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CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 669 membrana peroxissômicas são feitas no citosol e inseridas na membrana de peroxisso- mos preexistentes, enquanto outras são primeiro integradas na membrana do RE, onde são empacotadas em vesículas precursoras peroxissômicas especializadas. Novas vesí- culas precursoras podem então se fundir umas com as outras e começar a importação de proteínas peroxissômicas adicionais, usando sua própria maquinaria de importação de proteínas para tornarem-se peroxissomos maduros, os quais podem sofrer ciclos de crescimento e fissão. Resumo Os peroxissomos são especializados em promover reações de oxidação usando oxigênio molecular. Eles geram peróxido de hidrogênio, que é empregado em reações oxidativas – e contêm catalases para destruir o excesso do mesmo. Assim como as mitocôndrias e os plas- tídios, os peroxissomos são organelas autorreplicativas. Pelo fato de não conterem DNA ou ribossomos, toda sua proteína é codificada no núcleo da célula. Algumas dessas proteínas são repassadas aos peroxissomos via vesículas precursoras peroxissômicas que brotam do RE, mas muitas são sintetizadas no citosol e importadas diretamente. Uma sequência es- pecífica de três aminoácidos próxima à região C-terminal de muitas proteínas funciona como um sinal de importação peroxissômica. O mecanismo de importação de proteínas difere daquele de mitocôndrias e cloroplastos, no qual mesmo proteínas oligoméricas são importadas do citosol sem estarem desenoveladas. RETÍCULO ENDOPLASMÁTICO Todas as células eucarióticas possuem retículo endoplasmático (RE). Sua membrana em geral constitui mais do que a metade da membrana total de uma célula animal (ver Tabela 12-2, p. 643). O RE está organizado em um labirinto de túbulos ramificados e de vesículas achatadas que se estendem através do citosol (Figura 12-31 e Animação 12.4). Os túbulos e sacos são interconectados, e suas membranas são contíguas com a mem- brana nuclear externa; o compartimento que elas encerram, portanto, também é con- tíguo com o espaço entre as membranas nuclear externa e interna. Dessa forma, o RE e as membranas nucleares formam uma folha contínua envolvendo um espaço interno único, chamado de lúmen do RE ou espaço cisternal do RE, que costuma ocupar mais de 10% do volume celular total (ver Tabela 12-1, p. 643). Como mencionado no início deste capítulo, o RE tem um papel central na biossín- tese de lipídeos e proteínas, servindo também como um local de armazenamento intrace- lular de Ca2+, que é usado em muitas respostas de sinalização celular (discutido no Capí- tulo 15). A membrana do RE é o sítio de produção de todas as proteínas transmembrana e lipídeos para a maioria das organelas celulares, incluindo o próprio RE, o aparelho de Golgi, os lisossomos, os endossomos, as vesículas secretoras e a membrana plasmática. A membrana do RE é também o local onde é feita a maioria dos lipídeos para as membranas mitocondriais e peroxissômicas. Além disso, quase todas as proteínas que serão secre- tadas para o exterior celular – acompanhadas daquelas destinadas ao lúmen do RE, ao aparelho de Golgi ou aos lisossomos – são enviadas inicialmente ao lúmen do RE. Figura 12-31 Micrografias fluorescen- tes do retículo endoplasmático. (A) Uma cultura de tecido de células ani- mais foi geneticamente modificada para expressar uma proteína de membrana do RE fusionada a uma proteína fluores- cente. O RE estende-se como uma rede de túbulos e folhas ao longo de todo o citosol, de modo que todas as regiões do citosol estão próximas a algumas porções da membrana do RE. A membrana nuclear externa, que é contínua com o RE, tam- bém é corada. (B) Parte de uma rede do RE em uma célula vegetal viva geneticamente modificada para expressar uma proteína fluorescente no RE. (A, cortesia de Patrick Chitwood e Gia Voeltz; B, cortesia de Petra Boevink e Chris Hawes.) (A) 2 !m (B) 10 !m Túbulos do RE Folhas do RE Membrana nuclear externa NÚCLEO PEROXISSOMOS MITOCÔNDRIAS PLASTÍDIOS RETÍCULO ENDOPLASMÁTICO EXTERIOR DA CÉLULA GOLGI ENDOSSOMO TARDIO LISOSSOMO ENDOSSOMO PRIMÁRIO VESÍCULAS SECRETORAS CITOSOL 670 PARTE IV Organização interna da célula O RE é estrutural e funcionalmente diverso Enquanto as várias funções do RE são essenciais para cada célula, suas importâncias re- lativas variam muito entre tipos celulares individuais. Para satisfazer demandas funcio- nais diferentes, regiões distintas de RE tornam-se altamente especializadas. Observamos tal especialização funcional como mudanças dramáticas na estrutura do RE, e diferentes tipos celulares podem, portanto, possuir caracteristicamente diversos tipos de membra- na do RE. Uma das especializações mais notáveis é o RE rugoso. As células de mamíferos começam a importação de proteínas para o RE antes da síntese completa da cadeia polipeptídica – isto é, a importação é um processo cotra- ducional (Figura 12-32A). Ao contrário, a importação de proteínas nas mitocôndrias, nos cloroplastos, no núcleo e nos peroxissomos é um processo pós-traducional (Figura 12-32B). No transporte cotraducional, o ribossomo que está sintetizando a proteína está diretamente aderido à membrana do RE, permitindo que uma ponta da proteína seja translocada para o RE enquanto o restante da cadeia polipeptídica está sendo sintetiza- do. Esses ribossomos ligados à membrana cobrem a superfície do RE, criando regiões chamadas retículo endoplasmático rugoso, ou RE rugoso; regiões do RE sem ribosso- mos ligados são chamadas de retículo endoplasmático liso, ou RE liso (Figura 12-33). A grande maioria das células possui regiões limitadas de RE liso, e o RE é, com frequência, parcialmente liso e parcialmente rugoso. Áreas de RE liso a partir das quais vesículas carregando proteínas recém-sintetizadas e lipídeos se desprendem para trans- porte até o aparelho de Golgi são chamadas de RE transicional. Em certas células especia- lizadas, o RE liso é abundante e tem funções adicionais. Ele é proeminente, por exemplo, em células que se especializam no metabolismo de lipídeos, como células que sintetizam hormônios esteroides a partir do colesterol; o RE liso expandido acomoda as enzimas que fazem o colesterol e o modificam a fim de formar os hormônios (ver Figura 12-33B). Principal tipo celular no fígado, o hepatócito também possui uma quantidade sig- nificativa de RE liso. Ele é o principal sítio de produção de partículas de lipoproteína, que carregam lipídeos a outras partes do corpo via corrente sanguínea. As enzimas que sinte- tizam os componentes lipídicos das lipoproteínas estão localizadas na membrana do RE liso, a qual também contém enzimas que catalisam uma série de reações para destoxifi- car substâncias lipossolúveis e vários compostos danosos produzidos pelo metabolismo. As reações de destoxificação mais extensamente estudadas são realizadas pela família de enzimas citocromo P450, que catalisam uma série de reações nas quais substâncias inso- lúveis em água ou metabólitos que, de outra forma, poderiam ser acumulados em níveis tóxicos nas membranas celulares são transformados em solúveis em água o suficiente para deixarem a célula e serem excretados na urina. Uma vez que o RE rugoso sozinho não pode conter quantidades suficientes dessas e de outras enzimas necessárias, uma grande porção de membrana em um hepatócito normalmente consiste em RE liso (ver Tabela 12-2). Outra função crucial do RE na maioria das células eucarióticas é sequestrar Ca2+ do citosol. A liberação de Ca2+ do RE para o citosol e sua subsequente recaptação estão envolvidas em muitas respostas rápidas a sinais extracelulares, como discutido no Ca- Figura 12-32 Translocação cotraducio- nal e pós-traducional de proteínas. (A) Os ribossomos ligam-se à membrana do RE durante a translocação cotraducional. (B) Ao contrário, os ribossomos citosólicos completam a síntese de proteínas e as liberam antes da translocação pós-tradu- cional. Em ambos os casos,a proteína é direcionada para o RE por uma sequência- -sinal (vermelho e laranja). 5! 5!3! 3! TRANSLOCAÇÃO COTRADUCIONAL TRANSLOCAÇÃO PÓS-TRADUCIONAL(A) (B) Cadeia polipeptídica crescente mRNA Ribossomo ligado ao RE Ribossomo livre RERE CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 671 pítulo 15. Uma bomba de Ca2+ transporta Ca2+ do citosol para o lúmen do RE. O arma- zenamento de Ca2+ no lúmen do RE é facilitado pelas altas concentrações de proteínas que se ligam a Ca2+ lá existentes. Em alguns tipos celulares, e talvez na maioria, regiões específicas do RE são especializadas no armazenamento de Ca2+. As células musculares possuem um abundante RE liso modificado, denominado retículo sarcoplasmático. A li- beração e a recaptação de Ca2+ pelo retículo sarcoplasmático disparam, respectivamente, a contração e o relaxamento das miofibrilas, durante cada ciclo de contração muscular (discutido no Capítulo 16). Para estudar as funções e a bioquímica do RE, é necessário isolar sua membrana. Isso pode parecer uma tarefa inexequível, porque o RE é entremeado de forma intrin- cada com outros componentes do citosol. Felizmente, quando os tecidos ou as células são rompidos por homogeneização, o RE se quebra em fragmentos e recompõe-se na forma de muitas pequenas vesículas (cerca de 100 a 200 nm de diâmetro) denominadas microssomos. Os microssomos são relativamente fáceis de purificar. Para os bioquími- cos, os microssomos representam pequenas versões autênticas do RE, ainda capazes de translocação de proteínas, glicosilação proteica (discutido adiante), captação e liberação de Ca2+, bem como síntese de lipídeos. Os microssomos derivados do RE rugoso são cri- vados de ribossomos e denominados microssomos rugosos. Os ribossomos são sempre Núcleo Membrana nuclear interna Membrana nuclear externa Membrana do RE Membrana do RE (A) 200 nm (B) (D) 200 nm 0,5 !m RE rugoso RE liso Lúmen do RE (C) Figura 12-33 RE rugoso e liso. (A) Uma micrografia eletrônica de um RE rugoso em uma célula pancreática exócrina que produz e secreta diariamente grandes quantidades de enzimas digestivas. O citosol está preenchido com camadas empacotadas de mem- branas de RE que são ornadas com ribossomos. Em cima e à esquerda está mostrada uma porção do núcleo e seu envelope nuclear; note que a membrana nuclear externa, que é contínua com o RE, também está ornada com ribossomos. (B) RE liso abundante em uma célula secretora de hormônio esteroide. Esta micrografia eletrônica é de uma célula de Leydig secretora de testosterona em testículo humano. (C) Uma reconstrução tridimensional de uma região do RE liso e RE rugoso em uma célula de fígado. O RE rugoso forma pilhas orientadas de cisternas achatadas, cada uma possuindo um espaço luminal de 20 a 30 nm. A membrana do RE liso está conectada a estas cisternas e forma uma fina rede de túbulos de 30 a 60 nm de diâmetro. O lúmen do RE é de cor verde. (D) Uma reconstrução tomográfica de uma porção da rede do RE em uma célula de levedura. Ribossomos ligados à membrana (peque- nas esferas pretas) são vistos tanto nas folhas achatadas quanto nas regiões tubulares de diâmetro irregular, demonstrando que os ribossomos se ligam a membranas do RE de diferentes curvaturas nessas células. (A, cortesia de Lelio Orci; B, cortesia de Daniel S. Friend; C, de R.V. Krstić, Ultrastructure of the Mammalian Cell. New York: Springer-Verlag, 1979; D, de M. West et al., J. Cell Biol. 193:333–346, 2011. Com permissão de Rockefeller University Press.) 