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REPLICAÇÃO DO DNA REPLICAÇÃO O mecanismo de replicação baseado no pareamento das bases da dupla hélice do DNA. A estrutura do DNA contém a informação necessária para perpetuar sua sequência de bases. REPLICAÇÃO A replicação ocorre na fase S do ciclo celular. REPLICAÇÃO PROCESSO SEMICONSERVATIVO DNA parental Nova molécula de DNA Nova molécula de DNA (uma fita do DNA parental e uma fita nova) (uma fita do DNA parental e uma fita nova) REPLICAÇÃO 3 ESTÁGIOS: INICIAÇÃO – reconhecimento de uma origem de replicação; - separação e estabilização das fitas do DNA ELONGAÇÃO – síntese das fitas filhas DNA polimerase, primase, helicase, topoisomerase (girase) TERMINAÇÃO – DNA ligase, telomerase (cromossomos lineares) REPLICAÇÃO ORIGEM DE REPLICAÇÃO - Procarioto - CROMOSSOMO CIRCULAR (BACTÉRIA E. coli) INÍCIO EM UM ÚNICO SÍTIO; ORIGEM DE REPLICAÇÃO OU oriC (SEQÜÊNCIA DE 245 NUCLEOTÍDEOS – REGIÃO RICA EM AT) . - DUAS FORQUILHAS DE REPLICAÇÃO – MOVEM-SE EM SENTIDOS OPOSTOS ATÉ SE ENCONTRAREM. - A ORIGEM NOS PROCARIOTOS PODE SER ATIVADA MAIS DE UMA VEZ DURANTE UM CICLO CELULAR. REPLICAÇÃO ORIGEM DE REPLICAÇÃO- Eucarioto - INÍCIO EM VÁRIAOS PONTOS – VÁRIAS ORIGENS DE REPLICAÇÃO. - NO GENOMA HUMANO EXISTEM CERCA DE 20.000 ORIGENS, UMA A CADA 150 KB (KILOBASES = MIL BASES). REPLICAÇÃO REPLICON UNIDADE DE REPLICAÇÃO ATIVADOS APENAS UMA ÚNICA VEZ EM CADA CICLO CELULAR; 40-100 KB E SÃO INICIADOS EM TEMPOS DIFERENTES. O GENOMA DE UMA CÉLULA PROCARIÓTICA CONSTITUE UM ÚNICO REPLICON. REPLICAÇÃO A REPLICAÇÃO É BIDIRECIONAL O DNA É REPLICADO BIDIRECIONALMENTE. Procariotos - apenas uma "bolha" de replicação (uma única origem um replicon), Eucariotos - várias "bolhas" de replicação (várias origens de replicação vários replicons) que estão distribuídas ao longo do dna. "BOLHA" DE REPLICAÇÃO COM DUAS FORQUILHAS (REGIÃO DE SEPARAÇÃO DAS FITAS) QUE SE MOVIMENTAM EM SENTIDOS OPOSTOS. REPLICAÇÃO Helicase Rep Helicase DnaB Proteínas SSB Movimento da forquilha REPLICAÇÃO 1- Proteínas reconhecem a origem de replicação e promovem uma pequena abertura na dupla hélice do DNA. 2- Helicases – enzimas que desenrolam a hélice de DNA e separam as cadeias polinucleotídicas – rompem as pontes de hidrogênio entre as bases. 3- Proteínas SSB – proteínas que se ligam a simples fita de DNA impedindo o retorno ao estado de dupla fita. 4- Primase do DNA – é um tipo de RNA polimerase, uma proteína que sintetiza um pequeno fragmento de RNA sobre a cadeia molde do DNA, que vai atuar como iniciador (primer) para a replicação do DNA. 5- DNA polimerase III – síntese das fitas do DNA 6- Topoisomerase – faz corte na fita do DNA para relaxar a tensão gerada pela separação das fitas na forquilha. 7- DNA polimerase I – retira os iniciadores de RNA (primers) através de sua atividade 5’3’ exonuclease e substitui por DNA. 8- DNA ligase – enzima que faz a ligação entre os fragmentos de Okazaki da fita descontínua. REPLICAÇÃO REPLICAÇÃO SÍNTESE SEMIDESCONTÍNUA DO DNA A REPLICAÇÃO SEMIDESCONTÍNUA é o modo no qual uma fita é sintetizada continuamente enquanto a outra é sintetizada descontinuamente. -Fita leading - contínua -Fita lagging – descontínua Fragmentos de Okazaki Fita leading (contínua) Fita lagging (descontínua) Fragmento de Okazaki F o rq u ilh a d e re p lic aç ão REPLICAÇÃO SÍNTESE SEMIDESCONTÍNUA DO DNA FRAGMENTOS DE OKAZAKI – PEDAÇOS CURTOS DE DNA - 1000-2000 BASES – BACTÉRIAS; - MENOS DE 200 BASES – EUCARIOTOS. - SINTETIZADOS DURANTE A REPLICAÇÃO – POSTERIORMENTE SÃO LIGADOS, FORMANDO UMA FITA CONTÍNUA. Fita leading (contínua) Fita lagging (descontínua) REPLICAÇÃO SÍNTESE SEMIDESCONTÍNUA DO DNA Cada fragmento de Okazaki inicia-se com um primer de RNA e termina antes do fragmento seguinte. A DNA polimerase I, com sua atividade exonucleolítica 5’ 3’, consegue remover o primer e substituí-lo por DNA. A ligação dos fragmentos de Okazaki é o último passo no amadurecimento da cadeia lagging, e é realizado por uma enzima, a ligase do DNA. Essa enzima catalisa a formação de uma ligação fosfodiéster entre o grupo 3’-OH livre da extremidade de um fragmento de Okazaki e o grupo 5’ fosfato de um fragmento