Exercício por Temas-02

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Exercício por Temas 
 avalie sua aprendizagem 
 
 
 
 
 
BIOINFORMÁTICA 
 
Lupa 
 
 
 
 SDE4449_202103145078_TEMAS 
 
 
Aluno: CLEBER MAX VIEIRA GASQUES Matr.: 202103145078 
Disc.: BIOINFORMÁTICA 2023.3 FLEX (G) / EX 
 
Prezado (a) Aluno(a), 
 
Você fará agora seu EXERCÍCIO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá 
ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha. 
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da 
mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua 
AV e AVS. 
 
 
 
03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA 
 
 
 
 
 
1. 
 
 
Nos organismos __________ a expressão de um 
determinado gene é dependente do quão enovelado o DNA 
está, as ___________ regulam essa compactação. A reação 
de _________ ocorre o maior enovelamento, já a reação de 
____________ faz com que o DNA fique mais relaxado, 
possibilitando sua expressão. 
 
 
 
eucariotos / polimerases / acetilação / metilação 
 
 
procariotos / polimerase / metilação / acetilação 
 
 eucariotos / histona / metilação / acetilação 
 
 
procariotos / histona / metilação /acetilação 
 
 
 procariotos / polimerase /acetilação / metilação 
Data Resp.: 04/11/2023 13:32:25 
 
Explicação: 
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asp
javascript:voltar();
javascript:voltar();
javascript:diminui();
javascript:aumenta();
Nos organismos eucariotos a expressão de um determinado gene é dependente do quão 
enovelado o DNA está, as histonas regulam essa compactação. A reação de metilação 
ocorre o maior enovelamento, já a reação de acetilação faz com que o DNA fique mais 
relaxado, possibilitando sua expressão. Os organismos procariotos apresentam outro tipo 
de regulação, como a presença do operon lac. As polimerases são enzimas responsáveis 
enzima que catalisa a reação de polimerização de ácidos nucleicos a partir dos seus 
monômeros. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2. 
 
 
A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que 
apresenta diferentes aplicabilidades e tem sido bastante 
empregada para o desenvolvimento de novas metodologias 
de análise e garantindo diferentes avanços científicos. 
Durante o desenvolvimento do seu trabalho de conclusão de 
curso você estuda todas as possíveis interações entre a 
proteína S do coronavírus (receptor) e possíveis moléculas 
(ligantes) que serão empregadas em estudos clínicos para o 
tratamento da doença em um modelo chave-fechadura. Qual 
é essa técnica? 
 
 
 
Alinhamento molecular 
 
 
Dinâmica molecular 
 
 
Modelagem molecular 
 
QSAR 
 
Ancoramento molecular 
Data Resp.: 04/11/2023 13:33:29 
 
Explicação: 
O ancoramento molecular utiliza o modelo chave-fechadura, pois a variável tempo não é 
levada em consideração. Durante a análise, é fornecida uma pontuação de um 
ancoramento que significa que aquele algoritmo encontrou uma interação favorável 
dentro dos seus parâmetros, não é possível extrapolar que isso signifique uma melhor 
interação entre ligante e receptor, a pontuação é apenas um indicador. O alinhamento 
molecular visa identificar genes que compartilham funções ou determinada 
ancestralidade, podemos também usar o alinhamento para encontrar proteínas moldes, 
durante a etapa de modelagem molecular. O ancoramento molecular infere a modelagem 
molecular, para construir um modelo tridimensional e é utilizado para obter uma pose do 
ligante com o alvo e a dinâmica molecular para analisar como as interações acontecem, 
mimetizando o organismo. O QSAR é uma técnica estatística de tratamento de dados a 
partir de descritores, visa buscar uma equação que quando resolvida tenta prever a 
atividade de uma molécula nova contra determinado receptor. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
3. 
 