672 PARTE IV Organização interna da célula encontrados na superfície externa, de tal forma que o interior do microssomo é bioqui- micamente equivalente ao lúmen do RE (Figura 12-34A). Muitas vesículas de tamanho similar ao dos microssomos rugosos, porém des- providas de ribossomos aderidos, também são encontradas nesses homogenados. Tais microssomos lisos são derivados, em parte, de porções lisas do RE e, em parte, de frag- mentos vesiculados da membrana plasmática, do aparelho de Golgi, dos endossomos e das mitocôndrias (a proporção dependendo do tecido). Então, enquanto microssomos rugosos são claramente derivados de porções do RE rugoso, não é fácil separar micros- somos lisos derivados de organelas diferentes. Os microssomos preparados de células do fígado ou de células do músculo são uma exceção. Devido às grandes quantidades pouco comuns de RE liso ou retículo sarcoplasmático, respectivamente, muitos dos microsso- mos lisos nos homogenados desses tecidos são derivados do RE liso ou do retículo sarco- plasmático. Os ribossomos aderidos à membrana tornam os microssomos rugosos mais densos do que os microssomos lisos. Como resultado, os microssomos lisos e rugosos podem ser separados uns dos outros por centrifugação de equilíbrio (Figura 12-34B). Os microssomos têm sido inestimáveis na elucidação de aspectos moleculares da função do RE, como discutiremos a seguir. As sequências-sinal foram descobertas primeiro em proteínas importadas para o RE rugoso O RE captura proteínas selecionadas do citosol assim que elas são sintetizadas. Essas proteínas são de dois tipos: proteínas transmembrana, que são apenas parcialmente translocadas através da membrana do RE e tornam-se “embutidas” na membrana, e proteínas solúveis em água, que são totalmente translocadas através da membrana do RE e liberadas no lúmen do RE. Algumas das proteínas transmembrana funcionam no RE, mas muitas são destinadas à membrana plasmática ou à membrana de outra organela. As proteínas solúveis em água são destinadas tanto à secreção quanto à residência no lúmen do RE ou de outra organela. Todas essas proteínas, apesar do seu subsequente destino, são dirigidas para a membrana do RE por uma sequência-sinal do RE, a qual inicia a sua translocação por um mecanismo comum. As sequências-sinal (e a estratégia de sequência-sinal para endereçamento de proteínas) foram descobertas no início dos anos de 1970 em proteínas secretadas trans- locadas através da membrana do RE como um primeiro passo de sua liberação final da célula. No experimento-chave, o mRNA codificando a proteína secretada foi traduzido por ribossomos in vitro. Quando os microssomos foram omitidos desse sistema livre de células, a proteína sintetizada foi levemente maior do que a proteína normal secreta- da. Na presença de microssomos derivados do RE rugoso, todavia, foi produzida uma proteína de tamanho correto. De acordo com a hipótese do sinal, a diferença no tamanho reflete a presença inicial de uma sequência-sinal que direciona a proteína secretada à membrana do RE e é, então, clivada por uma peptidase-sinal na membrana do RE antes RE rugoso Homogeneização RE liso Microssomos rugosos e lisos Tubo com gradiente de concentração de sacarose crescente Os microssomos lisos têm baixa densidade e param de sedimentar flutuando em baixas concentrações de sacarose Os microssomos rugosos têm alta densidade e param de sedimentar flutuando em altas concentrações de sacarose Centri- fugação 200 nm (B) (A) Figura 12-34 Isolamento dos micros- somos rugosos e lisos do RE. (A) Uma micrografia eletrônica de secção fina de uma fração purificada do RE rugoso revela abundância de vesículas contendo ribosso- mos. (B) Quando sedimentados por meio de um gradiente de sacarose, os dois tipos de microssomos separam-se um do outro, de acordo com suas diferentes densidades. Note que a fração lisa também irá conter material não derivado do RE. (A, cortesia de George Palade.) CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 673 que a cadeia polipeptídica tenha sido completada (Figura 12-35). Os sistemas livres de células, nos quais as proteínas são importadas para os microssomos, oferecem procedi- mentos de análise eficazes para identificação, purificação e estudo de vários componen- tes da maquinaria molecular responsável pelos processos de importação do RE. Uma partícula de reconhecimento de sinal (SRP)direciona a sequência-sinal do RE para um receptor específico na membrana do RE rugoso A sequência-sinal do RE é guiada à membrana do RE por, pelo menos, dois componen- tes: uma partícula de reconhecimento de sinal (SRP, signal-recognition particle), que circula entre a membrana do RE e o citosol e liga-se à sequência-sinal, e um receptor SRP na membrana do RE. A SRP é um grande complexo; nas células animais ela consis- te em seis diferentes cadeias polipeptídicas ligadas a uma única pequena molécula de RNA. Enquanto a SRP e seu receptor possuem poucas subunidades em bactérias, homó- logos estão presentes em todas as células, indicando que esse mecanismo de proteína- -alvo surgiu cedo na evolução e tem sido conservado. As sequências-sinal do RE variam na sequência de aminoácidos, mas cada uma possui oito ou mais aminoácidos apolares no seu centro (ver Tabela 12-3, p. 648). Como a SRP pode ligar-se especificamente a tantas sequências diferentes? A resposta veio da estrutura cristalina da proteína SRP, a qual mostra que o sítio de ligação da sequência- -sinal é uma grande cavidade hidrofóbica coberta por metioninas. Devido ao fato de as metioninas possuírem cadeias laterais flexíveis não ramificadas, a cavidade é suficiente- mente plástica para acomodar sequências-sinal hidrofóbicas de diferentes sequências, tamanhos e formas. A SRP é uma estrutura do tipo haste, que envolve a subunidade ribossômica maior com uma ponta ligando a sequência-sinal do RE à medida que emerge do ribossomo como parte da cadeia polipeptídica recém-produzida; a outra ponta bloqueia o sítio de ligação do fator de elongamento na interface entre as subunidades grande e pequena do ribossomo (Figura 12-36). Esse evento provoca uma pausa na síntese proteica tão logo o peptídeo-sinal tenha emergido do ribossomo. A pausa transitória provavelmente dá tempo suficiente ao ribossomo para ligar-se à membrana do RE antes de comple- tar a síntese da cadeia polipeptídica, garantindo, desse modo, que a proteína não seja liberada no citosol. Esse dispositivo de segurança pode ter importância especial para Figura 12-35 A hipótese do sinal. Uma visão simplificada do transporte de proteínas através da membrana do RE, como proposto originalmente. Quando a sequência-sinal do RE emerge dos ribosso- mos, ela direciona os ribossomos para um translocador na membrana do RE, que for- ma um poro na membrana através do qual o polipeptídeo é translocado. A sequência- -sinal é retirada durante a tradução por uma peptidase-sinal, e a proteína madura é liberada para o lúmen do RE imediata- mente após ser sintetizada. O translocador permanece fechado até que o ribossomo tenha se ligado, mantendo a barreira de permeabilidade da membrana do RE em todos os momentos. CITOSOL LÚMEN DO RE CLIVAGEM DO PEPTÍDEO-SINAL Sequência-sinal da cadeia peptídica crescente NH2 NH2 COOH Cadeia polipeptídica madura 5! 3! Translocador fechado Subunidades ribossômicas livres mRNA Peptídeo-sinal clivado Peptidase -sinal 674 PARTE IV Organização interna da célula hidrolases secretadas e lisossômicas que poderiam causar danos ao citosol; entretanto as células que secretam grandes quantidades de hidrolases tomam a precaução extra de possuir altas concentrações de inibidores de hidrolases no seu citosol. A pausa também assegura que grandes porções de proteína, que poderiam enovelar-se em uma estrutura compacta, não sejam originadas antes de chegarem ao translocador na membrana do RE. Então, ao contrário da importação pós-traducional de proteínas em mitocôndrias e cloroplastos, proteínas chaperonas não são necessárias para capturar proteínas não enoveladas. Quando uma sequência-sinal se liga, a SRP expõe um sítio de ligação para o recep- tor SRP (ver Figura 12-36B, C), que é um complexo proteico transmembrana na mem- brana do RE rugoso. A ligação de SRP ao seu receptor traz o complexo ribossomo-SRP a um translocador proteico não ocupado na mesma membrana. A SRP e o receptor SRP são então liberados, e o translocador transfere a cadeia polipeptídica crescente através da membrana (Figura 12-37). Subunidade ribossômica menor Subunidade ribossômica menor Subunidade ribossômica maior Subunidade ribossômica maior DobradiçaSequência-sinal ligada à SRP Receptor de SRP Partícula de reconhecimento de sinal (SRP) (A) (B) (C) Sequência-sinal da cadeia polipetídica crescente Sítio de ligação do fator de alongamento Dobradiça Domínio da pausa traducional Bolsão de ligação da sequência-sinal Molécula de RNA da SRP SRP LÚMEN DO RE Figura 12-36 Partícula de reconhecimento de sinal (SRP). (A) A SRP de mamíferos é um complexo ribonucleoproteico do tipo haste contendo seis subunidades proteicas (marrom) e uma molécula de RNA (azul). O RNA da SRP forma uma cadeia principal que acopla o domínio proteico, contendo o bolsão de ligação à sequência-sinal ao domínio responsável pela pausa de tradução. As estruturas cristalinas de diversas partes de SRPs de espécies diferentes são montadas aqui em um modelo composto para se apro- ximar da estrutura de uma SRP completa. (B) O esboço tridimensional da SRP ligado a um ribossomo foi determinado por microscopia crioeletrônica. A SRP liga-se à subunidade maior do ribossomo, de modo que sua sequência-sinal de ligação está posicionada perto do sítio de saída da cadeia polipeptídica crescente e seu domínio de pausa traducional está posicionado na interface entre as subunidades ribossômicas, onde interfere na ligação do fator de alongamento. (C) Quando a sequência-sinal surge do ribossomo e se liga na SRP, uma modificação conformacional na SRP expõe um sítio de ligação para o receptor de SRP. (B, adaptada de M. Halic et al., Nature 427:808–814, 2004. Com permissão de Macmillan Publishers Ltd.) Figura 12-37 Como a sequência-sinal do RE e a SRP direcionam os ribosso- mos à membrana do RE. A SRP e seu receptor agem em conjunto. A SRP liga-se à sequência-sinal do RE exposta e ao ribos- somo, induzindo, portanto, uma pausa na tradução. O receptor SRP na membrana do RE, que, nas células animais, é composto de duas cadeias polipeptídicas diferentes, liga-se ao complexo SRP-ribossomo e di- reciona-o ao translocador. Em uma reação pouco conhecida, a SRP e seu receptor são então liberados, deixando o ribossomo ligado ao translocador na membrana do RE. O translocador insere a cadeia polipep- tídica na membrana e a transfere através da bicamada lipídica. Uma vez que uma das proteínas SRP e ambas as cadeias do receptor SRP contêm domínios de ligação a GTP, supõe-se que as mudanças confor- macionais que ocorrem durante os ciclos de ligação e hidrólise do GTP (discutido no Capítulo 15) garantam que a liberação de SRP ocorra somente após o ribossomo es- tar adequadamente associado ao translo- cador na membrana do RE. O translocador permanece fechado até que o ribossomo tenha se ligado, mantendo a barreira de permeabilidade da membrana do RE em todos os momentos. RECONHECIMENTO CITOSOL LÚMEN DO RE ALVO RECICLAGEM LIBERAÇÃO Sequência- -sinal do peptídeo crescente SRP A ligação da SRP ao peptídeo-sinal provoca uma pausa na tradução Receptor de SRP na membrana do RE rugoso Proteína translocadora N A tradução continua e começa a translocação CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 675 Esse processo de transferência cotraducional cria duas populações espacialmente separadas de ribossomos no citosol. Os ribossomos ligados à membrana, ligados ao lado citosólico da membrana do RE, estão empenhados na síntese de proteínas que es- tão sendo simultaneamente translocadas para o RE. Os ribossomos livres, não ligados a membranas, sintetizam todas as outras proteínas codificadas pelo genoma nuclear. Os ribossomos ligados à membrana e os livres são estrutural e funcionalmente idênticos. Eles diferem apenas quanto às proteínas que estão sendo produzidas por eles em um dado momento. Uma vez que muitos ribossomospodem se ligar a uma única molécula de mRNA, um polirribossomo costuma ser formado. Se o mRNA codifica uma proteína com uma sequência-sinal, o polirribossomo torna-se anexado à membrana do RE, dirigindo-a pe- las sequências-sinal em múltiplas cadeias polipeptídicas crescentes. Ribossomos indivi- duais associados a tais moléculas de mRNA podem retornar ao citosol quando acabam a tradução e misturam-se com a população de ribossomos livres. O mRNA, no entanto, permanece ligado à membrana do RE por uma troca de populações ribossômicas, cada um mantido transitoriamente na membrana por translocadores (Figura 12-38 ). A cadeia polipeptídica atravessa um canal aquoso no translocador Debateu-se longamente se as cadeias polipeptídicas são transferidas através da mem- brana do RE em contato direto com a bicamada lipídica, ou através de um canal em uma proteína translocadora. O debate se encerrou com a identificação da proteína transpor- tadora, que se mostrou capaz de formar um canal preenchido por água na membrana, pelo qual a cadeia polipeptídica cruza a membrana. O centro do translocador, deno- 5! 5! 5! 5! 3! 3! 3! 3! População comum de subunidades ribossômicas no citosol O mRNA codificando uma proteína citosólica permanece livre no citosol Polirribossomo livre no citosol O mRNA codificando uma proteína direcionada para o RE permanece ligado à membrana Polirribossomo ligado à membrana do RE por múltiplas cadeias polipeptídicas nascentes Sequência- -sinal do RE Membrana do RE CICLO DA SRP CICLO DO RIBOSSOMO LIVRE CICLO DO RIBOSSOMO LIGADO À MEMBRANA (B) 400 nm PolirribossomoMembrana do RE (A) 5! 3! LÚMEN DO RE Roseta do polirribossomo Figura 12-38 Polirribossomos livres e ligados à membrana. (A) Uma população comum de ribossomos sintetiza proteínas que permanecem no citosol e aquelas que são transportadas para o RE. A sequência-sinal do RE em uma cadeia polipeptídica recém-formada liga-se à SRP, que direciona ribossomos que iniciaram a tradução à membrana do RE. A molécula de mRNA se mantém permanentemente ligada ao RE como parte de um polirribossomo, enquanto os ribossomos que se movimentam ao longo do polirribossomo são reciclados; no fim de cada ciclo de síntese proteica, as subunidades ribossômicas são liberadas e reunidas na população comum no citosol. (B) Uma fina secção em micrografia eletrônica de polirribossomos ligados à membrana do RE. O plano da secção em alguns pontos corta o RE rugoso paralelamente à membrana, criando um padrão de roseta dos polirribossomos. (B, cortesia de George Palade.) 676 PARTE IV Organização interna da célula minado complexo Sec61, consiste em três subunidades que são altamente conserva- das desde bactérias até células eucarióticas. A estrutura do complexo Sec61 sugere que "-hélices da subunidade maior cercam um canal central através do qual uma cadeia po- lipeptídica atravessa a membrana (Figura 12-39). O canal é bloqueado por uma "-hélice pequena que parece manter o translocador fechado quando está inerte e se move para o lado quando está ocupado passando uma cadeia polipeptídica. Por essa razão, o poro é um canal dinâmico que se abre apenas brevemente quando uma cadeia polipeptídica atravessa a membrana. Em um translocador inerte, é importante manter o canal fecha- do, desse modo permanecendo a membrana impermeável a íons, como Ca2+, que, por outro lado, poderiam escapar do RE. Quando uma cadeia polipeptídica está se translo- cando, um anel de aminoácidos hidrofóbicos da cadeia lateral fornece um lacre flexível para evitar perda de íons. A estrutura do complexo Sec61 sugere que o poro também possa abrir uma fenda do seu lado. De fato, algumas estruturas do translocador mostraram-se bloqueadas na conformação da linha de junção aberta. Essa abertura permite a translocação por um acesso lateral à cadeia polipeptídica ao centro hidrofóbico da membrana, um processo que é importante tanto para a liberação do peptídeo-sinal clivado da membrana (ver Figura 12-35) quanto para a integração de proteínas na bicamada, como discutiremos a seguir. Em células eucarióticas, quatro complexos Sec61 formam um grande conjun- to de translocadores que podem ser visualizados nos ribossomos ligados ao RE após a solubilização da membrana do RE com detergente (Figura 12-40). É provável que esse FECHADO Fresta lateral Plugue ABERTO Plugue deslocado Peptídeo- -sinal Cadeia polipeptídica crescente Bicamada lipídica Fresta lateral Subunidade ! Subunidade " Subunidade # Dobradiça Dobradiça (A) (B) Plugue Plugue deslocado Plugue deslocado Abertura do poro Subunidade ! Figura 12-39 Estrutura do complexo Sec61. (A) Uma visão lateral (esquerda) e uma visão de cima (direita, a partir do citosol) da estrutura do complexo Sec61 da arqueia Methanococcus jannaschii. A subunidade " de Sec61 tem uma estrutura invertida repetida (ver Figura 11-10) e é mostrada em azul e marrom para indicar sua pseudos- simetria; as duas pequenas subunidades # e $ são mostradas em cinza. Na vista lateral, algumas hélices da frente foram omitidas para deixar o interior do poro visível. A pequena hélice amarela parece formar um plugue que tampa o poro quando o transportador está fechado. Para abri-lo, o complexo rearranja-se para deslocar o plugue, como indicado pela seta vermelha. Acredita-se que um anel de aminoácidos hidrofóbicos da cadeia lateral forme um estreito diafragma em torno da translocação da cadeia polipeptídica para evitar escapes de outras moléculas através da membrana. O poro do complexo Sec61 também pode abrir para o lado da fresta lateral. (B) Modelos de estados abertos e fechados do translocador são mostrados no topo, ilustrando como a sequência-sinal (ou um segmento transmembrana) poderia ser liberado na bicamada lipídica, após a abertura da fenda. (Códigos PDB: 1RH5 e 1RHZ.) CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 677 conjunto inclua outros complexos de membrana que se associam com o translocador, como enzimas que modificam a cadeia polipeptídica crescente, incluindo a transferase de oligossacarídeos e a peptidase-sinal. O conjunto de um translocador com esses com- ponentes acessórios é chamado de translócon. A translocação através da membrana do RE nem sempre necessita do alongamento da cadeia polipeptídica em andamento Como vimos, a translocação de proteínas para as mitocôndrias, os cloroplastos e os pe- roxissomos ocorre de modo pós-traducional depois que a proteína foi sintetizada e libe- rada no citosol, enquanto a translocação através da membrana do RE em geral ocorre durante a tradução (cotraducionalmente). Esse fato explica por que os ribossomos são ligados ao RE, mas não são ligados a outras organelas. Algumas proteínas, no entanto, são importadas para o RE depois de completada sua síntese, demonstrando que o transporte nem sempre requer tradução em anda- mento. A translocação pós-traducional de proteínas é especialmente comum através da membrana do RE em células de levedura e através da membrana plasmática bacteriana (a qual se acredita ser evolutivamente relacionada ao RE). Para atuar na translocação pós-traducional, o translocador do RE necessita de proteínas acessórias que coloquem a cadeia polipeptídica no poro e sustentem o transporte (Figura 12-41). Em bactérias, uma proteína motriz de translocação, a ATPase SecA, liga-se ao lado citosólico do trans- locador, onde desencadeia mudanças conformacionais cíclicas sustentadas por hidróli- se de ATP. Cada vez que um ATP é hidrolisado, uma porção da proteína SecA insere-se no poro do translocador, impelindo um curto segmento da proteína transportada com ela. Como resultado desse mecanismo de catraca, a ATPase SecA empurra a cadeia polipep- tídica da proteína transportada através da membrana. As células eucarióticas utilizam um conjunto diferente de proteínas acessórias que se associam ao complexo Sec61. Essas proteínas atravessam a membrana do RE e usam um pequeno domínio localizado no lado do lúmenda membrana do RE para depositar uma proteína chaperona do tipo hsp70 (denominada BiP, de binding protein) na cadeia polipeptídica, à medida que esta emerge do poro para o lúmen do RE. Ciclos ATP-dependentes de ligação e liberação de BiP dirigem a translocação unidirecional, como já descrito para proteínas hsp70 mitocondriais que puxam proteínas através de membranas mitocondriais. As proteínas que são transportadas para o RE por um mecanismo pós-traducional são primeiramente liberadas no citosol, onde se ligam a proteínas chaperonas, evitando o seu enovelamento por ligação, como discutido antes para as proteínas cujo destino são as mitocôndrias e os cloroplastos. Em proteínas transmembrana de passagem única, somente uma sequência-sinal interna do RE permanece na bicamada lipídica como uma "-hélice que atravessa a membrana A sequência-sinal RE da cadeia polipeptídica crescente parece disparar a abertura do poro na proteína translocadora Sec61: depois que a sequência-sinal é liberada da SRP e a cadeia crescente tenha alcançado um tamanho suficiente, a sequência-sinal liga-se a um sítio específico dentro do poro, abrindo dessa maneira o poro. Uma sequência- -sinal do RE é portanto reconhecida duas vezes: primeiro por uma SRP no citosol e Figura 12-40 Um ribossomo (verde) ligado a um translocador proteico do RE (azul). (A) Reconstrução da vista lateral do complexo a partir de imagens de microscopia eletrônica. (B) Uma visão do translocador observada do lúmen do RE. O translocador contém Sec61, proteínas acessórias e o detergente usado na preparação. Domínios de proteínas acessórias se estendem através da membrana e formam uma saliência. (C) Uma representação esquemática de um ribossomo aderido à membrana, ligado ao translo- cador, indicando a localização do túnel na subunidade ribossômica maior, pelo qual a cadeia polipeptídica crescente sai do ribossomo. O mRNA (não mostrado) poderia estar localizado entre as subunidades pequena e grande do ribossomo. (Adaptada de J.F. Mé- nétret et al., J. Mol. Biol. 348:445–457, 2005. Com permissão de Academic Press.) Subunidade ribossômica menor Subunidade ribossômica maior Proteína translocadora na