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Tipos de Bancos de Dados Biológicos

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Questões resolvidas

Um grande avanço da bioinformática aconteceu durante a execução do Projeto Genoma Humano, que durou mais de 10 anos e teve como objetivo principal determinar a ordem dos nucleotídeos de todo genoma da nossa espécie. Essa empreitada científica estimulou o aprimoramento de computadores e de programas para lidar com a grande quantidade de dados que começou a ser gerada. Hoje vivemos o que é chamado de 'era pós-genômica', como o desenvolvimento e aperfeiçoamento de técnicas e programas que permitem estudar outras ciências ômicas. De acordo com as ciências ômicas, analise as afirmativas a seguir:
Genética é o estudo de todo o DNA de um indivíduo.
Metabolômica estuda moléculas de baixo peso molecular produzidas por uma célula.
Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de uma amostra de seu RNA.
Quais são as afirmativas corretas?

A) As afirmativas 1 e 3 estão corretas.
B) Somente a afirmativa 2 está correta.
C) As afirmativas 1 e 2 estão corretas.
D) Somente a afirmativa de número 1 está correta.
E) Somente a afirmativa de número 3 está correta.

Qual banco de dados você recomendaria a ele?


PubMed.
Swiss-Prot.
KEGG.
PDB.
GenBank.

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Questões resolvidas

Um grande avanço da bioinformática aconteceu durante a execução do Projeto Genoma Humano, que durou mais de 10 anos e teve como objetivo principal determinar a ordem dos nucleotídeos de todo genoma da nossa espécie. Essa empreitada científica estimulou o aprimoramento de computadores e de programas para lidar com a grande quantidade de dados que começou a ser gerada. Hoje vivemos o que é chamado de 'era pós-genômica', como o desenvolvimento e aperfeiçoamento de técnicas e programas que permitem estudar outras ciências ômicas. De acordo com as ciências ômicas, analise as afirmativas a seguir:
Genética é o estudo de todo o DNA de um indivíduo.
Metabolômica estuda moléculas de baixo peso molecular produzidas por uma célula.
Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de uma amostra de seu RNA.
Quais são as afirmativas corretas?

A) As afirmativas 1 e 3 estão corretas.
B) Somente a afirmativa 2 está correta.
C) As afirmativas 1 e 2 estão corretas.
D) Somente a afirmativa de número 1 está correta.
E) Somente a afirmativa de número 3 está correta.

Qual banco de dados você recomendaria a ele?