 
O alinhamento molecular é a técnica importante dentro da 
bioinformática e para o desenvolvimento de um novo alvo 
terapêutico representa a primeira etapa a ser realizada. Com 
relação ao alinhamento molecular marque a alternativa 
correta: 
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asp
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asp
 
 
 
É a técnica responsável por alinhar proteínas que serão utilizadas em uma 
simulação, dentro de um ambiente virtual, o mais próximo possível da realidade. 
 
 
É a técnica responsável por combinar duas sequencias de DNA ou proteínas para 
que possamos identificar qual é a correta. 
 
 
O alinhamento é capaz de armazenar informações que serão usadas para 
transcrever o DNA em RNAm. 
 
É capaz de identificar se diferentes espécies possuem alguma relação evolutiva ou 
gene com função em comum. 
 
 
 O alinhamento é capaz de modelar proteínas tridimensionais, que irão auxiliar em 
diversas outras técnicas de bioinformática. 
Data Resp.: 04/11/2023 13:36:11 
 
Explicação: 
O alinhamento molecular é feito pela correlação de duas ou mais sequencias de DNA ou 
proteínas, a partir de um algoritmo de pontuação. Assim podemos identificar genes que 
compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também usar o 
alinhamento para encontrar proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. 
O alinhamento não armazenar informações que serão usadas para transcrever o DNA em 
RNAm, não compara sequencias para dizer qual é a correta, não realiza o modelamento 
de proteínas e não realiza a modelagem molecular, etapa posterior ao alinhamento e não 
tem a finalidade de alinhar proteínas o mais próximo da realidade, e sim encontrar os 
melhores alinhamentos entre as proteínas já cadastradas no banco de dados. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4. 
 
 
Desde a descoberta da estrutura do DNA e do 
desenvolvimento da biologia molecular, o homem vem 
buscando novas alternativas que o auxiliem na busca por 
maior fluidez nos trabalhos de pesquisa, acelerando a 
geração de processos e produtos. A bioinformática tem 
contribuído para avanços na pesquisa básica, mas também 
na ciência aplicada (....). 
Fonte: adaptado de ARAÚJO, N. D.; et al. A era da 
bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. 
Sobre a bioinformática, analise as afirmativas a seguir: 
I. O projeto Genoma Humano tinha como objetivo a detecção 
dos genes que compõem o DNA humano. Concluído em 
1990, esse projeto contou com o apoio decisivo da 
bioinformática. 
II. A biologia computacional é um campo de pesquisa 
diferente ao da bioinformática. 
III. Uma das aplicações da bioinformática é o alinhamento de 
sequencias que tem como objetivo principal da comparação 
de sequências biológicas é encontrar o(s) alinhamento(s) de 
maior escore de similaridade. 
É correto o que se afirma em: 
 
 
 
I. 
 
 
II. 
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asp
 
 
I e III. 
 
III. 
 
 
I e II. 
Data Resp.: 04/11/2023 13:40:00 
 
Explicação: 
Bioinformática e a biologia computacional são duas utilizadas como sinônimos e tem 
como objetivo a aplicação de ferramentas computacionais para coletar, armazenar, 
analisar, manipular, apresentar e compartilhar dados biológicos. Mas é importante 
ressaltar que segundo o NCBI a Biologia computacional é uma área de pesquisa que tem 
como foco principal problemas de pesquisa específicos em biologia. O projeto genoma foi 
iniciado na década de 90, e tinha como objetivo o desvendar por completo o DNA do ser 
humano. Após 13 anos para a conclusão desse projeto, a bioinformática mais uma vez foi 
essencial, pois a partir de programas de computador específicos, os pequenos trechos 
sequenciados eram adicionados a um grande banco de dados e encaixados no seu 
devido lugar, formando um único arquivo editável em que todos os participantes do 
trabalho. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
5. 
 
