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“Peptídeos e proteínas” FIT5205-02501A/B/C (20201) Bioquímica Agrícola Carolina Herrera Mazo Química Farmacêutica Mestranda em Biologia de Fungos, Algas e Plantas chm.udea@gmail.com Setembro de 2020 Ligações de aminoácidos PEPTIDEOS Reação do grupo carboxila de um aminoácido e o amino de outro Estrutura dos peptídeos Tipo de configuração de ligação peptídica Ângulos de torque, phi e psi A ligação peptídica é quase plana e é favorecida pela forma trans, que é a mais estável. Alanina - Glicina- Serina Ala- Gly- Ser A- G- S Oligopeptídeos: União de 2 a 15-20 aminoácidos. Polipeptídeos: União de 20 a 100 aminoácidos. Exemplos de peptídeos bioativos de alimentos Muitos peptídeos de origem vegetal e animal com potencial bioativo relevante foram descobertos, sendo a maioria deles isolados de produtos à base de leite. As proteínas candidatas contendo essas atividades biológicas latentes são encontradas no leite, ovos, carnes e peixes, bem como em diferentes fontes de proteína vegetal, como soja e trigo. Visão geral dos efeitos benéficos dos peptídeos bioativos de proteínas alimentares Uma ampla gama de atividades foi descrita, incluindo propriedades antimicrobianas, efeitos de redução da pressão arterial, capacidade de redução do colesterol, atividades antioxidantes e aumento da absorção / biodisponibilidade de minerais. Além disso, alguns peptídeos são multifuncionais e podem exercer mais de um dos efeitos mencionados. Sistema cardiovascular Sistema nervoso Sistema gastrointestin al sistema imunológico Ligação mineral Imunomodulador Hipocolesterolêmi co Agonista opioide Antioxidante Antagonista opioide Antitrombótico Antimicrobiano PROTEÍNAS As proteínas são polímeros lineares de α-aminoácidos com ampla variabilidade estrutural e funções biológicas altamente diversas. A variedade de proteínas é muito alta, e para sua classificação costuma-se usar: Física Químico Estrutural Funcional Níveis de Organização das Proteínas Formado por ligações peptídicas a sequência de uma é sempre lida a partir de sua extremidade amino formación de puentes de hidrógeno entre los átomos que forman el enlace peptídico Enrole em uma forma tridimensio nal (3D). Consiste em mais de uma cadeia polipeptídica Estrutura primária Estrutura secundária Estrutura terciária Estrutura quaternária Resíduos de aminoácidos Hélice alfa Cadeia polipeptídica Subunidades montadas Estrutura Secundária • A região plana em cada ligação peptídica. • A formação de ligações de hidrogênio. • Separação adequada de grupos R (cadeias laterais de aminoácidos) HELICE ALFA ∞ Ligações de hidrogênio vista lateral vista superior FOLHA DOBRADA (FOLHA) BETA β Tipos de Folha Beta Outros elementos de estruturas secundárias: ➢ Conformações aleatórias ➢ Beta spins ESTRUTURAS SUPERSECUNDÁRIAS: hélice-rotação- hélice, grampo b, barril b, coiled- coil, Rossmann,etc. Estrutura Terciária • Interações hidrofóbicas das cadeias laterais. • Pontes de dissulfeto. • Ligações de hidrogênio. • Grupos protéticos. A estrutura terciária de uma proteína é diretamente responsável por suas propriedades biológicas. Tipos de estrutura terciária: ➢ Tipo fibroso, em que uma das dimensões é muito maior que as outras duas. Exemplos de colágeno, queratina, fibroína. ➢ Tipo globular, mais frequente, em que não há uma dimensão que predomine sobre as outras e sua forma é aproximadamente esférica. Exemplo de mioglobina. Domínios 50 - 300 aminoácidos Domínio proteico é uma parte da cadeia polipeptídica que pode de enovelar independentemente para formar uma estrutura compacta e estável. • Unidades estruturais, funcionais e evolutivas das proteínas • Geral- segmento contínuo da sequência de aminoácidos • Proteínas multidomínio Estrutura Quaternária A estrutura quaternária deve considerar: • o número e a natureza das diferentes subunidades ou monômeros que compõem o oligômero. • a maneira pela qual eles se associam no espaço para dar origem ao oligômero. uma cadeia polipeptídica quatro cadeias polipeptídicas Estrutura Quaternária A estrutura quaternária modula a atividade biológica da proteína e a separação das subunidades freqüentemente leva à perda de funcionalidade. As forças que mantêm as diferentes cadeias polipeptídicas juntas são amplamente as mesmas que estabilizam a estrutura terciária. As mais abundantes são as interações fracas (hidrofóbicas, polares, eletrostáticas e ligações de hidrogênio), embora em alguns casos, como nas imunoglobulinas, a estrutura quaternária seja mantida por ligações dissulfeto. A montagem dos monômeros é realizada de forma espontânea, o que indica que o oligômero possui um mínimo de energia livre em relação aos monômeros. Classificação físico-quimico Físico (Solubilidade) Químico albuminas: proteínas que são solúveis em água ou soluções salinas diluídas Proteínas simples: compostas exclusivamente por α-aminoácidos, como