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Sequenciamento de DNA Profa. Dra. Mariana Melo Faculdade Maurício de Nassau Definição • Sequenciamento de DNA = determinar a sequência de pares de base de uma molécula de DNA Histórico • Estrutura do DNA – Watson & Crick, 1953 • Sequenciamento – Maxan & Gilbert, 1977 • Método da degradação química – Sanger, 1977 • Método do dideoxinucleotídeo Métodos clássicos de sequenciamento Método da degradação química • Método baseado na alteração química da molécula de DNA, com posterior sequenciamento baseado na clivagem em nucleotídeos específicos • Também chamado de método enzimático ou método de Maxam & Gilbert Método da degradação química Método do dideoxinucleotídeo • Método baseado na síntese de DNA a partir de nucleotídeos modificados – os dideoxinucleotídeos, que provocam a interrupção da síntese – Separação dos fragmentos gerados por eletroforese – Identificação do último nucleotídeo adicionado durante a síntese • Também chamado de método de Sanger Método do dideoxinucleotídeo Método do dideoxinucleotídeo Sequenciamento semi-automático • Substituição de marcadores radioativos por marcadores fluorescentes • Fluorófos • Eletroforese com utilização de ddNTP (dideoxinucleotídeos) fluorescentes ou • Eletroforese com corantes fluorescentes colocados no poço no próprio gel Sequenciamento Automático • Utilização de ciclos de amplificação Sequenciamento Automático • Primer anela-se a apenas uma das fitas do DNA • Utilização de ddNTP marcados com fluorescência • Resultado: mistura de fragmentos de DNA terminado em ddNTPs fluorescentes que podem ser detectados Sequenciamento Automático Vídeo: http://eaulas.usp.br/portal/video.action?idItem=1966 Sequenciador de DNA Outras técnicas de sequenciamento • Pirosequenciamento • Sequenciamento por hibridização • Espectrometria de massa Aplicações do sequenciamento • Análise genômica • Analise filogenética • Biologia da conservação • Epidemiologia
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