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Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 1 BIOMOLÉCULAS As biomoléculas são compostos químicos orgânicos formados a partir de elementos químicos (ver na tabela periódica) e que fazem parte dos organismos vivos. Existem elementos que são necessários em grandes quantidades e, outros em pequenas quantidades. Em amarelo estão os microelementos (µg) e, em laranja, os macroelementos (mg). São compostos de carbono com uma variedade de grupos funcionais. A maior parte das biomoléculas pode ser considerada como derivada de hidrocarbonetos, com átomos de hidrogênio substituídos por uma variedade de grupos funcionais para produzir famílias diferentes de compostos orgânicos. C → 4 ligações; N → 3 ligações; O → 2 ligações; H → 1 ligação; Energia para a ruptura de ligações: tripla >dupla> simples. Esses microelementos atuam principalmente como cofatores enzimáticos. Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 2 ● Mais de 90 elementos químicos, cerca de 30 são essenciais para organismos vivos. ● 99% são C, H, O, N nas células. Porém 70% de H2O. ● A atmosfera primitiva era constituída por H2O, N2, CO2, CH4, NH3, SO2. ● Década de 30, Oparin e Haldane sugeriram a influência de UV ou descargas elétricas na formação de compostos orgânicos. ● Em 1953, Müller e Urey comprovaram em laboratório que submetendo uma mistura de CH4, NH3, H2O, H2 por uma semana a descargas elétricas havia a formação de compostos orgânicos. Moléculas precursoras *** Os aminoácidos, bases nitrogenadas, ácidos graxos, etc... São moléculas constituintes das biomoléculas que formam os organismos Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 3 *** O núcleo da célula vegetal é uma organela e possui vários complexos supramoleculares incluindo cromatina. A cromatina, por exemplo, consiste em dois tipos de macromoléculas, DNA e muitas proteínas diferentes; Componentes moleculares da célula E. coli: A ligação entre os átomos. A versatilidade do átomo de C formar ligações covalentes. Hierarquia estrutural na organização molecular das células Obrigatoriamente o C faz sempre 4 ligações, independente se for ligações simples, dupla ou tripla com outros átomos. As ligações triplas são raras em biomoléculas. Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 4 Tabela de Nomenclatura de acordo com os números de carbonos em moléculas: Nº Prefixo Nº Prefixo 1 Met 6 Her 2 Et 7 Hept 3 Prop 8 Oct 4 But 9 Non 5 Pent 10 Dec Principais Funções Orgânicas: Função Orgânica Fórmula Geral Nomenclatura IUPAC Exemplos ÁLCOOL R-OH (OH ligado a C saturado) (Nome do Radical) + ol CH3 -CH2-CH2-OH 1-propanol FENOL R-OH hidroxi + (Nome do Radical) OH hidroxibenzeno ÉTER R1-O-R2 (Nome Radical 1) + oxi + (Nome Radical 2) CH3-O-CH2-CH3 metoxietano A ligação simples tem liberdade de rotação, já a ligação dupla é planar e rígida por isso não sofre rotação. Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 5 ALDEÍDO R1-CHO (Nome do Radical - a letra o) + al CH3-CH2-CHO propanal CETONA R1- CO-R2 (Nome dos Radicais - a letra o) + ona O || CH3-C- CH3 propanona ÁCIDO CARBOXÍLICO R-COOH ácido + (Nome do Radical) + óico CH3-CH2-COOH ácido propanóico ÉSTER O || R1-C-O-R2 (Nome do Radical 1 menos ácido e óico) + ato + (Nome do Radical 2) O || CH3-CH2-C- O-CH3 propanoato de metila AMINA R1-NH2 (primária) (Nome do Radical) + amina CH3-CH2-CH2-NH2 propilamina R2 | R1-N-H (secundária) (Nome do Radical 1 e Radical 2) + amina CH3 | CH3-CH2-N-H Metiletilamina R2 | R1-N- R3 (terciária) (Nome do Radical 1, Radical 2 e Radical 3) + amina CH2-CH3 | CH3-CH2-CH2-N- CH3 metiletilpropilamina AMIDA O || R-C-NH2 (Nome do Radical) + amida O || CH3-CH2-C- NH2 propanoamida http://www.coladaweb.com/quimica/funcoesorganicas.htm Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 6 HALETO ORGÂNICO R-X(onde X é: F, Cl, Br, I) (Nome do Radical) + haleto CH3-CH2-CH2-Cl 1-cloro-propano As biomoléculas contém vários grupos funcionais que podem conferir polaridade ou não a ela. Os grupos funcionais presentes em moléculas: Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 7 Aparelho Polarímetro e para que serve? ▪Mede a atividade ótica; ▪Usado para moléculas em solução; ▪Fonte de luz (1); ▪Um filtro polarizador fixo (2); ▪Um tubo (3) contendo a amostra (4); ▪Um filtro polarizador para análise (6), que ao ser girado registra o sentido levógiro (-) ou dextrógiro (+) e o ângulo em graus (de 0 à 180); ▪Observe na figura o desvio do plano ao sair à luz do compartimento da amostra (5); ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL: Estereoisômeros Enantiômeros e diasteroisômeros A maioria das biomoléculas é assimétrica. (Elas fazem quatro ligações diferentes). R=D/S=L Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 8 -Isômeros ópticos envolvem ligações simples (R, S: D, L). -Isômeros geométricos envolvem ligações duplas (cis-trans). ESTEREOESPECIFICIDADE – é a habilidade para distinguir entre dois isômeros. Estereoisômeros: Toda e qualquer molécula no espaço, com a mesma forma molecular, mas diferentes configurações. Enantiômeros: São isômeros que apresentam imagem especular, mas não são sobreponíveis. Diastereoisômeros: São estereoisômeros que não apresentam imagem especular. Configuração: refere-se à organização dos átomos ao longo da cadeia. Os isômeros configuracionais só podem ser interconvertidos com quebras e formações de novas ligações. Conformação: refere-se aos diferentes arranjos de átomos e de grupos substituintes da cadeia polimérica resultantes apenas por rotações ao redor de ligações simples. Isômeros geométricos: envolvem ligações duplas (cis-trans). Molécula aquiral: a molécula rodada pode ser superposta na sua imagem especular. Molécula quiral: a molécula rodada não pode ser superposta na imagem especular. Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 9 As milhares de reações químicas catalisadas por enzimas nas células são organizadas funcionalmente em muitas seqüências de reações consecutivas, chamadas vias metabólicas, onde o produto de uma reação se torna o reagente na próxima. Algumas vias degradam nutrientes orgânicos em produtos finais simples a fim de extrair a energia química e convertê- la em uma forma útil para a célula; juntas essas reações degradativas, produtoras de energia livre, são designadascatabolismo. Outras vias começam com moléculas precursoras pequenas e as convertem em moléculas mais complexas e maiores, incluindo proteínas e os ácidos nucleicos. Tais vias biossintetizadoras, que invariavelmente requerem a adição de energia, são coletivamente designadas anabolismo. O ATP é o intermediário químico compartilhado na ligação dos processos liberadores de energia e os requerentes de energia da célula. Seu papel na célula é análogo àquele do dinheiro na economia: ele é “ganho/produzido” nas reações exergônicas e “gasto/consumido” nas endergônicas. No catabolismo a energia liberada pelas reações catabólicas promovem a síntese de ATP. No anabolismo as redes de rotas catalisadas por enzimas constituem o metabolismo celular e produz equivalentes NADH, NADPH e FADH2 a)Convergência catabólica: Ocorre quando as moléculas como aminoácidos, lipídios entre outros são degradados até serem convertidas enzimaticamente em produtos finais mais simples e menores c) Ciclo cíclico: Durante este ciclo vai ser gerado as moléculas de energia, como por ex: ATP e equivalentes como NADH, NADPH e FADH2 . b) Divergência anabólica: As energias geradas no ciclo cíclico serão utilizados para sintetizar moléculas novas, as quais são macromoléculas. Três tipos de vias metabólicas não-lineares Relações energéticas entre as vias catabólicas e anabólicas Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 10 Metabolismo – sistemas multi-enzimáticos atuando de forma coordenada para: • Obtenção de energia química; • Converter moléculas de nutrientes em moléculas próprias de cada célula; • Polimerização a partir de monômeros precursores; • Sintetizar e degradar biomoléculas necessárias. • O metabolismo é a soma de muitas sequências de reações interconectadas que se interconvertem os metabólitos celulares. Cada sequência é regulada de forma a fornecer o que a célula necessita em um dado instante e para gastar energia apenas quando for necessário. Existem vários tipos de reações: Reações de oxidação-redução: ***Quanto mais hidrogênio menos oxigênio e quanto mais oxigênio menos hidrogênio. Nas reações químicas, as ligações são quebradas e novas ligações são formadas. Importante!!! Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 11 Reações que formam ou rompem ligações C-C: Rearranjos internos, isomerizações e eliminações: Reações de transferência de grupos: - As células e organismos vivos necessitam realizar trabalho para manter a vida, crescer e se reproduzir. -Energia livre de Gibbs; (G): Expressa a quantidade de energia capaz de realizar trabalho durante uma reação à temperatura e pressão constantes; pode ser positiva ou negativa. -Entalpia; (H): É o conteúdo de calor do sistema reagente; pode ser positiva ou negativa. Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 12 -Entropia; (S): É uma expressão quantitativa de casualidade, ou ainda, desordem de um sistema; pode ser positiva ou negativa. - Primeira lei da termodinâmica: ΔG = ΔH – T ΔS. - Segunda lei da termodinâmica: entropia - Células – sistemas isotérmicos e isobáricos. - A variação de energia livre está relacionada com a constante de equilíbrio. - Condições fisiológicas intracelulares – ΔG’° ΔG’° = -RT ln K’eq. - As variações de energia livre são aditivas – acoplamento de reações. A variação de energia está diretamente relacionada com a constante de equilíbrio Hidrólise do ATP como exemplo de reação que libera energia. OBS: AG° é negativo Prof. Valéria Dornelles Gindri Sinhorin 13 Questionário 1) Quais os principais elementos químicos constituintes das biomoléculas? 2) Quais os tipos de ligações que podem ocorrer entre átomos de carbono? 3) Qual a diferença entre ligação iônica e covalente? 4) Diferencie conformação e configuração em uma molécula? 5) Qual é o requisito para que um composto orgânico de cadeia aberta tenha isomeria geométrica? 6) O que é um carbono assimétrico? 7) O que é uma molécula assimétrica ou quiral? 8) O que são estereoisômeros, enantiômeros e diasteroisômeros? 9) Quais são os tipos de reações mais comumente encontrados em organismos vivos? 10) Na formação de macromoléculas a partir de subunidades monoméricas, em geral, ocorre gasto de energia (reação endergônica). Que recursos às células utilizam para que as macromoléculas possam ser formadas? 11) O que é energia livre de Gibbs, entalpia e entropia e como se apresentam? 12)Conceitue oxidação e redução. 13) Diferencie nucleófilo de eletrófilo. 14) Qual é o requisito para que um composto orgânico de cadeia aberta tenha isomeria geométrica? 15) Identifique grupos funcionais nas moléculas: