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05/11/2023, 11:04 Estácio: Alunos
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Exercício
 avalie sua aprendizagem
Na era pós-moderna, com o advento e a consolidação da revolução robótica no século XX, foi possível aprimorar a
criação de tecnologias computacionais nas mais variadas áreas do conhecimento, o que tem provocado profundas
mudanças sociais em âmbito individual e coletivo. Nesse cenário, a bioinformática ou biocomputação surge na
década de 1980, a �m de superar as fronteiras das ciências pelo desenvolvimento de novas abordagens capazes de
promover a análise e a apresentação de dados biológicos, bem como de garantir a investigação de novos métodos
para a resolução de complexas perguntas.
Fonte: ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. Sobre a
bioinformática analise as a�rmativas a seguir:
I. A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que combina diferentes disciplinas, com destaque para a
Estatística, biologia, química, informática e física.
II. A bioinformática possibilitou a interpretação da linguagem dos de genes por algoritmos.
III. Atualmente, os programas de computadores estão muito modernos, e é possível realizar todas grandes análises
de forma rápida e precisa, como prever a ligação de diferentes átomos em uma molécula.
É correto o que se a�rma em:
BIOINFORMÁTICA
Lupa  
 
SDE4449_202103145078_TEMAS
Aluno: CLEBER MAX VIEIRA GASQUES Matr.: 202103145078
Disc.: BIOINFORMÁTICA  2023.3 FLEX (G) / EX
Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu EXERCÍCIO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O
mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se
familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
03017INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA
 
1.
I.
I e III.
II.
I e II.
III.
Data Resp.: 04/11/2023 12:32:50
Explicação:
javascript:voltar();
javascript:voltar();
javascript:voltar();
javascript:voltar();
javascript:diminui();
javascript:diminui();
javascript:aumenta();
javascript:aumenta();
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A determinação da estrutura do Ácido Desoxirribonucléico foi um marco importante para a Biologia, esclarecendo
como a informação hereditária é codi�cada em sequências de nucleotídeos de DNA nas células. A respeito desse
tema, analise as alternativas a seguir:
I. Os genes humanos são de grande tamanho e são constituídos de segmentos relativamente curtos de DNA, que
codi�cam proteínas (íntrons), intercalados com longos segmentos de DNA não codi�cantes (éxons).
II. As sequências de íntrons são transcritas em RNAm enquanto as sequências de éxons são removidas por meio de
um processo conhecido como splicing.
III. O dogma central da biologia nos mostra o �uxo de informações que vai do DNA até a formação de uma unidade
proteica, na ordem DNA > transcrição > RNAm > tradução > proteína
IV. Eucromatina é o nome dado ao padrão de cromatina desenovelado do DNA.
É correto o que se a�rma em:
A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que apresenta diferentes aplicabilidades e tem sido bastante
empregada para o desenvolvimento de novas metodologias de análise e garantindo diferentes avanços cientí�cos.
A seguir são listadas algumas técnicas da bioinformática. Assinale a alternativa que indica a técnica que tenta
prever a atividade biológica de um composto baseado em equações estatísticas.
Existem diversas ciências envolvidas com a bioinformática, que desfrutam do seu avanço, entretanto as áreas
mais intimamente ligadas de acordo com a questão 17 são: Estatística, biologia, química, informática e física.
Essa nova ciência permitiu que algoritmos fossem criados auxiliando na interpretação de genes, alinhamentos
dos genes, descobrir sequências e funções de genes desconhecidas. No entanto, ainda precisamos de programas
de computadores mais avançados, para por exemplo, analisar as dinâmicas moleculares (interação de átomos de
diferentes proteínas), mas complexas e mais longas.
 
2.
III e IV.
I e III.
II e III.
I e II.
II e IV.
Data Resp.: 04/11/2023 12:37:56
Explicação:
As sequências de éxons são transcritas em RNAm enquanto as sequências de íntrons são removidas por meio de
um processo conhecido como splicing de RNA. Os genes humanos são de grande tamanho e são constituídos de
segmentos relativamente curtos de DNA. Durante a regulação de quais genes irão ser transcritos, temos a
formação de regiões mais condensadas, que não são transcritos a heterocromatina e regiões com padrão de
cromatina desenovelado que o DNA assume quando está aberto para a chegada da maquinaria de expressão ou
replicação. O padrão desnovelado recebe o nome de eucromatina.
 
3.
Dinâmica molecular
QSAR
Modelagem molecular
Alinhamento molecular
Ancoramento molecular
Data Resp.: 04/11/2023 12:54:36
Explicação:
O QSAR é uma técnica estatística de tratamento de dados a partir de descritores, visa buscar uma equação que
quando resolvida tenta prever a atividade de uma molécula nova contra determinado receptor. O alinhamento
molecular visa identi�car genes que compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também
usar o alinhamento para encontrar proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. O ancoramento
molecular infere a modelagem molecular, para construir um modelo tridimensional e é utilizado para obter uma
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 (UFSM, 2006, Biólogo) As temperaturas são essenciais para realização da ampli�cação do DNA por PCR. Associe a
segunda coluna com a primeira.
 