membrana do RE (A) (C) Canal condutor de proteína na subunidade ribossômica maior (B) LÚMEN DO RE LÚMEN DO RE 678 PARTE IV Organização interna da célula então por um sítio de ligação no poro da proteína translocadora, onde serve como um sinal de início de transferência (ou peptídeo de início de transferência) que abre o poro (p. ex., ver na Figura 12-35 como funciona para uma proteína solúvel). O reconhe- cimento duplo pode auxiliar assegurando que apenas proteínas apropriadas entrem no lúmen do RE. Enquanto ligada no poro de translocação, a sequência-sinal está em contato não apenas com o complexo Sec61, que forma as paredes do poro, mas também ao longo da linha de junção lateral com o centro hidrofóbico da bicamada lipídica. Isso foi mos- trado em experimentos de ligação química, nos quais a sequência-sinal e cadeias de hidrocarbonetos de lipídeos foram covalentemente unidas. Quando a cadeia polipep- tídica nascente tiver crescido o suficiente, a peptidase-sinal do RE cliva a sequência- -sinal e a libera do poro na membrana, onde é rapidamente degradada a aminoácidos por outras proteases na membrana do RE. Para liberar a sequência-sinal na membra- na, o translocador abre lateralmente ao longo da junção (ver Figuras 12-35 e 12-39). O translocador pode então tomar duas direções: abrir-se para formar um poro através da membrana a fim de deixar porções hidrofílicas de proteínas na bicamada lipídi- ca, e abrir-se lateralmente dentro da membrana para deixar porções hidrofóbicas de proteínas na bicamada lipídica. A saída lateral do poro é um passo essencial durante a integração de proteínas transmembrana. A integração de proteínas de membrana exige que algumas partes da cadeia poli- peptídica sejam transportadas através da bicamada lipídica, enquanto outras não. Ape- sar dessa complexidade adicional, todos os modos de inserção de proteínas de membra- na podem ser considerados como simples variantes da sequência de eventos descrita antes para transferir uma proteína solúvel no lúmen do RE. Começaremos descrevendo as três maneiras pelas quais as proteínas transmembrana de passagem única (ver Fi- gura 10-17) são inseridas na membrana do RE. CITOSOL LÚMEN DO RE CITOSOL ESPAÇO EXTRACELULAR CITOSOL LÚMEN DO RE TRANSLOCAÇÃO COTRADUCIONAL TRANSLOCAÇÃO PÓS-TRADUCIONAL ATPase SecA Complexo SecY Complexo Sec62, 63, 71, 72 BiP SRP Receptor de SRP BACTÉRIAS ARQUEIAS EUCARIOTOS EUCARIOTOS BACTÉRIAS (A) (B) (C) Complexo Sec61 ATP ADP ATP ADP Sequência-sinal do RE Pi+ Pi+ Membrana (plasmática) interna bacteriana mRNA Figura 12-41 Três maneiras pelas quais a translocação de proteínas pode ser dirigida através de translocadores estruturalmente semelhantes. (A) Translocação cotraducional. O ribossomo é conduzido à membrana pela SRP e pelo receptor SRP e então estabelece uma forte associação com a proteína translocadora Sec61. A cadeia polipeptídica crescente é conduzida através da membrana assim que é sintetizada. Não é necessário energia adicional, uma vez que o único caminho disponível para a cadeia crescente é cruzar a membrana. (B) A translocação pós-tradu- cional em células eucarióticas necessita de um complexo adicional, composto das proteínas Sec62, Sec63, Sec71 e Sec72, que são ligadas ao trans- locador Sec61 e depositam moléculas BiP na cadeia translocada assim que ela surge do translocador no lúmen do RE. Os ciclos de ligação de BiP e de liberação movidos por ATP puxam a proteína para o lúmen, um mecanismo que se assemelha ao modelo de catraca térmica para importação mitocondrial na Figura 12-23. (C) Translocação pós-traducional em bactérias. A cadeia polipeptídica completa é dirigida do lado citosólico para o homólogo bacteriano do complexo Sec61 (chamado complexo SecY na bactéria) na membrana plasmática pela ATPase SecA. As mudanças confor- macionais possibilitadas pela hidrólise de ATP são responsáveis pelo movimento tipo pistão na SecA, cada ciclo impelindo cerca de 20 aminoácidos da cadeia proteica pelo poro do translocador. A via Sec usada para transporte de proteínas através da membrana tilacoide em cloroplastos utiliza um mecanismo semelhante (ver Figura 12-26B). Enquanto o translocador Sec61, SRP e receptor de SRP são encontrados em todos os organismos, SecA é encontrado exclusivamente em bactérias, e o complexo Sec62, 63, 71 e 72 é encontrado exclusivamente em células eucarióticas. (Adaptada de P. Walter e A.E. Johnson, Annu. Rev. Cell Biol. 10:87–119, 1994. Com permissão de Annual Reviews.) CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 679 No caso mais simples, uma sequência-sinal N-terminal inicia a translocação, como para uma proteína solúvel, mas um segmento hidrofóbico adicional na cadeia polipeptí- dica interrompe o processo de transferência antes que a cadeia inteira seja transportada. Esse sinal de parada da transferência ancora a proteína na membrana depois que a sequência-sinal do RE (o sinal de início da transferência) tenha sido clivada e liberada do translocador (Figura 12-42). A sequência de parada da transferência é transferida para a bicamada pelo mecanismo de controle lateral, onde permanece como um único segmento "-hélice atravessando a membrana, com a região N-terminal da proteína no lado do lúmen da membrana e a região C-terminal no lado citosólico. Nos outros dois casos, a sequência-sinal é interna, em vez de ser na extremidade N-terminal da proteína. Como uma sequência-sinal N-terminal do RE, a SRP liga-se a uma sequência-sinal interna mediante reconhecimento hidrofóbico de características da "-hélice. A SRP leva o ribossomo que está sintetizando a proteína para a membrana do RE, e a sequência-sinal do RE serve então como um sinal de início da transferência que inicia a translocação da proteína. Após aliberação do translocador, a sequência in- terna de início da transferência permanece na bicamada lipídica como uma "-hélice que atravessa a membrana uma única vez. As sequências internas de início da transferência podem ligar-se ao aparato de transporte em uma de duas orientações; por sua vez, essa orientação da sequência de início de transferência determina qual segmento da proteína (aquele que precede ou o que segue a sequência de início da transferência) é movido através da membrana para o lúmen do RE. Em um caso, a proteína de membrana resultante tem sua região C-termi- nal no lado do lúmen (via A na Figura 12-43), enquanto, no outro, a região N-terminal está situada no lado do lúmen (via B na Figura 12-43). A orientação da sequência de início da transferência depende da distribuição dos aminoácidos carregados adjacentes, como descrito na legenda da figura. As combinações de sinais de início e de parada da transferência determinam a topologia das proteínas transmembrana de passagem múltipla Nas proteínas transmembrana de passagem múltipla, a cadeia polipeptídica passa para frente e para trás repetidamente ao longo da bicamada lipídica como uma "-hé- lice hidrofóbica (ver Figura 10-17). Acredita-se que uma sequência-sinal interna sirva como um sinal de início de transferência nessas proteínas para iniciar a translocação, Figura 12-42 Como uma proteína transmembrana de passagem única, com a sequência-sinal do RE clivada, é integrada na membrana do RE. Nessa proteína, o processo de translocação co- traducional é iniciado pela sequência-sinal N-terminal do RE (vermelho) que funciona como um sinal de início de transferência, abrindo o translocador como na Figura 12-35. Além dessa sequência de início de transferência, contudo, a proteína tam- bém contém uma sequência de parada de transferência (laranja); quando essa sequência entra no translocador e interage com o sítio de ligação dentro do poro, o translocador abre na fenda e descarrega a proteína lateralmente na bicamada lipídica, onde a sequência de parada de transferência permanece para ancorar a proteína na membrana. (Nesta figura e nas duas figuras que seguem, os ribossomos foram omitidos para maior clareza.) NH2 LÚMEN DO RE COOH Proteína transmembrana de passagem única madura na membrana do RE NH2 Sequência de parada de transferência Peptidase- -sinal Sequência de início de transferência CITOSOL 680 PARTE IV Organização interna da célula que continua até o translocador encontrar uma sequência de parada da transferência; em proteínas transmembrana de duas passagens, por exemplo, o polipeptídeo pode, em seguida, ser liberado na bicamada (Figura 12-44). Em proteínas de passagem múltipla mais complexas, nas quais muitas "-hélices hidrofóbicas atravessam a bicamada, uma segunda sequência de início da transferência reinicia a translocação mais adiante na ca- deia polipeptídica, até a próxima sequência de parada do transporte induzir a liberação do polipeptídeo, e assim por diante, para posteriores sequências de início e de parada da transferência (Figura 12-45 e Animação 12.5). Sequências-sinal hidrofóbicas de início e de parada de transferência agem para corrigir a topologia da proteína na membrana, trancando-as como "-hélices que atra- vessam membrana; e elas podem fazê-lo em qualquer orientação. Sabe-se que uma dada sequência-sinal hidrofóbica atuará como uma sequência de início ou de parada da transferência, dependendo da sua localização na cadeia polipeptídica, uma vez que sua função pode ser trocada pela mudança da sua localização na proteína, utilizando técnicas de DNA recombinante. Assim, a distinção entre sequências de início e de pa- rada da transferência resulta, principalmente, da sua ordem relativa na cadeia polipep- tídica crescente. Parece que a SRP inicia procurando por segmentos hidrofóbicos na região N-terminal de uma cadeia polipeptídica desenovelada e prossegue em direção à região C-terminal, na direção em que a proteína é sintetizada. Reconhecendo o primei- ro segmento hidrofóbico apropriado para emergir do ribossomo, a SRP ajusta a “matriz de leitura”: se a translocação é iniciada, o próximo segmento hidrofóbico apropriado é reconhecido como uma sequência de parada da transferência, induzindo a região inter- mediária da cadeia polipeptídica a passar pela membrana. Um processo de varredura Figura 12-43 Integração de uma proteína de membrana de passagem única com uma sequência-sinal interna na membrana do RE. Uma sequência- -sinal do RE interna que atua como um sinal de início da transferência pode ligar- -se ao translocador em uma das duas vias, levando a uma proteína de membrana que possui tanto seu C-terminal (via A) quanto seu N-terminal (via B) no lúmen do RE. Proteínas são direcionadas às duas vias pelas características na cadeia polipeptí- dica que flanqueia a sequência interna de início da transferência: se existirem mais aminoácidos carregados positivamente logo antes do núcleo hidrofóbico da sequência de início da transferência do que após essa região, a proteína de mem- brana será inserida no translocador na orientação mostrada na via A; enquanto, se existirem mais aminoácidos carregados positivamente imediatamente após o nú- cleo hidrofóbico da sequência de início da transferência do que antes dessa região, a proteína de membrana será inserida no translocador na orientação mostrada na via B. Devido ao fato de o transporte não poder iniciar antes que uma sequência de início da transferência apareça na superfí- cie do ribossomo, o transporte da porção