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UNIVERSIDADE FEDERAL DA BAHIA INSTITUTO DE BIOLOGIA BIO A93 BIOLOGIA CELULAR E MOLECULAR APLICADA À MEDICINA VETERINÁRIA 1. Descreva as diferentes etapas do ciclo celular enfatizando suas principais ocorrências. 2. Identifique os principais pontos de verificação (check points) do ciclo celular, analisando quais fatores são verificados para que ocorra progresso ao longo dos diferentes estágios do ciclo celular. 3. Identifique as principais proteínas responsáveis pelo controle do ciclo celular, analisando seus modos de ação. 4. À medida que as células progridem ao longo da fase G2 até a mitose, o MPF (ciclina + Cdc2) é ativado por uma proteína quinase chamada CAK e inativada por uma outra quinase, a Wee1. Esta combinação de modificações estimulatória e inibitória significam que o MPF está pronto para uma ativação explosiva. No final, o MPF é ativado durante a prófase pela proteína quinase Cdc25, que remove os fosfatos inibitórios e desencadeia a transição G2/M. Explique por que existe esse sistema tão elaborado para regular a transição G2/M. 5. Sobre a estrutura do DNA, relacione a segunda coluna de acordo com a primeira: 1 Histonas ( ) Unidade estrutural básica da cromatina 2 Cromatossomo ( ) Cada um dos dois filamentos de um cromossomo duplicado unidos por um centrômero comum. 3 Cromátide ( ) Material nuclear que constitui os cromossomos descondensados, isto é, na interfase. 4 Solenóide ( ) Subunidade da cromatina de 166 pb de DNA, enrolada num núcleo de histonas e mantida pela H1 5 Genoma ( ) Arranjo espiralizado do DNA em cromossomos eucarióticos produzidos pela espiralização de um conjunto de nucleossomos. 6 Cromatina ( ) Sequência da fita de DNA entre dois nucleossomos vizinhos 7 Nucleossomo ( ) Conjunto haplóide de cromossomos portando os genes de uma espécie. 8 Eucromatina ( ) Proteínas que interrompem a estrutura da cromatina. 9 Fator remodelador do nucleossomo ( ) Principal proteína envolvida na compactação do DNA eucariótico 10 DNA de ligação ( ) Regiões da cromatina que se encontram menos condensadas e onde, acredita-se serem as regiões onde estão situados os genes ativos 6. Se compararmos as proteínas cromossômicas histônicas e não histônicas de cromatina isolada de diferentes tipos de células de um determinado organismo eucariótico, que classe de proteínas apresentará maior heterogeneidade? Explique 7. O fato da DNA primase adicionar primers de RNA, que nem sempre são complementares à fita do DNA, afeta a fidelidade da replicação do DNA? 8. Que característica de um cromossomo metafásico demonstra que o DNA já passou por replicação? 9. Se o número haplóide de cromossomos na ovelha (Ovis aries) é 27 (n = x = 27), determine quantos cromossomos e quantas cromátides uma célula somática tem nos seguintes estágios da mitose Estágio Número de cromossomos Número de cromátides 1. Prófase 2. Metáfase 3. Telófase (por núcleo filho) 4. Interfase - fase G1 10. As duas fitas da dupla hélice do DNA podem ser separadas por aquecimento. Se você aumentou a temperatura de uma solução contendo as três seguintes moléculas de DNA (1, 2 e 3), em que ordem supõe-se que elas iriam desnaturar (abrir)? Explique sua reposta. 5’ G C G G G C C A G C C G A G T G G G T A G C C 3’ ( ) 3’ C G C C C G G T C G G C T C A C C C A T C G G 5’ 5’ A G C A T T T T C G 3’ 3’ T C G T A A A A G C 5’ ( ) 5’ A T T A T A A A A A A T A A A G C A T 3’ 3’ T A A T A T T T T T T A T T T C G T A 5’ ( ) 11. A droga dideoxicitidina, que é usada para tratar infecções virais, é um nucleotídeo cujo açúcar não possui o grupo –OH ligado nem na direção 2’ e tampouco na direção 3’. Quando essa droga é administrada em um sistema celular de replicação, a replicação da molécula de DNA é interrompida. Explique por que essa droga bloqueia a replicação da molécula de DNA. 12. O RNA foi extraído do TMV (vírus do mosaico do fumo) e verificou-se que 20% das suas bases são citosinas. Usando essa informação é possível provar que porcentagem de bases em TMV são adenina? Se sim, que porcentagem? 13. Que característica de um cromossomo metafásico demonstra que o DNA já passou por replicação? 14. Os vinte cromossomos de uma célula de milho perfazem um comprimento total de aproximadamente 80, ao passo que o comprimento linear das suas moléculas de DNA atinge um comprimento de 4,62m, o que resulta numa condensação de 57 mil vezes. Como isso é possível? 15. O que é telômero e qual o papel da telomerase? 16. Identifique os principais pontos de verificação (check points) do ciclo celular, analisando quais fatores são verificados para que ocorra progresso ao longo dos diferentes estágios do ciclo celular. 17. A micrografia abaixo mostra o processo de replicação da molécula do DNA. A partir da análise dessa micrografia, indique se ela corresponde a uma célula procariótica ou eucariótica? Explique porque você chegou a essa conclusão. 18. A partir do esquema abaixo, que representa uma molécula de DNA sofrendo replicação teta, identifique a origem de replicação, um primer de RNA, os fragmentos de Okasaki e as fitas contínua e descontínua. 19. O que são as topoisomerases ? Qual e como elas desempenham seu papel na molécula de DNA? 20. O que são os nucleossomos e como é sua organização na cromatina? 21. O que são as histonas? 22. O esquema abaixo mostra o experimento de Avery, MacLeod, McCarty (1944) que serviu como base para a elucidação da natureza química do material genético. A partir desse esquema, explique como foi elaborado esse experimento e os resultados por eles observados em 1, 2 e 3. Bactérias S mortas pelo calor Lipídeos Carboidratos Adição de proteases Adição de RNAse Adição de DNAse Bactérias R Bactérias R Bactérias R 1 2 3 Bactérias S mortas pelo calor Lipídeos Carboidratos Adição de proteases Adição de RNAse Adição de DNAse Bactérias RBactérias R Bactérias RBactérias R Bactérias RBactérias R 1 2 3 23. Explique cinco diferenças entre a replicação entre células eucarióticas e das células procarióticas. 24. A identificação e caracterização de genes envolvidos com reparo de DNA são de grande interesse, dada a sua importância na manutenção da integridade genômica. Além disso, a alta conservação dos genes de reparo de DNA faz com que possam ser utilizados como fonte de informação no que diz respeito à origem e evolução das espécies. Os mecanismos relacionados à remoção de danos pelo reparo de DNA, bem como suas conseqüências biológicas, já são bem conhecidas em bactérias, leveduras e animais. A partir dessas informações explique o mecanismo de reparo de DNA por excisão de bases 25. Quais das seguintes taxas são compatíveis com o modelo de Watson e Crick para a molécula de DNA? Explique. a. G + C / A + T = 1 b. G + A / C + T = 1 c. Pirimidinas / purinas = 1 d. G + C + A / T = 1 e. GA / C = T 26. Após o DNA ter sido replicado, um mecanismo de reparo examina a molécula recém duplicada e procura por bases mal-pareadas, podendo, por exemplo, detectar um par AC ao invés de um par AT. Como esse mecanismo reconhece e corrige a base que foi incorporada pela DNA polimerase de maneira incorreta?
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