PubMed.
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1 Marcar para revisão
Diferentes tipos de dados biológicos podem ser
armazenados em bancos de dados
computacionais. Em relação aos tipos de
bancos de dados biológicos, relacione as duas
colunas.
1. Curado.
2. Acesso livre.
3. Especializado
4. Primário.
( ) Armazenam informações biológicas originais,
resultados de experimentos científicos.
( ) Banco que contém informações processadas
por um profissional com uma boa experiência
no assunto.
( ) Reúnem todo conteúdo que atende a um
interesse em particular, por exemplo, sobre o
HIV.
( ) Está disponível para qualquer tipo de
usuário, sem restrição de acesso.
Qual a sequência correta?
Questão 1 de 10
Corretas �10�
Em branco �0�
1 2 3 4 5
6 7 8 9 10
Lista de exercícios Anotação… Sair
A
B
C
D
E
4�1�3�2.
1�2�3�4.
1�3�2�4.
4�3�2�1.
2�4�1�3.
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
Os bancos de dados biológicos podem ser
categorizados de diversas formas,
incluindo a disponibilidade de acesso, o
conteúdo dos dados armazenados e a
qualidade desses dados. Quando falamos
de disponibilidade de acesso, um banco de
dados pode ser de acesso livre, ou seja,
disponível para qualquer tipo de usuário,
sem restrição de acesso �2�. Em relação ao
conteúdo dos dados, um banco de dados
primário é aquele que armazena
informações biológicas originais,
resultados de experimentos científicos �4�,
enquanto um banco de dados
especializado reúne todo conteúdo que
atende a um interesse em particular, como,
por exemplo, sobre o HIV �3�. No que se
refere à qualidade dos dados, um banco de
dados curado é aquele que contém
informações processadas por um
A
B
C
D
E
profissional com uma boa experiência no
assunto �1�. Portanto, a sequência correta é
4�1�3�2.
2 Marcar para revisão
�CESPE/UNB �  INMETRO � 2010� Biotecnologia
Molecular)
Microarranjo é uma técnica empregada em
biologia molecular que permite medir os níveis
de expressão de transcritos em larga escala.
Com relação a essa técnica, assinale a opção
correta.
O microarranjo de DNA consiste em
um arranjo predefinido de moléculas
de DNA quimicamente ligadas a uma
superfície sólida.
As lâminas de vidro utilizadas são
revestidas por moléculas de lipídios.
A expressão dos genes é
acompanhada com o emprego de
sondas marcadas com brometo de
etídio.
A detecção é realizada por meio de
eletroforese em gel de agarose.
A técnica em questão é empregada
em estudos proteômicos, visto que
permite a identificação direta das
proteínas expressas.
A
B
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
A técnica em questão é empregada em
estudos transcriptômicos, visto que
permite a identificação direta das RNAs
expressas. Para a técnica, são utilizadas
lâminas de vidro revestidas com sondas de
DNA. A expressão dos genes é
acompanhada com o emprego de sondas
marcadas com corantes fluorescentes. A
detecção é realizada por meio de detecção
da fluorescência.
3 Marcar para revisão
�Adaptado de UFCE � 2015 � Engenheiro - Área
Engenharia de Pesca)
A transcritômica ou transcriptômica é a ciência
que estuda o transcritoma produzido por
determinada célula, tecido ou organismo. Sobre
esse tema, é correto afirmar que:
O transcriptoma é o mesmo em todos
tecidos e órgãos.
Podem haver vários transcriptomas
em um único organismo.
C
D
E
Independente de estágio de
desenvolvimento, o transcriptoma é o
mesmo.
A transcriptômica estuda o conjunto
de proteínas.
Apesar de sua aplicação em diversos
campos da biologia, a transcriptômica
não pode ser pesquisada a partir de
técnicas de alto desempenho e
sequenciamento de nova geração
�NGS�.
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
O transcriptoma estuda o conjunto de
RNAs, que varia de acordo com a condição
a qual a célula está exposta, portanto, se
estudar diferentes tipos de células o
transcriptoma será distinto. Além disso, o
transcriptoma depende do estágio de
desenvolvimento e em cada indivíduo pode
haver vários transcriptomas. O
transcriptoma pode ser estudado pelo
sequenciamento de nova geração,
realizando a pré-etapa de síntese do DNA
complementar.
4 Marcar para revisão
A
B
C
D
E
Um grande avanço da bioinformática aconteceu
durante a execução do Projeto Genoma
Humano, que durou mais de 10 anos e teve
como objetivo principal determinar a ordem dos
nucleotídeos de todo genoma da nossa
espécie. Essa empreitada científica estimulou o
aprimoramento de computadores e de
programas para lidar com a grande quantidade
de dados que começou a ser gerada. Hoje
vivemos o que é chamado de ¿era pós-
genômica¿, como o desenvolvimento e
aperfeiçoamento de técnicas e programas que
permitem estudar outras ciências ômicas. De
acordo com as ciências ômicas, analise as
afirmativas a seguir:
I��Genética é o estudo de todo o DNA de um
indivíduo.
II�� Metabolômica estuda moléculas de baixo
peso molecular produzidas por uma célula.
