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Prova Impressa GABARITO | Avaliação I - Individual (Cod.:955519) Peso da Avaliação 2,00 Prova 82893710 Qtd. de Questões 10 Acertos/Erros 10/0 Nota 10,00 As endonucleases de restrição são produzidas naturalmente por diversas bactérias. De acordo com essas enzimas, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) As enzimas de restrição são utilizadas para fragmentar o DNA em regiões específicas, permitindo a manipulação do DNA. ( ) Cada bactéria produz uma enzima de restrição específica, que pode ser isolada e purificada a partir de colônias dessas bactérias. ( ) As enzimas de restrição não reconhecem sequências específicas, apresentando regiões de clivagem aleatórias de 4 a 8 nucleotídeos. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A V - V - F. B F - V - F. C V - F - F. D F - F - V. A escolha do gel para a técnica de eletroforese deve-se dar através do tamanho da molécula a ser isolada e do objetivo do isolamento. Com base nas matrizes de agarose e poliacrilamida para a técnica de eletroforese em gel, analise as sentenças a seguir: I- A poliacrilamida pode separar fragmentos de DNA com até mesmo uma única base nitrogenada de diferença. II- A agarose, apresenta menor resolução, ou seja, cada banda presente no gel, representa um agrupamento de moléculas de tamanho semelhantes. III- No gel de poliacrilamida, uma menor faixa de tamanho das moléculas pode se movimentar, enquanto fragmentos maiores de DNA podem migrar facilmente no gel de agarose. Assinale a alternativa CORRETA: A As sentenças I, II e III estão corretas. B Somente a sentença I está correta. C Somente a sentença III está correta. VOLTAR A+ Alterar modo de visualização 1 2 D Somente a sentença II está correta. O mais recente avanço no campo de sequenciamento de DNA foi o desenvolvimento de plataformas portáteis capazes de sequenciar grandes moléculas de DNA em pequenos equipamentos. Um exemplo dessas plataformas é a MinION. Sobre a plataforma MinION, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas: I- Para que seja realizado o sequenciamento por meio da plataforma MinION, as amostras a serem sequenciadas são ligadas a enzimas de processamento. Essas enzimas induzem o fragmento de DNA a passar pelo nano poro, onde as variações da corrente elétrica são detectadas. PORQUE II- Sendo conhecidas as variações características de cada nucleotídeo, a sequência de nucleotídeos é formada rapidamente. Assinale a alternativa CORRETA: A As asserções I e II são proposições falsas. B As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I. C As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. D A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira. Através da técnica de eletroforese, ocorre a separação de moléculas em populações de tamanhos semelhantes, as quais são visualizadas como bandas no gel através de marcadores específicos. Sobre os marcadores para técnica de eletroforese em gel, assinale a alternativa CORRETA: A O corante ideal para eletroforese de DNA e RNA é aquele que não se liga ao DNA ou ao RNA, ficando somente na solução tampão da técnica. B O marcador ideal para a técnica de eletroforese em gel será aquele capaz de separar as bandas de DNA em diferentes tons de cores. C O corante mais utilizado para marcação de DNA é o azul de brometo. D O marcador ideal é o brometo de etídio, um corante fluorescente, que se liga ao DNA ou RNA e possibilita a sua visualização através de luz ultravioleta (UV). [Laboratório Virtual - Extração e Purificação de DNA e RNA] Segundo o sumário da aula prática, as amostras contendo o DNA ou RNA purificados devem ser: 1) ressuspensas em um tampão e armazenadas em tubos, ambos “livres” de enzimas que possam degradá-las (como DNAse ou RNAse – nucleases); e 2) mantidas em baixas temperaturas (-20 ºC ou - 80 ºC). Todos os procedimentos devem ser realizados com luvas para evitar a degradação das amostras, devido à presença de nucleases nos fluidos corporais das mãos. De acordo com o processo de extração de DNA e RNA identificado na prática, associe os itens, utilizando o código a seguir: I- Etapa de Lise. 3 4 5 II- Etapa de Ligação. III- Etapa de Lavagem. IV- Etapa de Eluição. ( ) Pipete 25 µl da Proteinase K no tubo Eppendorf. Em seguida, pipete 200 µl da amostra de sangue no mesmo tubo e, por último, pipete 200 µl do tampão lise S no tubo. Tampe o Eppendorf e homogeneíze no Vórtex por 20 segundos. Após esse tempo, incube o Eppendorf por 15 min. ( ) Pipete 210 µl de álcool 96% no Eppendorf e homogeneíze de novo no Vórtex. Em seguida, pipete 640 µl do Eppendorf para o tubo spin e centrifugue a 11.000 rpm por 1 minuto. ( ) Retire o Eppendorf da centrífuga, descarte o tubo de coleta e coloque o tubo spin em um novo tubo de coleta. Em seguida, pipete 500 µl do tampão de lavagem SI no tubo spin e centrifugue novamente. Repita o mesmo processo de troca de tubo de coleta, porém a lavagem utilizará 600 µl do tampão de lavagem SII, e centrifugue novamente. Por fim, repita o mesmo processo da troca do tubo de coleta e centrifugue novamente. ( ) Retire o Eppendorf da centrífuga, descarte o tubo de coleta e coloque o tubo spin em um novo tubo de coleta. Em seguida, pipete 200 µl do tampão de eluição S no tubo spin, espere 1 minuto e centrifugue a amostra. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A I - II - IV - III. B IV - III - II - I. C I - II - III - IV. D II - III - IV - I. Existem diferentes formas de sequenciar um genoma, sendo que cada uma se aplica dependendo da realidade do pesquisador em questão, podendo ser técnicas recentes, que são mais robustas e sofisticadas, ou então, técnicas mais antigas, que, ainda assim, demonstram um excelente resultado, apesar de serem mais complicadas e menos automatizadas. Sobre essas técnicas, associe os itens, utilizando o código a seguir: I- Sequenciamento de Sanger. II- Next Generation Sequencing. III- Sequenciamento de terceira geração. ( ) Método de primeira geração, mais conhecido por utilizar nucleotídeos terminados de cadeia (ddNTP). ( ) Método que permite a análise da sequência de nucleotídeos em uma única molécula de DNA, sem a necessidade de amplificação dessa molécula, em tempo real. ( ) São métodos de nova geração, que não utilizam nucleotídeos terminadores de cadeia para o processamento das amostras. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A I - II - III. B III - II - I. C II - I - III. D I - III - II. 6 A hibridização in situ foi elaborada com o objetivo de isolar e identificar fragmentos, através do anelamento entre duas fitas simples de origens distintas, sejam elas DNA ou RNA. Sobre essa técnica, associe os itens, utilizando o código a seguir: I- Northen-blotting. II- Southern-blotting. III- Hibridização in situ. ( ) Técnica que utiliza sondas de ácidos nucleicos, com marcação química, no local em que a molécula de interesse deve ser encontrada (RNA dentro da célula, DNA específico em cromossomos). ( ) Técnica que avalia padrões de sequências de nucleotídeos de genes do DNA e utiliza sondas de DNA molde, os quais são marcados com radiação ou quimicamente. ( ) Nesta técnica, o RNA mensageiro (mRNA) é utilizado a fim de buscar comparar situações distintas, como, por exemplo, utilizar amostras controle como padrão para expressão do gene de interesse e, assim, comparar com a amostra de interesse. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A II - I - III. B I - III - II. C I - II - III. D III - II - I. O uso de bibliotecas de DNA ou cDNA permitem a manutenção e replicação do material genético em grandes coleções mantidas em colônias de bactérias, nas quais um fragmento específico de DNA ou um gene podem ser procurados. Sobre as bibliotecas de DNA e cDNA, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas: I- A bactéria E. coli éa principal célula hospedeira utilizada no processo de clonagem em vetores, inclusive na construção de bibliotecas de DNA e cDNA, em que cada bactéria irá internalizar apenas um vetor. PORQUE II- Assim que o vetor é inserido, em condições adequadas de diluição e meio de cultivo, em poucas horas corre a formação de diversos clones dos fragmentos inseridos, sendo cada um encontrado em uma colônia diferente de crescimento bacteriano. Assinale a alternativa CORRETA: A A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira. B As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I. C As asserções I e II são proposições falsas. D As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. 7 8 [Laboratório Virtual - Hibridização] Segundo o roteiro de hibridização, o sucesso dessa prática depende da capacidade do DNA de se anelar às sequências complementares após a desnaturação (período em que a fita de DNA é simples). Dessa forma, o ponto de fusão do DNA, ou seja, o momento em que ocorre a ruptura das pontes de hidrogênio e a abertura da dupla fita de DNA, varia de um organismo para outro. O ponto de fusão do DNA também depende da quantidade de pares de base G-C e A-T, sendo que, quanto mais pares G-C, maior o ponto de fusão do genoma. Isso ocorre porque o par G-C é mais estável, apresentando três pontes de hidrogênio, enquanto o par A-T conta apenas com duas. Após o anelamento da sonda com sua sequência-alvo complementar, o padrão de hibridização é visto em microscópio de fluorescência. Além do ponto de fusão, outros fatores podem interferir na hibridização da sonda de DNA. Sobre esses fatores, analise as opções a seguir: I- Temperatura de fusão. II- pH alto para produzir condições de hibridização. III- Concentração de cátions monovalentes. IV- Presença de solventes orgânicos.Assinale a alternativa CORRETA: A Somente a opção I está correta. B As opções I, II, III e IV estão corretas. C Somente a opção II está correta. D Somente a opção III está correta. O sequenciamento de um gene de um organismo é umas das técnicas mais importante na biologia molecular, pois detecta mutações, cadeias de transmissão e origem da chegada do vírus a uma região específica. . De acordo com as técnicas empregadas para o sequenciamento de DNA, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) Os didesoxinucleotídeos (ddNTP) são utilizados para o sequenciamento com o método de Sanger, em que, posteriormente, faz-se a identificação da sequência com eletroforese. ( ) O método empregado na plataforma Illumina foi a base para o desenvolvimento dos testes de sequenciamento que conhecemos atualmente, sendo a primeira geração de sequenciamento de DNA. ( ) O pirosequenciamento tem como base a formação de pirofosfato a cada novo nucleotídeo adicionado à nova fita. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A V - F - V. B F - F - V. C V - F - F. D V - V - F. 9 10 Imprimir