecnologia do DNA recombinante, que permite a transferência de material genético entre organismos vivos, passaram a existir dois conceitos de biotecnologia. Essa classificação, baseou-se no nível científico e tecnológico das diferentes técnicas biotecnológicas. 23 Histórico ❑ Biotecnologia tradicional: caracteriza-se pela utilização dos organismos vivos como são encontrados na natureza. ❑ Biotecnologia moderna: caracteriza-se pela utilização de organismos vivos modificados geneticamente por meio da engenharia genética ou tecnologia do DNA recombinante. http://www.portaldaindustria.com.br/cni/canais/industria-2027/noticias/saiba-por-que-a-biotecnologia-e-uma-inovacao-relevante-para-o-presente-e-o-futuro/ 24 Biotecnologia moderna Além do uso de microrganismos para realizar as modificações, pesquisadores aprenderam a interferir diretamente no DNA das espécies. Isso possibilitou o desenvolvimento de plantas, animais e outros seres vivos com novas características genéticas. Assim surgiram os primeiros organismos geneticamente modificados (OGM), que apresentam benefícios para o consumidor, para o agricultor e para o meio ambiente. 25 Histórico ▪ 1981: primeira planta geneticamente modificada (OGM). 26 Transgenia Bruno, 2014. https://cib.org.br/wp-content/uploads/2011/10/ApresentacaoCTC.pdf 27 Histórico ▪ 1981: primeira planta geneticamente modificada. ▪ 1996: nascia a primeira ovelha clonada, chamada Dolly. ▪ 1997: camundongos, porcos, ovelhas, bovinos, cabras, cavaloss foram clonados com a mesma metodologia. 28 Histórico ▪ Com o advento da técnica de transgenia: criação de plantas resistentes a pragas (plantas transgênicas) e, portanto, com menor necessidade de uso de agrotóxicos. 29 Histórico ▪ 1982: O primeiro produto derivado de um organismo transgênico chega ao mercado. Tratava-se da insulina, produzida por uma bactéria geneticamente modificada, na qual foi inserido um gene humano para essa proteína. https://br.freepik.com/vetores-premium/uma-insulina-e-seringa-no-fundo-branco_2590788.htm 30 Vacinas ▪ 1976, Edward Jenner: conseguiu impedir que um menino de oito anos de idade desenvolvesse varíola após ter sido inoculado com o pus extraído da mão de uma ordenhadora que havia contraído a varíola bovina e, em seguida, com o líquido extraído de uma pústula oriunda do contágio pela varíola humana. Atualmente, as vacinas são produzidas por meio de técnicas biotecnológicas para uma série de doenças que antes eram praticamente fatais. https://brasil.elpais.com/brasil/2017/08/24/ciencia/1503587279_312148.html 31 Biotecnologia e setores de atuação http://profissaobiotec.com.br/singularidade-da-biotecnologia/ 32 Biotecnologia na saúde ❑ Antibióticos: penicilina; ❑ Medicamentos; ❑ Hormônios: insulina e hormônio do crescimento; ❑ Vacinas: contra hepatite B e contra dengue; ❑ Testes diagnósticos e reagentes. 33 Biotecnologia na agricultura ❑ Biofertilizantes; ❑ Biopesticidas; ❑ Adubos; ❑ Mudas de árvores para reflorestamento; ❑ Mudas de plantas livres de doenças; ❑ Mudas de plantas resistentes a pragas; ❑ Plantas com novas características. As características introduzidas nos transgênicos disponíveis para a agricultura facilitam o manejo do produtor. A tolerância a herbicidas e a resistência a insetos otimizam o uso de defensivos químicos. Redução das perdas nas lavouras e, consequentemente, aumento da produtividade. Isso faz com que mais alimentos estejam disponíveis para compor a ração animal e também para o consumidor final. Curiosidades sobre os transgênicos 34 https://transgnia.wordpress.com/author/transgnia/ Curiosidades sobre os transgênicos Curiosidades sobre os transgênicos 37 https://cib.org.br/wp-content/uploads/2011/10/ApresentacaoCTC.pdf Herbicida é um tipo de produto químico destinado a combater e eliminar as chamadas plantas daninhas ou ervas daninhas 38 Avaliação da segurança de uma planta GM https://cib.org.br/wp-content/uploads/2011/10/ApresentacaoCTC.pdf 39 Legislação brasileira https://cib.org.br/wp-content/uploads/2011/10/ApresentacaoCTC.pdf 40 https://cib.org.br/wp-content/uploads/2011/10/ApresentacaoCTC.pdf Biotecnologia no meio ambiente • Recuperação de petróleo; • Tratamento de água usada e do lixo; • Eliminação de poluente por biorremediação, em que organismos vivos são utilizados para remover os poluentes. 41 Ao otimizar o uso de insumos, os transgênicos permitem que o agricultor use menos água para diluir os produtos e menos combustível para a aplicação. Biotecnologia na indústria de alimentos • Alimentos transgênicos: realçam o sabor e a cor do alimento, e conferem textura; • Alimentos com maior valor nutritivo; • Alimentos orgânicos capazes de serem cultivados em ambientes extremos, como no solo seco ou salinizado; • Produção de pães e biscoitos, laticínios - como iogurtes, bebidas lácteas e queijos, bebidas alcoólicas - como cervejas, vinhos e destilados; • Produção de adoçantes. 