N-terminal da proteína mostrada em (B) somente poderá ocorrer após ela ter sido completamente sintetizada. Note que existem duas formas para inserir uma proteína transmembrana de passagem única cuja região N-terminal esteja localizada no lúmen do RE: aquela mostrada na Figura 12-42 e esta mostrada aqui em (B). Proteína transmembrana madura de passagem única na membrana do RE NH2 CITOSOL LÚMEN DO RE COOH NH2 NH2 NH2 + (A) Proteína transmembrana madura de passagem única na membrana do RE CITOSOL LÚMEN DO RE COOH NH2 NH2 NH2 + (B) CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 681 similar continua até que todas as regiões hidrofóbicas na proteína tenham sido inseridas na membrana como "-hélices transmembrana. Uma vez que as proteínas de membrana sempre estão inseridas no lado citosólico do RE dessa maneira programada, todas as cópias da mesma cadeia polipeptídica terão a mesma orientação na bicamada lipídica. Esse mecanismo gera uma assimetria na mem- brana do RE, na qual os domínios proteicos expostos em um dos lados são diferentes dos domínios expostos do outro. Essa assimetria é mantida durante os muitos eventos de brotamento e de fusão que transportam as proteínas sintetizadas no RE a outras mem- branas celulares (discutido no Capítulo 13). Assim, a maneira que uma proteína recém- -sintetizada é inserida na membrana do RE determina a orientação da proteína em todas as outras membranas. Quando as proteínas são extraídas de uma membrana com detergente e, então, reconstituídas em vesículas lipídicas artificiais, costuma ocorrer uma mistura aleatória de proteínas com orientações com o lado correto para fora e com o lado interno para fora. Assim, a assimetria proteica observada em membranas celulares parece não ser uma propriedade inerente às proteínas, mas resulta somente do processo pelo qual as proteínas passam do citosol à membrana do RE. Figura 12-44 Integração de uma proteína de membrana de dupla pas- sagem com uma sequência-sinal inter- na na membrana do RE. Nessa proteína, uma sequência-sinal interna do RE atua como um sinal de início da transferência (como na Figura 12-43) e inicia a transfe- rência da porção C-terminal da proteína. No mesmo ponto, após uma sequência de parada da transferência ter penetrado o translocador, este libera a sequência late- ralmente na membrana. NH2 COOHProteína transmembrana madura de dupla passagem na membrana do RE NH2Sequência de parada de transferência LÚMEN DO RE CITOSOL Sítio de ligação ao peptídeo hidrofóbico de início de transferência Sítio de ligação ao peptídeo hidrofóbico de parada de transferência Proteína translocadora NH2 NH2 Sequência de início de transferência Figura 12-45 Inserção da proteína de membrana de passagem múltipla ro- dopsina na membrana do RE. As rodopsinas são proteínas sensíveis à luz nos bastonetes fotorreceptores na retina dos mamíferos (discutido no Capítulo 15). (A) Um gráfico de hidropatia (ver Figura 10-20) identifica sete pequenas regiões hidrofóbicas na rodopsina. (B) A região hidrofóbica mais próxima da região N- -terminal serve como uma sequência de início da transferência que induz a porção anterior à região N-terminal da proteína a passar através da membrana do RE. As sequências hidrofóbicas subsequentes fun- cionam alternadamente como sequências de início e de parada da transferência. As setas verdes indicam as porções da proteína que são inseridas no translocador. (C) A rodopsina integrada final tem sua região N-terminal localizada no lúmen do RE e sua região C-terminal localizada no citosol. Os hexágonos azuis representam oligossacarídeos ligados covalentemente. 1 2 3 4 5 7 Número de aminoácidos 0 100 200 (A) (C) (B) NH2 COOH CITOSOL H2N + Início Início Parada Início Parada Início Parada COOH H id ro fí lic o H id ro fó bi co 6 LÚMEN 682 PARTE IV Organização interna da célula Proteínas ancoradas pela cauda são integradas na membrana do RE por um mecanismo especial Muitas proteínas de membrana importantes são ancoradas na membrana por uma "-hélice hidrofóbica transmembrana C-terminal. Essas proteínas ancoradas pela cauda no RE incluem um grande número de subunidades proteicas SNARE que dirigem o trá- fego vesicular (discutido no Capítulo 13). Quando tais proteínas ancoradas pela cauda se inserem na membrana do RE a partir do citosol, apenas poucos aminoácidos que seguem a "-hélice transmembrana na extremidade C-terminal são translocados para o lúmen do RE, enquanto a maior parte da proteína permanece no citosol. Devido à posição única da "-hélice transmembrana na sequência proteica, a tradução termina enquanto os aminoá- cidos da porção C-terminal que irão formar a "-hélice transmembrana ainda não emergi- ram do túnel de saída do ribossomo. O reconhecimento de SRP não é, portanto, possível. Por muito tempo acreditou-se que essas proteínas fossem liberadas do ribossomo e que a porção C-terminal hidrofóbica fosse espontaneamente incorporada na membrana do RE. Tal mecanismo não poderia explicar, entretanto, por que as proteínas da cauda, ancoradas no RE, se inserem na membrana do RE seletivamente e não em todas as outras membranas da célula. Está claro agora que uma maquinaria de direcionamento especializada está en- volvida e que é abastecida pela hidrólise de ATP (Figura 12-46). Embora os componentes e detalhes difiram, esse mecanismo de direcionamento pós-traducional é conceitualmen- te semelhante ao do direcionamento de proteínas dependente de SRP (ver Figura 12-37). Nem todas as proteínas ancoradas com cauda são inseridas no RE. Algumas pro- teínas contêm uma âncora de membrana C-terminal que possui uma informação adi- cional de endereçamento que direciona a proteína para mitocôndrias ou peroxissomos. Ainda não se sabe como essas proteínas são endereçadas. As cadeias polipeptídicas transportadas enovelam-se e são montadas no lúmen do RE rugoso Muitas das proteínas no lúmen do RE estão em trânsito, en route a outros destinos; ou- tras, contudo, residem lá normalmente e estão presentes em altas concentrações. Essas proteínas residentes no RE contêm um sinal de retenção no RE de quatro aminoácidos na sua região C-terminal que são responsáveis pela retenção da proteína no RE (ver Ta- bela 12-3, p. 648; discutido no Capítulo 13). Algumas dessas proteínas atuam cataliti- camente para auxiliar as muitas proteínas que são transportadas para o lúmen do RE a enovelar-se e montar-se corretamente. Uma importante proteína residente no RE é a proteína dissulfeto isomerase (PDI), que catalisa a oxidação de grupos sulfidrila (SH) livres nas cisteínas para formar ligações dissulfeto (S-S). Quase todas as cisteínas nos domínios proteicos expostos no espaço ex- tracelular ou no lúmen das organelas em vias secretoras e endocíticas são ligadas por liga- ções dissulfeto. Ao contrário, as ligações dissulfeto são raramente formadas em domínios expostos ao citosol, em função da existência de um ambiente redutor no local. Figura 12-46 Mecanismo de inserção de proteínas ancoradas pela cauda. Nessa via pós-traducional para a in- serção de proteínas do RE ancoradas pela cauda, um complexo solúvel de pré-endereçamento captura a "-hélice C-terminal hidrofóbica depois que ela emerge do túnel de saída ribossômico e a carrega na ATPase Get3. O complexo resultante é direcionado para a membrana do RE pela interação do receptor de Get1- -Get2, que funciona como uma maquina- ria de inserção de proteínas na membrana. Depois que Get3 hidrolisa o ATP ligado, a proteína ancorada pela cauda é liberada do receptor e inserida na membrana do RE. A liberação de ADP e renovação do ATP liga- do recicla Get3 de volta para o citosol. RECONHECIMENTO ENDEREÇAMENTO RECICLAGEM LIBERAÇÃO ATP ATP ATP ADP Complexo pré-endereçamento N N N N C Proteína ancorada pela cauda ATPase Get3 Get1-Get2 LÚMEN DO RE CITOSOL ATP Pi+ CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 683 Outra proteína residente no RE é a proteína chaperona BiP. Já discutimos como a BiP atua para puxar proteínas de modo pós-traducional para o RE por meio do transloca- dor do RE Sec61. Como outras chaperonas (discutidas no Capítulo 13), a BiP reconhece proteínas enoveladas incorretamente, bem como subunidades proteicas que ainda não se agregaram aos seus complexos oligoméricos finais. Para isso, ela liga-se à sequência de aminoácidos exposta, que estaria, de modo normal, oculta no interior das cadeias polipeptídicas corretamente enoveladas ou agregadas. Um exemplo de sítio de ligação a BiP é uma faixa de aminoácidos hidrofílicos e hidrofóbicos alternados que normalmen- te estariam embaixo de uma folha # com seu lado hidrofóbico orientado na direção do centro hidrofóbico da proteína enovelada. A BiP ligada impede a agregação da proteína e auxilia na manutenção da proteína no RE (e, assim, fora do aparelho de Golgi e das eta- pas posteriores da via secretora). Como alguns outros membros da família de proteínas chaperonas hsp70, que se ligam a proteínas não dobradas e facilitam sua importação para mitocôndrias e cloroplastos, a BiP hidrolisa ATP para alternar entre estados de alta e baixa afinidade de ligação, que lhe permitem segurar e soltar suas proteínas de substrato em um ciclo dinâmico. A maioria das proteínas sintetizadas no RE rugoso é glicosilada pela adição de um oligossacarídeo comum ligado ao N A adição covalente de oligossacarídeos às proteínas é uma das principais funções bios- sintéticas do RE. Cerca de metade das proteínas solúveis e ligadas à membrana que são processadas no RE – incluindo aquelas destinadas ao transporte para o aparelho de Gol- gi, lisossomos, membrana plasmática ou espaço extracelular – são glicoproteínas que sofrem modificações nesse caminho. Muitas proteínas no citosol e núcleo são também glicosiladas, mas não com oligossacarídeos; elas carregam uma modificação com açúcar muito mais simples, na qual um único grupo N-acetilglicosamina é adicionado a uma serina ou treonina da proteína. Durante a forma mais comum de glicosilação da proteína no RE, um oligossa- carídeo precursor pré-formado (composto de N-acetilglicosamina, manose e glico- se e contendo um total de 14 açúcares) é transferido em bloco para proteínas. Esse oligossacarídeo é transferido ao grupo NH2da cadeia lateral de um aminoácido aspa- ragina na proteína, sendo, por isso, considerado ligado ao N ou ligado à asparagina (Figura 12-47A). A transferência é catalisada por uma enzima ligada à membrana, uma oligossacaril transferase, que tem seu sítio ativo exposto no lado do lúmen da Proteína com sítio para N-glicosilação Oligossacarídeo ligado a lipídeo ancorado na membrana do RE Asn P P Oligossacaril transferase LÚMEN DO RE CITOSOL (B)(A) N-acetilglicosamina Manose Glicose Ser Thr[ ] Cadeia lateral da asparagina C CN [X] H O H CH2 C O NH NH2 COOH Figura 12-47 Glicosilação de proteínas ligadas ao N no RE rugoso. (A) Quase tão logo a cadeia polipeptídica penetre o lúmen do RE, ela é glicosilada em resíduos de asparagina-alvo. O oligossacarídeo precursor (mostrado em cor) está ligado apenas a asparaginas nas sequências Asn-X-Ser e Asn-X-Thr (onde X é qual- quer aminoácido exceto prolina). Essas sequências ocorrem em uma frequência muito menor em glicoproteínas do que em proteínas citosólicas não glicosiladas. Evidentemente essas sequências foram selecionadas durante