III��Para investigar o genoma de um indivíduo,
precisamos de uma amostra de seu RNA.
Quais são as afirmativas corretas?
As afirmativas 1 e 3 estão corretas.
As afirmativas 1 e 2 estão corretas.
Somente a afirmativa de número 3
está correta.
Somente a afirmativa 2 está correta.
Somente a afirmativa de número 1 está
correta.
A
B
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
O estudo de todo o DNA de um indivíduo é
chamado de genômica. A genética é a
parte da ciência que estuda a
hereditariedade, a estrutura e a função dos
genes e a variação dos seres vivos. Na
genética estudamos genes individuais. Às
vezes, genética e genômica são usadas
indistintamente, mas têm significados
diferentes. Para investigar o genoma de um
indivíduo, precisamos de uma amostra de
seu DNA.
5 Marcar para revisão
Depois de resultados do sequenciamento
genômico, um pesquisador agora deseja
analisar a expressão dos genes e comparar o
resultado de dois pacientes, um saudável e
outro com câncer pulmonar. Para isso, ele
analisou o conjunto completo de RNAs da
biópsia do pulmão dos pacientes. Como é
chamada a abordagem ômica utilizada pelo
pesquisador na fase atual de sua pesquisa?
Proteômica.
Genômica.
C
D
E
Metabolômica.
Transcriptômica.
Lipidômica.
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
A abordagem ômica utilizada pelo
pesquisador na fase atual de sua pesquisa
é chamada de Transcriptômica. As ciências
ômicas são um conjunto de disciplinas que
estudam um determinado tipo de
moléculas produzido pelas células em sua
totalidade. Cada uma dessas disciplinas
recebe um nome de acordo com o tipo de
molécula que é estudada. A Proteômica
estuda o conjunto de proteínas; a
Genômica estuda o DNA; a Metabolômica
estuda os metabólitos; a Transcriptômica
estuda os transcritos �RNA�; e a Lipidômica
estuda os lipídeos. Portanto, como o
pesquisador está analisando o conjunto
completo de RNAs, a abordagem ômica
utilizada é a Transcriptômica.
6 Marcar para revisão
�Adaptado de VUNESP � 2020 � EBSERH -
Farmacêutico) A revolução biotecnológica tem
A
B
C
D
E
fornecido informações extremamente úteis para
a descoberta de fármacos. O sufixo "ômica"
indica uma série de novas disciplinas e
procedimentos que visam à identificação
funcional e/ou estrutural de tecidos, de células,
de padrões de expressão gênicos e de
características metabólicas �Bhogal & Balls,
2008�, dentre elas:
BHOGAL, N.; BALLS, M. Translation of new
technologies: from basic research to drug
discovery and development. Curr. Drug Discov.Technol., v.5, n.3, p.250�62, 2008.
Genômica, transcriptômica e biônica.
Genômica, transcriptômica e
metabolômica.
Proteômica, lipidômica e dicotômica.
Genômica, dicotômica e proteômica.
Genômica, lipidômica e biônica.
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
As ciências "ômicas" referem-se a campos
de estudo na biologia que terminam com o
sufixo "ômica", como genômica,
transcriptômica e metabolômica. A
genômica é o estudo do genoma completo
de um organismo. A transcriptômica é o
A
B
C
estudo de todos os transcritos de RNA de
um organismo, enquanto a metabolômica é
o estudo do perfil metabólico de um
organismo. Portanto, a alternativa correta é
a "B", que lista genômica, transcriptômica e
metabolômica. As outras alternativas listam
termos que não se enquadram na definição
de ciências "ômicas". Por exemplo,
"dicotômica" refere-se a algo que se divide
em duas partes, e "biônica" é um campo
de estudo que busca aplicar processos
biológicos para fins militares e
tecnológicos. A "lipidômica" é uma ciência
"ômica", mas está listada com termos que
não são ciências "ômicas".
7 Marcar para revisão
A sequência de Shine-Delgarno e as
sequências das "pontas" dos íntrons são
exemplos de sinais na sequência de DNA. Esses
sinais são sequências características
conservadas, que marcam as regiões
necessárias para que a transcrição e tradução
ocorram. Qual processo de bioinformática inclui
a identificação desses sinais?
Montagem do genoma.
Predição gênica.
Extração do DNA.
D
E
Sequenciamento do genoma.
Construção de árvore filogenética.
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
A identificação de sinais na sequência de
DNA, como a sequência de Shine-Delgarno
e as sequências das "pontas" dos íntrons,
é uma característica do processo de
predição gênica. Esses sinais são
sequências características conservadas
que indicam as regiões que serão
transcritas e traduzidas. É importante notar
que esses sinais podem variar entre
procariotos e eucariotos, o que justifica a
utilização de diferentes programas para a
predição gênica nesses grupos de
organismos. Outros processos de
bioinformática, como a montagem do
genoma, a extração do DNA e o
sequenciamento do genoma, têm objetivos
diferentes. A montagem do genoma
envolve a união de pequenos fragmentos
sequenciados para obter sequências
maiores. A extração do DNA é o processo