42 Biotecnologia na indústria de alimentos • Além de utilizar OGM (como soja e milho) e seus derivados (óleo, amido, proteína, etc), a indústria de alimentos se vale de aditivos e ingredientes para formular seus produtos, muitos deles produzidos via fermentação por microrganismos geneticamente modificados. • Alguns exemplos são enzimas (proteases, lipases, amilases), aminoácidos (glutamato, lisina, treonina), gomas (xantana, gelana, dextrana), vitaminas (B12, B2 e C), aromas (baunilha, citronelol, diacetil), ácidos orgânicos (cítrico, acético e lático) e antimicrobianos (nisina). 43 44 Biotecnologia na indústria de energia ❑ Produção de etanol: fermentação de açúcar por leveduras; ❑ Produção de butanol: fermentação por Clostridium acetobutylicum; ❑ Biodiesel: transesterificação à base de óleo e gorduras vegetais ou animais; ❑ Outros combustíveis a partir de biomassa (um material renovável que provém de matéria orgânica). Produção de combustíveis líquidos renováveis, que substituam o uso de combustíveis fósseis, derivados do petróleo. Atualmente, os biocombustíveis representam cerca de 1% da matriz mundial de transportes, sendo os maiores produtores os Estados Unidos, Alemanha, Brasil e China. Os biocombustíveis mais importantes da matriz energética brasileira são o álcool etanol e o biodiesel. Estudos alternativos: milho, soja, bagaço e palha da cana-de-açúcar, e restos de outras culturas agrícolas. 45 Quantos produtos transgênicos estão aprovados hoje no País? ❑ De 1998 a outubro de 2017, a Comissão Técnica Nacional de Biossegurança (CTNBio) emitiu parecer técnico favorável à liberação de 116 eventos transgênicos no Brasil. Destes, 40 são de milho, 15 de algodão, 14 de soja, um de feijão, um de eucalipto e um de cana-de-açúcar. Os três últimos, porém, ainda não são plantados comercialmente. O País tem, ainda, 28 vacinas geneticamente modificadas (GM) já aprovadas para uso animal e humano. Além disso, a CTNBio liberou um mosquito da dengue (Aedes aegypti) transgênico, um medicamento para melanoma (câncer de pele) e mais 14 microrganismos GM – leveduras e microalgas usadas para fabricação de etanol, triglicerídeos e bioprodutos. 46 Obrigada https://abobrinhaecia.wordpress.com/2011/11/04/focinho-de-porco/ Questão 01 - (Enem 2015) A palavra "biotecnologia" surgiu no século XX, quando o cientista Herbert Boyer introduziu a informação responsável pela fabricação da insulina humana em uma bactéria, para que ela passasse a produzir a substância. As bactérias modificadas por Herbert Boyer passaram a produzir insulina humana porque receberam: ( ) a) A sequência de DNA codificante de insulina humana.( ) b) A proteína sintetizada por células humanas. ( ) c) Um RNA recombinante de insulina humana. ( ) d) O RNA mensageiro de insulina humana. ( ) e) Um cromossomo da espécie humana. Questão Questão 2 - (Acafe 2015/1) Biotecnologia é o conjunto de conhecimentos que permite a utilização de agentes biológicos (organismos, células, organelas, moléculas) para obter bens ou assegurar serviços. Sobre o tema, analise as afirmações a seguir. I - As técnicas biotecnológicas possibilitam à Indústria Farmacêutica cultivar microrganismos para produzir os antibióticos, por exemplo. II - A Engenharia Genética ocupa um lugar de destaque como tecnologia inovadora, seja porque permite substituir métodos tradicionais de produção de hormônio de crescimento e insulina, seja porque permite obter produtos inteiramente novos (Organismos transgênicos). III - Hoje, a utilização de plasmídeos bacterianos restringe-se à produção de novos medicamentos. IV - Através de técnicas biotecnológicas é possível o tratamento de despejos sanitários pela ação de microorganismos em fossas sépticas. V - A aplicação da biotecnologia está limitada a área médica e de saúde. Todas as afirmações corretas estão em: ( ) a) I - II - III ( ) b) I - II - IV ( ) c) II - III - IV ( ) d) III - V ( ) e) IV - V Slide 1: ARA0484 Biotecnologia e Bioinformática Slide 2 Slide 3 Slide 4 Slide 5 Slide 6 Slide 7 Slide 8 Slide 9 Slide 10: Aula 01 -Conceitos, Histórico e Bases da Biotecnologia Slide 11 Slide 12 Slide 13 Slide 14 Slide 15 Slide 16 Slide 17 Slide 18 Slide 19 Slide 20 Slide 21 Slide 22 Slide 23 Slide 24 Slide 25 Slide 26 Slide 27 Slide 28 Slide 29 Slide 30 Slide 31 Slide 32 Slide 33 Slide 34: Curiosidades sobre os transgênicos Slide 35 Slide 36 Slide 37 Slide 38 Slide 39 Slide 40 Slide 41 Slide 42 Slide 43 Slide 44 Slide 45 Slide 46 Slide 47 Slide 48
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