1. de 0°C a 10°C
2. de 35°C a 65°C
3. 72°C
4. 82°C
5. de 90°C a 96°C
(  ) Maior probabilidade de alinhamento dos primers com a �ta molde.
(  ) Formação de �tas-molde a partir de todos os seguimentos.
(  ) Ideal para ação da enzima Taq-DNA-polimerase.
(  ) Ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3'.
(  ) Estabelecimento de ligações - pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers.
 
Escolha a opção que justi�que por que é importante que o comprimento do produto ampli�cado pela reação de
PCR seja maior que 150 pares de bases (pb).
pose do ligante com o alvo e a dinâmica molecular para analisar como as interações acontecem, mimetizando o
organismo.
02925NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS
 
4.
2 - 3 - 1 - 3 - 4.
4 - 2 - 3 - 2 - 1.
5 - 4 - 1 - 5 - 3.
2 - 5 - 3 - 3 - 2.
3 - 4 - 5 - 4 - 2.
Data Resp.: 04/11/2023 12:56:52
Explicação:
Durante a etapa de desnaturação, a temperatura está entre 90-96°C e a dupla �ta do DNA se separa, por
desnaturação, etapa em que ocorre a formação de �tas-molde a partir de todos os seguimentos. O anelamento
ocorre entre 35°C a 65°C, quando os primers se anelam na região complementar do molde, esse é o momento de
estabelecimento de ligações ¿ pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers. Após, a DNA polimerase
pode adicionar os nucleotídeos, em 72°C, essa é a temperatura ideal para extensão dos primers a partir da
extremidade 3¿. Durante o ciclo do PCR, a faixa entre 0°C a 10°C e as temperaturas de 82°C não são utilizadas.
 
5.
A temperatura de anelamento para ampli�car uma região menor que 150pb é maior que 72°C.
Estabelecer um comprimento mínimo do produto aumenta a especi�cidade da reação.Primers que se ligam ao
redor de regiões menores que 150pb formam estruturas secundárias com maior facilidade.
A enzima Taq DNA polimerase não consegue ampli�car seguimentos de DNA menores que 150pb.
Produtos ampli�cados menores que 150pb podem se confundir com restos de primers que não se ligaram ao
DNA e �cam no �nal da eletroforese.
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Muitos programas de computador já foram e vêm sendo desenvolvidos para auxiliar no desenho de primers
usados na PCR (Reação em Cadeia de Polimerase). Dentre eles, podemos citar o Primer3,que pode ser usado
de forma on-line por qualquer pessoa. Qual das opções abaixo contém uma informação essencial que o usuário
precisa fornecer obrigatoriamente, para que um programa consiga desenhar primers?
(CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular)
Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que permite medir os níveis de expressão de
transcritos em larga escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta.
Primers que se ligam ao redor de regiões menores que 150pb formam estruturas secundárias com maior
facilidade.
Data Resp.: 04/11/2023 12:58:17
Explicação:
O tamanho do produto ampli�cado não interfere na especi�cidade, na formação de estruturas secundárias ou na
temperatura de anelamento. O tamanho ideal do produto da PCR está entre 150 e 1.000 pares de bases (pb).
Fragmentos muito pequenos podem ser confundidos com restos de primers que não se ligaram ao alvo e
aparecem no �nal do gel da eletroforese. Por outro lado, se a região ampli�cada for muito grande, a DNA
polimerase pode não conseguir adicionar todos os nucleotídeos necessários, e nesses casos a PCR não vai
funcionar. A Taq tem di�culdade para ampli�car produtos maiores que 1000pb.
 
6.
Temperatura de anelamento.
Temperatura de melting.
Sequência de nucleotídeos do alvo no DNA.
Conteúdo GC.
Tamanho do produto ampli�cado.
Data Resp.: 04/11/2023 13:00:02
Explicação:
Os primers são uma sequência de nucleotídeos que é complementar à sequência molde, que queremos
ampli�car. Essas sequências moldes podem ser obtidas em bancos de dados biológicos de sequências de
nucleotídeos, como GenBank e RefSeq, disponíveis no portal no NCBI. Nos programas utilizados para desenhar
esses oligonucleotídeos, é impossível desenhar uma sequência complementar de primers sem ter essa
sequência.  As outras alternativas da questão são todos parâmetros para o desenho de primers, mas o usuário
não precisa alterar as con�gurações do programa, só se ele achar necessário.
03015ANOTAÇÃO GÊNICA
 