 
(adaptada de IBADE - 2018 - Prefeitura de Presidente 
Kennedy - ES - Biólogo ) As informações genéticas nos seres 
vivos são codificadas por bases nitrogenadas que constituem 
os ácidos nucléicos. Analise as sequências de nucleotídeos a 
seguir.Fita 1 - CCCTATACGCTAGCATGACTT 
Fita 2 - GGGATATGCGATCGTACTGAA 
A seguir são listadas algumas características sobre as fitas 
de nucleotídeo 1 e 2. Assinale a alternativa correta: 
 
 
 
As fitas analisadas constituem um segmento de uma molécula de RNA. 
 
As fitas 1 e 2 são complementares, formando juntas um segmento do DNA. 
 
 
Na fita 1 existem 30 códons e 15 nucleotídeos. 
 
 
Na fita 1 e 2 existem 21 códons e 07 nucleotídeos 
 
 
Se considerarmos a fita 1 como a fila molde, o RNAm formado por esta sequência 
apresentará as mesmas bases nitrogenadas da fita 2. 
Data Resp.: 04/11/2023 13:57:12 
 
Explicação: 
Tanto a sequência de nucleotídeos 1 e 2 apresentam 21 nucleotídeos e 7 códons (um 
códon equivale a 3 nucleotídeos). Como ambas as fitas apresentam as bases C, G, A e T 
elas são representativas do DNA e não do RNA. Para ser uma fita de RNA deveria 
apresentar as bases C, G, A e U. Além disso, se observarmos as fitas vemos que 1 e 2 
são complementares, ou seja, no lugar que temos uma base C na outra fita equivale a G, 
e no lugar que temos uma base A na outra fita equivale a t e vice-versa, representando as 
duas fitas de DNA, que são complementares entre si. 
 
 
 
 
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asp
 
 
 
 
 
6. 
 
 
(ADAPTADA DE ENADE 2013- biomedicina) 
Os mecanismos envolvidos na expressão e interação dos 
genes, assim como a compreensão das redes funcionais 
estabelecidas pelas proteínas, fazem com que, no cenário 
científico atual, a genômica e a proteômica estejam cada vez 
mais em evidência. Quatro são os principais bancos de dados 
utilizados para as diferentes análises de nucleotídeos. Um 
deles é o INSDC (INTERNATIONAL NUCLEOTIDE 
SEQUENCE DATABASE), que disponibiliza um repertório de 
sequências e é resultado da associação de três bancos de 
dados parceiros, o DDBJ (DATA BANK OF JAPAN), o EMBL 
(EMBL NUCLEOTIDE SEQUENCE DATABASE) e o 
GenBank. Devido à sua designação como provedor de dados 
primários, EMBL/DDBJ/GenBak é fonte inicial de muitos 
bancos de dados em biologia molecular. Como exemplos de 
bancos de dados de sequências genômicas secundárias, 
pode-se citar o Ensembl, o RefSeq e o Genome Review, que 
representa uma versão da sequência original de um 
cromossomo ou plasmídeo, com informações importadas de 
fontes que incluem o UniProt (UNIVERSAL PROTEIN 
RESOURCE), o Gene Ontology (GO), o projeto GOA (GO 
ANNOTATION), o InterPro e o HoGenom, além de serem 
disponibilizadas referências cruzadas com 18 bancos de 
dados. 
Fonte: ESPINDOLA, F. S. et al. Recursos de bioinformática 
aplicados às ciências ômicas como genômica, 
transcriptômica, proteômica, interatômica e metabolômica. 
Bioscience Journal, Uberlândia, v. 26, n. 3, p. 463-477, 
Maio/Junho 2010 (adaptado). 
I. As informações disponíveis nos bancos de dados de 
sequências possibilitam o desenvolvimento de pesquisas in 
sílico (realizadas em programas de computador), dependendo 
dos métodos interpretativos e programas de análises 
envolvidos. 
PORQUE 
II. Os bancos de dados de sequências fornecem informações 
sobre diversos genes, que podem ser utilizadas de forma 
rápida, independentemente do tipo de processamento. 
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: 
 
 
 
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. 
 