a evolução de proteínas, presumivelmente porque a glicosilação em muitos sítios poderia in- terferir com o dobramento das proteínas. Os cinco açúcares na caixa cinza formam a “região central” desse oligossacarídeo. Para muitas glicoproteínas, somente os açúcares centrais sobrevivem ao extenso processo de acabamento com oligossacarídeos que ocorre no aparelho de Golgi. (B) O oligossacarídeo precursor é transferido de um lipídeo dolicol para uma aspargina como uma unidade intacta em uma reação catalisada por uma enzima transmembrana oligossacaril transferase. Uma cópia dessa enzima encontra-se associada a cada proteína translocadora na membrana do RE. (O translocador não é mostrado.) A oligossacaril transferase contém 13 "-hélices transmembrana e um enorme domínio luminal do RE que contém seus sítios de ligação ao substrato. A asparagina liga-se ao túnel que penetra o interior da enzima. Ali, o grupo amino da asparagina é torcido para fora do plano que estabiliza as ligações amida pobre- mente reativas, ativando-o para a reação com o oligossacarídeo dolicol. A estrutura mostrada é de um homólogo procarioto que se assemelha à subunidade catalítica da oligossacaril transferase de eucariotos. (Código PDB: 3RCE.) 684 PARTE IV Organização interna da célula membrana do RE; esse fato explica por que as proteínas citosólicas não são glico- siladas dessa forma. Uma molécula lipídica especial denominada dolicol abriga o oligossacarídeo precursor na membrana do RE. O oligossacarídeo precursor é trans- ferido para a asparagina-alvo em um único passo enzimático imediatamente de- pois de o aminoácido ter alcançado o lúmen durante a translocação da proteína. O oligossacarídeo precursor é ligado ao lipídeo dolicol por uma ligação pirofosfato de alta energia, que providencia a energia de ativação para conduzir a reação de glico- silação (Figura 12-47B). Uma cópia da oligossacaril transferase é associada a cada proteína translocadora, permitindo a ela procurar e glicosilar as cadeias polipeptídi- cas que entram de maneira eficiente. O oligossacarídeo precursor é construído açúcar por açúcar no lipídeo dolicol li- gado à membrana e então transferido para uma proteína. Os açúcares são primeiro ati- vados no citosol pela formação de um intermediário açúcar-nucleotídeo (UDP ou GDP), que, então, doa seu açúcar (direta ou indiretamente) ao lipídeo em uma sequência or- denada. Ao longo desse processo, o oligossacarídeo ligado ao lipídeo é movido do lado citosólico para o lado do lúmen da membrana do RE (Figura 12-48 ). Toda a diversidade de estruturas de oligossacarídeos ligados ao N em glicopro- teínas maduras resulta da modificação tardia do oligossacarídeo precursor original. Enquanto ainda no RE, três glicoses (ver Figura 12-47) e uma manose são rapidamente removidas dos oligossacarídeos da maioria das glicoproteínas. Retornaremos à impor- tância da retirada rápida de glicoses. Essa “poda” ou “processamento” do oligossacarídeo continua no aparelho de Golgi, como discutido no Capítulo 13. Os oligossacarídeos ligados ao N são de longe os mais comuns encontrados em 90% das glicoproteínas. Com menos frequência, os oligossacarídeos são ligados ao grupo hidroxila na cadeia lateral dos aminoácidos serina, treonina ou hidroxilisina. Um primei- ro açúcar desses oligossacarídeos O-ligados é adicionado no RE e o oligossacarídeo é, então, mais estendido no aparelho de Golgi (ver Figura 13-32). Figura 12-48 Síntese do oligossa- carídeo precursor ligado a lipídeo na membrana do RE rugoso. O oligossa- carídeo é montado açúcar por açúcar no carregador lipídico dolicol (um poli-isopre- noide; ver Painel 2-5, p. 98-99). O dolicol é longo e muito hidrofóbico: suas 22 uni- dades de cinco carbonos podem atravessar mais de três vezes a espessura de uma bicamada lipídica. Assim, o oligossacarídeo aderido é firmemente ancorado na mem- brana. O primeiro açúcar é ligado ao doli- col por uma ponte pirofosfato. Essa ponte de alta energia ativa o oligossacarídeo para sua eventual transferência do lipídeo para uma cadeia lateral da asparagina de um polipeptídeo crescente no lado do lúmen do RE rugoso. Como indicado, a síntese do oligossacarídeo inicia-se no lado citosólico da membrana do RE e continua na face do lúmen após o lipídeo intermediário (Man)5(GlcNAc)2 ser inverti- do através da bicamada por uma proteína translocadora (que não é mostrada). Todas as reações subsequentes de transferência de glicosil no lado do lúmen do RE envol- vem transferência de dolicol-P-glicose e dolicol-P-manose; esses monossacarídeos ativados ligados a lipídeo são sintetizados a partir de dolicol fosfato e de UDP-glicose ou de GDP-manose (quando apropriado) no lado citosólico do RE e, então, são invertidos através da membrana do RE. GlcNAc, N-acetilglicosamina; Man, mano- se; Glc, glicose. LÚMEN DO RE CITOSOL 2 GlcNAc (GlcNAc)2 (GlcNAc)2(Man)5 Man + 5 5 “GIRANDO” NA MEMBRANA Glc (Man)9(GlcNAc)2 Man (Man)5(GlcNAc)2 4 X 3 X (Glc)3(Man)9(GlcNAc)2 Doador de manose produzido a partir de dolicol fosfato e GDP-manose Doador de glicose produzido a partir de dolicol fosfato e UDP-glicose Bicamada lipídica da membrana do RE Dolicol Dolicol Dolicol Dolicol Dolicol Dolicol Dolicol Dolicol Dolicol Dolicol Dolicol CTP CDP GDP GDP UDP UDP UMP P P P P P P P P P P PP P P P P P CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 685 Os oligossacarídeos são utilizados como “rótulos” para marcar o estado de enovelamento da proteína Tem sido longamente debatido por que a glicosilação é uma modificação comum das proteínas que entram no RE. Uma observação particularmente intrigante reside no fato de que algumas proteínas necessitam de glicosilação ligada ao N para o enovelamento adequado no RE, ainda que a localização precisa dos oligossacarídeos aderidos na su- perfície da proteína não pareça ser importante. Um indício para o papel da glicosilação no enovelamento da proteína deriva de estudos de duas proteínas chaperonas do RE denominadas calnexina e calreticulina, pois necessitam de Ca2+ para suas atividades. Essas chaperonas são proteínas de ligação de carboidratos, ou lectinas, que se ligam a oligossacarídeos nas proteínas que não estão completamente enoveladas e as retêm no RE. Como outras chaperonas, elas impedem que as proteínas enoveladas incompleta- mente sofram agregação irreversível. Tanto a calnexina quanto a calreticulina também promovem a associação de proteínas incompletamente enoveladas com outra chapero- na do RE, que se liga a cisteínas que ainda não formaram ligações dissulfeto. Calnexina e calreticulina reconhecem oligossacarídeos ligados ao N que contêm uma única glicose terminal e, portanto, elas se ligam a proteínas apenas depois que duas das três glicoses do oligossacarídeo precursor tenham sidoremovidas durante o corte de glicose por glicosidases do RE. Quando a terceira glicose é removida, a glicoproteína dissocia-se da sua chaperona e pode deixar o RE. Como, então, a calnexina e a calreticulina distinguem proteínas enoveladas das incompletamente enoveladas? A resposta está, ainda, em outra enzima do RE, a glicosil transferase, que continua adicionando uma glicose àqueles oligossacarídeos que per- deram sua última glicose. Ela adiciona a glicose, entretanto, somente a oligossacarídeos que estão associados a proteínas desenoveladas. Assim, uma proteína desenovelada sofre ciclos contínuos de retirada de glicose (por glicosidase) e de adição (pela glicosil transferase) e mantém uma afinidade por calnexina e calreticulina, até alcançar seu es- tado de completo enovelamento (Figura 12-49). As proteínas enoveladas inadequadamente são exportadas do RE e degradadas no citosol Apesar de todo o auxílio das chaperonas, muitas moléculas proteicas (mais de 80% em algumas proteínas) transportadas para o RE falham na tentativa de alcançar seu enove- lamento adequado ou seu estado oligomérico. Tais proteínas são exportadas de volta do RE para o citosol, onde são degradadas em proteassomos (discutido no Capítulo 6). Em muitas vias, o mecanismo de retrotranslocação é similar a outros modos de translocação Figura 12-49 Papel da glicosilação ligada ao N no enovelamento da proteína do RE. A proteína chaperona ligada à membrana do RE, calnexina, liga-se a proteínas incompletamente enoveladas contendo uma glicose ter- minal nos oligossacarídeos ligados ao N, mantendo a proteína no RE. A remoção da glicose terminal por uma glicosidase libera a proteína da calnexina. Uma glicosil transferase é a enzima fundamental que determina se a proteína está enovelada de forma adequada ou não: se a proteína ainda está incompletamente enovelada, a enzima transfere uma nova glicose da UDP-glicose para o oligossacarídeo ligado ao N, renovando a afinidade da proteína pela calnexina e retendo-a no RE. O ciclo se repete até a proteína ter se enovelado completamente. A calreticulina atua de modo semelhante, exceto pelo fato de que é uma proteína solúvel residente no RE. Outra chaperona do RE, a ERp57 (não mostrada), colabora com a calnexina e a calreticulina na retenção de proteínas eno- veladas incompletamente no RE. A ERp57 reconhece grupos sulfidrila livres, que são um sinal de formação de pontes dissulfeto incompletas. INCOMPLETAMENTE ENOVELADAS NORMALMENTE ENOVELADAS NÃO ENOVELADAS UDP- -glicose UDP Glicosil transferase SAÍDA DO RE Oligossacarídeo ligado ao N Oligossacarídeo precursor Calnexina LÚMEN DO RE CITOSOLMembrana do RE Glicosidase Glicose RECORTE DE GLICOSES 686 PARTE IV Organização interna da célula pós-traducional. Por exemplo, assim como a translocação para mitocôndrias ou cloro- plastos, proteínas chaperonas são necessárias para manter a cadeia polipeptídica em um estado desenovelado antes e durante a translocação. De maneira semelhante, a fonte de energia é necessária para dar direcionalidade ao transporte e para puxar a proteína para o citosol. Enfim, um translocador é necessário. A seleção de proteínas do RE para degradação é um processo desafiador: proteínas mal enoveladas ou subunidades proteicas não montadas devem ser degradadas, mas intermediários de dobramento de proteínas recém-formadas não. Os oligossacarídeos ligados ao N ajudam a fazer essa distinção, o que serve como cronômetro da medida de quanto tempo uma proteína deve permanecer no RE. O recorte de uma manose lenta, em particular no núcleo do oligossacarídeo, por uma enzima (uma manosidase) no RE cria uma nova estrutura de oligossacarídeos que as lectinas do RE luminal do aparelho de retrotranslocação reconhecem. As proteínas que se dobram e saem do RE mais rá- pido do que a manosidase podem remover sua manose-alvo, escapando, portanto, da degradação. Além das lectinas no RE que reconhecem os oligossacarídeos, chaperonas e pro- teínas dissulfeto isomerase (enzimas mencionadas antes, que catalisam a formação e a quebra de ligações S-S) se associam a proteínas que devem ser degradadas. As cha- peronas impedem a agregação de proteínas mal enoveladas, e as dissulfeto isomerases quebram ligações dissulfeto que podem ter sido formadas incorretamente, e assim uma cadeia polipeptídica linear pode ser translocada de volta para o citosol. Múltiplos complexos translocadores movimentam diferentes proteínas da mem- brana ou lúmen do RE para o citosol. Uma característica comum é que eles contêm