que visa obter o DNA da célula para futuras
análises, como o PCR e o sequenciamento
de uma determinada região desse material
genético. Por fim, a construção de árvores
filogenéticas representa hipóteses sobre as
relações evolutivas em um grupo de
organismos, podendo ser baseada em
características morfológicas, bioquímicas,
A
B
C
D
E
comportamentais ou moleculares de
espécies ou outros grupos.
8 Marcar para revisão
A química de produtos naturais tem empregado
novas metodologias com o objetivo de acelerar
a descoberta e o isolamento de novos
compostos que são originários das plantas e
que podem ser empregados com fins
terapêuticos. Entre eles, técnicas de separação
associadas às espectrométricas de alto
desempenho, assim analisando o extrato bruto
de uma planta, ou seja, sem prévio isolamento
de um composto único, uma vez que esses
estudos são realizados para a obtenção das
informações qualitativas e quantitativas acerca
da maior quantidade possível de tipos
diferentes de constituintes de cada amostra.
Esse tipo de estudo emprega qual abordagem
ômica?
Transcriptômica.
Genômica.
Proteômica.
Lipidômica.
Metabolômica.
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
O enunciado da questão descreve um
cenário onde a análise é voltada para a
maior quantidade possível de constituintes
da amostra e para o isolamento de novos
compostos originários das plantas, que
podem ser utilizados para fins
terapêuticos. Esses compostos são
produtos (metabólitos) derivados do
metabolismo das plantas. Além disso, o
enunciado menciona a utilização de
técnicas espectrométricas, que são
comumente empregadas em estudos de
metabolômica. As demais abordagens
mencionadas nas alternativas focam em
tipos específicos de moléculas biológicas,
o que não se encaixa no cenário descrito
no enunciado. Portanto, a abordagem
ômica que melhor se aplica ao contexto
apresentado é a metabolômica, tornando a
alternativa E a resposta correta.
9 Marcar para revisão
O aluno Pedro está começando agora uma nova
iniciação científica. Sua orientadora lhe disse
que ele irá trabalhar com a enzima
mieloperoxidase �MOP�, mas ele ainda não
compreende a importância do seu projeto. Ele
precisa acessar um banco de dados biológico
que reúna uma grande variedade de
informações sobre essa proteína, como vias
A
B
C
D
E
metabólicas e doenças associadas a ela. Qual
banco de dados você recomendaria a ele?
Swiss-Prot.
PubMed.
PDB.
GenBank.
KEGG.
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
O banco de dados KEGG é a melhor opção
para o aluno Pedro, pois ele reúne
diferentes tipos de dados biológicos,
possibilitando uma compreensão mais
ampla e detalhada da funcionalidade e
utilidade de moléculas biológicas em um
nível elevado de complexidade. Isso será
útil para o Pedro entender melhor a enzima
mieloperoxidase �MOP) e a importância do
seu projeto. Os demais bancos de dados,
como Swiss-Prot, PubMed, PDB e
GenBank, focam em um determinado tipo
de dados, como anotação de proteínas,
literatura científica, estrutura de proteínas
ou sequências de nucleotídeos,
A
B
C
respectivamente, e não forneceriam uma
visão tão completa quanto o KEGG.
10 Marcar para revisão
Julgue as afirmativas abaixo usando seus
conhecimentos sobre bancos de dados
biológicos.
I � Existem diversos bancos de dados
biológicos disponíveis, e o tipo de informação
disponível costuma ser diferente, como
sequências, estruturas e vias metabólicas.
II � Os bancos de dados biológicos só podem
ser acessados mediante o pagamento de uma
mensalidade pelo usuário.
III � Quanto mais detalhado o processo de
curadoria dos dados disponibilizados por um
banco, mais confiáveis eles são.
As afirmativas I, II e III são proposições
verdadeiras.
A afirmativa I é uma proposição
verdadeira, e II e III são proposições
falsas.
As afirmativas I e III são proposições
verdadeiras, e a II é uma proposição
falsa.
D
E
A afirmativa III é uma proposição
verdadeira, enquanto I e II são
proposições falsas.
As afirmativas I e II são proposições
verdadeiras, enquanto a III é falsa.
Resposta correta
Parabéns, você selecionou a
alternativa correta. Confira o
gabarito comentado!
Gabarito Comentado
As afirmativas I e III são verdadeiras.
Realmente existem diversos bancos de
dados biológicos disponíveis e o tipo de
informação disponível costuma ser
diferente, como sequências, estruturas e
vias metabólicas. Além disso, quanto mais
detalhado for o processo de curadoria dos
dados disponibilizados por um banco, mais
confiáveis eles são. Por outro lado, a
afirmativa II é falsa. A maioria dos bancos
de dados biológicos mais conhecidos e
utilizados são aqueles cujo acesso é livre,
ou seja, qualquer um pode acessar e obter
os dados armazenados. Eles são muito
úteis para o compartilhamento de
informações e verificação da veracidade
de dados divulgados por cientistas.

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