a ubiquitina, uma protease intracelular composta por 53 AA. globulinas: requerem maiores concentrações de sal para permanecer na solução Proteínas conjugadas: que contêm, além da cadeia polipeptídica, um componente não aminoácido denominado grupo protético, que pode ser um açúcar, um lipídeo, um ácido nucleico ou simplesmente um íon inorgânico. As proteínas conjugadas são hemoglobina, mioglobina, citocromos, etc. prolaminas: solúveis em álcool glutelinas: só se dissolvem em soluções ácidas ou básicas A proteína na ausência de seu grupo protético não é funcional e é chamada de apoproteína. escleroproteínas: são insolúveis na grande maioria dos solventes A proteína ligada ao seu grupo protético é funcional e é chamada de holoproteína (holoproteína = apoproteína + grupo protético). Classificação estrutural e funcional Funcional Estrutural Proteínas monoméricas: consistem em uma única cadeia polipeptídica, como a mioglobina. (funcional no transporte e armazenamento de oxigênio) Proteínas globulares: a cadeia polipeptídica aparece enrolada sobre si mesma dando origem a uma estrutura mais ou menos esférica e compacta. Exemplo: triosefosfato isomerase proteínas oligoméricas: consistem em várias cadeias polipeptídicas. As diferentes cadeias polipeptídicas que formam uma proteína oligomérica são chamadas de subunidades e podem ser iguais ou diferentes umas das outras. Ex: Hemoglobina Proteínas fibrosas: se houver uma dimensão que predomine sobre as outras, a proteína é dita fibrosa. As proteínas fibrosas geralmente têm funções estruturais. Exemplo: colágeno Propriedades das proteínas Precipitação seletiva Qualquer fator que modifique a interação da proteína com o solvente diminuirá sua estabilidade em solução e causará precipitação. Assim, o desaparecimento total ou parcial do envelope aquoso, a neutralização das cargas elétricas repulsivas ou a quebra das ligações de hidrogênio facilitarão a agregação intermolecular e causarão precipitação. A precipitação geralmente é consequência de um fenômeno denominado desnaturação. Propriedades das proteínas Capacidade de Amortecimento A maioria das proteínas intracelulares tem carga negativa, já que seu pH isoelétrico é inferior ao pH fisiológico (que está próximo a 7). As proteínas ácidas são aquelas que têm um ponto isoelétrico baixo (como a pepsina), e as proteínas básicas aquelas que têm um ponto isoelétrico alto (como as histonas). pI: carga líquida zero PH alto: carga negativa líquida Baixo pH: carga positiva líquida Propriedades das proteínas Propriedades Osmóticas Como todos os solutos moleculares ou iônicos, as proteínas exercem efeito osmótico quando existem barreiras que limitam sua difusão livre, como uma membrana semipermeável, que permite a passagem de água, mas não de solutos. O valor da pressão osmótica pode ser calculado usando a fórmula de Van't Hoff: p = cRT onde p é a pressão osmótica, c é a concentração, Ré a constante do gás e T é a temperatura absoluta proteínas se comportam como polianions A existência de proteínas em apenas um dos compartimentos provoca a retenção permanente de íons difusíveis naquele lado da membrana (efeito Donnan), o que aumenta o efeito osmótico Efeito Donnan: situação inicial Efeito Donnan: em equilíbrio Funções de proteínas Funções Exemplos Hormonal Insulina, glucagon (regular os níveis de glicose no sangue) Hormônio do crescimento calcitonina (regula o metabolismo do cálcio) Reconhecimento de sinal receptores de hormônio Transdução de sinal A rodopsina, converte fótons de luz durante o processo de visão. Estrutural fibras de colágeno são uma parte importante da matriz extracelular Regulação da expressão gênica A ciclina atua no mecanismo regulatório nas diferentes fases do ciclo celular Transporte Mioglobina, transporta oxigênio no sangue Movimento A actina e a miosina atuam na contração muscular. Reserva gliadina e hordeína, reservam aminoácidos para o posterior desenvolvimento de sementes em trigo e cevada, respectivamente. Defesa endonucleases de restrição, defesas em bactérias. imunoglobulina, reconhecimento de organismos estranhos. ENZIMÁTICO transferases, hidrolases, liases Denaturalização de proteínas Estado de origem Estado desnaturado desnaturação renaturação A desnaturação causa vários efeitos na proteína: 1. mudanças nas propriedades hidrodinâmicas da proteína: aumento da viscosidade e diminuição do coeficiente de difusão 2. uma diminuição drástica em sua solubilidade, uma vez que os resíduos hidrofóbicos no interior aparecem na superfície 3. perda de propriedades biológicas Detergentes, solventes orgânicos, pH, força iônica. Agentes desnaturantes Físico Temperatura Produtos químicos Três Estados de Renaturação intermediário parcialmente dobrado conformação nativa desdobrar conformação https://youtu.be/3IL_Df5ouUc https://youtu.be/O5uqdxQyJj8
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