uma enzima E3 ubiquitina-ligase, que anexa etiquetas de poliubiquitina nas proteínas dese- noveladas assim que elas emergem para o citosol, marcando-as para destruição. Alimen- tada pela energia derivada da hidrólise de ATP, uma ATPase hexamérica da família de AAA-ATPases (ver Figura 6-85) puxa a proteína mal enovelada através do translocador para o citosol. Uma N-glicanase remove as cadeias de oligossacarídeos em bloco. Guiado pela sua etiqueta de ubiquitina, o polipeptídeo deglicosilado é rapidamente direcionado aos proteassomos, onde é degradado (Figura 12-50). As proteínas mal enoveladas no RE ativam uma resposta à proteína desenovelada As células monitoram cuidadosamente a quantidade de proteínas mal enoveladas con- tidas em vários compartimentos. Um acúmulo dessas proteínas no citosol, por exemplo, desencadeia uma resposta ao choque térmico (heat-shock response, discutido no Capítulo 6), que estimula a transcrição de genes que codificam chaperonas citosólicas que auxi- liam no reenovelamento das proteínas. De maneira similar, um acúmulo de proteínas mal enoveladas no RE dispara uma resposta à proteína desenovelada, o que inclui um aumento na transcrição de genes que codificam proteínas envolvidas na retrotransloca- ção e degradação de proteínas no citosol, chaperonas do RE e muitas outras proteínas que ajudam a aumentar a capacidade de dobramento de proteínas no RE. Figura 12-50 Exportação e degrada- ção de proteínas do RE mal enovela- das. Proteínas solúveis mal enoveladas no lúmen do RE são reconhecidas e marcadas para um complexo translocador na mem- brana do RE. Elas primeiro interagem com chaperonas no lúmen do RE, dissulfeto iso- merases e lectinas. Elas são então exporta- das para o citosol através do translocador. No citosol elas são ubiquitinadas, deglico- siladas e degradadas nos proteoassomos. Proteínas de membrana mal enoveladas seguem uma via similar, mas usam um translocador diferente. AAA-ATPase S S ATP ADP N-glicanase Ubiquitina E3 ubiquitina-ligase Cadeia poliubiquitina Lectina Proteína mal enovelada Chaperona Dissulfeto isomerase Complexo translocador de proteínas Proteassomo CITOSOL LÚMEN DO RE Pi+ CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 687 Como as proteínas mal enoveladas no RE sinalizam ao núcleo? Existem três vias paralelas que executam a resposta à proteína desenovelada (Figura 12-51A). A primeira via, inicialmente descoberta em células de levedura, é notável. Uma pro- teína-cinase transmembrana no RE, chamada de IRE1, é ativada por proteínas mal enoveladas, que induzem a sua oligomerização e autofosforilação. (Alguns recepto- res-cinase de superfície na membrana plasmática são ativados de forma semelhante, como discutido no Capítulo 15.) A oligomerização e autofosforilação de IRE1 ativa um domínio da endorribonuclease na porção citosólica da mesma molécula, que cliva uma molécula de mRNA citosólica específica em duas posições, excisando um LÚMEN DO RE Membrana do RE Três sensores de proteínas mal enoveladas CITOSOL O SPLICING REGULADO DE mRNA INICIA A TRADUÇÃO DA A FOSFORILAÇÃO INATIVA O FATOR DE INÍCIO DA TRADUÇÃO PROTEÍNA REGULADORA DA TRANSCRIÇÃO 1 ATIVAÇÃO DE GENES PARA AUMENTAR A CAPACIDADE DE ENOVELAMENTO DE PROTEÍNAS NO RE A PROTEÓLISE REGULADA NO APARELHO DE GOLGI LIBERA A PROTEÍNA REGULADORA DA TRANSCRIÇÃO 3 TRADUÇÃO SELETIVA DA PROTEÍNA REGULADORADA TRANSCRIÇÃO 2 REDUÇÃO DE PROTEÍNAS ENTRANDO NO RE (A) (B) IRE1 PERK ATF6 P P P P NÚCLEO CITOSOL 4 6 7 1 Chaperona do RE Poro nuclear Regulador da transcrição Proteínas mal enoveladas Proteínas mal enoveladas ligadas à chaperona1 AS PROTEÍNAS MAL ENOVELADAS NO RE SINALIZAM A NECESSIDADE DE MAIS CHAPERONAS NO RE. ELAS SE LIGAM E ATIVAM UMA CINASE TRANSMEMBRANA 2 A CINASE ATIVADA REVELA UMA ATIVIDADE ENDORRIBONUCLEASE 3 A ENDORRIBONUCLEASE CORTA MOLÉCULAS ESPECÍFICAS DE RNA EM DUAS POSIÇÕES, REMOVENDO UM ÍNTRON 6 O REGULADOR DA TRANSCRIÇÃO ENTRA NO NÚCLEO E ATIVA GENES CODIFICANDO CHAPERONAS DO RE 7 CHAPERONAS SÃO PRODUZIDAS NO RE, ONDE AJUDAM NO ENOVELAMENTO DE PROTEÍNAS 4 DOIS ÉXONS SÃO LIGADOS PARA FORMAR UM mRNA ATIVO 5 O mRNA É TRADUZIDO PARA PRODUZIR UM REGULADOR DA TRANSCRIÇÃO Proteína-cinase transmembrana (sensor) LÚMEN DO RE 3 Pré-mRNA Íntron mRNA chaperona Gene da chaperona 2 Domínio ribonuclease P P 5 mRNA Éxon Éxon Domínio ribonuclease Domínio cinase Domínio cinase Figura 12-51 A resposta à proteína desenovelada. (A) Por três vias de sinali- zação intracelular, o acúmulo de proteínas mal enoveladas no lúmen do RE sinaliza ao núcleo para ativar a transcrição de genes que codificam proteínas que auxiliam a cé- lula a conter as proteínas mal enoveladas no RE. (B) O splicing regulado de RNA é o controle-chave de regulação na via 1 de resposta à proteína desenovelada (Animação 12.6). 688 PARTE IV Organização interna da célula íntron. (Essa é a única exceção à regra de que os íntrons sofrem splicing enquanto o RNA ainda está no núcleo). Os éxons separados são então unidos por uma RNA-ligase, gerando um mRNA processado, que é traduzido nos ribossomos para produzir uma proteína reguladora de transcrição. A proteína migra ao núcleo e ativa a transcrição de genes codificadores de proteínas que ajudam a mediar a resposta à proteína deseno- velada (Figura 12-51B). Proteínas mal enoveladas também ativam uma segunda cinase transmembrana no RE, PERK, que inibe um fator de início da tradução pela sua fosforilação e redução da síntese de novas proteínas na célula. Uma consequência da redução da síntese de proteínas é a redução do fluxo de proteínas no RE, reduzindo então o carregamento de proteínas que precisam ser enoveladas lá. Algumas proteínas, entretanto, são pre- ferencialmente traduzidas quando os fatores de início da tradução são escassos (dis- cutido no Capítulo 7, p. 424), e uma dessas é um regulador de transcrição que auxilia a ativação da transcrição de genes que codificam proteínas ativas na resposta à proteína desenovelada. Por fim, o terceiro regulador transcricional, ATF6, é inicialmente sintetizado como uma proteína transmembrana do RE. Uma vez que está incorporada na membrana do RE, ela não pode ativar a transcrição de genes no núcleo. Quando proteínas mal enove- ladas acumulam-se no RE, contudo, a proteína ATF6 é transportada para o aparelho de Golgi, onde encontra proteases que clivam seus domínios citosólicos, que podem agora migrar para o núcleo e ajudar a ativar a transcrição de genes que codificam proteínas en- volvidas na resposta à proteína desenovelada. (Esse mecanismo é similar àquele descrito na Figura 12-16 para ativação do regulador da transcrição que controla a biossíntese do colesterol.) A importância relativa de cada uma dessas três vias na resposta à proteína desenovelada difere em tipos celulares distintos, permitindo que cada tipo celular possa adequar a resposta à proteína desenovelada. Algumas proteínas de membrana adquirem uma âncora de glicosilfosfatidilinositol (GPI) ligada covalentemente Como discutido no Capítulo 10, várias enzimas citosólicas catalisam a adição cova- lente de uma única cadeia de ácido graxo ou grupo prenila a proteínas selecionadas. Os lipídeos anexados ajudam a direcionar e ancorar essas proteínas à membrana ce- lular. Um processo relacionado é catalisado por enzimas do RE, que ligam covalente- mente uma âncora de glicosilfosfatidilinositol (GPI, glycosylphosphatidylinositol) à região C-terminal de algumas proteínas de membrana com destino à membrana plasmática. Essa ligação é formada no lúmen do RE, onde, ao mesmo tempo, o seg- mento transmembrana da proteína é clivado (Figura 12-52). Um grande número de proteínas da membrana plasmática é modificado dessa forma. Uma vez que são ade- ridas ao exterior da membrana plasmática somente pelas suas âncoras de GPI, elas podem, em princípio, ser liberadas das células na forma solúvel, em resposta a sinais que ativam uma fosfolipase específica na membrana plasmática. Os tripanossomos Figura 12-52 Adesão de uma âncora de GPI a uma proteína no RE. Proteínas ancoradas a GPI são direcionadas à mem- brana do RE por uma sequência-sinal N-terminal (não mostrado), que é removida (ver Figura 12-42). Imediatamente após o término da síntese da proteína, a proteína precursora permanece ancorada na mem- brana do RE por uma sequência hidrofóbi- ca C-terminal de 15 a 20 aminoácidos; o restante da proteína está no lúmen do RE. Em um intervalo de menos de 1 minuto, uma enzima no RE excisa a proteína da sua região C-terminal ligada à membrana e, simultaneamente, adere a sua nova região C-terminal a um grupo amino em uma GPI intermediária pré-sintetizada. A cadeia de açúcar contém um inositol aderido ao lipídeo do qual a âncora de GPI deriva seu nome. Ela é seguida por uma glicosamina e três manoses. A manose terminal liga-se a uma fosfoetanolamina que fornece o grupo amino para a ligação da proteína. O sinal que especifica essa modificação está contido na sequência hidrofóbica C-termi- nal e em uns poucos aminoácidos adjacen- tes a ela no lado do lúmen da membrana do RE; se esse sinal é adicionado a outras proteínas, elas também se modificam dessa forma. Devido ao fato de a âncora de lipídeo estar covalentemente ligada, a proteína permanece aderida à membrana, com todos os seus aminoácidos expostos inicialmente no lúmen do RE e, por fim, no exterior da membrana plasmática. H2N COOH Glicosilfosfatidilinositol COOH Peptídeo C-terminal clivado Proteína ligada à membrana pela âncora de GPI NH2 NH2 NH2 CITOSOL LÚMEN DO RE Inositol P P P P Etanolamina CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 689 parasitas, por exemplo, caso sejam atacados pelo sistema imune, utilizam esse meca- nismo para liberar seu revestimento de proteínas de superfície GPI-ancoradas. As ân- coras de GPI também são usadas para direcionar proteínas de membrana plasmática para balsas lipídicas e, assim, segregar as proteínas de outras proteínas de membrana (ver Figura 10-13). A maioria das bicamadas lipídicas é montada no RE A membrana do RE é o local de síntese de quase todas as principais classes de lipí- deos da célula, incluindo fosfolipídeos e colesterol necessários à produção de novas membranas celulares. O principal fosfolipídeo sintetizado é a fosfatidilcolina (também chamada de lecitina), que pode ser formada em três etapas a partir de colina, de dois ácidos graxos e de glicerol fosfato (Figura 12-53). Cada etapa é catalisada por enzimas na membrana do RE que têm seus sítios ativos voltados para o citosol, onde são en- contrados todos os metabólitos necessários. Assim, a síntese de fosfolipídeos ocorre exclusivamente no folheto citosólico da membrana do RE. Devido ao fato de os ácidos graxos não serem solúveis em água, eles são conduzidos dos seus sítios de síntese ao RE por proteínas de ligação a ácidos graxos no citosol. Depois de chegarem na mem- brana do RE e serem ativados com coenzima A (CoA), aciltransferases adicionam dois ácidos graxos sucessivamente ao glicerol fosfato para produzir ácido fosfatídico. O ácido fosfatídico é suficientemente insolúvel em água para permanecer na bicamada lipídica, e não pode ser extraído dela por proteínas de ligação a ácidos graxos. Esse é, então, o primeiro passo para que a bicamada lipídica seja aumentada. Asetapas pos- teriores determinam o grupo da