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1.Durante o processo de extração de DNA, é importante considerar a possibilidade de interferências causadas pelas desoxirribonucleases (DNAses). No que se refere às funções desempenhadas pelas enzimas DNAses, assinale a opção correta. Resposta correta. B. São responsáveis pela quebra enzimática da ligação fosfodiéster do DNA; As enzimas desoxirribonucleases (DNAses) catalisam a clivagem hidrolítica de ligações de fosfodiéster entre os nucleotídeos que compõem a estrutura do DNA. As DNAses são um tipo de nucleases. 2. No que se refere a possíveis interferentes na extração de DNA, assinale a afirmativa correta. Você acertou! A. Diversos tipos de amostras podem ser utilizados para a extração. Entretanto, a amostra também irá determinar a qualidade do material extraído; 3. Sobre o uso de análises de DNA na investigação forense, é correto afirmar que: Resposta correta. A. técnicas de identificação baseadas na análise direta de amostras de DNA são consideradas a maior revolução científica na esfera forense por produzirem resultados de alta precisão; 4. Sobre a quantificação de DNA, assinale a alternativa correta. Você acertou! C. A Lei de Lambert-Beer pode ser utilizada para calcular a quantidade de amostra de DNA obtida. 5. Boas práticas laboratoriais determinam que se deve tomar o máximo de precaução e cuidados a fim de evitar a contaminações. Dentro desse contexto, assinale a opção correta. Você acertou! B. A contaminação por DNA exógeno representa uma forma de contaminação que não pode ser purificada ou corrigida matematicamente, inutilizando a amostra; 1. Após realizar o processo de extração de DNA, um pesquisador mediu a absorbância (A) da amostra em comprimentos de onda a 230nm (A230), 260nm (A260) e 280nm (A280), em espectrofotômetro, para avaliar a pureza das amostras obtidas. Assinale a afirmativa correta. Resposta correta. A. Se o DNA extraído apresenta razão A260/A280 entre 1,7 e 2,0, ele apresenta pureza adequada e pode ser empregado em técnicas como PCR; 2. Acerca dos espectrofotômetros, assinale a opção correta Resposta correta. C. A absorbância da linha base (branco) deve ser subtraída da absorbância medida da amostra de DNA para que se obtenha a absorbância verdadeira da amostra. Para eliminar possíveis interferências da solução em que a amostra 3. Alguns procedimentos básicos são realizados para isolar e purificar o DNA. Assinale a informação correta Resposta correta. B. Etapa de lavagem: as etapas de lavagem removem resíduos contaminantes, utilizando a incubação com soluções, seguida por centrifugação; 4. No que diz respeito ao uso de Chelex 100 para extração de DNA, assinale a alternativa correta Você acertou! B. A solução de Chelex 100 protege a amostra da ação das DNAses que podem permanecer ativas após o aquecimento das amostras; 5. Sobre o processo de extração de DNA, assinale a alternativa correta Resposta correta. A. O aquecimento das amostras durante a extração tem como objetivo auxiliar na quebra das células e preservar a amostra de degradação; 1. Em relação à técnica de PCR, assinale a alternativa correta: Você acertou! B. Os fragmentos de DNA da amostra são deslocados por uma corrente elétrica por meio da matriz de gel, separando os fragmentos de DNA de acordo seus comprimentos; 2. A sequência de oligonucleotídeos de DNA curto utilizados para amplificação da reação PCR é chamada de Resposta correta. B. Primers; 3. A reação PCR é utilizada na amplificação de uma região específica do DNA. Trata-se de uma técnica: Resposta correta. A. In vitro; 4. Em uma eletroforese de ácidos nucleicos, o que diferencia uma molécula de outra é o seu comprimento. O comprimento molecular é geralmente expresso por: Resposta correta. B. pares de bases; 5. A reação PCR é utilizada para amplificar, detectar e quantificar sequências específicas de DNA. Assinale a alternativa que apresenta as principais aplicações dessa técnica. Resposta correta. A. Detecção de agentes infecciosos e diagnóstico de doenças genéticas; 1. As etapas da reação PCR para a síntese de DNA são, respectivamente: Resposta correta. A. desnaturação, anelamento e extensão; 2. Suponha que você trabalhe em um laboratório de medicina forense e tenha recebido uma amostra de uma cena de crime. Considerando que a amostra de DNA da cena do crime é homozigota para a versão 200 pares de bases (pb) do marcador, a amostra de DNA do suspeito deverá ser: Você acertou! B. alelo homozigoto de 200 pb; 3. O mix de reação utilizado na técnica de PCR compreende: Resposta correta. C. tampão de reação; primers e enzima Taq polimerase. 4. Assinale a alternativa correta em relação à interpretação do resultado de uma eletroforese em gel. Resposta correta. B. Os fragmentos de DNA mais longos migram mais lentamente através do gel; 5. Na reação PCR, a Taq polimerase é uma enzima termoestável que permite a amplificação de qualquer sequência de DNA coletada de amostras, tal/tais como: Resposta correta. A. sangue, urina e outros fluidos corporais; 1. Para ser sequenciado, um segmento de DNA deve estar disponível em grande quantidade e, por isso, é necessária a prévia amplificação do segmento por clonagem ou, mais comumente, por PCR. A técnica de PCR consiste em três etapas, cada uma ocorrendo em uma temperatura específica: desnaturação, anelamento do primer e polimerização. Assinale a alternativa que contém a ordem correta das temperaturas utilizadas na técnica. Resposta correta. C. 95ºC – 60ºC – 72ºC. 2. A reação em cadeia da polimerase (PCR) consiste em uma técnica de Biologia Molecular com múltiplas aplicações, na qual, a partir de um segmento de DNA molde, milhões de cópias deste são obtidas. Quando há aumento ou diminuição da temperatura ambiente, as ligações entre as fitas de DNA são desfeitas ou refeitas, respectivamente. Qual é o tipo de ligação presente entre as fitas de DNA que permite esse fenômeno? Você acertou! C. Pontes de hidrogênio. 3. No sequenciamento manual, uma mesma amostra de DNA é submetida a reações de sequenciamento que ocorrem simultaneamente em quatro tubos diferentes, cada um contendo um dos quatro ddNTPs devidamente marcados. Esse conjunto de segmentos é, então, desnaturado e submetido a eletroforese em gel. Na eletroforese em gel, a mistura de segmentos de DNA é colocada em uma das extremidades de um bloco de gel de: Resposta correta. B. acrilamida; 4. Na eletroforese em gel, os segmentos de DNA são misturados a um corante para aumentar a densidade dos segmentos, impedindo-os de saírem dos poços, colorindo-os e servindo como um indicador do processo eletroforético. Qual é o corante mais comumente utilizado na eletroforese em gel? Você acertou! A. Azul de bromofenol; 5. Previamente ao sequenciamento, o DNA de uma amostra (mancha de sangue, por exemplo) deve ser extraído e amplificado por PCR. A extração de DNA é o procedimento que serve de base para o fornecimento do material que será posteriormente analisado, consistindo basicamente em quatro etapas: 1) lise celular; 2) remoção dos lipídios da membrana; 3) remoção de proteínas da membrana; 4) precipitação do DNA. No início da extração do DNA, é adicionada uma pequena quantidade de cloreto de sódio (NaCl). Qual é a finalidade da adição desse sal? Você acertou! B. Impedir que o complexo DNA-histonas se enovele; 1. O precursor normal da síntese do DNA é o desoxirribonucleosídeo trifosfatado (dNTP), que apresenta uma hidroxila na posição 3’. Entretanto, para a técnica de sequenciamento, é utilizado um tipo diferente de nucleotídeo, denominado dideoxirribonucleosídeo trifosfatado (ddNTP), que não apresenta essa hidroxila. Qual é a finalidade do ddNTP no sequenciamento de DNA? Você acertou! C. Interromper a incorporação de nucleotídeos. 2. O princípio das reações de sequenciamento está relacionado à utilização de um tipo diferente de nucleotídeo, o dideoxirribonucleosídeo trifosfatado (ddNTP). Se o ddNTP for marcado, a fita de DNA interrompida por ele poderá ser facilmente detectada por meio da marcação. Qual o tipode marcação dos ddNTPs no sequenciamento automático de DNA? Você acertou! B. Marcação fluorescente; 3. A obtenção de uma sequência completa de nucleotídeos de um segmento de DNA (sequenciamento) é essencial para a compreensão da organização de um gene e sua regulação, sua relação com outros genes ou a função do RNA ou da proteína que ele codifica. Assim como na técnica do DNA recombinante e na PCR, o sequenciamento de DNA explora a complementaridade de pares de bases, juntamente com o entendimento da bioquímica básica da replicação do DNA. Assinale a alternativa correta sobre o sequenciamento automático de DNA. Você acertou! A. Os kits para sequenciamento de DNA contêm tampão de reação, dNTPs, ddNTPs marcados e Taq DNA polimerase; 4. Sequenciadores automáticos analisam fitas de DNA previamente amplificadas e marcadas com fluoróforos diferentes para cada ddNTP. Posteriormente, a mistura de segmentos é aplicada em um gel de acrilamida ou no interior de um capilar, e a migração, então, ocorre até passar pelo detector do equipamento, que capta a emissão de luz oriunda dos fluoróforos quando estes são excitados por um feixe de laser. O sequenciador, por sua vez, interpreta o sinal e o transforma em um espectro gráfico denominado: Você acertou! B. eletroferograma; 5. Um estagiário do Instituto de Biologia Molecular do Paraná (IBMP) foi designado para realizar o sequenciamento de DNA da mancha de sangue encontrada no carro de Rômulo Rodrigues Dias, marido de Graziela Pinheiro Rubiano, de 36 anos, cujo corpo nunca foi encontrado. Após extrair o DNA da mancha e realizar as etapas de amplificação e eletroforese, o estagiário recortou as bandas do gel de agarose e prosseguiu a análise, preparando a amostra para o sequenciamento automático. Após o término do sequenciamento, os resultados obtidos não foram satisfatórios, porque houve sobra de primers, ddNTPs, alguns sais e outros resíduos, uma vez que o estagiário não manteve a qualidade em todas as etapas que antecedem o sequenciamento, esquecendo-se de: Resposta correta. C. precipitar a amostra com etanol/EDTA/acetato de sódio. 