de Okazaki adjacente. REPLICAÇÃO DNA POLIMERASES ENZIMAS QUE POLIMERIZAM DESOXINUCLEOTÍDEOS TRIFOSFATADOS (dNTPS). DIREÇÃO DA REPLICAÇÃO - TODAS AS DNA POLIMERASES PROMOVEM O CRESCIMENTO DA FITA DE DNA SOMENTE NA DIREÇÃO DE 5’ PARA 3’ (só agem na hidroxila da extremidade 3’ livre adicionando os nucleotídeos). TRÊS TIPOS EM PROCARIOTOS: DNA polimerase I , DNA polimerase II e DNA polimerase III VÁRIAS POLIMERASES EM EUCARIOTOS: NA REPLICAÇÃO DO DNA NUCLEAR - α, δ, ε. REPLICAÇÃO DNA POLIMERASES DNA POLIMERASE I - utilizada pela célula nos processos de REPLICAÇÃO e REPARO DO DNA. • POLIMERIZAÇÃO NO SENTIDO 5’ => 3’ • ATIVIDADE EXONUCLEOLÍTICA NO SENTIDO 3’ => 5’ – capaz de reconhecer e clivar pareamento errôneo na extremidade 3’ OH da fita nova – elimina somente o último nucleotídeo que foi adicionado - importante para que a replicação ocorra livre de erro. • ATIVIDADE EXONUCLEOLÍTICA NO SENTIDO 5’ => 3’ – é capaz de retirar os ribonucleotídeos que fazem parte dos primers de RNA. DNA POLIMERASE II - Ainda não tem suas funções bem definidas in vivo. Envolvida com REPARO DE LESÕES NO DNA. DNA POLIMERASE III – é a PRINCIPAL ENZIMA PARA O PROCESSO DE REPLICAÇÃO, sendo responsável pelo crescimento das novas cadeias polinucleotídicas durante a replicação do DNA •polimerização no sentido 5’ => 3’ • atividade exonucleolítica no sentido 3’ => 5’ REPLICAÇÃO DNA POLIMERASES EUCARIOTOS •DNA POLIMERASE α – (alfa)(Pol α/primase ) inicializa a síntese de fitas novas, através da síntese do primer de RNA. •DNA POLIMERASE δ (delta)– -atividade polimerização 5’=> 3’ -atividade exonucleolítica 3’=> 5’ -maior processividade -continua a polimerização •DNA POLIMERASE ε –parece estar relacionada aos mecanismos de reparo do DNA. Pol I PolII PolIII Polimerização 5’ 3’ + + + Exonuclease 3’ 5’ + + + Exonuclease 5’ 3’ + - - Número de subunidades 1 4 10 Reparo e replicação Reparo Principal enzima da replicação Pol Pol Pol Polimerização 5’ 3’ + + + Exonuclease 3’ 5’ - + + Exonuclease 5’ 3’ - - - Número de subunidades 4 1 2 ou 3 Síntese dos primers Principal enzima da replicação Reparo POLIMERASES Propriedades das DNA-polimerases Eucarióticas POLIMERASES Propriedades das DNA-polimerases Bacterianas Fragmentos de Okasaki ocorrem na fita descontínua A DNA polimerase III é responsável pela síntese da maior parte do DNA A DNA polimerase I remove o primer de RNA e preenche as lacunas A DNA ligase sela as quebras REPLICAÇÃO PROCARIOTOS X EUCARIOTOS procariótica eucariótica Velocidade da forquilha 50.000pb/min 2.000pb/min Nº de replicons 1 vários Tamanho dos replicons 40-150kb Tamanho dos fragmentos de Okazaki 1000-2000 nucleotídeos 100-200 nucleotídeos Tamanho do primer de RNA 2-3 nucleotídeos9-10 nucleotídeos Polimerases do DNA I, II e III α, e Modelo E.coli PROTEÍNAS SSB - Duas cadeias complementares de ácidos nucléicos têm uma tendência muito grande em se associarem, tomando a configuração de hélice; um fenômeno conhecido como hibridação. As cadeias complementares de uma molécula de DNA mantêm-se separadas na região da forquilha de replicação graças a ação das SSBP (do inglês, Single Strand DNA-Binding Proteins – proteínas que se ligam à fita simples do DNA). A presença de diversas moléculas de proteínas SSB sobre uma cadeia simples de DNA produz uma conformação estendida e pouco flexível, favorável à ação da polimerase III. À medida que as cadeias complementares vão sendo sintetizadas, as proteínas SSB se soltam do DNA, uma vez que elas não têm afinidade por dupla-hélice. TOPOISOMERASES - A medida que a forquilha de replicação "anda" pela dupla fita de DNA, começa a aparecer uma tensão na porção logo a frente da forquilha, devido ao superenrolamento ("supercoil“) do DNA. Para aliviar esta pressão do superenrolamento um grupo de enzimas, denominadas de topoisomerases, quebram momentaneamente uma das cadeias do DNA, fazendo com que este sofra algumas rotações e em seguida este mesmo grupo de enzimas refazem a ligação "quebrada". Em procariotos estas topoisomerases são conhecidas como DNA girase. Este processo de desenrolamento do DNA é extremamente importante em procariotos.
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