cabeça de uma molécula de lipídeo recém-formada e, portanto, a natureza química da bicamada, mas não resultam em crescimento líquido da membrana. Os outros dois principais fosfolipídeos – fosfatidilserina e fosfatidileta- nolamina (ver Figura 10-3) –, assim como o menor fosfolipídeo fosfatidilinositol (PI), são todos sintetizados nessa via. Como a síntese de fosfolipídeo ocorre no folheto citosólico da bicamada lipídica do RE, é necessário que exista um mecanismo que transfira algumas das moléculas de fosfolipídeos recém-formados para o folheto do lado do lúmen da bicamada. Em bica- madas lipídicas sintéticas, lipídeos não se movem da forma flip-flop (ver Figura 10-10). No RE, todavia, os fosfolipídeos equilibram-se através da membrana em minutos, o que é quase cem mil vezes mais rápido do que o flip-flop (retorno) espontâneo. Esse movimen- to transbicamada rápido é mediado por um translocador de fosfolipídeos pobremente C O Á ci do g ra xo C O Á ci do g ra xo CH2 CH2CH Colina Colina 5 4 CoA CoACoA 2 CoA2 Aciltrans- ferase Fosfatase Colina fosfotransferase Glicerol 3-fosfato LÚMEN DO RE Ácido fosfatídico Diacilglicerol Fosfatidilcolina O O C O Á ci do g ra xo C O Á ci do g ra xo CH2 CH2 OH CH O O CH2 CH2CH OH OH OHOH C O Á ci do g ra xo C O Á ci do g ra xo C O Á ci do g ra xo C O CH2 CH2CH O O Á ci do g ra xo C O Á ci do g ra xo C O Á ci do g ra xo O HC O Ácido graxo C C CMP 3 2 1 Acil-CoA-ligase Proteína ligada ao ácido graxo Bicamada lipídica do RE CDP-colina P P P P P P Pi CITOSOL Figura 12-53 Síntese de fosfatidilco- lina. Como ilustrado, este fosfolipídeo é sintetizado a partir de glicerol-3-fosfato, citidina-difosfocolina (CDP-colina) e ácidos graxos entregues ao RE por proteínas cito- sólicas ligadas a ácidos graxos. 690 PARTE IV Organização interna da célula caracterizado, denominado embaralhador (scramblase) que, de maneira não seletiva, equilibra fosfolipídeos entre os dois folhetos da bicamada lipídica (Figura 12-54). Assim, os diferentes tipos de fosfolipídeos parecem ser igualmente distribuídos entre os dois folhetos da membrana do RE. A membrana plasmática contém um tipo diferente de translocador fosfolipí- dico que pertence à família de transportadores de absorção do tipo P (discutido no Capítulo 11). Essas flipases reconhecem especificamente fosfolipídeos que contêm gru- pos amino livres nos seus grupos da cabeça (fosfatidilserina e fosfatidiletanolamina – ver Figura 10-3) e os transfere a partir do meio extracelular para o folheto citosólico, utili- zando a energia da hidrólise do ATP. A membrana plasmática, portanto, apresenta uma composição fosfolipídica altamente assimétrica, que é ativamente mantida por flipases (ver Figura 10-15). A membrana plasmática também contém um misturador, mas, ao contrário do misturador do RE, que é sempre ativo, a enzima da membrana plasmática é regulada e ativada apenas em algumas situações, como em apoptose e em plaquetas ati- vadas, onde age para cancelar a assimetria da bicamada lipídica; a exposição resultante de fosfatidilserina na superfície de células apoptóticas serve como um sinal para células fagocíticas ingerirem e degradarem a célula morta. O RE também produz colesterol e ceramida (Figura 12-55). A ceramida é sin- tetizada pela condensação do aminoácido serina com um ácido graxo para formar o aminoálcool esfingosina (ver Figura 10-3); um segundo ácido graxo é então adicionado covalentemente para formar a ceramida. A ceramida é exportada ao aparelho de Gol- gi, onde serve como um precursor para a síntese de dois tipos de lipídeos: as cadeias oligossacarídicas são adicionadas para formar glicoesfingolipídeos (glicolipídeos; ver Figura 10-16), e os grupos da cabeça de fosfocolina são transferidos da fosfatidilcolina a outras moléculas de ceramida para formar esfingomielina (discutido no Capítulo 10). Assim, tanto os glicolipídeos quanto a esfingomielina são produzidos tardiamente no processo de síntese de membrana. Pelo fato de serem produzidos por enzimas que têm seus sítios ativos expostos ao lúmen do Golgi e não serem substratos para transportado- res de lipídeos, são encontrados exclusivamente no folheto não citosólico da bicamada lipídica que os contém. Figura 12-54 Papel dos translocadores de fosfolipídeos na síntese da bicama- da lipídica. (A) Uma vez que novas molé- culas de lipídeos são adicionadas somente à metade citosólica da bicamada da mem- brana do RE e que as moléculas de lipídeos não se movem de maneira espontânea de uma monocamada à outra, o trans- locador de fosfolipídeo transmembrana (chamado de “misturador”) é necessário para transferir moléculas de lipídeo da metade citosólica à metade do lúmen, de modo que a membrana desenvolva-se como uma bicamada. O “misturador” não é específico para grupos da cabeça de fosfolipídeo em particular e, portanto, equilibra os diferentes fosfolipídeos entre as duas monocamadas. (B) Alimentada pela hidrólise de ATP, uma flipase grupo da cabeça-específica na membrana plas- mática move ativamente fosfatidilserina e fosfatidiletanolamina direcionalmente do folheto extracelular ao citosólico, criando a assimetria característica da bicamada li- pídica da membrana plasmática de células animais (ver Figura 10-15). CITOSOL LÚMEN DO RE Bicamada lipídica do retículo endoplasmático Crescimento assimétrico da bicamada Crescimento simétrico de ambas as metades da bicamada A SÍNTESE DE FOSFOLIPÍDEOS SOMA-SE À METADE CITOSÓLICA DA BICAMADA A SCRAMBLASE CATALISA A TRANSFERÊNCIA DE MOLÉCULAS FOSFOLIPÍDICAS DO FOLHETO CITOSÓLICA PARA O FOLHETO DO LADO DO LÚMEN (A) MEMBRANA DO RE (B) MEMBRANA PLASMÁTICA EXTERIOR DA CÉLULA CITOSOL Bicamada lipídica assimétrica da membrana plasmática DISTRIBUIÇÃO DA NOVA MEMBRANA POR EXOCITOSE A FLIPASE CATALISA A LIBERAÇÃO DE FOSFOLIPÍDEOS ESPECÍFICOS PARA A MONOCAMADA CITOSÓLICA CH3 OH CH OH CH2 (CH2)12 CH CH CH O NH (CH2)16 CH3 C CERAMIDA Figura 12-55 A estrutura da ceramida. CAPÍTULO 12 Compartimentos intracelulares e endereçamento de proteínas 691 Como discutido no Capítulo 13, a membrana plasmática e as membranas do apa- relho de Golgi, os lisossomos e os endossomos fazem parte de um sistema de membra- nas que se comunica com o RE por meio do transporte de vesículas que transferem pro- teínas e lipídeos. As mitocôndrias e os plastídios, todavia, não pertencem a esse sistema e requerem, portanto, mecanismos diferentes para a importação de proteínas e lipídeos para o crescimento. Já vimos que a maioria das proteínas nessas organelas é importada do citosol. Embora as mitocôndrias modifiquem alguns dos lipídeos que importam, não sintetizam lipídeos de novo; antes, seus lipídeos devem ser importados do RE, direta ou indiretamente, por meio de outras membranas celulares. Em ambos os casos, são neces- sários mecanismos especiais para a transferência. Os detalhes de como a distribuição dos lipídeos entre diferentes membranas é ca- talisada e regulada não são conhecidos. Proteínas carreadoras solúveis em água chama- das de proteínas de troca de fosfolipídeos (ou proteínas de transferência de fosfolipídeos) transferem moléculas individuais de fosfolipídeos entre as membranas, funcionando como proteínas de ligação a ácidos graxos que guiam os ácidos graxos através do citosol (ver Figura 12-54). Além disso, as mitocôndrias são frequentemente vistas em estreita justaposição a membranas do RE em micrografias eletrônicas, e complexas junções es- pecíficas têm sido identificadas, as quais mantêm o RE e as membranas mitocondriais externas em forte proximidade. Acredita-se que esses complexos juncionais forneçam mecanismos específicos de transferência de lipídeos dependentes de contato que ope- ram entre essas membranas adjacentes. Resumo A extensa rede do RE serve como uma fábrica para a produção de quase todos os lipídeosdas células. Além disso, a maior porção da síntese de proteínas celulares ocorre na super- fície citosólica do RE rugoso: quase todas as proteínas destinadas à secreção ou ao próprio RE, o aparelho de Golgi, os lisossomos, os endossomos e a membrana plasmática são im- portadas, primeiramente, do citosol para o RE. No lúmen do RE, as proteínas enovelam-se e se oligomerizam; ligações dissulfeto são formadas, e oligossacarídeos ligados ao N são adicionados. A glicosilação ligada ao N é utilizada para indicar o grau do enovelamento proteico, de tal modo que as proteínas deixam o RE apenas quando estão adequadamente enoveladas. As proteínas que não se enovelam ou oligomerizam corretamente são trans- portadas de volta ao citosol, onde são desglicosiladas, poliubiquitinadas e degradadas em proteassomos. Se as proteínas mal enoveladas acumularem-se extensivamente no RE, elas desencadeiam uma resposta à proteína desenovelada, que ativa genes apropriados no núcleo para auxiliar o RE a contornar o problema. Apenas as proteínas que portam uma sequência-sinal especial do RE são impor- tadas para ele. A sequência-sinal é reconhecida por uma partícula de reconhecimento de sinal (SRP), que se liga à cadeia polipeptídica crescente e ao ribossomo e os direciona a uma proteína receptora na superfície citosólica da membrana do RE rugoso. Essa li- gação à membrana do RE inicia o processo de translocação que força uma alça da ca- deia polipeptídica através da membrana do RE, pelo poro hidrofílico de uma proteína translocadora. As proteínas solúveis – destinadas ao lúmen do RE para secreção ou transferência ao lúmen de outras organelas – passam completamente para o lúmen do RE. As proteínas transmembrana destinadas ao RE ou a outras membranas celulares são transportadas parcialmente através da membrana do RE e permanecem lá ancoradas por um ou mais segmentos de "-hélice em sua cadeia polipeptídica que atravessam a membrana. Essas porções hidrofóbicas da proteína podem atuar como sinais de início ou de parada da transferência durante o processo de translocação. Quando um polipeptídeo contém múl- tiplos sinais alternantes de início e de parada da transferência, ele passará múltiplas ve- zes para trás e para a frente através da bicamada como uma proteína transmembrana de passagem múltipla. A assimetria da inserção da proteína e da glicosilação no RE estabelece a assi- metria das membranas de todas as outras organelas que o RE supre com proteínas de membrana. O QUE NÃO SABEMOS • Como os receptores de importa- ção nuclear lidam com o interior emaranhado semelhante a um gel do complexo de poro nuclear de maneira tão eficiente? • O complexo de poro nuclear é uma estrutura rígida ou ela pode ser expandida e contraída depen- dendo da carga transportada? • Comparações de sequências mos- tram que as sequências-sinal para uma proteína individual como a insulina são extremamente con- servadas entre as espécies, muito mais do que seria esperado a par- tir do nosso entendimento atual de que tudo o que importa para a sua função são características es- truturais gerais, como hidrofobici- dade. Que outras funções podem sinalizar sequências que poderiam contribuir para a conservação evo- lutiva da sequência? • Como são arranjados os polirri- bossomos na membrana do retí- culo endoplasmático para que o próximo ribossomo inicial possa encontrar um translocador deso- cupado? • Por que a partícula de reconheci- mento do sinal possui uma subu- nidade de RNA indispensável?