 
As asserções I e II são proposições falsas. 
 
 
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. 
 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da 
I. 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I. 
Data Resp.: 04/11/2023 14:00:01 
 
Explicação: 
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asp
Em relação a proposição I e II são verdadeiras, pois as informações disponíveis nos 
bancos de dados, como sequências de genes, quanto proteínas) possibilitam a sua 
utilização em pesquisa in sílico de forma rápida. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
7. 
 
 
A determinação da estrutura do Ácido Desoxirribonucléico foi 
um marco importante para a Biologia, esclarecendo como a 
informação hereditária é codificada em sequências de 
nucleotídeos de DNA nas células. A respeito desse tema, 
analise as alternativas a seguir: 
I. Os genes humanos são de grande tamanho e são 
constituídos de segmentos relativamente curtos de DNA, que 
codificam proteínas (íntrons), intercalados com longos 
segmentos de DNA não codificantes (éxons). 
II. As sequências de íntrons são transcritas em RNAm 
enquanto as sequências de éxons são removidas por meio de 
um processo conhecido como splicing. 
III. O dogma central da biologia nos mostra o fluxo de 
informações que vai do DNA até a formação de uma unidade 
proteica, na ordem DNA > transcrição > RNAm > tradução > 
proteína 
IV. Eucromatina é o nome dado ao padrão de cromatina 
desenovelado do DNA. 
É correto o que se afirma em: 
 
 
 
II e III. 
 
 
I e II. 
 
 
I e III. 
 
III e IV. 
 
 
II e IV. 
Data Resp.: 04/11/2023 14:01:39 
 
Explicação: 
As sequências de éxons são transcritas em RNAm enquanto as sequências de íntrons 
são removidas por meio de um processo conhecido como splicing de RNA. Os genes 
humanos são de grande tamanho e são constituídos de segmentos relativamente curtos 
de DNA. Durante a regulação de quais genes irão ser transcritos, temos a formação de 
regiões mais condensadas, que não são transcritos a heterocromatina e regiões com 
padrão de cromatina desenovelado que o DNA assume quando está aberto para a 
chegada da maquinaria de expressão ou replicação. O padrão desnovelado recebe o 
nome de eucromatina. 
 
 
 
 
 
 
 
 
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asp
 
8. 
 
 
Na era pós-moderna, com o advento e a consolidação da 
revolução robótica no século XX, foi possível aprimorar a 
criação de tecnologias computacionais nas mais variadas 
áreas do conhecimento, o que tem provocado profundas 
mudanças sociais em âmbito individual e coletivo. Nesse 
cenário, a bioinformática ou biocomputação surge na década 
de 1980, a fim de superar as fronteiras das ciências pelo 
desenvolvimento de novas abordagens capazes de promover 
a análise e a apresentação de dados biológicos, bem como 
de garantir a investigação de novos métodos para a 
resolução de complexas perguntas. 
Fonte: ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud 
Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. Sobre a bioinformática 
analise as afirmativas a seguir: 
I. A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que 
combina diferentes disciplinas, com destaque para a 
Estatística, biologia, química, informática e física. 
II. A bioinformática possibilitou a interpretação da linguagem 
dos de genes por algoritmos. 
III. Atualmente, os programas de computadores estão muito 
modernos, e é possível realizar todas grandes análises de 
forma rápida e precisa, como prever a ligação de diferentes 
átomos em uma molécula. 
É correto o que se afirma em: 
 
 
 
II. 
 
I e II. 
 
 
I e III. 
 
 
I. 
 
 
III. 
Data Resp.: 04/11/2023 14:03:21 
 
Explicação: 
Existem diversas ciências envolvidas com a bioinformática, que desfrutam do seu avanço, 
entretanto as áreas mais intimamente ligadas de acordo com a questão 17 são: 
Estatística, biologia, química, informática e física. Essa nova ciência permitiu que 
algoritmos fossem criados auxiliando na interpretação de genes, alinhamentos dos genes, 
descobrir sequências e funções de genes desconhecidas. No entanto, ainda precisamos 
de programas de computadores mais avançados, para por exemplo, analisar as 
dinâmicas moleculares (interação de átomos de diferentes proteínas), mas complexas e 
mais longas. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9. 
 
A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que 
apresenta diferentes aplicabilidades e tem sido bastante 
empregada para o desenvolvimento de novas metodologias 
de análise e garantindo diferentes avanços científicos. A 
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asphttps://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asp
 
seguir são listadas algumas técnicas da bioinformática. 
Assinale a alternativa que indica a técnica que tenta prever a 
atividade biológica de um composto baseado em equações 
estatísticas. 
 
 
 
Alinhamento molecular 
 
QSAR 
 
 
Dinâmica molecular 
 
 
Modelagem molecular 
 
 
Ancoramento molecular 
Data Resp.: 04/11/2023 14:05:54 
 
Explicação: 
O QSAR é uma técnica estatística de tratamento de dados a partir de descritores, visa 
buscar uma equação que quando resolvida tenta prever a atividade de uma molécula 
nova contra determinado receptor. O alinhamento molecular visa identificar genes que 
compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também usar o 
alinhamento para encontrar proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. 
O ancoramento molecular infere a modelagem molecular, para construir um modelo 
tridimensional e é utilizado para obter uma pose do ligante com o alvo e a dinâmica 
molecular para analisar como as interações acontecem, mimetizando o organismo. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
10. 
 
A bioinformática ou biocomputação associa conhecimentos 
em distintas áreas do conhecimento a fim de decifrar o código 
genético contido nas biomoléculas pelo estabelecimento de 
modelos lógico-matemáticos e estatísticos. Tais estratégias 
têm assegurado a interpretação e elucidação de eventos 
biológicos gerados a partir do sequenciamento de genes e 
proteínas. Bancos de dados de informações biológicas cada 
vez mais crescentes, o desenvolvimento de novas 
abordagens para análise e apresentação desses dados e a 
investigação de novas e complexas perguntas são as forças 
motrizes da bioinformática. A partir do advento dos projetos 
genomas, biologistas moleculares passam a empregar 
ferramentas computacionais capazes de analisar grandes 
quantidades de dados biológicos, a predizer funções dos 
genes e a demonstrar relações entre genes e proteínas. A 
internet e sua capacidade de compartilhar dados, além do 
desenvolvimento de processadores mais rápidos e com maior 
memória, desempenharam um papel decisivo para a 
consolidação da bioinformática como potencial campo do 
conhecimento científico. A partir disso, diferentes técnicas 
foram criadas permitindo o reconhecimento da genética atual. 
Sobre as técnicas da bioinformática analise a relação entre as 
afirmativas a seguir: 
I. A modelagem molecular é a técnica capaz de utilizar um 
modelo de ajuste induzido, a partir de uma simulação 
molecular. 
PORQUE 
https://simulado.estacio.br/bdq_simulados_exercicio_temas.asp
 
II. Visa mimetizar um ambiente o mais próximo possível do 
real e com isso obter diversas informações sobre a interação 
entre uma proteína e o receptor. 
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: 
 
 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da 
I. 
 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I. 
 
 
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. 
 
 
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. 
 
As asserções I e II são proposições falsas. 
Data Resp.: 04/11/2023 14:07:28 
 
Explicação: 
A dinâmica molecular é a técnica capaz de utilizar um modelo de ajusto induzido, a partir 
de uma simulação molecular, onde um sistema é inserido em uma caixa com água 
visando mimetizar um ambiente o mais próximo possível do real e com isso obter diversas 
informações sobre a interação entre um ligante e o receptor. A modelagem molecular visa 
achar proteínas moldes. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 Não Respondida Não Gravada Gravada 
 
 
 
 
Exercício por Temas inciado em 04/11/2023 13:30:25.