7.
As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas de lipídios.
O microarranjo de DNA consiste em um arranjo prede�nido de moléculas de DNA quimicamente ligadas a
uma superfície sólida.
A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com brometo de etídio.
A técnica em questão é empregada em estudos proteômicos, visto que permite a identi�cação direta das
proteínas expressas.
A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de agarose.
Data Resp.: 04/11/2023 13:01:50
Explicação:
A técnica em questão é empregada em estudos transcriptômicos, visto que permite a identi�cação direta das
RNAs expressas. Para a técnica, são utilizadas lâminas de vidro revestidas com sondas de DNA. A expressão dos
genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com corantes �uorescentes. A detecção é realizada
por meio de detecção da �uorescência.
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Julgue as a�rmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos.
I - Existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser
diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas.
II - Os bancos de dados biológicos só podem ser acessados mediante o pagamento de uma mensalidade pelo
usuário.
III - Quanto mais detalhado o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais con�áveis eles
são.
Existem diversas metodologias para buscar a melhor árvore �logenética. Todas estas abordagens são fundamentais
para o avanço da compreensão da evolução. Dentre estes métodos está a aplicação do neighbor-joining. Qual é a
melhor de�nição desta técnica?
 
8.
As a�rmativas I e II são proposições verdadeiras, enquanto a III é falsa.
As a�rmativas I, II e III são proposições verdadeiras.
As a�rmativas I e III são proposições verdadeiras, e a II é uma proposição falsa.
A a�rmativa III é uma proposição verdadeira, enquanto I e II são proposições falsas.
A a�rmativa I é uma proposição verdadeira, e II e III são proposições falsa.
Data Resp.: 04/11/2023 13:03:42
Explicação:
A maioria dos bancos de dados biológicos mais conhecidos e utilizados são aqueles cujo acesso é livre, isto é,
qualquer um pode acessar e obter os dados armazenados. Eles são muito úteis para o compartilhamento de
informações e veri�cação da veracidade de dados divulgados por cientistas. No entanto, existem diversos
bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser diferente, como
sequências, estruturas e vias metabólicas, e quanto mais detalhado for o processo de curadoria dos dados
disponibilizados por um banco, mais con�áveis eles são.
02265ANÁLISE FILOGENÉTICA
 
9.
Um algoritmo rápido que encontrará uma árvore com base em distâncias entre pares.
Uma árvore é estimada com base na proximidade dos táxons em uma matriz de dados.
Uma busca em árvore é conduzida para encontrar a árvore que minimiza a diferença entre as distâncias
observadas e previstas.
Um protocolo para adicionar táxons a uma árvore construída por parcimônia ou máxima verossimilhança.
A árvore mais curta é encontrada sob a suposição de que há uma árvore mais curta.
Data Resp.: 04/11/2023 13:05:16
Explicação:
Gabarito: Um algoritmo rápido que encontrará uma árvore com base em distâncias entre pares.
Justi�cativa: O método neighbor-joining é um método que utiliza a distância genética calculada a partir de uma
matriz táxon/caracter para construir uma árvore. A árvore escolhida é aquela que minimiza a diferença entre as
distâncias na matriz e as previstas pela árvore. Assim como outros métodos de distância, o método neighbor-
joining conduz uma serie de cálculos em cima da matriz a partir de um algoritmo. Esse é um método rápido. As
outras alternativas não se enquadram como de�nições dessa metodologia.
 
10.
05/11/2023, 11:04 Estácio: Alunos
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O quadro a seguir mostra uma matriz de dados táxons x caracteres, sendo apresentados 9 espécies (de A ao I) e 9
caracteres (de 1 ao 9):
Como uma análise de parcimônia seria afetada pela remoção das duas primeiras posições (1 e 2) e da última posição
(9) da matriz de dados fornecida?
A topologia de árvore ideal certamente mudará; a árvore ótima será menor.
A topologia de árvore ideal de�nitivamente não mudará; a árvore ótima será três etapas mais curta.
A topologia de árvore ideal pode ou não mudar; o comprimento ideal da árvore pode ser maior ou menor.
A topologia de árvore ideal de�nitivamente não mudará; a árvore ótima terá três etapas a mais.
A topologia de árvore ideal de�nitivamente não mudará, e nem seu comprimento.
Data Resp.: 04/11/2023 13:23:39
Explicação:
Gabarito: A topologia de árvore ideal de�nitivamente não mudará, e nem seu comprimento.
Justi�cativa: Os caracteres que estão na posição 1, 2 e 9 na matriz de dados não possui variação de estados, ou
seja, ao analisar a matriz de dados vemos que em todas as espécies (de A a I) na posição 1 temos a base C, na
posição 2 a base G e na posição 9 a base C. Isso signi�ca que elas não trazem informações que possam
diferenciar um táxon ou um conjunto de táxons. Assim, a retirada destes caracteres, por tanto, não modi�ca a
topologia e o comprimento de ramos, pois não houve alteração. A modi�cação na topogra�a só seria obtida caso
tivesse alteração nos carateres entre os táxons, assim todas as outras alternativas estão falsas.
    Não Respondida      Não Gravada     Gravada
Exercício inciado em 04/11/2023 12:22:26.