1. Sobre os eletroferogramas obtidos de uma sequência de DNA, assinale a alternativa correta. Resposta correta. C. A sequência de DNA apresentada em um eletroferograma pode ser revisada e editada. 2.Sobre a imagem a seguir, marque a alternativa correta. Você acertou! B. A figura representa uma sequência de DNA apresentada de forma gráfica com picos coloridos. Cada cor representa uma base nitrogenada; 3. As técnicas de sequenciamento de DNA estão cada vez mais presentes no cotidiano, envolvendo a produção de alimentos, diagnósticos, prevenção e tratamentos médicos, testes de paternidade e resolução de crimes. Qual a técnica mais antiga e ainda utilizada nos dias de hoje? Resposta correta. A. Sequenciamento de Sanger; 4. Um estudante de Biomedicina trabalha em um laboratório e extraiu o DNA de determinadas amostras, amplificou um pequeno fragmento desse DNA por meio da técnica de PCR e enviou os produtos de PCR (PPCR) para sequenciamento em outro laboratório. Depois de alguns dias, recebeu o resultado e verificou a qualidade de suas sequências. Sobre o resultado e a qualidade das sequências, é correto afirmar que: Você acertou! B. o resultado vem em um CD com o arquivo em formato de extensão, sendo representado por meio de imagens gráficas geradas em softwares específicos; 5. Os picos coloridos do eletroferograma representam os picos luminosos emitidos durante o sequenciamento de DNA. Cada cor representa uma base nitrogenada. Com base na sequência TTTAGCCT, indique a alternativa que apresenta a sequência correta de cores. Resposta correta. C. (T) vermelho, vermelho, vermelho; (A) verde; (G) preto; (C) azul, azul; (T) vermelho. 1. A Bioinformática é uma disciplina multidisciplinar que corresponde à aplicação de técnicas da Informática na Genética e em áreas afins. Para a visualização gráfica das sequências de ácidos nucleicos, será necessário certo conhecimento sobre os softwares utilizados. Com base nessas afirmações, marque a alternativa correta. Resposta correta. B. O software Chromas 2.6.6 é utilizado para executar projetos simples de sequenciamento de DNA, sendo um programa gratuito 2. Um estudante, ao realizar a análise de um eletroferograma, se esqueceu de revisar e editar a sequência, interpretando os resultados de forma errada. Sobre edições de sequência, marque a alternativa correta. Resposta correta. A. Nunca se utiliza a sequência do jeito que ela vem do sequenciamento, devendo-se primeiro editá-la; 3. Os eletroferogramas contêm quadrados acima das bases nitrogenadas que permitem verificar a confiabilidade do pico gerado no sequenciamento. Sobre a importância desses quadrados, marque a afirmativa correta. Você acertou! B. Um quadrado totalmente preenchido acima de uma base indica que ela é confiável; 4. As impressões digitais e o perfil genético de um indivíduo que tenha segurado uma arma de fogo podem ser utilizados como provas para a elucidação de crimes. O esperado é que esse perfil seja o do indivíduo que empunhou e disparou a arma de fogo. Mas um trabalho publicado recentemente trouxe uma nova utilização para materiais obtidos de armas de fogo: a obtenção do perfil genético da vítima. Foi demonstrado que é possível recuperar tecido da vítima do cano de armas de fogo utilizadas em suicídios e/ou homicídios, desde que ocorra proximidade ou contato do cano da arma com a vítima. Com esse trabalho, os pesquisadores concluem que é importante o exame sistemático da presença de material biológico dentro do cano de armas de fogo utilizadas em casos criminais. Com relação aos perfis genéticos gerados a partir de material biológico forense, assinale a alternativa correta. Você acertou! C. A observação de picos adicionais em um eletroferograma pode ser decorrente de aberrações cromossômicas, tanto numéricas quanto estruturais, e quando são encontradas simultaneamente na amostra-caso e na referência, geram um aumento no poder estatístico e da conclusão final. 5. Os picos coloridos do eletroferograma representam os picos luminosos emitidos durante o sequenciamento de DNA. Cada cor representa uma base nitrogenada. Marque a alternativa que corresponde corretamente à cor de cada base. Resposta correta. A. Adenina – verde, timina – vermelho, citosina – azul e guanina – preto;
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